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8c7y

Crystal structure of BRAF V600E in complex with a hybrid compound 6

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 90.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase B-raf

Homo sapiens

UniProt P15056

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 444–721 链 B； UniProt 444–721 未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 NO3 NITRATE ION × 1 TXV ~{N}-[3-[(5-chloranyl-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-3-(2-cyanopropan-2-yl)benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；13% PEG3350, 0.2M sodium nitrate, 5% ethylene glycol 分辨率 1.65 Å R-free 0.175

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8C7Y Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1UWH The complex of wild type B-RAF and BAY439006. 提交 2004-02-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 447–722（276 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 447-722
链 B 447–722（276 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 447-722
未记录 BAX 4-{4-[({[4-CHLORO-3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO}CARBONYL)AMINO]PHENOXY}-N-METHYLPYRIDINE-2-CARBOXAMIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.50
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
1UWJ The complex of mutant V599E B-RAF and BAY439006. 提交 2004-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 447–722（276 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 447-722
链 B 447–722（276 aa） 片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 447-722
突变：YES 突变：YES BAX 4-{4-[({[4-CHLORO-3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO}CARBONYL)AMINO]PHENOXY}-N-METHYLPYRIDINE-2-CARBOXAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.50
分辨率 3.50 Å R-free 0.357
2FB8 Structure of the B-Raf kinase domain bound to SB-590885 提交 2005-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–723（279 aa） 片段：B-Raf kinase domain, residues 445-723
未记录 215 (1Z)-5-(2-{4-[2-(DIMETHYLAMINO)ETHOXY]PHENYL}-5-PYRIDIN-4-YL-1H-IMIDAZOL-4-YL)INDAN-1-ONE OXIME × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；8% PEG 8000, 0.4 M LiCl, 0.1 M Tris, 0.02 M Bis-Tris Propane, 15% glycerol, 1 mM DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 18K, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.291
2FB8 Structure of the B-Raf kinase domain bound to SB-590885 提交 2005-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–723（279 aa） 片段：B-Raf kinase domain, residues 445-723
未记录 215 (1Z)-5-(2-{4-[2-(DIMETHYLAMINO)ETHOXY]PHENYL}-5-PYRIDIN-4-YL-1H-IMIDAZOL-4-YL)INDAN-1-ONE OXIME × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；8% PEG 8000, 0.4 M LiCl, 0.1 M Tris, 0.02 M Bis-Tris Propane, 15% glycerol, 1 mM DTT, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 18K, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.291
2L05 Solution NMR Structure of the Ras-binding domain of Serine/threonine-protein kinase B-raf from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR4694F 提交 2010-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 149–232（84 aa） 片段：RBD domain residues 149-232
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成 0.84 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HR4694F, 20 mM ammonium acetate, 100 mM sodium chloride-3, 5 mM calcium chloride, 10 mM DTT, 0.02 % sodium azide, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.69 mM [U-5% 13C; U-100% 15N] HR4694F, 20 mM ammonium acetate, 100 mM sodium chloride, 5 mM calcium chloride, 10 mM DTT, 0.02 % sodium azide, 50 uM DSS-14, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3C4C B-Raf Kinase in Complex with PLX4720 提交 2008-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 444–721（278 aa） 片段：KINASE DOMAIN
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；100mM BisTris at pH 6.0, 12.5% 2,5-hexanediol, and 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.57 Å R-free 0.303
3C4C B-Raf Kinase in Complex with PLX4720 提交 2008-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 444–721（278 aa） 片段：KINASE DOMAIN
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；100mM BisTris at pH 6.0, 12.5% 2,5-hexanediol, and 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.57 Å R-free 0.303
3D4Q Pyrazole-based inhibitors of B-Raf kinase 提交 2008-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 433–726（294 aa） 片段：Residues 432-726
未记录 SM5 (1E)-5-(1-piperidin-4-yl-3-pyridin-4-yl-1H-pyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-one oxime × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；285 K；5% PEG 3350 0.1M Tris 10% Tacsimate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
分辨率 2.80 Å R-free 0.250
3D4Q Pyrazole-based inhibitors of B-Raf kinase 提交 2008-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 433–726（294 aa） 片段：Residues 432-726
未记录 SM5 (1E)-5-(1-piperidin-4-yl-3-pyridin-4-yl-1H-pyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-one oxime × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；285 K；5% PEG 3350 0.1M Tris 10% Tacsimate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
分辨率 2.80 Å R-free 0.250
3IDP B-Raf V600E kinase domain in complex with an aminoisoquinoline inhibitor 提交 2009-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 434–727（294 aa） 片段：kinase domain
突变：V600E L1E N~1~-(4-chlorophenyl)-6-methyl-N~5~-[3-(7H-purin-6-yl)pyridin-2-yl]isoquinoline-1,5-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.6；298 K；17% PEG 8000, 75 mM sodium succinate, 0.1 M Tris, pH 8.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
3IDP B-Raf V600E kinase domain in complex with an aminoisoquinoline inhibitor 提交 2009-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 434–727（294 aa） 片段：kinase domain
突变：V600E L1E N~1~-(4-chlorophenyl)-6-methyl-N~5~-[3-(7H-purin-6-yl)pyridin-2-yl]isoquinoline-1,5-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.6；298 K；17% PEG 8000, 75 mM sodium succinate, 0.1 M Tris, pH 8.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
3II5 The Complex of wild-type B-RAF with Pyrazolo pyrimidine inhibitor 提交 2009-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 831 N-[3-(3-{4-[(dimethylamino)methyl]phenyl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl)phenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.0, 18% PEG8k,100mM KH2PO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.79 Å R-free 0.251
3II5 The Complex of wild-type B-RAF with Pyrazolo pyrimidine inhibitor 提交 2009-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 831 N-[3-(3-{4-[(dimethylamino)methyl]phenyl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl)phenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.0, 18% PEG8k,100mM KH2PO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.79 Å R-free 0.251
3II5 The Complex of wild-type B-RAF with Pyrazolo pyrimidine inhibitor 提交 2009-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：UNP residues 432-726
链 B 432–726（295 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 831 N-[3-(3-{4-[(dimethylamino)methyl]phenyl}pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl)phenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.0, 18% PEG8k,100mM KH2PO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.79 Å R-free 0.251
3NY5 Crystal structure of the RBD domain of serine/threonine-protein kinase B-raf from Homo sapiens. Northeast Structural Genomics Consortium Target HR4694F 提交 2010-07-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 153–237（85 aa） 片段：RBD domain residues 153-237
链 B 153–237（85 aa） 片段：RBD domain residues 153-237
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch under Paraffin oil；pH 6.5；291 K；28% PEG 2000, 0.1M Bis-tris, pH 6.5, Microbatch under Paraffin oil, temperature 291K
分辨率 1.99 Å R-free 0.271
3NY5 Crystal structure of the RBD domain of serine/threonine-protein kinase B-raf from Homo sapiens. Northeast Structural Genomics Consortium Target HR4694F 提交 2010-07-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 153–237（85 aa） 片段：RBD domain residues 153-237
链 D 153–237（85 aa） 片段：RBD domain residues 153-237
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch under Paraffin oil；pH 6.5；291 K；28% PEG 2000, 0.1M Bis-tris, pH 6.5, Microbatch under Paraffin oil, temperature 291K
分辨率 1.99 Å R-free 0.271
3NY5 Crystal structure of the RBD domain of serine/threonine-protein kinase B-raf from Homo sapiens. Northeast Structural Genomics Consortium Target HR4694F 提交 2010-07-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 153–237（85 aa） 片段：RBD domain residues 153-237
链 D 153–237（85 aa） 片段：RBD domain residues 153-237
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Microbatch under Paraffin oil；pH 6.5；291 K；28% PEG 2000, 0.1M Bis-tris, pH 6.5, Microbatch under Paraffin oil, temperature 291K
分辨率 1.99 Å R-free 0.271
3PPJ Human B-Raf Kinase in Complex with a Furopyridine Inhibitor 提交 2010-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 432-726
未记录 FOI methyl 3-{[(5S)-1-(hydroxyamino)-5H-inden-5-yl]amino}furo[2,3-c]pyridine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.70 Å R-free 0.272
3PPJ Human B-Raf Kinase in Complex with a Furopyridine Inhibitor 提交 2010-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 432-726
未记录 FOI methyl 3-{[(5S)-1-(hydroxyamino)-5H-inden-5-yl]amino}furo[2,3-c]pyridine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.70 Å R-free 0.272
3PPK Human B-Raf Kinase in Complex with a Non-Oxime Furopyridine Inhibitor 提交 2010-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 432-726
未记录 FNI 3-[(5-hydroxynaphthalen-2-yl)amino]-N-(pyrimidin-4-yl)furo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；PEG 3350, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
3PPK Human B-Raf Kinase in Complex with a Non-Oxime Furopyridine Inhibitor 提交 2010-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 432-726
未记录 FNI 3-[(5-hydroxynaphthalen-2-yl)amino]-N-(pyrimidin-4-yl)furo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；PEG 3350, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.280
