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7srk

Single chain trimer HLA-A*24:02 (Y108C, A163C) with 8mer peptide YPPVPETF

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 103.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RPA-related protein RADX peptide,Beta-2-microglobulin,MHC class I antigen chimera

Homo sapiens

UniProt A0A411J078

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 25–299 突变：Y108C, A163C VHH × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM MES, pH 6.0, 200 mM KSCN, 18% Peg 3350 分辨率 2.50 Å R-free 0.260
2 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 25–299 突变：Y108C, A163C VHH × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM MES, pH 6.0, 200 mM KSCN, 18% Peg 3350 分辨率 2.50 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7SRK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6XQA Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWVLKNL, an 9-mer epitope from Influenza B virus 提交 2020-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–302（278 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；24% PEG8000, 0.1 HEPES pH 7.5, 2% isopropanol, 5% w/v Polyvinylpyrrolidone K15
分辨率 2.16 Å R-free 0.229
6XQA Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWVLKNL, an 9-mer epitope from Influenza B virus 提交 2020-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 25–302（278 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；24% PEG8000, 0.1 HEPES pH 7.5, 2% isopropanol, 5% w/v Polyvinylpyrrolidone K15
分辨率 2.16 Å R-free 0.229
7EJL Complex Structure of HLA-A*2402 with the Peptide from HCoV(CoV-2) spike protein 提交 2021-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–298（274 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；Na/K phosphate
分辨率 1.89 Å R-free 0.255
7EJM Complex Structure of HLA-A*2402 with the Peptide from HCoV(CoV-229E) spike protein 提交 2021-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–298（274 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na citrate, PEG 3350
分辨率 1.71 Å R-free 0.221
7EJN Complex Structure of HLA-A*2402 with the Peptide from HCoV(CoV-HKU1) spike protein 提交 2021-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–298（274 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 3350, Tris-HCl
分辨率 2.11 Å R-free 0.264
7JYU Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with IYFSPIRVTF, an 10-mer epitope from Influenza B virus 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–302（278 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% PEG 8000, 0.2 MgCl2, 0.1 Tris-HCl pH 8.5
分辨率 2.75 Å R-free 0.259
7JYU Crystal Structure of HLA-A*2402 in complex with IYFSPIRVTF, an 10-mer epitope from Influenza B virus 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 25–302（278 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% PEG 8000, 0.2 MgCl2, 0.1 Tris-HCl pH 8.5
分辨率 2.75 Å R-free 0.259
7JYV Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with YFSPIRVTF, an 9-mer influenza epitope 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–302（278 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；19% PEG 3350, 0.2 MgCl2
分辨率 1.51 Å R-free 0.206
7JYW Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWIIRNW, an 9-mer influenza epitope 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–302（278 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；20% PEG3350, 0.2M Na acetate
分辨率 2.90 Å R-free 0.275
7JYX Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWIIRNWET, an 11-mer epitope from Influenza 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–302（278 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；24% PEG8000, 0.1 HEPES pH 7.5, 5% v/v Ethyl acetate
分辨率 2.95 Å R-free 0.275
7JYX Crystal Structure of HLA A*2402 in complex with TYQWIIRNWET, an 11-mer epitope from Influenza 提交 2020-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 25–302（278 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；24% PEG8000, 0.1 HEPES pH 7.5, 5% v/v Ethyl acetate
分辨率 2.95 Å R-free 0.275
7K80 KIR3DL1*001 in complex with HLA-A*24:02 presenting the RYPLTFGW peptide 提交 2020-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 ACT ACETATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate, pH 5.0, and 0.1 M trisodium citrate, pH 5.6
分辨率 2.40 Å R-free 0.249
7K80 KIR3DL1*001 in complex with HLA-A*24:02 presenting the RYPLTFGW peptide 提交 2020-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 25–300（276 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate, pH 5.0, and 0.1 M trisodium citrate, pH 5.6
分辨率 2.40 Å R-free 0.249
7K81 KIR3DL1*005 in complex with HLA-A*24:02 presenting the RYPLTFGW peptide 提交 2020-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate, pH 5.0, and 0.1 M trisodium citrate, pH 5.6
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
7NMD Human Major Histocompatibility Complex A24 Allele presenting QLPRLFPLL 提交 2021-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 4000, 0.1 M TRIS (pH 7.5), 15% glycerol.
分辨率 2.25 Å R-free 0.265
7NMD Human Major Histocompatibility Complex A24 Allele presenting QLPRLFPLL 提交 2021-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 25–300（276 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 4000, 0.1 M TRIS (pH 7.5), 15% glycerol.
