7wtn

Cryo-EM structure of a yeast pre-40S ribosomal subunit - State Tsr1-1 (with Rps2)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

40S ribosomal protein S1-A

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS3A1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 SB； PDB构建体 1–255； UniProt 1–255

40S ribosomal protein S2

物种未注明

UniProt P25443

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 SC； PDB构建体 1–254； UniProt 1–254

40S ribosomal protein S4-A

物种未注明

UniProt P0CX35

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS4A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 SE； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261

40S ribosomal protein S6-A

物种未注明

UniProt P0CX37

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS6A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 SG； PDB构建体 1–236； UniProt 1–236

40S ribosomal protein S7-A

物种未注明

UniProt P26786

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS7A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 SH； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190

40S ribosomal protein S8-A

物种未注明

UniProt P0CX39

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS8A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 SI； PDB构建体 1–200； UniProt 1–200

40S ribosomal protein S9-A

物种未注明

UniProt O13516

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS9A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 SJ； PDB构建体 1–197； UniProt 1–197

40S ribosomal protein S11-A

物种未注明

UniProt P0CX47

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS11A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 SL； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

40S ribosomal protein S13

物种未注明

UniProt P05756

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS13_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 SN； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151

40S ribosomal protein S14-A

物种未注明

UniProt P06367

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS14A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 SO； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137

40S ribosomal protein S22-A

物种未注明

UniProt P0C0W1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS22A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 SW； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

40S ribosomal protein S23-A

物种未注明

UniProt P0CX29

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS23A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 SX； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

40S ribosomal protein S24-A

物种未注明

UniProt P0CX31

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS24A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 SY； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

40S ribosomal protein S27-A

物种未注明

UniProt P35997

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS27A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 Sb； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82

40S ribosomal protein S30-A

物种未注明

UniProt P0CX33

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS30A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 Se； PDB构建体 1–63； UniProt 1–63

Pre-rRNA-processing protein PNO1

物种未注明

UniProt Q99216

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） 18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase × 1 （P25627） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PNO1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 CA； PDB构建体 1–274； UniProt 1–274

18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase

物种未注明

UniProt P25627

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 1	18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-A × 1 （P0CX35） 40S ribosomal protein S6-A × 1 （P0CX37） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （Q99216） ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BUD23_YEAST
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 CB； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7wtn
沉积日期 deposition_date	2022-02-05
结构标题 title	Cryo-EM structure of a yeast pre-40S ribosomal subunit - State Tsr1-1 (with Rps2)
关键词 keywords	ribosome biogenesis, 40S ribosome, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7wtn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7wtn__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7wtn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	60.25 Å
Rg（电子密度）	61.33 Å
总 Rg	61.31 Å
原子数	46427
残基数	3835
排除体积	735970 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7wtn__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	18S rRNA
分子量 formula_weight	579761.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	C2
原子数 atom_count	46427

UAUCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCAAUUUAUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUCGUUUAUUUGAUAGUUCCUUUACUACAUGGUAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCUUAAAAUCUCGACCCUUUGGAAGAGAUGUAUUUAUUAGAUAAAAAAUCAAUGUCUUCGGACUCUUUGAUGAUUCAUAAUAACUUUUCGAAUCGCAUGGCCUUGUGCUGGCGAUGGUUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGUGGCCUACCAUGGUUUCAACGGGUAACGGGGAAUAAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUAAUUCAGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACGAUACAGGGCCCAUUCGGGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUGUAAAUACCUUAACGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAACUUUGGGCCCGGUUGGCCGGUCCGAUUUUUUCGUGUACUGGAUUUCCAACGGGGCCUUUCCUUCUGGCUAACCUUGAGUCCUUGUGGCUCUUGGCGAACCAGGACUUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCGUAUUGCUCGAAUAUAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACGUUUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACCAUCGUAAUGAUUAAUAGGGACGGUCGGGGGCAUCAGUAUUCAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUAUUGAAGACUAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGACGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGAUGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGGGAUCGGGUGGUGUUUUUUUAAUGACCCACUCGGCACCUUACGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACACAAUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUUUGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGCUUAAUUGCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUACUAAAUAGUGGUGCUAGCAUUUGCUGGUUAUCCACUUCUUAGAGGGACUAUCGGUUUCAAGCCGAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGACGGAGCCAGCGAGUCUAACCUUGGCCGAGAGGUCUUGGUAAUCUUGUGAAACUCCGUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGUAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUAGUACCGAUUGAAUGGCUUAGUGAGGCCUCAGGAUCUGCUUAGAGAAGGGGGCAACUCCAUCUCAGAGCGGAGAAUUUGGACAAACUUGGUCAUUUAGAGGAACUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S1-A
分子量 formula_weight	28798.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SB

