8cwo

Cutibacterium acnes 30S ribosomal subunit with Sarecycline bound, body domain only in the local refined map

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S4

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2B7JMY9_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–201； UniProt 1–201

30S ribosomal protein S5

物种未注明

UniProt A0A2B7I5L8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2B7I5L8_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–215； UniProt 1–215

30S ribosomal protein S6

物种未注明

UniProt A0A2C6L3A1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2C6L3A1_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–96； UniProt 1–96

30S ribosomal protein S8

物种未注明

UniProt A0A2B7ITQ7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2B7ITQ7_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

30S ribosomal protein S11

物种未注明

UniProt A0A2B7I645

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2B7I645_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

30S ribosomal protein S12

物种未注明

UniProt A0A2C6LJN0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2C6LJN0_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–123； UniProt 1–123

30S ribosomal protein S15

物种未注明

UniProt A0A2B7I743

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2B7I743_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87

30S ribosomal protein S17

物种未注明

UniProt A0A2B7JMS7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2B7JMS7_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90

30S ribosomal protein S18

物种未注明

UniProt A0A2C6LI71

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2C6LI71_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79

30S ribosomal protein S20

物种未注明

UniProt A0A2B7I592

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2B7I592_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–88； UniProt 1–88

30S ribosomal protein S16

物种未注明

UniProt A0A2B7IXM7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2B7IXM7_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147

30S ribosomal protein bS22

物种未注明

UniProt A0A533INE0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein S2 × 1 （A0A2B7I756） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A533INE0_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–33； UniProt 1–33

30S ribosomal protein S2

物种未注明

UniProt A0A2B7I756

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 13 RNA 2	16S ribosomal RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （A0A2B7JMY9） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A0A2B7I5L8） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A2C6L3A1） 30S ribosomal protein S8 × 1 （A0A2B7ITQ7） 30S ribosomal protein S11 × 1 （A0A2B7I645） 30S ribosomal protein S12 × 1 （A0A2C6LJN0） 30S ribosomal protein S15 × 1 （A0A2B7I743） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A2B7JMS7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （A0A2C6LI71） 30S ribosomal protein S20 × 1 （A0A2B7I592） 30S ribosomal protein S16 × 1 （A0A2B7IXM7） 30S ribosomal protein bS22 × 1 （A0A533INE0） mRNA × 1 MAGNESIUM ION × 66 water × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2B7I756_CUTAC
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8cwo
沉积日期 deposition_date	2022-05-19
结构标题 title	Cutibacterium acnes 30S ribosomal subunit with Sarecycline bound, body domain only in the local refined map
关键词 keywords	ribosome, sarecycline, acne, ANTIBIOTIC; ANTIBIOTIC
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8cwo__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8cwo__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8cwo__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	54.64 Å
Rg（电子密度）	55.44 Å
总 Rg	55.46 Å
原子数	34341
残基数	2542
排除体积	529110 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8cwo__assembly_1__model_1`	pentadecameric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	16S ribosomal RNA
分子量 formula_weight	498742.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	34342

UUUUUCAUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGACGAACGCUGGCGGCGUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGAAAGGCCCUGCUUUUGUGGGGUGCUCGAGUGGCGAACGGGUGAGUAACACGUGAGUAACCUGCCCUUGACUUUGGGAUAACUUCAGGAAACUGGGGCUAAUACCGGAUAGGAGCUCCUGCUGCAUGGUGGGGGUUGGAAAGUUUCGGCGGUUGGGGAUGGACUCGCGGCUUAUCAGCUUGUUGGUGGGGUAGUGGCUUACCAAGGCUUUGACGGGUAGCCGGCCUGAGAGGGUGACCGGCCACAUUGGGACUGAGAUACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGGAAGCCUGAUGCAGCAACGCCGCGUGCGGGAUGACGGCCUUCGGGUUGUAAACCGCUUUCGCCUGUGACGAAGCGUGAGUGACGGUAAUGGGUAAAGAAGCACCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUGAUACGUAGGGUGCGAGCGUUGUCCGGAUUUAUUGGGCGUAAAGGGCUCGUAGGUGGUUGAUCGCGUCGGAAGUGUAAUCUUGGGGCUUAACCCUGAGCGUGCUUUCGAUACGGGUUGACUUGAGGAAGGUAGGGGAGAAUGGAAUUCCUGGUGGAGCGGUGGAAUGCGCAGAUAUCAGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGGUUCUCUGGGCCUUUCCUGACGCUGAGGAGCGAAAGCGUGGGGAGCGAACAGGCUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCUGUAAACGGUGGGUACUAGGUGUGGGGUCCAUUCCACGGGUUCCGUGCCGUAGCUAACGCUUUAAGUACCCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUAAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGCCCCGCACAAGCGGCGGAGCAUGCGGAUUAAUUCGAUGCAACGCGUAGAACCUUACCUGGGUUUGACAUGGAUCGGGAGUGCUCAGAGAUGGGUGUGCCUCUUUUGGGGUCGGUUCACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUUCACUGUUGCCAGCACGUUAUGGUGGGGACUCAGUGGAGACCGCCGGGGUCAACUCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGUCCAGGGCUUCACGCAUGCUACAAUGGCUGGUACAGAGAGUGGCGAGCCUGUGAGGGUGAGCGAAUCUCGGAAAGCCGGUCUCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACUCGACCUCAUGAAGUCGGAGUCGCUAGUAAUCGCAGAUCAGCAACGCUGCGGUGAAUACGUUCCCGGGGCUUGUACACACCGCCCGUCAAGUCAUGAAAGUUGGUAACACCCGAAGCCGGUGGCCUAACCGUUGUGGGGGAGCCGUCGAAGGUGGGACUGGUGAUUAGGACUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCUAAGGAG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S4
分子量 formula_weight	23271.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MARYTGPLTKKSRRLGTDLVGNDKSFERRPYPPGVHGRGRTKDSEYSLQLREKQKARYAYGVLEKQFRRYYEEADRAQGKTGDVLLQILESRLDNVVYRAGLAATRRQARQMVSHGHFLVNGKKVNIPSYRVSTHDIIDVREKSKDLPPIVIARETFETRDVPAWLEVRPNKGRILVHQLPTRDQIVIDVNEQAIVELYSK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S5
分子量 formula_weight	22603.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSGTQRRGGGAGGERRGRDNRRGQNDRNRNQNEYLERVVAINRVAKVVQGGRRFSFTALVVVGDGEGSVGVGYGKAKEVPAAIAKAVEEAKKHFFKVPLVGRTITHPVIGEKAAGVVMLRPASPGTGVIAGGSARAVLECAGVHDVLAKSLGSSNAINVVHATVDALQQLEEPEEVARRRGKSVEDIAPAAMLRARKEADEAAAAARMEEKAGVN

