8fru

60S subunit of the Giardia lamblia 80S ribosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 272.3 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	8fru
沉积日期 deposition_date	2023-01-08
结构标题 title	60S subunit of the Giardia lamblia 80S ribosome
关键词 keywords	Giardia lamblia, Ribosome structure, Translation, parasite, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	73.15 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	75.08 Å
零角强度 I(0) i0	72300800000.00
分子量 molecular_weight	1586300.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1694300 Å³
包络体积 envelope_volume	2805100 Å³
水化壳体积 shell_volume	283980 Å³
包络直径 envelope_diameter	263.6 Å
壳层 Rg shell_rg	88.43 Å
包络 Rg envelope_rg	74.97 Å
形状 Rg shape_rg	75.21 Å
总 Rg total_rg	74.88 Å
总原子数 total_atoms	137869
残基数 n_residues	8679
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	272.3 Å
Rg (实空间) rg_real	76.22 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.69 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.2320e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6360e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal	73.88 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	72440000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8821
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	90.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.537
峰度 Kurtosis kurtosis	0.375
角度范围 angular_range	— – 0.1050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.9540
最高正则化参数 α highest_alpha	11330000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	22
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.655; Stabil: 0.891; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.948; Smooth: 0.897

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (49)

Entity 1 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL3
分子量 formula_weight	42688.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	140991

MSHRKFSCCRKGNLGYLPRKRCTRGRGRCKTFPPDVQGAPIHLTAFLGYKAGCTHVMRFIDHRGSNLHNRQAIDQATIIDAPPMICTAIIGYAKTPKGLRAVTTVWAAHIAEPAMRRFYRNYFHAEKTAFSTYMKKAADGTYIKEQLGRLKQHADVIRIVAHTQPALTPLKQKKADIMEIQVNGGASVAEKVDYAYALMEKPISIKDVFSVGAQIDTISITRGRGFEGVVTRWGVTRLPRKTRRGNRKVACIGAWHPANVQYTVARAGQMGYFHRTDTNKQVFMIDTAENPRCCTTEFDLTDKSINPVGGFVNYGRVQGDFIMIKGTCPGPKRRPVVMRNALLPHRNCPPVQLQWISTASKFGHGIFETVEERRQFYAK

Entity 2 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL15
分子量 formula_weight	17167.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MPTRIRKSRKRRGHRQMGYGRVGGHRKHPSGRGKAGGLQHKRTSFDKYHPGYFGKLGMRNYHVRRNIEYNPTINIDKIWSLIPEEQRDGFLQRKSTTEAPVVDVTRFGFFKVLGRGSLPQCPIIIKARYFSSDAEKKLREVGGVPLLVP

Entity 3 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL4
分子量 formula_weight	35048.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MNPTVKVFGPTGTQVAELPRPKVFNVPLRPDIINFVHTQLRKCLRTPYAVSRYAGVQCTAHSWGPGRAVARLPRKHGGIGAYANFARGGHMAHPTTVIRRWCRKVNLNQRRYAVASALAASANAALVEARGHRIADVPSIPLVVDTDNVTKTKDALAIIKAVGVLRDVERCKDSRHIRAGRGKMRNRRYITRKGPLVIYNTEDVARGFRNLPGVDLCHVSSIRLLELAPGSHPGRLILWTKSAFASLDDVYAAKQNYTLPRSCITQTDIERILQSDAVQKTFVPKRDPLVIERKVDPFSSKEALARLDPSGTVMPK

Entity 4 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL16
分子量 formula_weight	24283.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MGRRPARCYRYQKNKPYPKSRFCRGVPDPKIRYFDLGNRRAKVNDFPYCFHLLSGEKEQVSSEALEACRIACNKYIAKKAGKDSFHLRIRVHPFHVIRINKMLSCAGADRLQTGMRGAWGKPQGTVARVSIGQPLLSVRCRASAKDYVKDALRRAKFKIPGRQAIVESRNWGFTEFTKEEYEDLRERGELQYDGNNAHRISRKGPLNLKL

Entity 5 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL43
分子量 formula_weight	10508.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	p