分辨率 2.25 Å R-free 0.265
7NME Human MHC Class I, A24 Allele presenting QLPRLFPLL, Complex with 4C6 TCR 提交 2021-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；291 K；Molecular Dimensions Pact Premier C06: 0.1M PCTCP buffer, 25% PEG 1500, pH 9.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
7NMF Human MHC Class I, A24 Allele presenting QLPRLFPLL, Complex with 4C6 TCR, monoclinic form 提交 2021-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M Sodium Bromide, 0.1 M bis-tris Propane, pH 7.5, 20% PEG 3350
分辨率 2.98 Å R-free 0.259
7NMG Human MHC Class I, A24 Allele presenting LWM, Complex with 4C6 TCR 提交 2021-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 1500, 0.1M PCTP Buffer, pH 9.0
分辨率 2.48 Å R-free 0.271
7WT3 Crystal structure of HLA-A*2402 complexed with 4-mer lipopeptide 提交 2022-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 24–300（277 aa）
未记录 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 ACT ACETATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 26 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；2mM ZnCL2, 100mM Tris, 20% PEG 6000
分辨率 1.89 Å R-free 0.235
7WT3 Crystal structure of HLA-A*2402 complexed with 4-mer lipopeptide 提交 2022-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 24–300（277 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；2mM ZnCL2, 100mM Tris, 20% PEG 6000
分辨率 1.89 Å R-free 0.235
7WT4 Crystal structure of HLA-A*2402 complexed with 8-mer Influenza PB1 peptide 提交 2022-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 24–300（277 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 33 ZN ZINC ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；100mM Tris, 20% PEG 6000
分辨率 1.89 Å R-free 0.232
7WT4 Crystal structure of HLA-A*2402 complexed with 8-mer Influenza PB1 peptide 提交 2022-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 24–300（277 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；100mM Tris, 20% PEG 6000
分辨率 1.89 Å R-free 0.232
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJH HLA A*2402-NF9_6F pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene Glycol 4,000, 20% w/v MES, 0.1 M, pH7
分辨率 2.60 Å R-free 0.264
8RJI HLA A*2402-NF9_5R pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene glycol 4000, 20% w/v Sodium Cacodylate, 0.1 M, pH 6
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
8RJI HLA A*2402-NF9_5R pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene glycol 4000, 20% w/v Sodium Cacodylate, 0.1 M, pH 6
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
8RJI HLA A*2402-NF9_5R pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene glycol 4000, 20% w/v Sodium Cacodylate, 0.1 M, pH 6
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
8RJI HLA A*2402-NF9_5R pMHC complex 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 25–300（276 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Glycerol 15% v/v Polyethylene glycol 4000, 20% w/v Sodium Cacodylate, 0.1 M, pH 6
分辨率 2.30 Å R-free 0.265
8SBK Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI (ATG2A). 提交 2023-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–304（280 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.219
8SBL Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI 提交 2023-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 25–304（280 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.05M MES monohydrate pH 6.5, 22.5% Polyethylene Glycol w/v 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
8SBL Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI 提交 2023-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 25–304（280 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.05M MES monohydrate pH 6.5, 22.5% Polyethylene Glycol w/v 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
8SBL Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI 提交 2023-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 25–304（280 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.05M MES monohydrate pH 6.5, 22.5% Polyethylene Glycol w/v 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
8SBL Structure of HLA-A*24:02 in complex with peptide, LYLPVRVLI 提交 2023-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 25–304（280 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.05M MES monohydrate pH 6.5, 22.5% Polyethylene Glycol w/v 3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.270
9BL5 KIR3DL1*001 in complex with HLA-A*24:02 presenting the TW9 peptide 提交 2024-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；16% PEG-3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
9BL6 KIR3DL1*114 in complex with HLA-A*24:02 presenting the TW9 peptide 提交 2024-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；14% PEG 3550, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.40 Å R-free 0.256
9BL9 KIR3DL1*114 in complex with HLA-A*24:02 presenting the NEF peptide 提交 2024-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.60 Å R-free 0.246
9BLA KIR3DL1*086 in complex with HLA-A*24:02 presenting the NEF peptide 提交 2024-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 25–300（276 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；14% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 3.00 Å R-free 0.248

