SAXSdb — 7z36

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	SMARCAD1 CUE1 domain × 2 Zinc finger protein 93 × 1 （P35789） ZINC ION × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ENLYS_BPT4
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 26–185； UniProt 2–161 作者链 B； PDB构建体 26–185； UniProt 2–161

Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta

Homo sapiens

UniProt Q13263

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	SMARCAD1 CUE1 domain × 2 Zinc finger protein 93 × 1 （P35789） ZINC ION × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIF1B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 187–271； UniProt 56–140 作者链 B； PDB构建体 187–271； UniProt 56–140

Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta

Homo sapiens

UniProt Q13263-2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	SMARCAD1 CUE1 domain × 2 Zinc finger protein 93 × 1 （P35789） ZINC ION × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIF1B-2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 272–482； UniProt 121–331 作者链 B； PDB构建体 272–482； UniProt 121–331

Zinc finger protein 93

Homo sapiens

UniProt P35789

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta × 2 （P00720,Q13263,Q13263-2） SMARCAD1 CUE1 domain × 2 ZINC ION × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ZNF93_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–70； UniProt 2–71

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7z36
沉积日期 deposition_date	2022-03-01
结构标题 title	Crystal structure of the KAP1 tripartite motif in complex with the ZNF93 KRAB domain
关键词 keywords	Transcription factor, TRIM family, KRAB domain, CRISPRi, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7z36__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7z36__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7z36__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	53.24 Å
Rg（电子密度）	53.57 Å
总 Rg	53.77 Å
原子数	15589
残基数	1014
排除体积	140200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7z36__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta
分子量 formula_weight	54755.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.17,2.3.2.27,2.3.2.27
突变 mutation	KAP1 B-box 1 domain (residues 141-202) deleted
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	15589

MGSSHHHHHHSQDPNSSSENLYFQGNIFEMLRIDERLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSIWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAAEALELLEHCGVCRERLRPEREPRLLPCLHSACSACLGPAAPAAANSSGDGGAAGDGTVVDCPVCKQQCFSKDIVENYFMRDSGSGERTVYCNVHKHEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDKHATLQKSTKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAILQIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQERLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEPHGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAERP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	SMARCAD1 CUE1 domain
分子量 formula_weight	8189.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,S

MGSSHHHHHHSQDPNSSSENLYFQGLSELEDLKDAKLQTLKELFPQRSDNDLLKLIESTSTMDGAIAAALLMF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Zinc finger protein 93
分子量 formula_weight	8194.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYSNLVFLGIVVSKPDLIAHLEQGKKPLTMKRHEMV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	7z36B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	530 — Lysozyme
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

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晶胞边长 a length_a	190.283 Å
晶胞边长 b length_b	68.583 Å
晶胞边长 c length_c	149.111 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	114.05 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	63.790 Å
R 因子 r_factor	0.2291
R_work r_work	0.2267
R_free r_free	0.2740

Crystal structure of the KAP1 tripartite motif in complex with the ZNF93 KRAB domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Zinc finger protein 93

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7z36__assembly_1__model_1

7z36__assembly_1__model_1 | I(q)

7z36__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the KAP1 tripartite motif in complex with the ZNF93 KRAB domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Endolysin,Transcription intermediary factor 1-beta,Isoform 2 of Transcription intermediary factor 1-beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Zinc finger protein 93

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7z36__assembly_1__model_1

7z36__assembly_1__model_1 | I(q)

7z36__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)