3PRF Crystal Structure of Human B-Raf Kinase Domain in Complex with a Non-Oxime Furopyridine Inhibitor 提交 2010-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 432-726
未记录 FP3 2-chloro-5-{[2-(pyrimidin-2-yl)furo[2,3-c]pyridin-3-yl]amino}phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；PEG 3350, Tris buffer, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.310
3PRF Crystal Structure of Human B-Raf Kinase Domain in Complex with a Non-Oxime Furopyridine Inhibitor 提交 2010-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 432-726
未记录 FP3 2-chloro-5-{[2-(pyrimidin-2-yl)furo[2,3-c]pyridin-3-yl]amino}phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；PEG 3350, Tris buffer, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.310
3PRI Crystal Structure of Human B-Raf Kinase in Complex with a Non-Oxime Furopyridine Inhibitor 提交 2010-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 432-726
未记录 FP4 3-(4-{[2-(pyrimidin-2-yl)furo[2,3-c]pyridin-3-yl]amino}-1H-indazol-3-yl)propan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 10% PEG 4000, 0.2 M NDSB-256, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.303
3PRI Crystal Structure of Human B-Raf Kinase in Complex with a Non-Oxime Furopyridine Inhibitor 提交 2010-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：Kinase domain, UNP residues 432-726
未记录 FP4 3-(4-{[2-(pyrimidin-2-yl)furo[2,3-c]pyridin-3-yl]amino}-1H-indazol-3-yl)propan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 10% PEG 4000, 0.2 M NDSB-256, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.303
3PSB Furo[2,3-c]pyridine-based Indanone Oximes as Potent and Selective B-Raf Inhibitors 提交 2010-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 433–726（294 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 SM6 ethyl 3-{[1-(hydroxyamino)-2H-inden-5-yl]amino}thieno[2,3-c]pyridine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；10% PEG 8K 100mM Hepes pH8.0 3% aminocaproic acid 10% glycerol 2.6mg/ml protein 500uM inhibitor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.268
3PSB Furo[2,3-c]pyridine-based Indanone Oximes as Potent and Selective B-Raf Inhibitors 提交 2010-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 433–726（294 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 SM6 ethyl 3-{[1-(hydroxyamino)-2H-inden-5-yl]amino}thieno[2,3-c]pyridine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；10% PEG 8K 100mM Hepes pH8.0 3% aminocaproic acid 10% glycerol 2.6mg/ml protein 500uM inhibitor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.268
3PSD Non-oxime pyrazole based inhibitors of B-Raf kinase 提交 2010-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 433–726（294 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 SM7 6-[1-(piperidin-4-yl)-3-(pyridin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]indeno[1,2-c]pyrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；7.5% PEG 3350 100mM Tris pH8.0 10% Tacsimate 10% glycerol 1.6mg/ml protein 500uM inhibitor , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.335
3PSD Non-oxime pyrazole based inhibitors of B-Raf kinase 提交 2010-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 433–726（294 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 SM7 6-[1-(piperidin-4-yl)-3-(pyridin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]indeno[1,2-c]pyrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；7.5% PEG 3350 100mM Tris pH8.0 10% Tacsimate 10% glycerol 1.6mg/ml protein 500uM inhibitor , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.335
3Q4C Crystal Structure of Wild Type BRAF kinase domain in complex with organometallic inhibitor CNS292 提交 2010-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa）
未记录 RSW [(1,2,3,4,5,6-eta)-(1S,2R,3R,4R,5S,6S)-1-carboxycyclohexane-1,2,3,4,5,6-hexayl](chloro)(3-methyl-5,7-dioxo-6,7-dihydro-5H-pyrido[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazol-12-ide-kappa~2~N~1~,N~12~)ruthenium(1+) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；298 K；25mM magnesium acetate tetrahydrate, 100mM sodium cacodylate trihydrate, 20% PEG8K, pH 6.5, microbatch, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.280
3Q4C Crystal Structure of Wild Type BRAF kinase domain in complex with organometallic inhibitor CNS292 提交 2010-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；298 K；25mM magnesium acetate tetrahydrate, 100mM sodium cacodylate trihydrate, 20% PEG8K, pH 6.5, microbatch, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.280
3Q96 B-Raf kinase domain in complex with a tetrahydronaphthalene inhibitor 提交 2011-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 446–727（282 aa） 片段：residues 446-727
链 B 446–727（282 aa） 片段：residues 446-727
未记录 0NF (2S)-N-[3-(2-aminopropan-2-yl)-5-(trifluoromethyl)phenyl]-7-[(7-oxo-5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridin-4-yl)oxy]-1,2,3,4-tetrahydronaphthalene-2-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；14.025% PEG 8000, 0.8M NP Lithium Cl, 0.06M Tris base, 0.04M Tris Cl, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.288
3Q96 B-Raf kinase domain in complex with a tetrahydronaphthalene inhibitor 提交 2011-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 446–727（282 aa） 片段：residues 446-727
未记录 0NF (2S)-N-[3-(2-aminopropan-2-yl)-5-(trifluoromethyl)phenyl]-7-[(7-oxo-5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridin-4-yl)oxy]-1,2,3,4-tetrahydronaphthalene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；14.025% PEG 8000, 0.8M NP Lithium Cl, 0.06M Tris base, 0.04M Tris Cl, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.288
3Q96 B-Raf kinase domain in complex with a tetrahydronaphthalene inhibitor 提交 2011-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 446–727（282 aa） 片段：residues 446-727
未记录 0NF (2S)-N-[3-(2-aminopropan-2-yl)-5-(trifluoromethyl)phenyl]-7-[(7-oxo-5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridin-4-yl)oxy]-1,2,3,4-tetrahydronaphthalene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；14.025% PEG 8000, 0.8M NP Lithium Cl, 0.06M Tris base, 0.04M Tris Cl, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.288
3SKC Human B-Raf Kinase in Complex with an Amide Linked Pyrazolopyridine Inhibitor 提交 2011-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：Human B-raf Kinase UNP residues 432-726
未记录 BR2 2,6-difluoro-N-[(5S)-3-methoxy-5H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl]-3-[(phenylsulfonyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 10000, 100 mM Tris pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.271
3SKC Human B-Raf Kinase in Complex with an Amide Linked Pyrazolopyridine Inhibitor 提交 2011-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：Human B-raf Kinase UNP residues 432-726
未记录 BR2 2,6-difluoro-N-[(5S)-3-methoxy-5H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl]-3-[(phenylsulfonyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 10000, 100 mM Tris pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.271
3TV4 Human B-Raf Kinase Domain in Complex with an Bromopyridine Benzamide Inhibitor 提交 2011-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 TV4 N-(6-amino-5-bromopyridin-3-yl)-2,6-difluoro-3-[(propylsulfonyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 8000, Tris pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.307
3TV4 Human B-Raf Kinase Domain in Complex with an Bromopyridine Benzamide Inhibitor 提交 2011-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 TV4 N-(6-amino-5-bromopyridin-3-yl)-2,6-difluoro-3-[(propylsulfonyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 8000, Tris pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.307
3TV6 Human B-Raf Kinase Domain in Complex with a Methoxypyrazolopyridinyl Benzamide Inhibitor 提交 2011-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 B0R 2,6-difluoro-N-(3-methoxy-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)-3-[(propylsulfonyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 8000, Tris pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.288
3TV6 Human B-Raf Kinase Domain in Complex with a Methoxypyrazolopyridinyl Benzamide Inhibitor 提交 2011-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：UNP residues 432-726
未记录 B0R 2,6-difluoro-N-(3-methoxy-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)-3-[(propylsulfonyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 8000, Tris pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.288
4DBN Crystal Structure of the Kinase domain of Human B-raf with a [1,3]thiazolo[5,4-b]pyridine derivative 提交 2012-01-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–726（282 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 445-726)
链 B 445–726（282 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 445-726)
未记录 0JA 2-chloro-3-(1-cyanocyclopropyl)-N-[5-({2-[(cyclopropylcarbonyl)amino][1,3]thiazolo[5,4-b]pyridin-5-yl}oxy)-2-fluorophenyl]benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293 K；9.6% PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.15 Å R-free 0.243
4DBN Crystal Structure of the Kinase domain of Human B-raf with a [1,3]thiazolo[5,4-b]pyridine derivative 提交 2012-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–726（282 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 445-726)
未记录 0JA 2-chloro-3-(1-cyanocyclopropyl)-N-[5-({2-[(cyclopropylcarbonyl)amino][1,3]thiazolo[5,4-b]pyridin-5-yl}oxy)-2-fluorophenyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293 K；9.6% PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.15 Å R-free 0.243
4DBN Crystal Structure of the Kinase domain of Human B-raf with a [1,3]thiazolo[5,4-b]pyridine derivative 提交 2012-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–726（282 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 445-726)
未记录 0JA 2-chloro-3-(1-cyanocyclopropyl)-N-[5-({2-[(cyclopropylcarbonyl)amino][1,3]thiazolo[5,4-b]pyridin-5-yl}oxy)-2-fluorophenyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；293 K；9.6% PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.15 Å R-free 0.243
