SAXSdb — 7smk

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

Halothiobacillus neapolitanus (strain ATCC 23641 / c2)

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–473	未记录	Ribulose bisphosphate carboxylase small chain × 8 （P45686） Carboxysome shell carbonic anhydrase × 8 （O85042）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds	分辨率 1.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7SMK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–473（473 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.166
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–473（473 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 16 GOL GLYCEROL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.166
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–473（473 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.166
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–473（473 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.166
6UEW Rubisco / CsoS2 N-peptide complex responsible for alpha-carboxysome cargo loading 提交 2019-09-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 2–473（472 aa）链 C 2–473（472 aa）链 E 2–473（472 aa）链 G 2–473（472 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 400, magnesium chloride, HEPES	分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7SNV H. neapolitanus carboxysomal rubisco/CsoSCA-peptide (1-50)complex 提交 2021-10-28	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 2–473（472 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds	分辨率 2.07 Å
7ZBT Subtomogram averaging of Rubisco from native Halothiobacillus carboxysomes 提交 2022-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–473（473 aa）链 B 1–473（473 aa）链 C 1–473（473 aa）链 D 1–473（473 aa）链 E 1–473（473 aa）链 F 1–473（473 aa）链 G 1–473（473 aa）链 H 1–473（473 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 4 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBL1_HALNC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–474； UniProt 2–473

Ribulose bisphosphate carboxylase small chain

Halothiobacillus neapolitanus (strain ATCC 23641 / c2)

UniProt P45686

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–110	未记录	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （O85040） Carboxysome shell carbonic anhydrase × 8 （O85042）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds	分辨率 1.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7SMK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 1–110（110 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.166
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 M 1–110（110 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 16 GOL GLYCEROL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.166
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 1–110（110 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.166
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 1–110（110 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；298 K；ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.166
6UEW Rubisco / CsoS2 N-peptide complex responsible for alpha-carboxysome cargo loading 提交 2019-09-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–110（110 aa）链 D 1–110（110 aa）链 F 1–110（110 aa）链 H 1–110（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEG 400, magnesium chloride, HEPES	分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7SNV H. neapolitanus carboxysomal rubisco/CsoSCA-peptide (1-50)complex 提交 2021-10-28	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 B 1–110（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds	分辨率 2.07 Å
7ZBT Subtomogram averaging of Rubisco from native Halothiobacillus carboxysomes 提交 2022-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 I 1–110（110 aa）链 J 1–110（110 aa）链 K 1–110（110 aa）链 L 1–110（110 aa）链 M 1–110（110 aa）链 N 1–110（110 aa）链 O 1–110（110 aa）链 P 1–110（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 4 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBS_HALNC
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–110； UniProt 1–110

Carboxysome shell carbonic anhydrase

物种未注明

UniProt O85042

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–50	未记录	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （O85040） Ribulose bisphosphate carboxylase small chain × 8 （P45686）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds	分辨率 1.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7SMK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7SNV H. neapolitanus carboxysomal rubisco/CsoSCA-peptide (1-50)complex 提交 2021-10-28	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 C 1–50（50 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds	分辨率 2.07 Å
9G4T Beta carbonic anhydrase CsoSCA from the Halothiobacillus neapolitanus alpha-carboxysome 提交 2024-07-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：monomeric	链 A 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.51 Å
9SKR Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA in oxidizing conditions, hexamer 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.13 Å
9SKR Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA in oxidizing conditions, hexamer 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.13 Å
9SKR Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA in oxidizing conditions, hexamer 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.13 Å
9SKS Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA in oxidizing conditions, dimer, major state, active conformation 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.15 Å
9SKT Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA in oxidizing conditions, dimer, minor state 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.45 Å
9SKU Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA in reducing conditions, hexamer 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.06 Å
9SKV Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA in reducing conditions, dimer, major state, inactive conformation 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.12 Å
9SKW Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA in reducing conditions, dimer, minor state 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.27 Å
9SKX Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA C283A/C284A inactive mutant, hexamer 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.08 Å
9SKY Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA C283A/C284A inactive mutant, dimer, state 1 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.18 Å
9SKZ Cryo-EM structure of H. neapolitanus CsoSCA C283A/C284A inactive mutant, dimer, state 2 提交 2025-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–514（513 aa）链 B 2–514（513 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4C, 100% relative humidity, delay time 0s, blot time 3s, blot force 0	分辨率 2.22 Å