MAKRTKKVGLTGKYGTRYGRAARKQLLKIETSQKAKYTCPFCAKDKVRRTACGIWTCRSCSKTMAGGAYSLHTEPANAARATIRRLRLAREDAQ

Entity 6 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL18
分子量 formula_weight	33961.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MGWVKVQKTRSYFKRFQVQFRRRREGKTDYQARKALIIQDKNKYATPRYRFVVRRTNKDIICQVTAAELTKDRVVCAAYSHELPRYGIPVGLTNYAAAYATGLLCGRRLLEKLSVGIKENALAQLYPGLDKATGEEYHPDENENEEVHAFKAFLDIGLARASTGARVFAAMKGAVDAGLNIPHSMKRFPGYSKDGFDSSALRDRIMGKHVGDYMAELKAEDEETYRKRFSKYIAAKVEPLRLEAMYTKAHAAIRANPQAVKAKFEIKKPVRQARLTLKERKERIDAKKLEALKQLTK

Entity 7 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL6
分子量 formula_weight	20889.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MPLCSSMTIKVPTDVECTINKRVVTVKGKKGTLVRDFSHAPLDITHANDTISVAVWFPRGKRNALPRTICSHIENMFKGVTYGFEYKMRLAYAHFPIAATVVDNNKAIEIRNFMHQIKTRRIECLPGVTIAMSTNVKDELILRGISIEDVSHTAARIHESLKVPNKDLRKFLDGCYVSSRGLQEQ

Entity 8 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL8
分子量 formula_weight	25427.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MSKVSGSDIKRALAVPENKSRSKCDFDLTPFVRWPRQVRIQRQKAVLQRRLKVPPTVNQFMNPISRNLTNEIFNLARKYSPESKEEHKARLLQIADAKANGKPLPEKSDKLVIASGIRRITSLVESKRAKLVLIANDVDPLELVLWLPTLCHKMGVPYAIVRTKGDLGKLVHLKKTTSVCFTDVNPEDKPTFDKILAAVAHEVDYAKAMKTYGGGVRREDEAQQM

Entity 9 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL5
分子量 formula_weight	19767.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MSQESENPMRRIRIEKLVLNICIGGEGDALTKAAKVLQQLTDQEPTFSKSRLTIRGFGIRRGQKISTHVTVRGEKAREIIERGLRVKNFELPYSCFSTTGNFGFGITEHIDLGIKYDPSMGIYGMDFYVVLSRPGFRVNKRRAQQQHVGASHKITPDEARAWVEREFEVVYTK

Entity 10 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL13
分子量 formula_weight	22921.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MSRIVIDCKGHILGRLSAIVAKELLHGHEVALVRCEKAIISGAFRDVKAHYLKKMHKRTNFNHLRGPFHFRAPAEIVRRTIRGMIPYKTVRGSDAMSRLRVYDGIPPCCARYKRVVCPSAMAYLCLRPERRRCEVGRVAHEIGWQHAADVERYEKRRLEECDKWYQDKIQIDKKIAEAAEKDAELQRINAELAKYGY

Entity 11 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL13
分子量 formula_weight	26640.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MASYASFILRLIHFNLNFVTAFCPLPRAMGRNVAFSNMRRYKCTNKGPNLIKNWFNQPARKIRRRQTRLQKAKAIFPCPLQKLRPSVTRCSQKFNLTQRIGRGFTLRELQGVGLSAGKARQIGIAVDPRRKNKSEESVARNVARLKEYLSKVTIFSKQAKPEEIQQAIQHQGVVMPVVNPKPVITTGSIAEAKKEVPENLFMYLRNARTARNRARLAKRDAEREAAAKTKGGKK

Entity 12 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL14
分子量 formula_weight	14785.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MSYHRFVEAGRLVYLGDGPDKGKLAVIVDILSTAAVLIDGPTTGVKRQVVSLRWAMLTDQVINISEKPTTEQLKKEIEASPAIDTFMNSVWGKKIQQQRLRAKATFEDMGKIAKLRRERKMAMKRIAMSIK

Entity 13 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL15
分子量 formula_weight	24353.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MGAYKYVQELWRKKQSEALHYLFRLRTWEYRQLNAIKRCSHPTRPEKARRLGYKAKRGYVVYRVRVRRGGRKRQCVHGISYGKPRNIGIVGLKPSRSLRALAEQKVGRRLPSLRVLNSYWVAQDGSYKWYEVILIDPFHPWIRNDPKINWICNPVMKRRECRGLTSAGRKARGLHNKGIGAMKLRPSKRAAWKRNHTRSLRRYR

