SAXSdb — 8a7h

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative Sensory box protein,Sensor protein FixL

Bradyrhizobium diazoefficiens (strain JCM 10833 / BCRC 13528 / IAM 13628 / NBRC 14792 / USDA 110)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 Flavin mononucleotide (semi-quinone intermediate) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FIXL_BRADU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 141–388； UniProt 258–505 作者链 B； PDB构建体 141–388； UniProt 258–505

Putative Sensory box protein,Sensor protein FixL

Bradyrhizobium diazoefficiens (strain JCM 10833 / BCRC 13528 / IAM 13628 / NBRC 14792 / USDA 110)

UniProt Q88JB0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 Flavin mononucleotide (semi-quinone intermediate) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q88JB0_PSEPK
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 21–140； UniProt 4–123 作者链 B； PDB构建体 21–140； UniProt 4–123

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8a7h
沉积日期 deposition_date	2022-06-21
结构标题 title	Crystal structure of a chimeric LOV-Histidine kinase SB2F1-I66R mutant (light state; asymmetrical variant, trigonal form with long c axis)
关键词 keywords	;LOV domain, PAS domain, Photocycle, Dimerization, Signaling blue light photoreceptor, sensory histidine kinase, chimeric, De Novo Protein, SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8a7h__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8a7h__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8a7h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	33.04 Å
Rg（电子密度）	33.15 Å
总 Rg	33.44 Å
原子数	5756
残基数	724
排除体积	100800 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8a7h__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Putative Sensory box protein,Sensor protein FixL
分子量 formula_weight	42944.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.13.3
突变 mutation	I66R
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5756

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMINAKLLQLMVEHSNDGIVVAEQEGNESILIYVNPAFERLTGYCADDILYQDCRFLQGEDHDQPGRAIIREAIREGRPCCQVLRNYRKDGSLFWNELSITPVHNEADQLTYYIGIQRDVTEHQQTQARLQELQSELVHVSRLSAMGEMASALAHELNQPLAAISNYMKGSRRLLAGSSDPNTPKVESALDRAAEQALRAGQIIRRLRDFVARGESEKRVESLSKLIEEAGALGLAGAREQNVQLRFSLDPGADLVLADRVQIQQVLVNLFRNALEAMAQSQRRELVVTNTPAADDMIEVEVSDTGSGFQDDVIPNLFQTFFTTKDTGMGVGLSISRSIIEAHGGRMWAESNASGGATFRFTLPAADEN

来源 Source

来源生物 organism	Bradyrhizobium diazoefficiens (strain JCM 10833 / BCRC 13528 / IAM 13628 / NBRC 14792 / USDA 110)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	224911
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	Flavin mononucleotide (semi-quinone intermediate)
分子量 formula_weight	458.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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晶胞边长 a length_a	139.420 Å
晶胞边长 b length_b	139.420 Å
晶胞边长 c length_c	89.881 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	trigonal

分辨率 resolution	3.145 Å
最低分辨率 resolution_low	45.640 Å
R 因子 r_factor	0.2574
R_work r_work	0.2533
R_free r_free	0.3056

Crystal structure of a chimeric LOV-Histidine kinase SB2F1-I66R mutant (light state; asymmetrical variant, trigonal form with long c axis)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative Sensory box protein,Sensor protein FixL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Putative Sensory box protein,Sensor protein FixL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8a7h__assembly_1__model_1

8a7h__assembly_1__model_1 | I(q)

8a7h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a chimeric LOV-Histidine kinase SB2F1-I66R mutant (light state; asymmetrical variant, trigonal form with long c axis)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative Sensory box protein,Sensor protein FixL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Putative Sensory box protein,Sensor protein FixL

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8a7h__assembly_1__model_1

8a7h__assembly_1__model_1 | I(q)

8a7h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)