SAXSdb — 8dd7

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cryptochrome-1 fusion

Drosophila melanogaster

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–181 链 B； UniProt 5–181	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8DD7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3KZY Crystal structure of SNAP-tag 提交 2009-12-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–182（182 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；34% PEG 3350, 100mM BisTris pH 5.5, 500mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.261
3KZY Crystal structure of SNAP-tag 提交 2009-12-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–182（182 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；34% PEG 3350, 100mM BisTris pH 5.5, 500mM NaCl , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.261
6RLA Structure of the dynein-2 complex; motor domains 提交 2019-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 5–181（177 aa）链 B 5–181（177 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6RLB Structure of the dynein-2 complex; tail domain 提交 2019-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 5–181（177 aa）链 B 5–181（177 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
6SC2 Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model 提交 2019-07-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 5–181（177 aa）链 B 5–181（177 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6Y8P Crystal structure of SNAP-tag labeled with a benzyl-tetramethylrhodamine fluorophore 提交 2020-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 7–182（176 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 OGQ [9-[2-carboxy-5-[(4-methylphenyl)methylcarbamoyl]phenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethyl-azanium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；100 mM Na HEPES pH 7.5 25% PEG 8000 10 mg/mL protein 100 nl:100 nL	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric	链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
8TK7 Myxococcus xanthus EncA protein shell with compartmentalized SNAP-tag cargo protein 提交 2023-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；150 mM NaCl, 20 mM Tris pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
9DI0 Cryo-EM structure of Kif18A bound to a microtubule 提交 2024-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 5–181（177 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 TA1 TAXOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 7 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E5BBQ0_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 38–218； UniProt 1–181 作者链 B； PDB构建体 1406–1582； UniProt 5–181

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cryptochrome-1 fusion

Drosophila melanogaster

UniProt O77059

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–520	未记录	Protein timeless,Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase fusion × 1 （P49021,E5BBQ0） FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8DD7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4GU5 Structure of Full-length Drosophila Cryptochrome 提交 2012-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–539（539 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；298 K；50 MM HEPES PH 8.0; 150 MM NACL 5MG/ML PROTEIN MIXED 1:1 WITH 18% PDG 4K, 150 MM MGACETATE, 100 MM TRIS PH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
4GU5 Structure of Full-length Drosophila Cryptochrome 提交 2012-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–539（539 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；298 K；50 MM HEPES PH 8.0; 150 MM NACL 5MG/ML PROTEIN MIXED 1:1 WITH 18% PDG 4K, 150 MM MGACETATE, 100 MM TRIS PH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
4JZY Crystal structures of Drosophila Cryptochrome 提交 2013-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–540（540 aa）链 B 1–540（540 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；0.2 M NH4OAc, 20% PEG 3350 , pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.34 Å R-free 0.222
4K03 Crystal structure of Drosophila Cryprochrome 提交 2013-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–542（542 aa）链 B 1–542（542 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM TrisHCl pH 8.0, 17% PEG 3350, 120 mM Mg-Acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.269
6WTB Sort-Tagged Drosophila Cryptochrome 提交 2020-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–539（539 aa）链 B 1–539（539 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；4 microliter drop (2 microliter protein solution, 2 microliter well solution) 100 mM Tris (pH 9) 150 mM Magneisum Acetate Tetrahydrate 17% PEG-4000 8 mg/mL sort-tagged WT Drosophila Cryptochrome	分辨率 2.58 Å R-free 0.287
7UD0 Room Temperature Drosophila Cryptochrome 提交 2022-03-17	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–539（539 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 8.5；298 K；5 mg/mL twin-strep tagged dCRY (1-539) 100 mM Tris (pH 8.5) 150 mM Magnesium acetate tetrahydrate 18% PEG-4000 Mixed 1:1 in Eppendorf tube; no vortexing	分辨率 3.50 Å R-free 0.294
7UD0 Room Temperature Drosophila Cryptochrome 提交 2022-03-17	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–539（539 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 8.5；298 K；5 mg/mL twin-strep tagged dCRY (1-539) 100 mM Tris (pH 8.5) 150 mM Magnesium acetate tetrahydrate 18% PEG-4000 Mixed 1:1 in Eppendorf tube; no vortexing	分辨率 3.50 Å R-free 0.294

