SAXSdb — 8cmu

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coagulation factor XIII A chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Coagulation factor XIII B chain × 2 （P05160） water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F13A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–732； UniProt 1–732 作者链 B； PDB构建体 1–732； UniProt 1–732

Coagulation factor XIII B chain

物种未注明

UniProt P05160

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Coagulation factor XIII A chain × 2 （P00488） water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F13B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–661； UniProt 1–661 作者链 D； PDB构建体 1–661； UniProt 1–661

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8cmu
沉积日期 deposition_date	2023-02-21
结构标题 title	High resolution structure of the coagulation Factor XIII A2B2 heterotetramer complex.
关键词 keywords	Factor XIII, BLOOD CLOTTING; BLOOD CLOTTING
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8cmu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8cmu__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8cmu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	37.98 Å
Rg（电子密度）	37.33 Å
总 Rg	37.87 Å
原子数	13580
残基数	1694
排除体积	240460 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8cmu__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Coagulation factor XIII A chain
分子量 formula_weight	83365.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.2.13
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	14328

MSETSRTAFGGRRAVPPNNSNAAEDDLPTVELQGVVPRGVNLQEFLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFSRPYDPRRDLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSSPKCIVGKFRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDIGVIFYGEVNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLVGSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVTNYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVDSTPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLIYITAKKDGTHVVENVDATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRSNVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVTLEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKVRGTQVVGSDMTVTVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCRPWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQRRPSM

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Coagulation factor XIII B chain
分子量 formula_weight	75600.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MRLKNLTFIIILIISGELYAEEKPCGFPHVENGRIAQYYYTFKSFYFPMSIDKKLSFFCLAGYTTESGRQEEQTTCTTEGWSPEPRCFKKCTKPDLSNGYISDVKLLYKIQENMRYGCASGYKTTGGKDEEVVQCLSDGWSSQPTCRKEHETCLAPELYNGNYSTTQKTFKVKDKVQYECATGYYTAGGKKTEEVECLTYGWSLTPKCTKLKCSSLRLIENGYFHPVKQTYEEGDVVQFFCHENYYLSGSDLIQCYNFGWYPESPVCEGRRNRCPPPPLPINSKIQTHSTTYRHGEIVHIECELNFEIHGSAEIRCEDGKWTEPPKCIEGQEKVACEEPPFIENGAANLHSKIYYNGDKVTYACKSGYLLHGSNEITCNRGKWTLPPECVENNENCKHPPVVMNGAVADGILASYATGSSVEYRCNEYYLLRGSKISRCEQGKWSSPPVCLEPCTVNVDYMNRNNIEMKWKYEGKVLHGDLIDFVCKQGYDLSPLTPLSELSVQCNRGEVKYPLCTRKESKGMCTSPPLIKHGVIISSTVDTYENGSSVEYRCFDHHFLEGSREAYCLDGMWTTPPLCLEPCTLSFTEMEKNNLLLKWDFDNRPHILHGEYIEFICRGDTYPAELYITGSILRMQCDRGQLKYPRCIPRQSTLSYQEPLRT

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	748

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.41 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	333272

High resolution structure of the coagulation Factor XIII A2B2 heterotetramer complex.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coagulation factor XIII A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Coagulation factor XIII B chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8cmu__assembly_1__model_1

8cmu__assembly_1__model_1 | I(q)

8cmu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)

High resolution structure of the coagulation Factor XIII A2B2 heterotetramer complex.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coagulation factor XIII A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Coagulation factor XIII B chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8cmu__assembly_1__model_1

8cmu__assembly_1__model_1 | I(q)

8cmu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)