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8fak

DNA replication fork binding triggers structural changes in the PriA DNA helicase that regulate the PriA-PriB replication restart pathway in E. coli

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Primosomal replication protein N

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P07013

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 3 DNA 3 ;DNA (5'-D(P*CP*AP*GP*AP*CP*TP*CP*AP*TP*TP*TP*AP*GP*CP*CP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*CP*G)-3') ; × 1 ;Primosomal protein N' ; × 1 （P17888） ;DNA (5'-D(P*CP*GP*GP*AP*TP*AP*AP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*AP*GP*CP*AP*CP*GP*CP*CP*GP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*CP*GP*GP*CP*GP*TP*GP*CP*TP*C)-3') ; × 1 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
1txy 1v1q 1woc 1woc 2pnh

共 5 个 assembly

同源四聚体
1woc

共 1 个 assembly

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2ccz 8fak 9zbt 9zbu

共 4 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRIB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104 作者链 B； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104

;Primosomal protein N' ;

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P17888

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 3 DNA 3 Primosomal replication protein N × 2 （P07013） ;DNA (5'-D(P*CP*AP*GP*AP*CP*TP*CP*AP*TP*TP*TP*AP*GP*CP*CP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*CP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*CP*GP*GP*AP*TP*AP*AP*GP*GP*GP*CP*TP*GP*AP*GP*CP*AP*CP*GP*CP*CP*GP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*TP*CP*GP*GP*CP*GP*TP*GP*CP*TP*C)-3') ; × 1 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
6dcr 6dcr

共 2 个 assembly

同源二聚体
2d7e 2d7e

共 2 个 assembly

同源四聚体
2d7e 2d7e

共 2 个 assembly

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2d7g 2d7g 2d7h 2dwl 2dwl 2dwm 2dwm 2dwn 2dwn 2dwn 2dwn 8fak

共 14 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRIA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–732； UniProt 1–732

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8fak
沉积日期 deposition_date2022-11-28
结构标题 titleDNA replication fork binding triggers structural changes in the PriA DNA helicase that regulate the PriA-PriB replication restart pathway in E. coli
关键词 keywordsPriA, PriB, replication restart, E. coli, HELICASE-DNA complex; HELICASE/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8fak__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8fak__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8fak__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）35.44 Å
Rg（电子密度）35.38 Å
总 Rg35.74 Å
原子数14963
残基数894
排除体积133510 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8fak__assembly_1__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 引用文献 (1)