4E26 BRAF in complex with an organic inhibitor 7898734 提交 2012-03-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：UNP RESIDUES 432-768
链 B 432–726（295 aa） 片段：UNP RESIDUES 432-768
未记录 734 5-chloro-7-[(R)-furan-2-yl(pyridin-2-ylamino)methyl]quinolin-8-ol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；298 K；200 MM Magnesium acetate tetrahydrate, 100 mm sodium cacodylate trihydrate (pH 6.5), and 20% polyethylene glycol 8000, MICROBATCH, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.262
4E26 BRAF in complex with an organic inhibitor 7898734 提交 2012-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：UNP RESIDUES 432-768
未记录 734 5-chloro-7-[(R)-furan-2-yl(pyridin-2-ylamino)methyl]quinolin-8-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；298 K；200 MM Magnesium acetate tetrahydrate, 100 mm sodium cacodylate trihydrate (pH 6.5), and 20% polyethylene glycol 8000, MICROBATCH, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.262
4E26 BRAF in complex with an organic inhibitor 7898734 提交 2012-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：UNP RESIDUES 432-768
未记录 734 5-chloro-7-[(R)-furan-2-yl(pyridin-2-ylamino)methyl]quinolin-8-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；298 K；200 MM Magnesium acetate tetrahydrate, 100 mm sodium cacodylate trihydrate (pH 6.5), and 20% polyethylene glycol 8000, MICROBATCH, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.262
4E4X Crystal Structure of B-Raf Kinase Domain in Complex with a Dihydropyrido[2,3-d]pyrimidinone-based Inhibitor 提交 2012-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：B-Raf (432-726)
未记录 T1Q N-(2,4-difluoro-3-{2-[(3-hydroxypropyl)amino]-8-methyl-7-oxo-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl}phenyl)propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 8000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.315
4E4X Crystal Structure of B-Raf Kinase Domain in Complex with a Dihydropyrido[2,3-d]pyrimidinone-based Inhibitor 提交 2012-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：B-Raf (432-726)
未记录 T1Q N-(2,4-difluoro-3-{2-[(3-hydroxypropyl)amino]-8-methyl-7-oxo-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl}phenyl)propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 8000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.315
4EHE B-Raf Kinase Domain in Complex with an Aminothienopyrimidine-based Inhibitor 提交 2012-04-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：Kinase Domain
链 B 432–726（295 aa） 片段：Kinase Domain
未记录 RI8 4-amino-N-{2,6-difluoro-3-[(propylsulfonyl)amino]phenyl}thieno[3,2-d]pyrimidine-7-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 8000, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.296
4EHG B-Raf Kinase Domain in Complex with an Aminopyridimine-based Inhibitor 提交 2012-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：kinase domain
链 B 432–726（295 aa） 片段：kinase domain
突变：V600E 突变：V600E RI9 N-{2,4-difluoro-3-[({6-[(2-hydroxyethyl)amino]pyrimidin-4-yl}carbamoyl)amino]phenyl}propane-1-sulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；12% PEG 8000, 400 mM Ammonium sulfate, 100 mM MES/Malic Acid/ Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.270
4FC0 Crystal Structure of Human Kinase Domain of B-raf with a DFG-out Inhibitor 提交 2012-05-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–726（282 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 445-726)
链 B 445–726（282 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 445-726)
未记录 0T2 2-chloro-3-[(2-cyanopropan-2-yl)oxy]-N-{5-[{2-[(cyclopropylcarbonyl)amino][1,3]thiazolo[5,4-b]pyridin-5-yl}(methyl)amino]-2-fluorophenyl}benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；7.8% PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.95 Å R-free 0.243
4FK3 B-Raf Kinase V600E Oncogenic Mutant in Complex with PLX3203 提交 2012-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 443–722（280 aa）
链 B 443–722（280 aa）
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, V600E, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, V600E, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 325 N-{2,4-difluoro-3-[(5-pyridin-3-yl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]phenyl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；277 K；100MM BISTRIS AT PH 6.0, 12.5% 2,5-HEXANEDIOL, AND 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.315
4FK3 B-Raf Kinase V600E Oncogenic Mutant in Complex with PLX3203 提交 2012-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 443–722（280 aa）
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, V600E, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 325 N-{2,4-difluoro-3-[(5-pyridin-3-yl-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]phenyl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；277 K；100MM BISTRIS AT PH 6.0, 12.5% 2,5-HEXANEDIOL, AND 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.315
4FK3 B-Raf Kinase V600E Oncogenic Mutant in Complex with PLX3203 提交 2012-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 443–722（280 aa）
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, V600E, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；277 K；100MM BISTRIS AT PH 6.0, 12.5% 2,5-HEXANEDIOL, AND 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.65 Å R-free 0.315
4G9C Human B-Raf Kinase Domain bound to a Type II Pyrazolopyridine Inhibitor 提交 2012-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 432-726)
未记录 0WP 3-{[3-(2-cyanopropan-2-yl)benzoyl]amino}-2,6-difluoro-N-(3-methoxy-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；100 mM Tris pH 9.0, PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.291
4G9C Human B-Raf Kinase Domain bound to a Type II Pyrazolopyridine Inhibitor 提交 2012-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 432-726)
未记录 0WP 3-{[3-(2-cyanopropan-2-yl)benzoyl]amino}-2,6-difluoro-N-(3-methoxy-2H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-5-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；100 mM Tris pH 9.0, PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.50 Å R-free 0.291
4G9R B-Raf V600E Kinase Domain Bound to a Type II Dihydroquinazoline Inhibitor 提交 2012-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 432-726)
突变：V600E B1E 3-(2-cyanopropan-2-yl)-N-{4-methyl-3-[(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 16% PEG 8000, 100 mM NDSB-256, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.277
4G9R B-Raf V600E Kinase Domain Bound to a Type II Dihydroquinazoline Inhibitor 提交 2012-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：Kinase Domain (UNP residues 432-726)
突变：V600E B1E 3-(2-cyanopropan-2-yl)-N-{4-methyl-3-[(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 16% PEG 8000, 100 mM NDSB-256, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.277
4H58 BRAF in complex with compound 3 提交 2012-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 448–722（275 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 448-722)
未记录 10Z N-(4-{[(2-methoxyethyl)amino]methyl}phenyl)-6-(pyridin-4-yl)quinazolin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；salt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.272
4H58 BRAF in complex with compound 3 提交 2012-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 448–722（275 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 448-722)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；salt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.272
4H58 BRAF in complex with compound 3 提交 2012-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 448–722（275 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 448-722)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；salt, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.272
4JVG B-Raf Kinase in Complex with Birb796 提交 2013-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 444–723（280 aa） 片段：Kinase Domain
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G B96 1-(5-TERT-BUTYL-2-P-TOLYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-[4-(2-MORPHOLIN-4-YL-ETHOXY)-NAPHTHALEN-1-YL]-UREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1M BisTris propane, 30% PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.09 Å R-free 0.295
4JVG B-Raf Kinase in Complex with Birb796 提交 2013-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 444–723（280 aa） 片段：Kinase Domain
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G B96 1-(5-TERT-BUTYL-2-P-TOLYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-[4-(2-MORPHOLIN-4-YL-ETHOXY)-NAPHTHALEN-1-YL]-UREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1M BisTris propane, 30% PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.09 Å R-free 0.295
4JVG B-Raf Kinase in Complex with Birb796 提交 2013-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 444–723（280 aa） 片段：Kinase Domain
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G B96 1-(5-TERT-BUTYL-2-P-TOLYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-[4-(2-MORPHOLIN-4-YL-ETHOXY)-NAPHTHALEN-1-YL]-UREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1M BisTris propane, 30% PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.09 Å R-free 0.295
4JVG B-Raf Kinase in Complex with Birb796 提交 2013-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 444–723（280 aa） 片段：Kinase Domain
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G B96 1-(5-TERT-BUTYL-2-P-TOLYL-2H-PYRAZOL-3-YL)-3-[4-(2-MORPHOLIN-4-YL-ETHOXY)-NAPHTHALEN-1-YL]-UREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1M BisTris propane, 30% PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.09 Å R-free 0.295
4KSP Crystal Structure of Human B-raf bound to a DFG-out Inhibitor TAK-632 提交 2013-05-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–726（282 aa） 片段：UNP residues 445-726
链 B 445–726（282 aa） 片段：UNP residues 445-726
未记录 1SU N-{7-cyano-6-[4-fluoro-3-({[3-(trifluoromethyl)phenyl]acetyl}amino)phenoxy]-1,3-benzothiazol-2-yl}cyclopropanecarboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop, vapor diffusion；pH 8.3；277 K；9.6 % PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris pH 8.3, sitting drop, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.93 Å R-free 0.242