共 24 个其他 PDB 条目、42 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A411J078_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 143–417； UniProt 25–299 作者链 C； PDB构建体 143–417； UniProt 25–299

RPA-related protein RADX peptide,Beta-2-microglobulin,MHC class I antigen chimera

Homo sapiens

UniProt P16213

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 21–119 突变：Y108C, A163C VHH × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM MES, pH 6.0, 200 mM KSCN, 18% Peg 3350 分辨率 2.50 Å R-free 0.260
2 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 21–119 突变：Y108C, A163C VHH × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM MES, pH 6.0, 200 mM KSCN, 18% Peg 3350 分辨率 2.50 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7SRK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7SQP Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108C) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDL 提交 2021-11-05 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：Y108C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NH4Citrate, 20.0% PEG 3350
分辨率 2.53 Å R-free 0.260
7SQP Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108C) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDL 提交 2021-11-05 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–119（99 aa）
突变：Y108C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NH4Citrate, 20.0% PEG 3350
分辨率 2.53 Å R-free 0.260
7SR0 Single chain trimer HLA-A*02:01 (H98L, Y108C) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPET 提交 2021-11-07 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：H98L, Y108C PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM HK2PO4, 20% PEG 3350
分辨率 2.54 Å R-free 0.242
7SR0 Single chain trimer HLA-A*02:01 (H98L, Y108C) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPET 提交 2021-11-07 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–119（99 aa）
突变：H98L, Y108C PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM HK2PO4, 20% PEG 3350
分辨率 2.54 Å R-free 0.242
7SR3 Single chain trimer HLA-A*02:01 (H98L, Y108C) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDL 提交 2021-11-07 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：H98L, Y108C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM K2SO4, 17% PEG 3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.248
7SR3 Single chain trimer HLA-A*02:01 (H98L, Y108C) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDL 提交 2021-11-07 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–119（99 aa）
突变：H98L, Y108C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM K2SO4, 17% PEG 3350
分辨率 2.49 Å R-free 0.248
7SR4 Single chain trimer HLA-A*02:01 (H98L, Y108C) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-07 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：H98L, Y108C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM KCitrate, pH 6.5, 17.5% PEG 3350
分辨率 2.59 Å R-free 0.247
7SR4 Single chain trimer HLA-A*02:01 (H98L, Y108C) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-07 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–119（99 aa）
突变：H98L, Y108C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM KCitrate, pH 6.5, 17.5% PEG 3350
分辨率 2.59 Å R-free 0.247
7SR5 Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108C, A163C) with Wilms tumor protein peptide RMFPNAPYL 提交 2021-11-07 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NH4Citrate, 14.5% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.248
7SR5 Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108C, A163C) with Wilms tumor protein peptide RMFPNAPYL 提交 2021-11-07 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NH4Citrate, 14.5% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.248
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 U 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 W 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 a 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 15 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 c 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 16 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 e 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 O 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7SSH Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 21–119（99 aa）
突变：Y108A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；200 mM NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, 1.45 M (NH4)2SO4
分辨率 2.73 Å R-free 0.294
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 U 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 W 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 a 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 15 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 c 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 16 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 e 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 O 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7ST3 Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 21–119（99 aa）
突变：Y108C,A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 7.5, 200 mM Li2SO4, 1.6 M AmSO4
分辨率 2.78 Å R-free 0.275
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 U 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 W 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 a 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 15 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 c 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 16 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 e 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 O 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 21–119（99 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276

共 8 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B2MG_PONPY
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 24–122； UniProt 21–119 作者链 C； PDB构建体 24–122； UniProt 21–119

RPA-related protein RADX peptide,Beta-2-microglobulin,MHC class I antigen chimera

Homo sapiens

UniProt Q6NSI4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 509–516 突变：Y108C, A163C VHH × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM MES, pH 6.0, 200 mM KSCN, 18% Peg 3350 分辨率 2.50 Å R-free 0.260
2 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 509–516 突变：Y108C, A163C VHH × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM MES, pH 6.0, 200 mM KSCN, 18% Peg 3350 分辨率 2.50 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7SRK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 U 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 W 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 a 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 15 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 c 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 16 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 e 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 O 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
7STG Consequences of HLA single chain trimer mutations on peptide presentation and binding affinity 提交 2021-11-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 509–516（8 aa）
突变：Y108C, A163C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100 mM Tris, pH 8.0, 200 mM Li2SO4, 1.1 M AmSO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.276
8U5Y human RADX trimer bound to ssDNA 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–855（855 aa）
链 B 1–855（855 aa）
链 C 1–855（855 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 HELIUM
分辨率 3.01 Å
8U61 Human RADX tetramer bound to ssDNA 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric
链 A 1–855（855 aa）
链 B 1–855（855 aa）
链 C 1–855（855 aa）
链 D 1–855（855 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 3 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RADX_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–8； UniProt 509–516 作者链 C； PDB构建体 1–8； UniProt 509–516

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7srk

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7srk
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7srk
沉积日期 deposition_date2021-11-08
结构标题 titleSingle chain trimer HLA-A*24:02 (Y108C, A163C) with 8mer peptide YPPVPETF
关键词 keywordsHLA, VHH, HPV, SCT, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier32.17 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron31.34 Å
零角强度 I(0) i0198560000.00
分子量 molecular_weight107720.0 kDa
排除体积 excluded_volume132540 ų
包络体积 envelope_volume174560 ų
水化壳体积 shell_volume45808 ų
包络直径 envelope_diameter108.6 Å
壳层 Rg shell_rg38.82 Å
包络 Rg envelope_rg31.13 Å
形状 Rg shape_rg31.33 Å
总 Rg total_rg31.98 Å
总原子数 total_atoms7602
残基数 n_residues983
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax103.8 Å
Rg (实空间) rg_real32.02 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.76 Å
I(0) (实空间) i0_real1.9860e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.9630e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal32.08 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal198600000.0000
解质量估计 total_estimate0.8761
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary42.4 Å
偏度 Skewness skewness0.241
峰度 Kurtosis kurtosis-0.196
角度范围 angular_range— – 0.2450 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha24460000.0000
实空间数据点数 n_real_points50
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.843; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.990; Smooth: 0.867
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id7srkB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id7srkD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)