MAVGKNKRLSKGKKGQKKRVVDPFTRKEWFDIKAPSTFENRNVGKTLVNKSTGLKSASDALKGRVVEVCLADLQGSEDHSFRKIKLRVDEVQGKNLLTNFHGMDFTTDKLRSMVRKWQTLIEANVTVKTSDDYVLRIFAIAFTRKQANQVKRHSYAQSSHIRAIRKVISEILTKEVQGSTLAQLTSKLIPEVINKEIENATKDIFPLQNIHVRKVKLLKQPKFDVGALMALHGEGSGEEKGKKVTGFKDEVLETV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S2
分子量 formula_weight	27490.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SC

MSAPEAQQQKRGGFGGRNRGRPNRRGPRNTEEKGWVPVTKLGRLVKAGKITTIEEIFLHSLPVKEFQIIDTLLPGLQDEVMNIKPVQKQTRAGQRTRFKAVVVVGDSNGHVGLGIKTAKEVAGAIRAGIIIAKLSVIPIRRGYWGTNLGQPHSLATKTTGKCGSVTVRLIPAPRGSGIVASPAVKKLLQLAGVEDVYTQSNGKTRTLENTLKAAFVAIGNTYGFLTPNLWAEQPLPVSPLDIYSDEASAQKKRF

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S4-A
分子量 formula_weight	29469.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SE

MARGPKKHLKRLAAPHHWLLDKLSGCYAPRPSAGPHKLRESLPLIVFLRNRLKYALNGREVKAILMQRHVKVDGKVRTDTTYPAGFMDVITLDATNENFRLVYDVKGRFAVHRITDEEASYKLGKVKKVQLGKKGVPYVVTHDGRTIRYPDPNIKVNDTVKIDLASGKITDFIKFDAGKLVYVTGGRNLGRIGTIVHKERHDGGFDLVHIKDSLDNTFVTRLNNVFVIGEQGKPYISLPKGKGIKLSIAEERDRRRAQQGL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S6-A
分子量 formula_weight	27054.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SG

MKLNISYPVNGSQKTFEIDDEHRIRVFFDKRIGQEVDGEAVGDEFKGYVFKISGGNDKQGFPMKQGVLLPTRIKLLLTKNVSCYRPRRDGERKRKSVRGAIVGPDLAVLALVIVKKGEQELEGLTDTTVPKRLGPKRANNIRKFFGLSKEDDVRDFVIRREVTKGEKTYTKAPKIQRLVTPQRLQRKRHQRALKVRNAQAQREAAAEYAQLLAKRLSERKAEKAEIRKRRASSLKA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S7-A
分子量 formula_weight	21658.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SH

MSAPQAKILSQAPTELELQVAQAFVELENSSPELKAELRPLQFKSIREIDVAGGKKALAIFVPVPSLAGFHKVQTKLTRELEKKFQDRHVIFLAERRILPKPSRTSRQVQKRPRSRTLTAVHDKILEDLVFPTEIVGKRVRYLVGGNKIQKVLLDSKDVQQIDYKLESFQAVYNKLTGKQIVFEIPSETH

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S8-A
分子量 formula_weight	22537.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SI

MGISRDSRHKRSATGAKRAQFRKKRKFELGRQPANTKIGAKRIHSVRTRGGNKKYRALRIETGNFSWASEGISKKTRIAGVVYHPSNNELVRTNTLTKAAIVQIDATPFRQWFEAHYGQTLGKKKNVKEEETVAKSKNAERKWAARAASAKIESSVESQFSAGRLYACISSRPGQSGRCDGYILEGEELAFYLRRLTAKK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S9-A
分子量 formula_weight	22487.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SJ

MPRAPRTYSKTYSTPKRPYESSRLDAELKLAGEFGLKNKKEIYRISFQLSKIRRAARDLLTRDEKDPKRLFEGNALIRRLVRVGVLSEDKKKLDYVLALKVEDFLERRLQTQVYKLGLAKSVHHARVLITQRHIAVGKQIVNIPSFMVRLDSEKHIDFAPTSPFGGARPGRVARRNAARKAEASGEAADEADEADEE