Entity 14 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL18
分子量 formula_weight	20207.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MGIDLKTGIKKRKVERKEPKSPNPYIRLLHNAFKVVYENTGEDFTKVLTKRLCLSKTNRPVLSVSRLAHLMHKREDKIAVVASTVTNDERLVTIPRMTICALKFSATARSRIEKAGGRCMSFDELLAEKPTGDNCVLLQGRRSCRAVCKKFGSPGRPNSHVKPKGEHKGRRGARGRHSW

Entity 15 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL20
分子量 formula_weight	24389.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MDAWTVLLFYQVLKQFQSEFVDALKSRAETRGMMQKYIVYGRRLPSEKFPEPEVFRMTIYAPNEIVAKSRFWYHLKSLKKIKRTHGEILDCQHIEENGDFVKNFGVLLRYRSRVGQHNMYREVRETTSARAMDKVYSEMAGQCRARYHDIQIINVKEVADEDVRREKVAMFTQKGVRFPHPCPYVHVKRAARTARFQDRAPHVPQ

Entity 16 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL19
分子量 formula_weight	23199.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MANLRLQKRLAADVLKCGKRRVRFNPAHEKYIEQASSREAIRSLIESKIIAKLDIKGSSRGRIRARHAAKRLGRHSGHGKRRGTREARMPSKTLWIQRQRVLRRLLSRYRDDEKIDRHLYETLYAKAKGNMFKNKRVLLEHIVGMQKEQELEKKKKEELEQRRKKAEQRCKERAEKVAANRLAFAQTGIFTEKTNK

Entity 17 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL21
分子量 formula_weight	18296.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MTHSQGYRCKTRYCFARKFRRHGMANLTTYNRVYKLGQYVNIKVNGAYHKGMPHRYYNGRTGTIFNIGPRALGVQIQKRVRGRIMLKRINVRLEHVHPSDCRKNHLERVAANDAARRLAKETGQPVPCLKRQNALPRAAHVVSIASAIDITPLKYDGVF

Entity 18 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL14
分子量 formula_weight	15450.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MASKRGRSGGIGNKFRISCGLPVGAVINCADNSGAKSLNMIAVKNWKGHLNRFPKASVGDMVLITVGRDGKPELRRKVTPAVVVRQRKVWRRKDGVWIYFQDNAGVIINPKGELKGSSITGPVAKEAADRWPKISTTAECVH

Entity 19 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL22
分子量 formula_weight	18722.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MVKYAFKSDNLLVGKSRRDGVKASFKNTYSTCRAIKGMGVKRAFAYLDNVLNHKEIVPFFKFYKGVGRHSQARGSGTDKGRWPEKSVVVVKDILKQAVSNAKHAHKKEEDELYVISYCVNRARGRRRRTFRAHGRISKYESQPCHVELIVGPKPLDVEKAKALQ

Entity 20 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL23
分子量 formula_weight	16053.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MSEKAQALKAQKAILHGTRVEAKKIRTNVHFFRPKTLVHKKAPLYPRNPIKKGSWDDPCDLLRYPIKTDENTTQIEKNNTIVFIVDRRASKPEIRKAFETVFETKVARVNTLITPLGLKKAFIRLAPDVQAMDVASKMGLA

Entity 21 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL24
分子量 formula_weight	15621.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MKLNSAVTASRRKCRKAYFTANAETRAKMMSSRLSKELRAEHKIKTMPIRRGDIVEIFTGGHKGTGKVVEVRRRDYKICVEGINQKARNPEAKPVPYPIHPSNCIIKELYMNGSRYRAIKRRQERNAERLARIGK

Entity 22 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL24
分子量 formula_weight	12005.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MVTTNQCSYSGRKILPGYGKRMSRHDKVLLIFLNRKASVHYLNKWNPRKIRWTLASRRARGKEVIVKARERVTRKAVVSKRNFLSIDDSKLEALKSKYSRVN

Entity 23 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL27
分子量 formula_weight	15374.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MSQPIIKPGLVCIVLQGRHAGKKAVIVEALPHNERGSYAIVAGIAALPRRITNSMSDEEAVCRGRVRSFVKCMNVNHLMPTSCRLENNYKDFISTQTVADVTKRREIIETVNKDFQRRILEHRDTWFFTKLPIDA

Entity 24 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL29
分子量 formula_weight	7363.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MAKLKNHTSKNQNRKDHRNGIKKPKKSAYTSHKGMCPKYLRNLRRSRANDPRQSLRPNLNKE