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S6
分子量 formula_weight	11270.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MRKYEVMIIIDPTVEERQVDSLMEKYLKVITDEKGTVDNVDVWGKRRLAYDIQKKSEGIYVVVNATCEPATIQELDRLLAIDEKIMRTKVMRPEIH

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S8
分子量 formula_weight	14677.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MTMTDPIADMLTRLRNANQAYHDQTSMPHSKIKAGIAGILKSEGYIADYKVNEPKEGEVGKTLTLTLKYGENRERSIAGVRRISKPGLRVYAKSTALPKVLGGLGIAIISTSQGLLTDKQAHEKSVGGEVLAYVW

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S11
分子量 formula_weight	14194.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MATAGHKGAPKTKVRRKEKKNVVAGQAHIKSTFNNTIIAITDPSGAVISWASAGTVGFKGSRKSTPFAAQMAAEAAGRRAMEHGMKRVDVFVKGPGSGRETAIRSLGAVGLEIGPISDVTPVPHNGCRPPKRRRV

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S12
分子量 formula_weight	13666.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MPTIQQLVRKGRTDKISKNKTPALKGSPQRRGVCTRVYTTTPKKPNSALRKVARVRLSSGIEVTAYIPGVGHNLQEHSMVLVRGGRVKDLPGVRYKIVRGSLDTQGVKGRKQARSRYGAKKEK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S15
分子量 formula_weight	10102.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MDAAEKKKIIEEYATHPGDTGSPDVQVAILTKRIAELTEHLKVHKGDHHSRRGLMLMVGQRRRLLNYIAKNDIEHYRELIARLGLRR

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S17
分子量 formula_weight	10475.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MSENTAERTTRRKVREGLVVSDKMNKTITVMVEDRVKHPLYGKVMTKSVRLKAHDENNEAGMGDRVRIMETRPLSATKRWRLVEIIEKAK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S18
分子量 formula_weight	8817.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MAGPQRKSVNKKKVVPIKTVHIGAVDYKDTALLRKFISERGKIRARRVTGLSVQDQRKVAIAIKNARELALLPYASTAR

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S20
分子量 formula_weight	9724.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MPNIKSQIKRVKTNEKSRQRNKAVKSALRTYVRNFRRAAEAGDVEAATKAARVANRQLDKAASKGVIHKNQAANRKSAISKKLNSLAA

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S16
分子量 formula_weight	15980.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MATKIRLKRLGKIRTPHYRVVVMDSRAKRDGRAIEEIGQYHPKADPSVIVIDSERVQYWLGVGAQPTEAVVALLKRTGDWQKFTGDTSPSGVKPQPERPNKDDLFNAALAEADEAPREAITKKSEGAAADEASESAAGDNSGEKAEA

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	30S ribosomal protein bS22
分子量 formula_weight	4120.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MGSVIKKRRKRMAKKKHRKLLKRTRIQRRRAGK

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S2
分子量 formula_weight	31583.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MAVVTTRQLLESGVHFGHQTRRWNPKMKRFIFTERNGIYIIDLHQSLTYIDKAYAFVKETVAKGGQILFVGTKKQAQESIVEQATRVGMPYVNQRWLGGMLTNFQTISKRIARLKELEAMDFDKVSGSGLTKKELLMLSREKDKLEKDLGGIRDMPKVPQAVWVVDTKKEHLAIDEARKLKIPVVAILDTNCDPDEVDYAIPGNDDAIRSVSLLTRIIADAAAEGLMARSAGKSGEQPAEAEPMPDWERELLEGDGAKTEAKAEEPKAEAKKADEAPEAEKSN

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	mRNA
分子量 formula_weight	7115.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Y

CAAGGAGGUAAAAAUGUUUUAA

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	66

实体 17 Entity 17 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	8cwoD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	290 — Structural Genomics Hypothetical 15.5 Kd Protein In mrcA-pckA Intergenic Region; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA-binding S4 domain

结构域编号 domain_id	8cwoF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Ribosomal protein S6/Translation elongation factor EF1B

结构域编号 domain_id	8cwoH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.84 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	70853

Cutibacterium acnes 30S ribosomal subunit with Sarecycline bound, body domain only in the local refined map

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S18

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S20

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体