共 5 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CRY1_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 227–746； UniProt 1–520

Protein timeless,Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase fusion

Homo sapiens

UniProt P49021

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–1398	未记录	Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cryptochrome-1 fusion × 1 （E5BBQ0,O77059） FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIM_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1398； UniProt 1–1398

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8dd7
沉积日期 deposition_date	2022-06-17
结构标题 title	The Cryo-EM structure of Drosophila Cryptochrome in complex with Timeless
关键词 keywords	Flavoprotein, Nuclear import, Light-sensor, Armadillo-repeat protein, CIRCADIAN CLOCK PROTEIN; CIRCADIAN CLOCK PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	41.58 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.49 Å
零角强度 I(0) i0	316017000.00
分子量 molecular_weight	147410.0 kDa
排除体积 excluded_volume	185370 Å³
包络体积 envelope_volume	248770 Å³
水化壳体积 shell_volume	51698 Å³
包络直径 envelope_diameter	136.8 Å
壳层 Rg shell_rg	44.65 Å
包络 Rg envelope_rg	41.20 Å
形状 Rg shape_rg	41.51 Å
总 Rg total_rg	41.60 Å
总原子数 total_atoms	10370
残基数 n_residues	1275
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	136.1 Å
Rg (实空间) rg_real	41.78 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.22 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.1600e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.4130e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	41.58 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	315900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8042
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	35.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.407
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.621
角度范围 angular_range	— – 0.1900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	78360000.0000
实空间数据点数 n_real_points	39
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.840; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.931; Smooth: 0.000

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cryptochrome-1 fusion
分子量 formula_weight	83838.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	10370

MEQKLISEEDLGGGEQKLISEEDLGGGEQKLISEEDLGGGMDKDCEMKRTTLDSPLGKLELSGCEQGLHRIIFLGKGTSAADAVEVPAPAAVLGGPEPLIQATAWLNAYFHQPEAIEEFPVPALHHPVFQQESFTRQVLWKLLKVVKFGEVISESHLAALVGNPAATAAVNTALDGNPVPILIPCHRVVQGDSDVGPYLGGLAVKEWLLAHEGHRLGKPGLGGGSGMATRGANVIWFRHGLRLHDNPALLAALADKDQGIALIPVFIFDGESAGTKNVGYNRMRFLLDSLQDIDDQLQAATDGRGRLLVFEGEPAYIFRRLHEQVRLHRICIEQDCEPIWNERDESIRSLCRELNIDFVEKVSHTLWDPQLVIETNGGIPPLTYQMFLHTVQIIGLPPRPTADARLEDATFVELDPEFCRSLKLFEQLPTPEHFNVYGDNMGFLAKINWRGGETQALLLLDERLKVEQHAFERGFYLPNQALPNIHDSPKSMSAHLRFGCLSVRRFYWSVHDLFKNVQLRACVRGVQMTGGAHITGQLIWREYFYTMSVNNPNYDRMEGNDICLSIPWAKPNENLLQSWRLGQTGFPLIDGAMRQLLAEGWLHHTLRNTVATFLTRGGLWQSWEHGLQHFLKYLLDADWSVCAGNWMWVSSSAFERLLDSSLVTCPVALAKRLDPDGTYIKQYVPELMNVPKEFVHEPWRMSAEQQEQYECLIGVHYPERIIDLSMAVKRNMLAMKSLRNSLITPP