Entity 25 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL29
分子量 formula_weight	14316.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h

MPGLKAKDLIGLSQEDLQRKLADLKRELLSLRTMKATAGPVPERIARFRVCKKDVARVLTIINQKARDEARAAFEGAKYIPKTFRPKLTHAMRCQLTDKQKRLLPNKVMKRKLQFPKLKYAVKV

Entity 26 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL30
分子量 formula_weight	27103.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MPIPELVLKHRRKVQRDIRSAAERATEKEKRAALVKDHAVKSAQVYARYYIDLVESEKKARENALKNNQLYVPDEPKVYLVVRIRGIVGVAPKVRTILSLLRLRQINNAVFMRCNKATLNALRIVDHYVTYGEPTVETIRNLIYKRGFAKVNGQRIPIVDNNLIDEQLSKHNILCAEDLVHEIFTCGSSFKEANNFLWPFQLNSAALKDKRNNFAEGGDFGYRGKYINEFVARMI

Entity 27 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL31
分子量 formula_weight	12184.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MGIVYEHTIRLNKAVRGKPSKKAAPIAIRAIRAQVEKLAKVEDVRLDPSVNVFVWSRGIRHVPRRIRLEVRLEGDDEHKFAYVINKDVENFKHLTTEKKGSEDGSE

Entity 28 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL32
分子量 formula_weight	15986.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MAGEMIHPLPHKIIIKKRKNKFIRFQSERFVRVKPSWRKPRGIDSPMRHQYRGQRPMVSIGYGSDKETRFMLPCGFFKHRISTVHELKTLFMNNKTHAAQIAHGVSARSRKQILEEAKKMGVRVLNADAKLRKEEL

Entity 29 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL34
分子量 formula_weight	13528.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g

MADCRVTCRFHSTYRTRSKIVRYKRTPGNRLTSLRVKKLPNAPHCAETGKQIHGIPRVIPQHLTRQQRKVSRPYGGKLCGSALRAHILESFLNEENQALREIAAQTAKTAKQTAGKGHAK

Entity 30 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL33
分子量 formula_weight	13913.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MEEIKGKTFLPAIFVGYQRSRAKQRENVALVKVSGIYTRAETDKVLGRLIAIIHSKSGKPIFGKICRPHGNSGMVRARFYTNLPGQLMGHKVRVFYDNIDVGDRATPKYERLYGNPNATVTYE

Entity 31 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL36
分子量 formula_weight	10586.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MPGKVFNLKKGGAVVRIVRKKEERKTKPHQEFVKSIIQECTGMAPYEMHIIELLRMNKDRHALRYAKKRLGNIKRAKAKRDQLSVYARNI

Entity 32 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL38
分子量 formula_weight	8605.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

MPNTITEENLMKMIADGRGKKLVVKSCSKGRLQGKVKLKLRTAKYLYTLTVPNADDAKSIVKGCKDKVEVQYVNDSE

Entity 33 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL42
分子量 formula_weight	12311.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	o

MVTYPAERRTFCKREGKHTVHKASLYKKGKDSLLAQGKRRYDRKQRGFGGQTKPIFRRKAKTTKKQVIRLTCSSCKCQTFQVLKRCHRLEISRLGATKKSKGSVVF

Entity 34 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL22
分子量 formula_weight	19942.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MEGQWILFPDQIVNHLCRHADHRLQARVSSKSNLKSNYAYYFSPSSEMRPRIKKCVKKEQGNIRFAVDCSAGKDLELNLNEFADYVRTHFKINNRKHGVAEKVACSVEGDSLVIQTTGYEFAKRYVKYLTKRFLYQDYQGVFRVLSTDKETYTLKPYTIEDDDDEAGTDDE

Entity 35 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL30
分子量 formula_weight	11698.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MSTKVATKKAQDSISLTLTLVVKSGKYTLGTDQAIRNIRDGKAQLVFMANNCPPLVKSQVDYLCHLSKTPVRVFAGSSRELGIAVGRQFNVSIMTILEAGDADLTSILG

Entity 36 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL37
分子量 formula_weight	11473.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

MELVAVKNGNSMSKGTASFGKRHTRIHGSCRRCGKHSFHLQKHECASCGYPSAKMRRYNWSYKSLRRRTQGTGSMSHMRKVYRAYNSGTLKANARKYLAK

Entity 37 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL39
分子量 formula_weight	6527.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	l