4KSP Crystal Structure of Human B-raf bound to a DFG-out Inhibitor TAK-632 提交 2013-05-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–726（282 aa） 片段：UNP residues 445-726
未记录 1SU N-{7-cyano-6-[4-fluoro-3-({[3-(trifluoromethyl)phenyl]acetyl}amino)phenoxy]-1,3-benzothiazol-2-yl}cyclopropanecarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop, vapor diffusion；pH 8.3；277 K；9.6 % PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris pH 8.3, sitting drop, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.93 Å R-free 0.242
4KSP Crystal Structure of Human B-raf bound to a DFG-out Inhibitor TAK-632 提交 2013-05-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–726（282 aa） 片段：UNP residues 445-726
未记录 1SU N-{7-cyano-6-[4-fluoro-3-({[3-(trifluoromethyl)phenyl]acetyl}amino)phenoxy]-1,3-benzothiazol-2-yl}cyclopropanecarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop, vapor diffusion；pH 8.3；277 K；9.6 % PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris pH 8.3, sitting drop, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.93 Å R-free 0.242
4KSQ Crystal Structure of Human B-raf bound to a DFG-out Inhibitor 5B 提交 2013-05-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–726（282 aa） 片段：UNP residues 445-726
链 B 445–726（282 aa） 片段：UNP residues 445-726
未记录 1SW N-{7-cyano-6-[4-fluoro-3-({[3-(trifluoromethyl)phenyl]carbamoyl}amino)phenoxy]-1,3-benzothiazol-2-yl}cyclopropanecarboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop, vapor diffusion；pH 8.3；277 K；7.8% PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris pH 8.3, sitting drop, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.256
4KSQ Crystal Structure of Human B-raf bound to a DFG-out Inhibitor 5B 提交 2013-05-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–726（282 aa） 片段：UNP residues 445-726
未记录 1SW N-{7-cyano-6-[4-fluoro-3-({[3-(trifluoromethyl)phenyl]carbamoyl}amino)phenoxy]-1,3-benzothiazol-2-yl}cyclopropanecarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop, vapor diffusion；pH 8.3；277 K；7.8% PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris pH 8.3, sitting drop, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.256
4KSQ Crystal Structure of Human B-raf bound to a DFG-out Inhibitor 5B 提交 2013-05-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–726（282 aa） 片段：UNP residues 445-726
未记录 1SW N-{7-cyano-6-[4-fluoro-3-({[3-(trifluoromethyl)phenyl]carbamoyl}amino)phenoxy]-1,3-benzothiazol-2-yl}cyclopropanecarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop, vapor diffusion；pH 8.3；277 K；7.8% PEG 8000, 0.8M LiCl, 100 mM Tris pH 8.3, sitting drop, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.256
4MBJ Human B-Raf Kinase Domain in Complex with an Imidazopyridine-based Inhibitor 提交 2013-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 432–723（292 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 432-723)
链 B 432–723（292 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 432-723)
未记录 DFS 2,6-difluoro-N-(1H-imidazo[4,5-b]pyridin-6-yl)-3-[(propylsulfonyl)amino]benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.328
4MNE Crystal structure of the BRAF:MEK1 complex 提交 2013-09-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 432–726（295 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 432-726)
链 C 432–726（295 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 432-726)
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 573 7-fluoro-3-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-{[(2S)-2-hydroxypropyl]oxy}furo[3,2-c]pyridine-2-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；20% PEG8000, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.85 Å R-free 0.240
4MNE Crystal structure of the BRAF:MEK1 complex 提交 2013-09-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 432–726（295 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 432-726)
链 G 432–726（295 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 432-726)
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 573 7-fluoro-3-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-{[(2S)-2-hydroxypropyl]oxy}furo[3,2-c]pyridine-2-carboxamide × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；20% PEG8000, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.85 Å R-free 0.240
4MNF Crystal structure of BRAF-V600E bound to GDC0879 提交 2013-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 432–736（305 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 432-736)
链 B 432–736（305 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 432-736)
突变：V600E 突变：V600E 29L 2-{4-[(1E)-1-(hydroxyimino)-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]-3-(pyridin-4-yl)-1H-pyrazol-1-yl}ethanol × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；10% PEG8000, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.5 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.80 Å R-free 0.275
4PP7 Highly Potent and Selective 3-N-methylquinazoline-4(3H)-one Based Inhibitors of B-RafV600E Kinase 提交 2014-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 432-726)
未记录 2VX N-{2,4-difluoro-3-[methyl(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；100 mM Tris, pH 9.0, 8% PEG6000, glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
4PP7 Highly Potent and Selective 3-N-methylquinazoline-4(3H)-one Based Inhibitors of B-RafV600E Kinase 提交 2014-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 432-726)
未记录 2VX N-{2,4-difluoro-3-[methyl(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；100 mM Tris, pH 9.0, 8% PEG6000, glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
4R5Y The complex structure of Braf V600E kinase domain with a novel Braf inhibitor 提交 2014-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 444–723（280 aa） 片段：BRAF kinase domain (UNP residues 444-723)
突变：V600E, I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 3K3 5-({(1R,1aS,6bR)-1-[5-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1a,6b-dihydro-1H-cyclopropa[b][1]benzofuran-5-yl}oxy)-3,4-dihydro-1,8-naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 23% PEG3350, 0.2 M magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
4R5Y The complex structure of Braf V600E kinase domain with a novel Braf inhibitor 提交 2014-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 444–723（280 aa） 片段：BRAF kinase domain (UNP residues 444-723)
突变：V600E, I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 3K3 5-({(1R,1aS,6bR)-1-[5-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1a,6b-dihydro-1H-cyclopropa[b][1]benzofuran-5-yl}oxy)-3,4-dihydro-1,8-naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 23% PEG3350, 0.2 M magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
4RZV Crystal structure of the BRAF (R509H) kinase domain monomer bound to Vemurafenib 提交 2014-12-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 443–723（281 aa） 片段：Protein kinase domain residues 443-723
突变：R509H, I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 032 N-(3-{[5-(4-chlorophenyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl]carbonyl}-2,4-difluorophenyl)propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Tris pH 7.0, 18% (w/v) PEG2000 MME , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.99 Å R-free 0.267
4RZV Crystal structure of the BRAF (R509H) kinase domain monomer bound to Vemurafenib 提交 2014-12-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 443–723（281 aa） 片段：Protein kinase domain residues 443-723
突变：R509H, I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 032 N-(3-{[5-(4-chlorophenyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl]carbonyl}-2,4-difluorophenyl)propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Tris pH 7.0, 18% (w/v) PEG2000 MME , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.99 Å R-free 0.267
4RZW Crystal structure of BRAF (R509H) kinase domain bound to AZ628 提交 2014-12-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 443–723（281 aa） 片段：Protein kinase domain residues 443-723
链 B 443–723（281 aa） 片段：Protein kinase domain residues 443-723
突变：R509H, I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 突变：R509H, I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G B1E 3-(2-cyanopropan-2-yl)-N-{4-methyl-3-[(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M Mg(NO3)2, 18% (w/v) PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.49 Å R-free 0.280
4RZW Crystal structure of BRAF (R509H) kinase domain bound to AZ628 提交 2014-12-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 443–723（281 aa） 片段：Protein kinase domain residues 443-723
突变：R509H, I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G B1E 3-(2-cyanopropan-2-yl)-N-{4-methyl-3-[(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M Mg(NO3)2, 18% (w/v) PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.49 Å R-free 0.280
4RZW Crystal structure of BRAF (R509H) kinase domain bound to AZ628 提交 2014-12-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 443–723（281 aa） 片段：Protein kinase domain residues 443-723
突变：R509H, I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G B1E 3-(2-cyanopropan-2-yl)-N-{4-methyl-3-[(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M Mg(NO3)2, 18% (w/v) PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.49 Å R-free 0.280
4WO5 Crystal structure of a BRAF kinase domain monomer 提交 2014-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 444–723（280 aa） 片段：UNP residues 444-723
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M Tris, 0.2 M trimethylamine-N-oxide, 20% (w/v) PEG-MME 2,000
分辨率 2.83 Å R-free 0.260
4WO5 Crystal structure of a BRAF kinase domain monomer 提交 2014-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 444–723（280 aa） 片段：UNP residues 444-723
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M Tris, 0.2 M trimethylamine-N-oxide, 20% (w/v) PEG-MME 2,000
分辨率 2.83 Å R-free 0.260
4XV1 B-Raf Kinase V600E oncogenic mutant in complex with PLX7904 提交 2015-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 444–705（262 aa） 片段：UNP RESIDUES 444-705
