Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–1480 | 突变:E1371Q | 无其他共同聚合物 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 6.90 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8EJ1 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1XMI Crystal structure of human F508A NBD1 domain with ATP 提交 2004-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
链 B
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
链 C
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
链 D
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
链 E
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
|
突变:F508A 突变:F508A 突变:F508A 突变:F508A 突变:F508A | MG MAGNESIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;PEG 400, glycerol, ethylene glycol, tris, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.265 |
| 1XMI Crystal structure of human F508A NBD1 domain with ATP 提交 2004-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
链 B
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
链 C
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
链 D
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
链 E
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
|
突变:F508A 突变:F508A 突变:F508A 突变:F508A 突变:F508A | MG MAGNESIUM ION × 10 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;PEG 400, glycerol, ethylene glycol, tris, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.265 |
| 1XMJ Crystal structure of human deltaF508 human NBD1 domain with ATP 提交 2004-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
388–678(291 aa)
片段:nucleotide binding domain one
|
突变:deltaF508 | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;PEG 4000, glycerol, ethylene glycol, tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.287 |
| 2BBO Human NBD1 with Phe508 提交 2005-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
389–678(290 aa)
片段:residues 389-678
|
突变:F409L, F429S, F433L, G550E, R553Q, R555K, H667R | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;280 K;30% PEG4000, 0.2M LiCl, 50mM Tris, pH 9, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.274 |
| 2BBS Human deltaF508 NBD1 with three solubilizing mutations 提交 2005-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
389–678(290 aa)
片段:residues 389-678
|
突变:F429S, F494N, Q636R | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;280 K;39% PEG4000, 0.1M LiCl, 50mM Tris, pH 9.0, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.291 |
| 2BBS Human deltaF508 NBD1 with three solubilizing mutations 提交 2005-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
389–678(290 aa)
片段:residues 389-678
|
突变:F429S, F494N, Q636R | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;280 K;39% PEG4000, 0.1M LiCl, 50mM Tris, pH 9.0, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.291 |
| 2BBT Human deltaF508 NBD1 with two solublizing mutations. 提交 2005-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
389–678(290 aa)
片段:residues 389-678
|
突变:F504N, Q646R | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;280 K;35% PEG4000, 0.2M LiCl, 50mM Tris pH 7.5, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.295 |
| 2BBT Human deltaF508 NBD1 with two solublizing mutations. 提交 2005-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
389–678(290 aa)
片段:residues 389-678
|
突变:F504N, Q646R | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;280 K;35% PEG4000, 0.2M LiCl, 50mM Tris pH 7.5, 3mM ATP, 5mM MgCl2, 2mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.295 |
| 2LOB PDZ Domain of CAL (Cystic Fibrosis Transmembrane Regulator-Associated Ligand) 提交 2012-01-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1473–1480(8 aa)
片段:PDZ-binding motif residues 1473-1480
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;310 K;离子强度(mmCIF原始值)1.0;压力 ambient
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2PZE Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer 提交 2007-05-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–404(18 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646(del405-436)
链 A
437–646(210 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646(del405-436)
|
突变:del405-436 突变:del405-436 | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;281 K;Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Hepes pH 7.5, 25% PEG 6K; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.247 |
| 2PZE Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer 提交 2007-05-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
387–404(18 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646(del405-436)
链 B
437–646(210 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646(del405-436)
|
突变:del405-436 突变:del405-436 | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;281 K;Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Hepes pH 7.5, 25% PEG 6K; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.247 |
| 2PZF Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer with delta F508 提交 2007-05-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–404(18 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646
链 A
437–646(210 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646
|
突变:del405-436, delF508 突变:del405-436, delF508 | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;281 K;Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Tris pH 8.5, 35% PEG 4K, 0.2M NaAcetate; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 2PZF Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer with delta F508 提交 2007-05-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