MSANKTLERKLRLGKKIRMNKNIPRWVILKDKLKKRWNYKRHHWRRSHLKL

Entity 38 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL40
分子量 formula_weight	14343.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m

MQLIVRSLDRTVALTASPADSLTSIRQRLLAVYSGHVVDSQRFVFAGRTLDEAKTLGDYSIGESSVLDLVPRLFGGVMEPTLINLAREYNQNMMICRHCYARNPLRATNCRRCRGTNLRKKKLSKYA

Entity 39 polymer

描述 description	60S ribosomal protein uL2
分子量 formula_weight	27090.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MGRRIRVQRKGAGSVFRAHVARRLGAAKLRANDFAERTGSVRGVVKAILHDRGRGAPLARVQFPNMRGEGRVNELFIAPEGMYTGQEVFSGNKATLHIGNILPVGNIPEGTYVCNVEEKPMDRGCLARASGTYCLVVAHNMETNKTRIRLPSGQKKLISSKARAMIGLVAGGGRTDKPLLKAGNAYHKYKAKRNCWPVVRGVAMNPVDHPHGGGNHQHIGVSSCVPRNAVPGQKVGLIAARRTGCSGGKRR

Entity 40 polymer

描述 description	60S ribosomal protein eL41
分子量 formula_weight	2145.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	n

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

Entity 41 polymer

描述 description	5S rRNA
分子量 formula_weight	38672.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	3

CAGUUCGGCCAUCCUACGGCGGAAACUCCUUAACUCGUUCCGAAUUAAGAAGAGAAGCGCCGUCAGGCCCCGCCAGUACUGCGAUCGGAGACGUCGUGGGAACACGGGGUGCCGAACUUU

Entity 42 polymer

描述 description	5.8S rRNA
分子量 formula_weight	45586.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	4

AACGCCCCGCCGGCGGAUGCCUCGGCCCGGGCGGCGACGAAGAGCGCGGCGGAGCGCGAGACGCGGUGCGGACCCGCCCGCCCCGAGAAGCACCGGCCCUCGAACGCAGCGCGCCCCGGCGCCGCCGCCUCGGUGCCCUGC

Entity 43 polymer

描述 description	28S rRNA
分子量 formula_weight	871348.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	1

