7tji

S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with flexible Orc6 N-terminal domain

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Origin recognition complex subunit 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P54784

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 7 DNA 2 Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA, 84 bp ARS1 × 1 DNA, 84 bp ARS1 × 1 Cell division control protein 6 × 1 (P09119) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 7 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC1_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–917; UniProt 1–914

Origin recognition complex subunit 2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32833

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 7 DNA 2 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA, 84 bp ARS1 × 1 DNA, 84 bp ARS1 × 1 Cell division control protein 6 × 1 (P09119) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 7 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC2_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–620; UniProt 1–620

Origin recognition complex subunit 3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P54790

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 7 DNA 2 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA, 84 bp ARS1 × 1 DNA, 84 bp ARS1 × 1 Cell division control protein 6 × 1 (P09119) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 7 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC3_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–616; UniProt 1–616

Origin recognition complex subunit 4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P54791

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 7 DNA 2 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA, 84 bp ARS1 × 1 DNA, 84 bp ARS1 × 1 Cell division control protein 6 × 1 (P09119) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 7 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC4_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 4–532; UniProt 1–529

Origin recognition complex subunit 5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P50874

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 7 DNA 2 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA, 84 bp ARS1 × 1 DNA, 84 bp ARS1 × 1 Cell division control protein 6 × 1 (P09119) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 7 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC5_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–479; UniProt 1–479

Origin recognition complex subunit 6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38826

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 7 DNA 2 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) DNA, 84 bp ARS1 × 1 DNA, 84 bp ARS1 × 1 Cell division control protein 6 × 1 (P09119) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 7 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC6_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–435; UniProt 1–435

Cell division control protein 6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P09119

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 7 DNA 2 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA, 84 bp ARS1 × 1 DNA, 84 bp ARS1 × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 7 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC6_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 4–516; UniProt 1–513

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7tji
沉积日期 deposition_date2022-01-16
结构标题 titleS. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with flexible Orc6 N-terminal domain
关键词 keywordsinitiator, helicase loader, AAA+ ATPase, REPLICATION-DNA complex; REPLICATION/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7tji__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7tji__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7tji__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)46.65 Å
Rg(电子密度)46.61 Å
总 Rg46.79 Å
原子数23654
残基数2758
排除体积420410 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7tji__assembly_1__model_1 nonameric (9) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id7tjiE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
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7. 引用文献 (1)