387–404(18 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646
链 B
437–646(210 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646
|
突变:del405-436, delF508 突变:del405-436, delF508 | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;281 K;Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Tris pH 8.5, 35% PEG 4K, 0.2M NaAcetate; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 2PZF Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a head-to-tail dimer with delta F508 提交 2007-05-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
387–404(18 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646
链 A
437–646(210 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646
链 B
387–404(18 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646
链 B
437–646(210 aa)
片段:CFTR NBD1 387-646
|
突变:del405-436, delF508 突变:del405-436, delF508 突变:del405-436, delF508 突变:del405-436, delF508 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;281 K;Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Tris pH 8.5, 35% PEG 4K, 0.2M NaAcetate; Cryo: 25% DMSO, vapor diffusion, temperature 281K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 2PZG Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a monomer 提交 2007-05-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
375–404(30 aa)
片段:CFTR NBD1 375-646(del405-436)
链 A
437–646(210 aa)
片段:CFTR NBD1 375-646(del405-436)
|
突变:del405-436 突变:del405-436 | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;281 K;Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Hepes pH 6.5, 25% PEG 10K ; Cryo: 25% glycerol, vapor diffusion, temperature 281K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 2PZG Minimal human CFTR first nucleotide binding domain as a monomer 提交 2007-05-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
375–404(30 aa)
片段:CFTR NBD1 375-646(del405-436)
链 B
437–646(210 aa)
片段:CFTR NBD1 375-646(del405-436)
|
突变:del405-436 突变:del405-436 | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;281 K;Protein: 9.5mg/ml NBD1, 0.15M NaCl, 0.01M methionine, 0.01M HEPES pH 7.5, 10% glycerol, 0.001M TCEP, 0.002M ATP; Well: 0.1M Hepes pH 6.5, 25% PEG 10K ; Cryo: 25% glycerol, vapor diffusion, temperature 281K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1193–1427(235 aa)
|
突变:Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D | B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1193–1427(235 aa)
|
突变:Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D | B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1193–1427(235 aa)
|
突变:Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D | B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1193–1427(235 aa)
|
突变:Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D | B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 3GD7 Crystal structure of human NBD2 complexed with N6-Phenylethyl-ATP (P-ATP) 提交 2009-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1193–1427(235 aa)
链 B
1193–1427(235 aa)
链 C
1193–1427(235 aa)
链 D
1193–1427(235 aa)
|
突变:Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D 突变:Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D 突变:Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D 突变:Q1280E, Y1307N, E1308A, Q1309A, W1310H, H1402A, Q1411D | B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;277 K;1.1-1.25 M tri-sodium citrate, pH 5.5-8, sitting drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.308 |
| 3ISW Crystal structure of filamin-A immunoglobulin-like repeat 21 bound to an N-terminal peptide of CFTR 提交 2009-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
5–22(18 aa)
片段:UNP residues 5-22
|
突变:R21A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0.1M Bis-Tris Propane pH 7.0, 60% Tacsimate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.298 |
| 4WZ6 Human CFTR aa389-678 (NBD1), deltaF508 with three solubilizing mutations, bound ATP 提交 2014-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
389–678(290 aa)
片段:UNP residues 389-678
|
突变:F429S, F494N, deltaF508, Q637R | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;283 K;0.2M Magnesium Chloride, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 33% PEG 4000
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.239 |
| 5D2D Crystal structure of human 14-3-3 zeta in complex with CFTR R-domain peptide pS753-pS768 提交 2015-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
747–774(28 aa)
片段:UNP residues 747-774
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;HEPES, NaCl, DTT, Li2SO4, Glycine, K2HPO4
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.220 |
| 5D3E Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CFTR R-domain peptide pS768-pS795 提交 2015-08-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
762–801(40 aa)
片段:UNP residues 762-801
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;HEPES, NaCl, DTT, (NH4)2SO4, Poly(acrylic acid sodium salt 2100
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.244 |
| 5D3E Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CFTR R-domain peptide pS768-pS795 提交 2015-08-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
762–801(40 aa)
片段:UNP residues 762-801
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;HEPES, NaCl, DTT, (NH4)2SO4, Poly(acrylic acid sodium salt 2100