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Drosophila melanogaster

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein timeless,Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase fusion
分子量 formula_weight	179996.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.63
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MDWLLATPQLYSAFSSLGCLEGDTYVVNPNALAILEEINYKLTYEDQTLRTFRRAIGFGQNVRSDLIPLLENAKDDAVLESVIRILVNLTVPVECLFSVDVMYRTDVGRHTIFELNKLLYTSKEAFTEARSTKSVVEYMKHILESDPKLSPHKCDQINNCLLLLRNILHIPETHAHCVMPMMQSMPHGISMQNTILWNLFIQSIDKLLLYLMTCPQRAFWGVTMVQLIALIYKDQHVSTLQKLLSLWFEASLSESSEDNESNTSPPKQGSGDSSPMLTSDPTSDSSDNGSNGRGMGGGMREGTAATLQEVSRKGQEYQNAMARVPADKPDGSEEASDMTGNDSEQPGSPEQSQPAGESMDDGDYEDQRHRQLNEHGEEDEDEDEVEEEEYLQLGPASEPLNLTQQPADKVNNTTNPTSSAPQGCLGNEPFKPPPPLPVRASTSAHAQMQKFNESSYASHVSAVKLGQKSPHAGQLQLTKGKCCPQKRECPSSQSELSDCGYGTQVENQESISTSSNDDDGPQGKPQHQKPPCNTKPRNKPRTIMSPMDKKELRRKKLVKRSKSSLINMKGLVQHTPTDDDISNLLKEFTVDFLLKGYSYLVEELHMQLLSNAKVPIDTSHFFWLVTYFLKFAAQLELDMEHIDTILTYDVLSYLTYEGVSLCEQLELNARQEGSDLKPYLRRMHLVVTAIREFLQAIDTYNKVTHLNEDDKAHLRQLQLQISEMSDLRCLFVLLLRRFNPSIHSKQYLQDLVVTNHILLLILDSSAKLGGCQTIRLSEHITQFATLEVMHYYGILLEDFNNNGEFVNDCIFTMMHHIGGDLGQIGVLFQPIILKTYSRIWEADYELCDDWSDLIEYVIHKFMNTPPKSPLTIPTTSLTEMTKEHNQEHTVCSWSQEEMDTLYWYYVQSKKNNDIVGKIVKLFSNNGNKLKTRISIIQQLLQQDIITLLEYDDLMKFEDAEYQRTLLTTPTSATTESGIEIKECAYGKPSDDVQILLDLIIKENKAQHLLWLQRILIECCFVKLTLRSGLKVPEGDHIMEPVAYHCICKQKSIPVVQWNNEQSTTMLYQPFVLLLHKLGIQLPADAGSIFARIPDYWTPETMYGLAKKLGPLDKLNLKFDASELEDATASSPSRYHHTGPRNSLSSVSSLDVDLGDTEELALIPEVDAAVEKAHAMASTPSPSEIFAVPKTKHCNSIIRYTPDPTPPVPNWLQLVMRSKCNHRTGPSGDPSDCIGSSSTTVDDEGFGKSISAATSQAASTSMSTVNPTTTLSLNMLNTFMGSHNENSSSSGCGGTVSSLSMVALMSTGAAGGGGNTSGLEMDVDASMKSSFERLEVNGSHFSRANNLDQEYSAMVASVYEKEKELNSDNVSLASDLTRMYVSDEDDRLERTEIRVPHYHLEGGSGMDKDCEMKRTTLDSPLGKLELSGCEQGLHRIIFLGKGTSAADAVEVPAPAAVLGGPEPLMQATAWLNAYFHQPEAIEEFPVPALHHPVFQQESFTRQVLWKLLKVVKFGEVISYSHLAALAGNPAATAAVKTALSGNPVPILIPCHRVVQGDLDVGGYEGGLAVKEWLLAHEGHRLGKPGLGGGGYPYDVPDYARTGGGSGSRLEEELRRRLTE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Drosophila melanogaster

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	785.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	160000

fit	/app/data/saxs_computation/dd/8dd7/8dd7.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dd/8dd7/8dd7.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dd/8dd7/8dd7.dat

The Cryo-EM structure of Drosophila Cryptochrome in complex with Timeless

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cryptochrome-1 fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cryptochrome-1 fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein timeless,Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)