共 11 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSOCA_HALNC
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–50； UniProt 1–50

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7smk
沉积日期 deposition_date	2021-10-26
结构标题 title	H. neapolitanus carboxysomal rubisco/CsoSCA-peptide (1-50)complex
关键词 keywords	rubisco, lyase, TIM-barrel, complex; LYASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	31.99 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	32.10 Å
零角强度 I(0) i0	65343600.00
分子量 molecular_weight	63778.0 kDa
排除体积 excluded_volume	79649 Å³
包络体积 envelope_volume	104990 Å³
水化壳体积 shell_volume	29328 Å³
包络直径 envelope_diameter	118.1 Å
壳层 Rg shell_rg	35.91 Å
包络 Rg envelope_rg	33.14 Å
形状 Rg shape_rg	32.07 Å
总 Rg total_rg	32.52 Å
总原子数 total_atoms	4503
残基数 n_residues	571
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	112.7 Å
Rg (实空间) rg_real	32.45 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.24 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.5340e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1660e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	32.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	65330000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7944
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.586
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.304
角度范围 angular_range	— – 0.2500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	15050000.0000
实空间数据点数 n_real_points	51
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.637; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.593; Smooth: 0.819

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain
分子量 formula_weight	53831.7 kDa
EC 编号 ec_number	4.1.1.39
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4729

MSAVKKYSAGVKEYRQTYWMPEYTPLDSDILACFKITPQPGVDREEAAAAVAAESSTGTWTTVWTDLLTDMDYYKGRAYRIEDVPGDDAAFYAFIAYPIDLFEEGSVVNVFTSLVGNVFGFKAVRGLRLEDVRFPLAYVKTCGGPPHGIQVERDKMNKYGRPLLGCTIKPKLGLSAKNYGRAVYECLRGGLDFTKDDENINSQPFMRWRDRFLFVQDATETAEAQTGERKGHYLNVTAPTPEEMYKRAEFAKEIGAPIIMHDYITGGFTANTGLAKWCQDNGVLLHIHRAMHAVIDRNPNHGIHFRVLTKILRLSGGDHLHTGTVVGKLEGDRASTLGWIDLLRESFIPEDRSRGIFFDQDWGSMPGVFAVASGGIHVWHMPALVNIFGDDSVLQFGGGTLGHPWGNAAGAAANRVALEACVEARNQGRDIEKEGKEILTAAAQHSPELKIAMETWKEIKFEFDTVDKLDTQNRWSHPQFEK

来源 Source

来源生物 organism	Halothiobacillus neapolitanus (strain ATCC 23641 / c2)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	555778
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Ribulose bisphosphate carboxylase small chain
分子量 formula_weight	12866.6 kDa
EC 编号 ec_number	4.1.1.39
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MAEMQDYKQSLKYETFSYLPPMNAERIRAQIKYAIAQGWSPGIEHVEVKNSMNQYWYMWKLPFFGEQNVDNVLAEIEACRSAYPTHQVKLVAYDNYAQSLGLAFVVYRGN

来源 Source

来源生物 organism	Halothiobacillus neapolitanus (strain ATCC 23641 / c2)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	555778
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Carboxysome shell carbonic anhydrase
分子量 formula_weight	5690.5 kDa
EC 编号 ec_number	4.2.1.1
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MNTRNTRSKQRAPFGVSSSVKPRLDLIEQAPNPAYDRHPACITLPERTCR

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	202

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7smkA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — RuBisCO large subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	7smkA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 — Ribulose bisphosphate carboxylase, large subunit, C-terminal domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.98 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	79562

fit	/app/data/saxs_computation/sm/7smk/7smk.fit
pddf	/app/data/pr_computation/sm/7smk/7smk.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/sm/7smk/7smk.dat

H. neapolitanus carboxysomal rubisco/CsoSCA-peptide (1-50)complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ribulose bisphosphate carboxylase small chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Carboxysome shell carbonic anhydrase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)