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.244 |
| 5D3E Crystal structure of human 14-3-3 gamma in complex with CFTR R-domain peptide pS768-pS795 提交 2015-08-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 K
762–801(40 aa)
片段:UNP residues 762-801
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;HEPES, NaCl, DTT, (NH4)2SO4, Poly(acrylic acid sodium salt 2100
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.244 |
| 5D3F Crystal structure of human 14-3-3 zeta in complex with CFTR R-domain peptide pS753-pS768 and stabilizer fusicoccin-A 提交 2015-08-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
747–774(28 aa)
片段:UNP residues 747-774
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | FSC FUSICOCCIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;HEPES, NaCl, DTT, PEG6000
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.303 |
| 5TF7 Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with ATP 提交 2016-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;279 K;40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.200 |
| 5TF8 Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dTTP 提交 2016-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;279 K;Protein buffer:containing 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5, Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.187 |
| 5TFA Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dUTP 提交 2016-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;279 K;Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5;
Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.195 |
| 5TFB Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with 7-methyl-GTP 提交 2016-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | MG MAGNESIUM ION × 1 MGP 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;279 K;Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5
Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.199 |
| 5TFC Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with GTP 提交 2016-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;279 K;Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5;
Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.201 |
| 5TFD Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with CTP 提交 2016-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | MG MAGNESIUM ION × 1 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;279 K;Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5;
Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.195 |
| 5TFF Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with UTP 提交 2016-09-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | MG MAGNESIUM ION × 1 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;279 K;Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5;
Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.190 |
| 5TFG Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with 5-methyl-UTP 提交 2016-09-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | MG MAGNESIUM ION × 1 M5T 5-Methyluridine triphosphate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;279 K;Protein buffer: 150 mM NaCl, 30% (v/v) glycerol, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5;
Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.184 |
| 5TFI Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dGTP 提交 2016-09-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | MG MAGNESIUM ION × 1 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;279 K;Protein buffer: 150 mM NaCl, 10% (v/v) glycerol,10% (v/v) Ethylene glycol, 10mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5. Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.201 |
| 5TFJ Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dCTP 提交 2016-09-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | MG MAGNESIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;279 K;Protein buffer: 150 mM NaCl, 10% (v/v) glycerol,10% (v/v) Ethylene glycol, 10mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5. Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.185 |
| 5TGK Nucleotide-binding domain 1 of the human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with dATP 提交 2016-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–646(260 aa)
片段:Nucleotide-binding domain 1 (UNP residues 387-646)
|
突变:V470M | MG MAGNESIUM ION × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;279 K;Protein buffer: 150 mM NaCl, 10% (v/v) glycerol,10% (v/v) Ethylene glycol, 10mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 20 mM Na-HEPES, pH 7.5. Precipitant buffer: 40% (v/v) PEG 400, 100 mM NH4Cl, and 100 mM MES, pH 6
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.198 |
| 5UAK Dephosphorylated, ATP-free human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) 提交 2016-12-19 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.87 Å |
| 6HEP Crystal structure of human 14-3-3 beta in complex with CFTR R-domain peptide pS753-pS768 提交 2018-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 E
747–774(28 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ETE 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;278 K;0.1M Tris, 25% v/v PEG350 MME
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.251 |
| 6HEP Crystal structure of human 14-3-3 beta in complex with CFTR R-domain peptide pS753-pS768 提交 2018-08-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 F