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S11-A
分子量 formula_weight	17785.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SL

MSTELTVQSERAFQKQPHIFNNPKVKTSKRTKRWYKNAGLGFKTPKTAIEGSYIDKKCPFTGLVSIRGKILTGTVVSTKMHRTIVIRRAYLHYIPKYNRYEKRHKNVPVHVSPAFRVQVGDIVTVGQCRPISKTVRFNVVKVSAAAGKANKQFAKF

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S13
分子量 formula_weight	17059.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SN

MGRMHSAGKGISSSAIPYSRNAPAWFKLSSESVIEQIVKYARKGLTPSQIGVLLRDAHGVTQARVITGNKIMRILKSNGLAPEIPEDLYYLIKKAVSVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYRTVAVLPPNWKYESATASALVN

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S14-A
分子量 formula_weight	14562.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SO

MSNVVQARDNSQVFGVARIYASFNDTFVHVTDLSGKETIARVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAAKCKEVGITAVHVKIRATGGTRTKTPGPGGQAALRALARSGLRIGRIEDVTPVPSDSTRKKGGRRGRRL

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S22-A
分子量 formula_weight	14650.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SW

MTRSSVLADALNAINNAEKTGKRQVLIRPSSKVIIKFLQVMQKHGYIGEFEYIDDHRSGKIVVQLNGRLNKCGVISPRFNVKIGDIEKWTANLLPARQFGYVILTTSAGIMDHEEARRKHVSGKILGFVY

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S23-A
分子量 formula_weight	16073.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SX

MGKGKPRGLNSARKLRVHRRNNRWAENNYKKRLLGTAFKSSPFGGSSHAKGIVLEKLGIESKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKKVTAFVPNDGCLNFVDENDEVLLAGFGRKGKAKGDIPGVRFKVVKVSGVSLLALWKEKKEKPRS

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S24-A
分子量 formula_weight	15362.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	SY

MSDAVTIRTRKVISNPLLARKQFVVDVLHPNRANVSKDELREKLAEVYKAEKDAVSVFGFRTQFGGGKSVGFGLVYNSVAEAKKFEPTYRLVRYGLAEKVEKASRQQRKQKKNRDKKIFGTGKRLAKKVARRNAD

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S27-A
分子量 formula_weight	8893.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Sb

MVLVQDLLHPTAASEARKHKLKTLVQGPRSYFLDVKCPGCLNITTVFSHAQTAVTCESCSTILCTPTGGKAKLSEGTSFRRK

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S30-A
分子量 formula_weight	7137.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Se

MAKVHGSLARAGKVKSQTPKVEKTEKPKKPKGRAYKRLLYTRRFVNVTLVNGKRRMNPGPSVQ

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Pre-rRNA-processing protein PNO1
分子量 formula_weight	30380.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	CA

MVAPTALKKATVTPVSGQDGGSSRIIGINNTESIDEDDDDDVLLDDSDNNTAKEEVEGEEGSRKTHESKTVVVDDQGKPRFTSASKTQGNKIKFESRKIMVPPHRMTPLRNSWTKIYPPLVEHLKLQVRMNLKTKSVELRTNPKFTTDPGALQKGADFIKAFTLGFDLDDSIALLRLDDLYIETFEVKDVKTLTGDHLSRAIGRIAGKDGKTKFAIENATRTRIVLADSKIHILGGFTHIRMARESVVSLILGSPPGKVYGNLRTVASRLKERY

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	18S rRNA (guanine(1575)-N(7))-methyltransferase
分子量 formula_weight	30788.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.309
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	CB

MSRPEELAPPEIFYNDSEAHKYTGSTRVQHIQAKMTLRALELLNLQPCSFILDIGCGSGLSGEILTQEGDHVWCGLDISPSMLATGLSRELEGDLMLQDMGTGIPFRAGSFDAAISISAIQWLCNADTSYNDPKQRLMRFFNTLYAALKKGGKFVAQFYPKNDDQVDDILQSAKVAGFSGGLVVDDPESKKNKKYYLVLSSGAPPQGEEQVNLDGVTMDEENVNLKKQLRQRLKGGKDKESAKSFILRKKELMKRRGRKVAKDSKFTGRKRRHRF

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	57203

Cryo-EM structure of a yeast pre-40S ribosomal subunit - State Tsr1-1 (with Rps2)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

40S ribosomal protein S1-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S4-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S6-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S7-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S8-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S9-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S11-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S13

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S14-A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体