链 B 444–705（262 aa） 片段：UNP RESIDUES 444-705
突变：S446A,S447A,I543A,I544S,I551K,Q562R,L588N,V600E,K630S,F667E,Y673S,A688R 突变：S446A,S447A,I543A,I544S,I551K,Q562R,L588N,V600E,K630S,F667E,Y673S,A688R 904 N'-(3-{[5-(2-cyclopropylpyrimidin-5-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl]carbonyl}-2,4-difluorophenyl)-N-ethyl-N-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；100MM BISTRIS AT PH 6.0, 12.5% 2,5- HEXANEDIOL, 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
分辨率 2.47 Å R-free 0.273
4XV2 B-Raf Kinase V600E oncogenic mutant in complex with Dabrafenib 提交 2015-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 444–705（262 aa） 片段：UNP RESIDUES 444-705
链 B 444–705（262 aa） 片段：UNP RESIDUES 444-705
突变：S446A,S447A,I543A,I544S,I551K,Q562R,L588N,V600E,K630S,F667E,Y673S,A688R 突变：S446A,S447A,I543A,I544S,I551K,Q562R,L588N,V600E,K630S,F667E,Y673S,A688R P06 Dabrafenib × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M BISTRIS AT PH 6.0, 12.5% 2,5- HEXABEDIOL, 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.244
4XV3 B-Raf Kinase V600E oncogenic mutant in complex with PLX7922 提交 2015-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 444–705（262 aa） 片段：UNP RESIDUES 444-705
链 B 444–705（262 aa） 片段：UNP RESIDUES 444-705
突变：S446A,S447A,I543A,I544S,I551K,Q562R,L588N,V600E,K630S,F667E,Y673S,A688R 突变：S446A,S447A,I543A,I544S,I551K,Q562R,L588N,V600E,K630S,F667E,Y673S,A688R P02 N'-{3-[5-(2-aminopyrimidin-4-yl)-2-tert-butyl-1,3-thiazol-4-yl]-2-fluorophenyl}-N-ethyl-N-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M BISTRIS AT PH 6.0, 12.5% 2,5- HEXABEDIOL, 12% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.296
4XV9 B-Raf Kinase domain in complex with PLX5568 提交 2015-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 442–705（264 aa） 片段：UNP RESIDUES 444-705
突变：I543A,I544S,I551K,Q562R,L588N,K630S,F667E,Y673S,A688R 1OO N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}-4-(trifluoromethyl)benzenesulfonamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M MES AT PH6.0, 35% (V/V) 2-METHYL- 2,4-PENTANEDIOL 0.2M LI2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
4YHT bRaf complexed with an inhibitor 提交 2015-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 449–720（272 aa） 片段：UNP residues 449-720
突变：I542T, I543N, I550T, L705T, L715T GOL GLYCEROL × 1 4EF 3-[(5-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-N-methyl-4-(morpholin-4-yl)benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris pH 8.0, 650 mM NaCl, 3-6 % PEG 8000
分辨率 3.05 Å R-free 0.233
4YHT bRaf complexed with an inhibitor 提交 2015-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 449–720（272 aa） 片段：UNP residues 449-720
突变：I542T, I543N, I550T, L705T, L715T GOL GLYCEROL × 1 4EF 3-[(5-chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-N-methyl-4-(morpholin-4-yl)benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris pH 8.0, 650 mM NaCl, 3-6 % PEG 8000
分辨率 3.05 Å R-free 0.233
5C9C CRYSTAL STRUCTURE OF BRAF(V600E) IN COMPLEX WITH LY3009120 COMPND 提交 2015-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：unp residues 432-726
突变：V600E 4Z5 1-(3,3-dimethylbutyl)-3-{2-fluoro-4-methyl-5-[7-methyl-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl]phenyl}urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；26% PEG 3350, 50 MM AMMONIUM CITRATE, 50 MM SODIUM FLORIDE, 2 MG/ML PROTEIN, 5-FOLD MOLAR EXCESS DP4978; CRYSTAL ID 215552F10, SITTING DROP VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 289K
分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5C9C CRYSTAL STRUCTURE OF BRAF(V600E) IN COMPLEX WITH LY3009120 COMPND 提交 2015-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa） 片段：unp residues 432-726
突变：V600E 4Z5 1-(3,3-dimethylbutyl)-3-{2-fluoro-4-methyl-5-[7-methyl-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl]phenyl}urea × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；26% PEG 3350, 50 MM AMMONIUM CITRATE, 50 MM SODIUM FLORIDE, 2 MG/ML PROTEIN, 5-FOLD MOLAR EXCESS DP4978; CRYSTAL ID 215552F10, SITTING DROP VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 289K
分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5C9C CRYSTAL STRUCTURE OF BRAF(V600E) IN COMPLEX WITH LY3009120 COMPND 提交 2015-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 432–726（295 aa） 片段：unp residues 432-726
链 B 432–726（295 aa） 片段：unp residues 432-726
突变：V600E 突变：V600E 4Z5 1-(3,3-dimethylbutyl)-3-{2-fluoro-4-methyl-5-[7-methyl-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl]phenyl}urea × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；26% PEG 3350, 50 MM AMMONIUM CITRATE, 50 MM SODIUM FLORIDE, 2 MG/ML PROTEIN, 5-FOLD MOLAR EXCESS DP4978; CRYSTAL ID 215552F10, SITTING DROP VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 289K
分辨率 2.70 Å R-free 0.238
5CSW B-RAF in complex with Dabrafenib 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 442–721（280 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 442-721
未记录 P06 Dabrafenib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350
分辨率 2.66 Å R-free 0.282
5CSW B-RAF in complex with Dabrafenib 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 442–721（280 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 442-721
未记录 P06 Dabrafenib × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350
分辨率 2.66 Å R-free 0.282
5CSX CRYSTAL STRUCTURE OF B-RAF IN COMPLEX WITH BI 882370 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 442–721（280 aa） 片段：UNP residues 442-721
未记录 54J N-(3-{5-[(1-ethylpiperidin-4-yl)(methyl)amino]-3-(pyrimidin-5-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-1-yl}-2,4-difluorophenyl)propane-1-sulfonamide × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350
分辨率 2.51 Å R-free 0.282
5CT7 BRAF in Complex with RAF265 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–723（279 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 445-723)
未记录 55J 1-methyl-5-({2-[5-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-2-yl]pyridin-4-yl}oxy)-N-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-benzimidazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；277 K；12% PEG8000, 0.1 M NaCl, and 0.1 M Tris pH 8.4
分辨率 3.17 Å R-free 0.217
5CT7 BRAF in Complex with RAF265 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–723（279 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 445-723)
未记录 55J 1-methyl-5-({2-[5-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-2-yl]pyridin-4-yl}oxy)-N-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-benzimidazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；277 K；12% PEG8000, 0.1 M NaCl, and 0.1 M Tris pH 8.4
分辨率 3.17 Å R-free 0.217
5FD2 B-Raf wild-type kinase domain in complex with a purinylpyridinylamino-based inhibitor 提交 2015-12-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 433–726（294 aa） 片段：UNP residues 433-726
链 B 433–726（294 aa） 片段：UNP residues 433-726
未记录 5XJ 6-[2-[[3-(dimethylsulfamoylamino)-2,6-bis(fluoranyl)phenyl]amino]pyridin-3-yl]-7~{H}-purine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；PEG 8000, tacsimate, tris
分辨率 2.89 Å R-free 0.278
5HI2 BRAF Kinase domain b3aC loop deletion mutant in complex with sorafenib 提交 2016-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 444–723（280 aa）
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G. delta N486-P490 BAX 4-{4-[({[4-CHLORO-3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO}CARBONYL)AMINO]PHENOXY}-N-METHYLPYRIDINE-2-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；292 K；20% PEG 3350, and 0.2M Potassium Nitrate
分辨率 2.51 Å R-free 0.237
5HID BRAF Kinase domain b3aC loop deletion mutant in complex with AZ628 提交 2016-01-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 444–723（280 aa）
链 B 444–723（280 aa）
未记录 B1E 3-(2-cyanopropan-2-yl)-N-{4-methyl-3-[(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}benzamide × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；20% PEG 3350, and 0.2M Potassium Nitrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.279
5HIE BRAF Kinase domain b3aC loop deletion mutant in complex with dabrafenib 提交 2016-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 432–726（295 aa）
未记录 P06 Dabrafenib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M Tris pH8.5, 19.3% PEG 8K, 500 mM NaCl
分辨率 3.00 Å R-free 0.221
5HIE BRAF Kinase domain b3aC loop deletion mutant in complex with dabrafenib 提交 2016-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 432–726（295 aa）
未记录 P06 Dabrafenib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M Tris pH8.5, 19.3% PEG 8K, 500 mM NaCl
分辨率 3.00 Å R-free 0.221
5HIE BRAF Kinase domain b3aC loop deletion mutant in complex with dabrafenib 提交 2016-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 432–726（295 aa）
未记录 P06 Dabrafenib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M Tris pH8.5, 19.3% PEG 8K, 500 mM NaCl
分辨率 3.00 Å R-free 0.221
5HIE BRAF Kinase domain b3aC loop deletion mutant in complex with dabrafenib 提交 2016-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 432–726（295 aa）
未记录 P06 Dabrafenib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；0.1M Tris pH8.5, 19.3% PEG 8K, 500 mM NaCl
分辨率 3.00 Å R-free 0.221
5ITA Crystal Structure of BRAF Kinase Domain Bound to AZ-VEM 提交 2016-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 448–723（276 aa） 片段：residues 448-723
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 6DC N-{2-cyano-3-[(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.1 K；PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.244
5ITA Crystal Structure of BRAF Kinase Domain Bound to AZ-VEM 提交 2016-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 448–723（276 aa） 片段：residues 448-723
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 6DC N-{2-cyano-3-[(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}propane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.1 K；PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.244
5ITA Crystal Structure of BRAF Kinase Domain Bound to AZ-VEM 提交 2016-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 448–723（276 aa） 片段：residues 448-723