747–774(28 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ETE 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;278 K;0.1M Tris, 25% v/v PEG350 MME
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.251 |
| 6MSM Phosphorylated, ATP-bound human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) 提交 2018-10-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1371Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6O1V Complex of human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) and GLPG1837 提交 2019-02-21 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
未记录 | LJP N-(3-carbamoyl-5,5,7,7-tetramethyl-4,7-dihydro-5H-thieno[2,3-c]pyran-2-yl)-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6O2P Complex of ivacaftor with cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) 提交 2019-02-24 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 AJP Digitonin × 1 VX7 N-(2,4-di-tert-butyl-5-hydroxyphenyl)-4-oxo-1,4-dihydroquinoline-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6RQR Extended NHERF1 PDZ2 domain in complex with the PDZ-binding motif of CFTR 提交 2019-05-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1477–1480(4 aa)
链 B
1477–1480(4 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;288 K;1.65 M ammonium sulphate, 100 mM tri-sodium citrate pH 5.6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.233 |
| 6UK1 Crystal structure of nucleotide-binding domain 2 (NBD2) of the human Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) 提交 2019-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1202–1430(229 aa)
|
突变:S1255L,Q1280E,K1292D,Y1307N,K1334G,S1359A,Q1411D,H1402A,Q1411D | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;277 K;24% PEG 8000, 100 mM Li2SO4, 10mM NaBr, 100 mM Bis-Tris Propane pH 6.0
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.304 |
| 6UK1 Crystal structure of nucleotide-binding domain 2 (NBD2) of the human Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) 提交 2019-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1202–1430(229 aa)
|
突变:S1255L,Q1280E,K1292D,Y1307N,K1334G,S1359A,Q1411D,H1402A,Q1411D | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;277 K;24% PEG 8000, 100 mM Li2SO4, 10mM NaBr, 100 mM Bis-Tris Propane pH 6.0
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.304 |
| 6UK1 Crystal structure of nucleotide-binding domain 2 (NBD2) of the human Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) 提交 2019-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1202–1430(229 aa)
|
突变:S1255L,Q1280E,K1292D,Y1307N,K1334G,S1359A,Q1411D,H1402A,Q1411D | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;277 K;24% PEG 8000, 100 mM Li2SO4, 10mM NaBr, 100 mM Bis-Tris Propane pH 6.0
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.304 |
| 6UK1 Crystal structure of nucleotide-binding domain 2 (NBD2) of the human Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) 提交 2019-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1202–1430(229 aa)
|
突变:S1255L,Q1280E,K1292D,Y1307N,K1334G,S1359A,Q1411D,H1402A,Q1411D | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;277 K;24% PEG 8000, 100 mM Li2SO4, 10mM NaBr, 100 mM Bis-Tris Propane pH 6.0
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.304 |
| 6WBS Human CFTR first nucleotide binding domain with dF508/V510D 提交 2020-03-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
388–646(259 aa)
|
突变:deltaF508, V510D, delta405-436 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;CFTR NBD1 V510D in buffer A was crystallized by mixing equal amounts of protein at 6 mg/mL with 0.1 M Tris pH 7.6, 28% (w/v) polyethylene glycol 10,000. Crystallization was induced by streak-seeding using crystals grown in 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) polyethylene glycol 550 monomethylether, and plates incubated at 4C. Crystals grew over several days and were frozen by quick dip in reservoir solution supplemented with 25% (w/v) ethylene glycol
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.213 |
| 6WBS Human CFTR first nucleotide binding domain with dF508/V510D 提交 2020-03-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
388–646(259 aa)
|
突变:deltaF508, V510D, delta405-436 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;CFTR NBD1 V510D in buffer A was crystallized by mixing equal amounts of protein at 6 mg/mL with 0.1 M Tris pH 7.6, 28% (w/v) polyethylene glycol 10,000. Crystallization was induced by streak-seeding using crystals grown in 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% (w/v) polyethylene glycol 550 monomethylether, and plates incubated at 4C. Crystals grew over several days and were frozen by quick dip in reservoir solution supplemented with 25% (w/v) ethylene glycol
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.213 |
| 7QI1 Crystal structure of human 14-3-3 protein beta in complex with CFTR peptide pS753pS768 and PPI stabilizer CY007424 提交 2021-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric |
链 E
747–774(28 aa)
链 F
747–774(28 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ARG ARGININE × 2 Q95 [2-(2-methylphenyl)sulfanylphenyl]methanamine × 2 TYR TYROSINE × 2 GLN GLUTAMINE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;Qiagen Cryos Suite #44 (0.09 M HEPES sodium salt pH7.5, 1.26M tri-sodium citrate, 10% (v/v) glycerol) with an extra 2% (v/v) of glycerol.
