SAXSdb — 7yi8

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MTA9

Tetrahymena thermophila SB210

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） P1 × 1 （Q22VV9） Transmembrane protein, putative × 1 （I7M8B9） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I7MIF9_TETTS
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–432； UniProt 1–432

MT-a70 family protein

Tetrahymena thermophila SB210

UniProt Q22GC0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	MTA9 × 1 （I7MIF9） P1 × 1 （Q22VV9） Transmembrane protein, putative × 1 （I7M8B9） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q22GC0_TETTS
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–372； UniProt 57–428

P1

Tetrahymena thermophila SB210

UniProt Q22VV9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	MTA9 × 1 （I7MIF9） MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） Transmembrane protein, putative × 1 （I7M8B9） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q22VV9_TETTS
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–360； UniProt 1–360

Transmembrane protein, putative

Tetrahymena thermophila SB210

UniProt I7M8B9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	MTA9 × 1 （I7MIF9） MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） P1 × 1 （Q22VV9） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I7M8B9_TETTS
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 30–171； UniProt 154–295

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7yi8
沉积日期 deposition_date	2022-07-15
结构标题 title	Cryo-EM structure of SAH-bound MTA1-MTA9-p1-p2 complex
关键词 keywords	N6-adenine methylation, MTAc holoenzyme, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7yi8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7yi8__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7yi8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.47 Å
Rg（电子密度）	32.36 Å
总 Rg	32.85 Å
原子数	5225
残基数	634
排除体积	93666 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7yi8__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MTA9
分子量 formula_weight	52026.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5225

MAPKKQEQEPIRLSTRTASKKVDYLQLSNGKLEDFFDDLEEDNKPARNRSRSKKRGRKPLKKADSRSKTPSRVSNARGRSKSLGPRKTYPRKKNLSPDNQLSLLLKWRNDKIPLKSASETDNKCKVVNVKNIFKSDLSKYGANLQALFINALWKVKSRKEKEGLNINDLSNLKIPLSLMKNGILFIWSEKEILGQIVEIMEQKGFTYIENFSIMFLGLNKCLQSINHKDEDSQNSTASTNNTNNEAITSDLTLKDTSKFSDQIQDNHSEDSDQARKQQTPDDITQKKNKLLKKSSVPSIQKLFEEDPVQTPSVNKPIEKSIEQVTQEKKFVMNNLDILKSTDINNLFLRNNYPYFKKTRHTLLMFRRIGDKNQKLELRHQRTSDVVFEVTDEQDPSKVDTMMKEYVYQMIETLLPKAQFIPGVDKHLKMMELFASTDNYRPGWISVIEK

来源 Source

来源生物 organism	Tetrahymena thermophila SB210
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	312017
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	MT-a70 family protein
分子量 formula_weight	42696.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSKAVNKKGLRPRKSDSILDHIKNKLDQEFLEDNENGEQSDEDYDQKSLNKAKKPYKKRQTQNGSELVISQQKTKAKASANNKKSAKNSQKLDEEEKIVEEEDLSPQKNGAVSEDDQQQEASTQEDDYLDRLPKSKKGLQGLLQDIEKRILHYKQLFFKEQNEIANGKRSMVPDNSIPICSDVTKLNFQALIDAQMRHAGKMFDVIMMDPPWQLSSSQPSRGVAIAYDSLSDEKIQNMPIQSLQQDGFIFVWAINAKYRVTIKMIENWGYKLVDEITWVKKTVNGKIAKGHGFYLQHAKESCLIGVKGDVDNGRFKKNIASDVIFSERRGQSQKPEEIYQYINQLCPNGNYLEIFARRNNLHDNWVSIGNEL

来源 Source

来源生物 organism	Tetrahymena thermophila SB210
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	312017
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	P1
分子量 formula_weight	41602.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSLKKGKFQHNQSKSLWNYTLSPGWREEEVKILKSALQLFGIGKWKKIMESGCLPGKSIGQIYMQTQRLLGQQSLGDFMGLQIDLEAVFNQNMKKQDVLRKNNCIINTGDNPTKEERKRRIEQNRKIYGLSAKQIAEIKLPKVKKHAPQYMTLEDIENEKFTNLEILTHLYNLKAEIVRRLAEQGETIAQPSIIKSLNNLNHNLEQNQNSNSSTETKVTLEQSGKKKYKVLAIEETELQNGPIATNSQKKSINGKRKNNRKINSDSEGNEEDISLEDIDSQESEINSEEIVEDDEEDEQIEEPSKIKKRKKNPEQESEEDDIEEDQEEDELVVNEEEIFEDDDDDEDNQDSSEDDDDDED

来源 Source

来源生物 organism	Tetrahymena thermophila SB210
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	312017
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Transmembrane protein, putative
分子量 formula_weight	19886.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MKHHHHHHHGAAGTSLYKKAGENLYFQGSMKKNGKSQNQPLDFTQYAKNMRKDLSNQDICLEDGALNHSYFLTKKGQYWTPLNQKALQRGIELFGVGNWKEINYDEFSGKANIVELELRTCMILGINDITEYYGKKISEEEQEEIKKSNIAKGKKENKLKDNIYQKLQQMQ

来源 Source

来源生物 organism	Tetrahymena thermophila SB210
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	312017
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
分子量 formula_weight	384.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	614753

Cryo-EM structure of SAH-bound MTA1-MTA9-p1-p2 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MTA9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

MT-a70 family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

P1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transmembrane protein, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7yi8__assembly_1__model_1

7yi8__assembly_1__model_1 | I(q)

7yi8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of SAH-bound MTA1-MTA9-p1-p2 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MTA9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

MT-a70 family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

P1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transmembrane protein, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7yi8__assembly_1__model_1

7yi8__assembly_1__model_1 | I(q)

7yi8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)