链 B 448–723（276 aa） 片段：residues 448-723
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 6DC N-{2-cyano-3-[(3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]phenyl}propane-1-sulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.1 K；PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.244
5J17 Solution structure of Ras Binding Domain (RBD) of B-Raf 提交 2016-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 151–232（82 aa） 片段：residues 151-232
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 1
NMR样品组成 200 uM [U-99% 15N] B-RAF RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 200 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] B-RAF RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5J18 Solution structure of Ras Binding Domain (RBD) of B-Raf complexed with Rigosertib (Complex I) 提交 2016-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 151–232（82 aa）
未记录 6FS N-[2-methoxy-5-({[(E)-2-(2,4,6-trimethoxyphenyl)ethenyl]sulfonyl}methyl)phenyl]glycine × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 1
NMR样品组成 200 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] B-RAF-RBD:Rigosertib Complex I, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5J2R Solution structure of Ras Binding Domain (RBD) of B-Raf 提交 2016-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 151–232（82 aa） 片段：residues 151-232
未记录 6FS N-[2-methoxy-5-({[(E)-2-(2,4,6-trimethoxyphenyl)ethenyl]sulfonyl}methyl)phenyl]glycine × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 1
NMR样品组成 200 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] B-RAF RBD:Rigosertib Complex II, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5JRQ BRAFV600E Kinase Domain In Complex with Chemically Linked Vemurafenib Inhibitor VEM-6-VEM 提交 2016-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
链 B 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E 6N9 N-{2,4-difluoro-3-[5-(4-methoxyphenyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-3-carbonyl]phenyl}propane-1-sulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 1 TMA TETRAMETHYLAMMONIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100mM Tris pH 8.5, 14% PEG Monomethyl Ether 2000, and 200mM Trimethyl Amine N-oxide Dihydrate
分辨率 2.29 Å R-free 0.254
5JSM BRAFV600E Kinase Domain In Complex with Chemically Linked Vemurafenib Inhibitor VEM-3-VEM 提交 2016-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
链 B 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 BEN BENZAMIDINE × 2 EOH ETHANOL × 3 6NB N,N'-{ethane-1,2-diylbis[oxyethane-2,1-diyloxy-4,1-phenylene-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5,3-diylcarbonyl(2,4-difluoro-3,1-phenylene)]}di(propane-1-sulfonamide) × 1 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100mM Tris pH 8.5, 5% Ethanol, 2% Benzamidine HCl
分辨率 2.19 Å R-free 0.260
5JSM BRAFV600E Kinase Domain In Complex with Chemically Linked Vemurafenib Inhibitor VEM-3-VEM 提交 2016-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
链 D 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 6NB N,N'-{ethane-1,2-diylbis[oxyethane-2,1-diyloxy-4,1-phenylene-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5,3-diylcarbonyl(2,4-difluoro-3,1-phenylene)]}di(propane-1-sulfonamide) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100mM Tris pH 8.5, 5% Ethanol, 2% Benzamidine HCl
分辨率 2.19 Å R-free 0.260
5JT2 BRAFV600E Kinase Domain In Complex with Chemically Linked Vemurafenib Inhibitor VEM-BISAMIDE 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
链 B 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E BEN BENZAMIDINE × 2 6NC 2,2'-oxybis(N-{[4-(3-{2,6-difluoro-3-[(propane-1-sulfonyl)amino]benzoyl}-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)phenyl]methyl}acetamide) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100mM Tris pH 8.5 5% Ethanol 2% Benzamidine HCl
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
5JT2 BRAFV600E Kinase Domain In Complex with Chemically Linked Vemurafenib Inhibitor VEM-BISAMIDE 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
链 D 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 448-723)
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G, V600E 6NC 2,2'-oxybis(N-{[4-(3-{2,6-difluoro-3-[(propane-1-sulfonyl)amino]benzoyl}-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)phenyl]methyl}acetamide) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100mM Tris pH 8.5 5% Ethanol 2% Benzamidine HCl
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
5VAL BRAF in Complex with N-(3-(tert-butyl)phenyl)-4-methyl-3-(6-morpholinopyrimidin-4-yl)benzamide 提交 2017-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–723（279 aa） 片段：UNP residues 445-723
未记录 92D N-(3-tert-butylphenyl)-4-methyl-3-[6-(morpholin-4-yl)pyrimidin-4-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；291 K；100 mM Tris ph 8.4, 12% PEG8000, and 100mM NaCl
分辨率 2.26 Å R-free 0.217
5VAL BRAF in Complex with N-(3-(tert-butyl)phenyl)-4-methyl-3-(6-morpholinopyrimidin-4-yl)benzamide 提交 2017-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–723（279 aa） 片段：UNP residues 445-723
未记录 92D N-(3-tert-butylphenyl)-4-methyl-3-[6-(morpholin-4-yl)pyrimidin-4-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；291 K；100 mM Tris ph 8.4, 12% PEG8000, and 100mM NaCl
分辨率 2.26 Å R-free 0.217
5VAM BRAF in Complex with RAF709 提交 2017-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–723（279 aa） 片段：UNP residues 445-723
未记录 92J N-{2-methyl-5'-(morpholin-4-yl)-6'-[(oxan-4-yl)oxy][3,3'-bipyridin]-5-yl}-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；291 K；100 mM Tris ph 8.4, 12% PEG8000, and 50mM NaCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.223
5VAM BRAF in Complex with RAF709 提交 2017-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–723（279 aa） 片段：UNP residues 445-723
未记录 92J N-{2-methyl-5'-(morpholin-4-yl)-6'-[(oxan-4-yl)oxy][3,3'-bipyridin]-5-yl}-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；291 K；100 mM Tris ph 8.4, 12% PEG8000, and 50mM NaCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.223
5VYK Crystal structure of the BRS domain of BRAF in complex with the CC-SAM domain of KSR1 提交 2017-05-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 36–110（75 aa） 片段：UNP Q8IVT5 residues 27-172, UNP F7FV05 residues 39-108
链 C 36–110（75 aa） 片段：UNP Q8IVT5 residues 27-172, UNP F7FV05 residues 39-108
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris pH 7.5, 3.0M sodium formate
分辨率 1.75 Å R-free 0.239
6B8U Crystals Structure of B-Raf kinase domain in complex with an Imidazopyridinyl benzamide inhibitor 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–723（279 aa） 片段：UNP residues 445-723
未记录 8EN ~{N}-[3-(2-acetamidoimidazo[1,2-a]pyridin-6-yl)-4-methyl-phenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；277 K；10% PEG8000, 0.1 M sodium citrate pH 4.7, and 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.68 Å R-free 0.218
6B8U Crystals Structure of B-Raf kinase domain in complex with an Imidazopyridinyl benzamide inhibitor 提交 2017-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–723（279 aa） 片段：UNP residues 445-723
未记录 8EN ~{N}-[3-(2-acetamidoimidazo[1,2-a]pyridin-6-yl)-4-methyl-phenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；277 K；10% PEG8000, 0.1 M sodium citrate pH 4.7, and 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.68 Å R-free 0.218
6CAD Crystal structure of RAF kinase domain bound to the inhibitor 2a 提交 2018-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 444–723（280 aa）
未记录 EU4 1-(propan-2-yl)-3-({3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]isoquinolin-8-yl}ethynyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；30% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris Propane pH 6.5, 0.2M Sodium Nitrate
分辨率 2.55 Å R-free 0.277
6CAD Crystal structure of RAF kinase domain bound to the inhibitor 2a 提交 2018-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 444–723（280 aa）
未记录 EU4 1-(propan-2-yl)-3-({3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]isoquinolin-8-yl}ethynyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；30% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris Propane pH 6.5, 0.2M Sodium Nitrate
分辨率 2.55 Å R-free 0.277
6N0P BRAF in complex with N-(3-(2-(2-hydroxyethoxy)-6-morpholinopyridin-4-yl)-4-methylphenyl)-2-(trifluoromethyl)isonicotinamide (LXH254) 提交 2018-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 449–721（273 aa）
未记录 K81 N-{3-[2-(2-hydroxyethoxy)-6-(morpholin-4-yl)pyridin-4-yl]-4-methylphenyl}-2-(trifluoromethyl)pyridine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Tris ph 7.7, 12% PEG8000, and 100 mM NaCl
分辨率 2.37 Å R-free 0.233
6N0P BRAF in complex with N-(3-(2-(2-hydroxyethoxy)-6-morpholinopyridin-4-yl)-4-methylphenyl)-2-(trifluoromethyl)isonicotinamide (LXH254) 提交 2018-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 449–721（273 aa）
未记录 K81 N-{3-[2-(2-hydroxyethoxy)-6-(morpholin-4-yl)pyridin-4-yl]-4-methylphenyl}-2-(trifluoromethyl)pyridine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Tris ph 7.7, 12% PEG8000, and 100 mM NaCl
分辨率 2.37 Å R-free 0.233
6N0Q BRAF in complex with N-(4-methyl-3-(1-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)benzamide. 提交 2018-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 K7S N-[4-methyl-3-(1-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl)phenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Tris pH 8.3, 15% PEG8000, and 25% glycerol
分辨率 2.04 Å R-free 0.213
6N0Q BRAF in complex with N-(4-methyl-3-(1-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)benzamide. 提交 2018-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–723（279 aa）
未记录 K7S N-[4-methyl-3-(1-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl)phenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Tris pH 8.3, 15% PEG8000, and 25% glycerol
分辨率 2.04 Å R-free 0.213
6NSQ Crystal structure of BRAF kinase domain bound to the inhibitor 2l 提交 2019-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 444–723（280 aa） 片段：residues 444-723
链 B 444–723（280 aa） 片段：residues 444-723