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.241 |
| 7SV7 The complex of phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with ATP/Mg and Tezacaftor (VX-661) 提交 2021-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1371Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 DD9 nonane × 2 D12 DODECANE × 4 CLR CHOLESTEROL × 2 C14 TETRADECANE × 1 PJ8 heptadecane × 1 CV6 Tezacaftor × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7SVD The complex of phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with ATP/Mg and Lumacaftor (VX-809) 提交 2021-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1371Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 D12 DODECANE × 1 D10 DECANE × 2 CLR CHOLESTEROL × 3 VX8 Lumacaftor × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7SVR The complex of dephosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) and Lumacaftor (VX-809) 提交 2021-11-19 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
未记录 | VX8 Lumacaftor × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8EIG The complex of phosphorylated human delta F508 cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with elexacaftor (VX-445) and ATP/Mg 提交 2022-09-15 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1371Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 WJX (6P)-N-(1,3-dimethyl-1H-pyrazole-4-sulfonyl)-6-[3-(3,3,3-trifluoro-2,2-dimethylpropoxy)-1H-pyrazol-1-yl]-2-[(4S)-2,2,4-trimethylpyrrolidin-1-yl]pyridine-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8EIO The complex of phosphorylated human delta F508 cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with elexacaftor (VX-445), lumacaftor (VX-809) and ATP/Mg 提交 2022-09-15 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1371Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 D12 DODECANE × 1 VX8 Lumacaftor × 1 WJX (6P)-N-(1,3-dimethyl-1H-pyrazole-4-sulfonyl)-6-[3-(3,3,3-trifluoro-2,2-dimethylpropoxy)-1H-pyrazol-1-yl]-2-[(4S)-2,2,4-trimethylpyrrolidin-1-yl]pyridine-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8EIQ The complex of phosphorylated human delta F508 cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with Trikafta [elexacaftor (VX-445), tezacaftor (VX-661), ivacaftor (VX-770)] and ATP/Mg 提交 2022-09-15 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1370Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 D12 DODECANE × 1 VX7 N-(2,4-di-tert-butyl-5-hydroxyphenyl)-4-oxo-1,4-dihydroquinoline-3-carboxamide × 1 WJX (6P)-N-(1,3-dimethyl-1H-pyrazole-4-sulfonyl)-6-[3-(3,3,3-trifluoro-2,2-dimethylpropoxy)-1H-pyrazol-1-yl]-2-[(4S)-2,2,4-trimethylpyrrolidin-1-yl]pyridine-3-carboxamide × 1 CV6 Tezacaftor × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8FZQ Dehosphorylated, ATP-bound human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) 提交 2023-01-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 8GLS Complex of human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) and Z1834339853 提交 2023-03-23 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ZRH (2S)-1-(3-amino-6-fluoro-1H-indazol-1-yl)-2-methyl-3-phenoxypropan-1-one × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8UBR Complex of the phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with CFTRinh-172 and ATP/Mg 提交 2023-09-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1371Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 WG5 4-[(Z)-{(3M)-4-oxo-2-sulfanylidene-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,3-thiazolidin-5-ylidene}methyl]benzoic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8V7Z Phosphorylated, ATP-bound, E1371Q human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (E1371Q-CFTR) 提交 2023-12-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
11–1431(1421 aa)
|
突变:E1371Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8V81 Phosphorylated, ATP-bound, inhibitor 172-bound E1371Q human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator 提交 2023-12-04 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–1440(1438 aa)
|
突变:E1371Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 CLR CHOLESTEROL × 1 WG5 4-[(Z)-{(3M)-4-oxo-2-sulfanylidene-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,3-thiazolidin-5-ylidene}methyl]benzoic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9DW4 Dephosphorylated CFTR in 1:1 complex with PKA-C (site II) 提交 2024-10-08 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 9DW5 Dephosphorylated CFTR in 1:1 complex with PKA-C (site I) 提交 2024-10-08 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9DW7 Dephosphorylated CFTR in 1:2 complex with PKA-C 提交 2024-10-08 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.00 Å |
| 9DW8 Dephosphorylated (E1371Q)CFTR in complex with PKA-C 提交 2024-10-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1371Q | B44 N-(2-phenylethyl)adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9DW9 Phosphorylated (E1371Q)CFTR in complex with PKA-C 提交 2024-10-08 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1371Q 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CLR CHOLESTEROL × 1 D10 DECANE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CL CHLORIDE ION × 4 UND UNDECANE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9MXL Complex of the phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with (R)-BPO-27 and ATP/Mg 提交 2025-01-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–1480(1480 aa)
|
突变:E1371Q | A1BUJ (6R,12R)-6-(5-bromofuran-2-yl)-7,9-dimethyl-8,10-dioxo-11-phenyl-7,8,9,10-tetrahydro-6H-pyrimido[4',5':3,4]pyrrolo[2,1-c][1,4]benzoxazine-2-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.10 Å |
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| UniProt名称 | CFTR_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–1479; UniProt 1–1480 |