SAXSdb — 7wlp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H2B type 1-O,Histone H2A type 1-D

Homo sapiens

UniProt P20671

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 4	Tegument protein BKRF4 × 3 （Q3KSS1） water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H2A1D_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 95–193； UniProt 14–112

Histone H2B type 1-O,Histone H2A type 1-D

Homo sapiens

UniProt P23527

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 4	Tegument protein BKRF4 × 3 （Q3KSS1） water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H2B1O_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–94； UniProt 34–126

Tegument protein BKRF4

Human gammaherpesvirus 4

UniProt Q3KSS1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 4	Histone H2B type 1-O,Histone H2A type 1-D × 1 （P20671,P23527） water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BKRF4_EBVG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–88； UniProt 16–102 作者链 C； PDB构建体 2–88； UniProt 16–102 作者链 D； PDB构建体 2–88； UniProt 16–102

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7wlp
沉积日期 deposition_date	2022-01-13
结构标题 title	Epstein-Barr virus protein BKRF4 restricts nucleosome assembly to suppress host antiviral responses
关键词 keywords	Epstein-Barr virus, BKRF4, histones, nucleosomes, DNA double-strand break repair, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7wlp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7wlp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7wlp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.30 Å
Rg（电子密度）	16.99 Å
总 Rg	18.05 Å
原子数	1505
残基数	194
排除体积	26895 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7wlp__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone H2B type 1-O,Histone H2A type 1-D
分子量 formula_weight	21364.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1506

MRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSSKKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tegument protein BKRF4
分子量 formula_weight	9917.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,C

MRRLLSDEEEETSQSSSYTLGSQASQSIQEEDVSDTDESDYSDEDEEIDLEEEYPSDEDPSEGSDSDPSWHPSDSDESDYSESDEDEA

来源 Source

来源生物 organism	Human gammaherpesvirus 4
通用名 common_name	Epstein-Barr virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10376
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	88.270 Å
晶胞边长 b length_b	88.270 Å
晶胞边长 c length_c	105.626 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	P 63 2 2
空间群编号 int_tables_number	182
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.290 Å
最低分辨率 resolution_low	38.250 Å
R 因子 r_factor	0.2278
R_work r_work	0.2271
R_free r_free	0.2416

Epstein-Barr virus protein BKRF4 restricts nucleosome assembly to suppress host antiviral responses

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H2B type 1-O,Histone H2A type 1-D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone H2B type 1-O,Histone H2A type 1-D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tegument protein BKRF4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7wlp__assembly_1__model_1

7wlp__assembly_1__model_1 | I(q)

7wlp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)

Epstein-Barr virus protein BKRF4 restricts nucleosome assembly to suppress host antiviral responses

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H2B type 1-O,Histone H2A type 1-D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B type 1-O,Histone H2A type 1-D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tegument protein BKRF4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7wlp__assembly_1__model_1

7wlp__assembly_1__model_1 | I(q)

7wlp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)