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G KZP 5-[(4-amino-1-ethyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)ethynyl]-N-(4-chlorophenyl)-6-methylisoquinolin-1-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris Propane pH 7.75, 0.2M Sodium Malonate
分辨率 3.05 Å R-free 0.275
6NYB Structure of a MAPK pathway complex 提交 2019-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6P3D The co-crystal structure of BRAF(V600E) with ponatinib 提交 2019-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 448–721（274 aa） 片段：KINASE DOMAIN RESIDUES 448-721
未记录 0LI 3-(imidazo[1,2-b]pyridazin-3-ylethynyl)-4-methyl-N-{4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}benzam ide × 2 SO4 SULFATE ION × 16 NH4 AMMONIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；2 M AMMONIUM SULFATE, 5% (V/V) 2 -PROPANOL, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 291K
分辨率 2.11 Å R-free 0.245
6P7G The co-crystal structure of BRAF(V600E) with PHI1 提交 2019-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain residues 446-723
链 B 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain residues 446-723
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, V600E, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, V600E, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G E7M 3-[(imidazo[1,2-b]pyridazin-3-yl)ethynyl]-4-methyl-N-[4-({[2-(morpholin-4-yl)ethyl]amino}methyl)-3-(trifluoromethyl)phenyl]benzamide × 2 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；291 K；0.1 M CHES/NaOH, 1 M Sodium Citrate
分辨率 2.65 Å R-free 0.279
6P7G The co-crystal structure of BRAF(V600E) with PHI1 提交 2019-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain residues 446-723
链 D 448–723（276 aa） 片段：Kinase domain residues 446-723
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, V600E, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, V600E, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G E7M 3-[(imidazo[1,2-b]pyridazin-3-yl)ethynyl]-4-methyl-N-[4-({[2-(morpholin-4-yl)ethyl]amino}methyl)-3-(trifluoromethyl)phenyl]benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；291 K；0.1 M CHES/NaOH, 1 M Sodium Citrate
分辨率 2.65 Å R-free 0.279
6PP9 Crystal structure of BRAF:MEK1 complex 提交 2019-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；100 mM Bis-Tris pH 6.4, 200 mM Ammonium Sulfate, and 22% PEG3350
分辨率 2.59 Å R-free 0.245
6Q0J Structure of a MAPK pathway complex 提交 2019-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–766（766 aa）
链 B 1–766（766 aa）
突变：S365A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S365A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6Q0K Structure of a MAPK pathway complex 提交 2019-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–766（766 aa）
链 B 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6Q0T Structure of a MAPK pathway complex 提交 2019-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–766（766 aa）
链 B 1–766（766 aa）
突变：S365A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S365A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
6U2G BRAF-MEK complex with AMP-PCP bound to BRAF 提交 2019-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 432–726（295 aa）
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Ammonium sulfate, MES, PEK 8000
分辨率 2.89 Å R-free 0.276
6U2H BRAF dimer bound to 14-3-3 提交 2019-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 447–735（289 aa）
链 D 447–735（289 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 29L 2-{4-[(1E)-1-(hydroxyimino)-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]-3-(pyridin-4-yl)-1H-pyrazol-1-yl}ethanol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；PEG 6000 Tris pH 7.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
6UAN B-Raf:14-3-3 complex 提交 2019-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–766（766 aa）
链 C 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6UUO Crystal structure of BRAF kinase domain bound to the PROTAC P4B 提交 2019-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 444–723（280 aa）
链 B 444–723（280 aa）
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G QH1 N-(3-{5-[(1-acetylpiperidin-4-yl)(methyl)amino]-3-(pyrimidin-5-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-1-yl}-2,4-difluorophenyl)propane-1-sulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；20% PEG 6000, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M Calcium Chloride
分辨率 3.29 Å R-free 0.288
6UUO Crystal structure of BRAF kinase domain bound to the PROTAC P4B 提交 2019-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 444–723（280 aa）
链 B 444–723（280 aa）
突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G 突变：I543A, I544S, I551K, Q562R, L588N, K630S, F667E, Y673S, A688R, L706S, Q709R, S713E, L716E, S720E, P722S, K723G QH1 N-(3-{5-[(1-acetylpiperidin-4-yl)(methyl)amino]-3-(pyrimidin-5-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-1-yl}-2,4-difluorophenyl)propane-1-sulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；20% PEG 6000, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.2 M Calcium Chloride
分辨率 3.29 Å R-free 0.288
6V2U Crystal structure of the insect cell-expressed WT-BRAF kinase in complex with Dabrafenib 提交 2019-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 P06 Dabrafenib × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Tris pH 7, 2.5 M Sodium Chloride, 100 mM Magnesium Chloride
分辨率 3.78 Å R-free 0.309
6V2U Crystal structure of the insect cell-expressed WT-BRAF kinase in complex with Dabrafenib 提交 2019-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 445–723（279 aa）
未记录 P06 Dabrafenib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Tris pH 7, 2.5 M Sodium Chloride, 100 mM Magnesium Chloride
分辨率 3.78 Å R-free 0.309
6V2W Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP 提交 2019-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Bis-Tris pH 8.5, 200 mM Lithium Sulfate, and 22% PEG3350
分辨率 3.12 Å R-free 0.237
6XAG Apo BRAF dimer bound to 14-3-3 提交 2020-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 447–735（289 aa）
链 D 447–735（289 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；100 mM HEPES pH 7.5, 200 mM ammonium sulfate, 23% (w/v) PEG 3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.300
7M0T Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Selumetinib 提交 2021-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 3EW 5-[(4-bromo-2-chlorophenyl)amino]-4-fluoro-N-(2-hydroxyethoxy)-1-methyl-1H-benzimidazole-6-carboxamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3350
分辨率 3.19 Å R-free 0.254
7M0U Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Binimetinib 提交 2021-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 QO7 5-[(4-bromo-2-fluorophenyl)amino]-4-fluoro-N-(2-hydroxyethoxy)-1-methyl-1H-benzimidazole-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Bis-Tris pH 8.5, 200 mM Lithium Sulfate, and 22% PEG3350
分辨率 3.09 Å R-free 0.230
7M0V Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Cobimetinib 提交 2021-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 EUI [3,4-BIS(FLUORANYL)-2-[(2-FLUORANYL-4-IODANYL-PHENYL)AMINO]PHENYL]-[3-OXIDANYL-3-[(2S)-PIPERIDIN-2-YL]AZETIDIN-1-YL]METHANONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3,350
分辨率 3.16 Å R-free 0.234
7M0W Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Pimasertib 提交 2021-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 QOA N-[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]-3-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]pyridine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3,350
分辨率 3.09 Å R-free 0.233
7M0X Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and PD0325901 提交 2021-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 4BM N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]benzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；100 mM Bis-Tris pH 6.4, 200 mM Ammonium Sulfate, and 22% PEG3350
分辨率 2.47 Å R-free 0.215
7M0Y Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Trametinib 提交 2021-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 QOM Trametinib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3,350
分辨率 3.45 Å R-free 0.218
7M0Z Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and CH5126766 提交 2021-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3,350
分辨率 3.12 Å R-free 0.225
7MFD Autoinhibited BRAF:(14-3-3)2:MEK complex with the BRAF RBD resolved 提交 2021-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7MFE Autoinhibited BRAF:(14-3-3)2 complex with the BRAF RBD resolved 提交 2021-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7MFF Dimeric (BRAF)2:(14-3-3)2 complex bound to SB590885 Inhibitor 提交 2021-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–766（766 aa）
链 B 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 215 (1Z)-5-(2-{4-[2-(DIMETHYLAMINO)ETHOXY]PHENYL}-5-PYRIDIN-4-YL-1H-IMIDAZOL-4-YL)INDAN-1-ONE OXIME × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.89 Å
7P3V B-Raf V600E structure bound to a new inhibitor 提交 2021-07-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 448–719（272 aa）
链 B 448–719（272 aa）
未记录 5I4 ~{N}-[3-[5-(2-azanylpyrimidin-4-yl)-2-[(3~{S})-morpholin-3-yl]-1,3-thiazol-4-yl]-2-fluoranyl-phenyl]-2,5-bis(fluoranyl)benzenesulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；100 mM BisTrisPropane, 20% PEG 3350, and 250 mM Na-formate
分辨率 2.37 Å R-free 0.247
7SHV Crystal structure of BRAF kinase domain bound to GDC0879 提交 2021-10-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 432–726（295 aa）
链 B 432–726（295 aa）
未记录 29L 2-{4-[(1E)-1-(hydroxyimino)-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]-3-(pyridin-4-yl)-1H-pyrazol-1-yl}ethanol × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；292 K；0.1 M Na Cacodylate pH 5.5, 0.1 M Ca Acetate, 12% PEG 8000
分辨率 2.88 Å R-free 0.242
7ZR0 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E) complex. 提交 2022-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–766（766 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ZR5 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(closed) complex 提交 2022-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 1–766（766 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7ZR6 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(open) complex 提交 2022-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 1–766（766 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8C7X Crystal structure of BRAF in complex with a hybrid compound 6 提交 2023-01-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 444–721（278 aa）
链 B 444–721（278 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 BR BROMIDE ION × 3 TXV ~{N}-[3-[(5-chloranyl-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-bis(fluoranyl)phenyl]-3-(2-cyanopropan-2-yl)benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；19% PEG3350, 0.1M bis-tris-propane pH 7.0, 0.2M sodium bromide, 10% ethylene glycol
分辨率 1.65 Å R-free 0.171
8DGS Cryo-EM structure of a RAS/RAF complex (state 1) 提交 2022-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8DGT Cryo-EM structure of a RAS/RAF complex (state 2) 提交 2022-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8F7O BRAF kinase in complex with TAK580 (tovorafenib) 提交 2022-11-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 441–723（283 aa）
链 B 441–723（283 aa）
未记录 QOP 6-amino-5-chloro-N-[(1R)-1-(5-{[5-chloro-4-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]carbamoyl}-1,3-thiazol-2-yl)ethyl]pyrimidine-4-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；8% tacimate pH 8.0, 20% PEG 3350
分辨率 3.54 Å R-free 0.269
8F7P BRAF kinase in complex with LXH254 (naporafenib) 提交 2022-11-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 441–723（283 aa）
链 B 441–723（283 aa）
未记录 K81 N-{3-[2-(2-hydroxyethoxy)-6-(morpholin-4-yl)pyridin-4-yl]-4-methylphenyl}-2-(trifluoromethyl)pyridine-4-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.74 Å R-free 0.258
8JNA CRAF ras-binding domain chimera, apo form 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 201–209（9 aa）
突变：K65S, F99Y, S120W, D129E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1.0M tri-sodium citrate, 0.1M imidazole, pH 8.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.272
8JNB CRAF ras-binding domain chimera, ligand complex 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 201–209（9 aa）
突变：K65S, F99Y, S120W, D129E USX 2-[4-[[(2S)-1-ethanoyl-3-oxidanylidene-2H-indol-2-yl]methyl]-2-methoxy-phenoxy]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate, 0.1M sodium citrate, pH 5.6
分辨率 1.62 Å R-free 0.242
8QQG Structure of BRAF in Complex With Exarafenib (KIN-2787). 提交 2023-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 448–722（275 aa）
未记录 WJ9 Exarafenib × 1 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Hepes pH 6.7, 3.9 M NaCl, 0.10 M SCN
分辨率 2.98 Å R-free 0.261
8QQG Structure of BRAF in Complex With Exarafenib (KIN-2787). 提交 2023-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 448–722（275 aa）
未记录 WJ9 Exarafenib × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Hepes pH 6.7, 3.9 M NaCl, 0.10 M SCN
分辨率 2.98 Å R-free 0.261
8QQG Structure of BRAF in Complex With Exarafenib (KIN-2787). 提交 2023-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 448–722（275 aa）
未记录 WJ9 Exarafenib × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Hepes pH 6.7, 3.9 M NaCl, 0.10 M SCN
分辨率 2.98 Å R-free 0.261
8VSO Ternary structure of 14-3-3 sigma, BRAF phosphopeptide (pS365) and compound 78 (1124378) 提交 2024-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 361–369（9 aa） 片段：residues 361-369 (Uniprot numbering)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 WQN 1-[8-(4-bromophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；PEG4000, HEPES, CaCl2, glycerol
分辨率 1.50 Å R-free 0.189
8VYO Cryo-EM Structure of the BRAF WT monomer 提交 2024-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Chameleon system (SPT Labtech)
分辨率 3.74 Å
8VYP Cryo-EM Structure of the BRAF V600E monomer 提交 2024-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–766（766 aa）
突变：V600E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Chameleon system (SPT Labtech)
分辨率 3.29 Å
8VYQ Cryo-EM Structure of the BRAF V600K monomer 提交 2024-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 360–734（375 aa） 片段：NTpS and CTpS phosphopeptides
突变：V600K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Chameleon system (SPT Labtech)
分辨率 4.43 Å
8VYR Cryo-EM Structure of the BRAF V600E monomer bound to GDC0879 提交 2024-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–766（766 aa）
突变：V600E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Chameleon system (SPT Labtech)
分辨率 4.32 Å
8VYS Cryo-EM Structure of the BRAF V600E monomer bound to PLX8394 提交 2024-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–766（766 aa）
突变：V600E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1AEN (3S)-N-{3-[5-(2-cyclopropylpyrimidin-5-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-3-carbonyl]-2,4-difluorophenyl}-3-fluoropyrrolidine-1-sulfonamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Chameleon system (SPT Labtech)
分辨率 3.06 Å
8VYU Cryo-EM Structure of the BRAF WT monomer bound to PLX8394 提交 2024-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1AEN (3S)-N-{3-[5-(2-cyclopropylpyrimidin-5-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-3-carbonyl]-2,4-difluorophenyl}-3-fluoropyrrolidine-1-sulfonamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Chameleon system (SPT Labtech)
分辨率 4.07 Å
8VYV Cryo-EM Structure of the BRAF K601E monomer 提交 2024-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–766（766 aa）
突变：K601E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Chameleon system (SPT Labtech)
分辨率 5.86 Å
8VYW Cryo-EM Structure of the BRAF D594G monomer 提交 2024-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 360–734（375 aa） 片段：NTpS and CTpS phosphopeptides
突变：D594G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Chameleon system (SPT Labtech)
分辨率 4.76 Å
9AXX Crystal structure of BRAF/MEK1 complex with NST-628 and an active RAF dimer 提交 2024-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 445–723（279 aa）
链 D 445–723（279 aa）
未记录 A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.24 M di-ammonium hydrogen phosphate pH 8.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.07 Å R-free 0.248
9AXY Crystal structure of BRAF/MEK complex with NST-628 and inactive RAF 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.2 M Lithium chloride, 0.1 M TRIS pH 8, 20% w/v PEG 8000
分辨率 3.60 Å R-free 0.237
9BFB Crystal structure of BRAF kinase domain with PF-07284890 提交 2024-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 A1AN9 N-{2-chloro-3-[(3,5-dimethyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]-4-fluorophenyl}-3-fluoropropane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；100mM Hepes pH 7.0, 15 % PEG 8K, 10% Tacsimate
分辨率 1.92 Å R-free 0.189
9BP8 Crystal structure of BRAF kinase domain with PF-07799933 提交 2024-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 445–723（279 aa）
未记录 A1AQY N-{(1R,2P)-6-chloro-5-[(5-chloro-3-methyl-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-6-yl)amino]-4-fluorocyclohexa-2,3,5-trien-1-yl}-3-fluoroazetidine-1-sulfonamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；17% PEG5000MME, 1% PEG6000, Sodium Acetate, 0.2M NaCl, 5% Tacsimate.
分辨率 1.73 Å R-free 0.193
9ECU Crystal structure of the inactive BRAF/MEK1 complex bound to IK-595 提交 2024-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 445–723（279 aa） 片段：kinase domain
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 A1BIS 4-[2-chloro-3-(methylsulfamamido)phenoxy]-N-cyclopropyl-2-(2-fluoro-4-iodoanilino)-1,5-dimethyl-6-oxo-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v PEG 3350
分辨率 3.46 Å R-free 0.237
9EW6 Binary structure of 14-3-3s and BRAF phosphopeptide (pS365) 提交 2024-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 361–369（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.65 Å R-free 0.221
9O2Z Autoinhibited BRAF:(14-3-3)2:MEK complex from Insect cells 提交 2025-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–766（766 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å

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UniProt名称 BRAF_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 3–280； UniProt 444–721 作者链 B； PDB构建体 3–280； UniProt 444–721

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8c7y

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8c7y
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8c7y
沉积日期 deposition_date2023-01-17
结构标题 titleCrystal structure of BRAF V600E in complex with a hybrid compound 6
关键词 keywordsBRAF, kinase, kinase inhibitor, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier26.54 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron25.56 Å
零角强度 I(0) i065161200.00
分子量 molecular_weight62845.0 kDa
排除体积 excluded_volume78717 ų
包络体积 envelope_volume95345 ų
水化壳体积 shell_volume31067 ų
包络直径 envelope_diameter94.2 Å
壳层 Rg shell_rg33.04 Å
包络 Rg envelope_rg25.91 Å
形状 Rg shape_rg25.50 Å
总 Rg total_rg26.56 Å
总原子数 total_atoms4409
残基数 n_residues534
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax90.2 Å
Rg (实空间) rg_real26.55 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.68 Å
I(0) (实空间) i0_real6.5160e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.4160e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal26.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal65160000.0000
解质量估计 total_estimate0.8718
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary30.1 Å
偏度 Skewness skewness0.427
峰度 Kurtosis kurtosis-0.156
角度范围 angular_range— – 0.3000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha25610000.0000
实空间数据点数 n_real_points61
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.793; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.971; Smooth: 0.983
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id8c7yA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id8c7yA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
结构域编号 domain_id8c7yB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id8c7yB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)