CGCGGCCCGAGGCGGCGGGGGCGACGGGCGGAACUUAAGCAUAUCAGUACGCCCCGGAGGAGAAACCAACCGGGAUUCCCCGUAGCGGCGAGCGACGCGGGAGGAGCCCGCCCCGAAGGCGCGCUGUGGGGCGCAGGCGCAGGCCCGCCGCGAGGGGGCCCGAGGGCCCCGCCCGAGAGGGUGCAAGCCCCGUACGGCGGCCGCCGGGCCUGCGCGGCGAGUAGCGCUGCUUGAGCGUGCAGCGCGAAGGGAGGCGCGGCCCUUCCAAGGCUAAAUACGCCCCGGGACCGAUAGCGGACCAAGUAGCGCGAGCGAACGGUGAAAAGGACGCCCUGCGGCCGCUCAAAAGACCUGAACCCGGCCGGCCGCCGGCCCGCCGGCCCCGUCUCGAAACACGGACCGAGGAGCCACGCGCCGCGGCGAGCCCGAGGGAGCCCCCGCGGCGGAGCGAGCGCGAGACGCCCCGGGCCCGCCAUGCCCCUGCGGGCGUGCGCGGGCCGAGCCGCGGCGCGUGGGCCCGAAAGGCGGUGAUCUAUGCCCGGCGAGGGCGAGGCCGGGCGAAAGCCUGGUGGAGGCCCGCCGCGGUGCUGACGCGCAGAUCGCUCGUCGGAGCCGGGCAUGGGGGCGAAAGACUCAUCGAACCGCCUGGUAGCUGGUUGCCUCCGAAAUGUCUCCCAGGACAGCCGCCGCCCCGCAGUUGCGGCCCGUAGAGCGCUGGCCGGCGGGAGCGGGGGGCCUGCCCCUCGCCCGCCCCCCAAACUCCGAAGGGCCGCGCCGCCCCGCCGCUGGCCUGGGCGGGGCGGGCGAAUGCGGGCGGCGCGUGGGCCCCUCCUGGUAAGCAGGACGGGCGAGGCGGGACGAUCCGGACGCCGGGCCAGGGUGCGCCGCCGGGGCCCGCGGAACGGCGUCGGCCGGUCCCGACAGCUGGAAGGUGGCCCCAGAAGUCGGCAUCCUCCAGGGAGUGUGUAACAACCCACCAGCCGAAUCGGCCGGCCCGGAAAAUGGAGCGCGCCGGAGCCCCGGACCCGCGCCCGGCCGCCGCGCGCGGCGGGUAGGAGGCCGCAGAGGCCCCGGGGGCGAAGGCGGCGCGCAGGCCCCGCCGGACCGGCCUCUGGUGCAGAUCUCGGCAGCAGUAGCCGCUACUCCGCGCCCCGGAGGACUGAGGGGGAGACGGGUUCCGCGGCGCCUGCAUCUGGCCGCGGGUGACUCGGGCCUAAGCGGCGGGUGAAGACCGGGAAGGGGCGUGCCCGCCCGUCGAACGGGGAGCCGGCGGAGACUCCGGCAGGCGCGGCCCCCGCGGAGACGCCCGCCCCCCGGCGACGCGCACGGGGACCGCGGCGGGCGGCGCCCCGGCCCGCGAACGCCCCGCAGCCCCCGGACGCCUUGCGCGGAGAGGGGGGCCCGGGGGCGGACCCCGCGCGUCCCCGGCCGCCCCUGAAAAGCCGGGGGGCGCCGGCCGCGCGCCGUACCGACCGCAGCAGGACUCCGGGGUCAGCAGCCUCUAGCGCGGGAGCGAACGCGGCUCAGGGAAGUCGGCAAGCCGGCUCCGUAACCUCGGGAAAAGGAGUGGCUCUGACGGCGCGCCGGGUCAGAACUGGAACGGACGCGGGGAUCCCGACUGUUUACUAGAAACACAGCGUCGCGAGGGCCGCACCCGGCGCUGGCGCGACGUGAUUUCUGCCCAGUGCCACGACCGUCACCGUGAAGCGAUCCGCCGAAGCCCUGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCGGGCAAUUUCCGACGUGCAUGAAUGGACCAACGAGGAUCCCACUGUCCCGAGCCGCGCCUCCGCGAGCCUCCAGCCUCGGGAACGGGCGAGGGCCGGCCAGCGGGGCAAGAAGACCCUUUUGAGCUUGACUCCAGCCCGGGCCUGUGGGGCGGGGCGGCCGGCGCAGCGCACAGGGGAGGCCGCGCCCCUGAGACACCCUGACGGCCGCCGCCGCCCCGCUCACCCGGUCGCGCGGGGACCCGCCCGGGCGGGGAGUUCGGCUGGGGCGGCGCGCCUGCUACACCGGACCGCAGGCGUCCCACGGCGGGCUCAGCGAGGACGGAGACCUCCCGCGGAGCAGAAGGGCACAAGCCCGCCCGACCCGCGCCCCCCGUGCCGGCGCGGGCCGCGAAAGCGGGGCCUACCGAUCCUUCGCCGCCCCGGCCGCGGGCGCGGAGGUGGCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCCGCCGAGCGCCCGCAGCGACGCGGCUUUUUGAUCCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUACCGUCCGCGCGCACCGGCGCGGAAGCGUCGGAUUGUUCACCCGUUCAAGGGAUCGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGGCCCCGGGGCCAGAGCACGGCGGGCCAGUACGAGAGGAACGCCCGCCGCGGGCCGCCAGCCCCGCGGUUGCCCGGCCGGGCAGCGCCGCGCCGCCGCGCCCGGGGGCCCUGCGCUGACCGCCUCUAAGCGCGCACCCCGCCUCGCGCCCCGCCCGGCCGCGCGCCCCAGCCCCGUGCCCCGUCGCCGAGCGGCCCCCGCCCGGGGAGACCACCCGGCGCGGCGCUCCUGUACGGCGCAGAGCCCUGCGAUCGCCUGAGGGACGCGCCUGCAGAGCGC

Entity 44 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	27

Entity 45 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	129

Entity 46 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 47 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	33

Entity 48 non-polymer

描述 description	SPERMIDINE
分子量 formula_weight	145.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 49 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3122

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7. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.49 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	289618

fit	/app/data/saxs_computation/fr/8fru/8fru.fit
pddf	/app/data/pr_computation/fr/8fru/8fru.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/fr/8fru/8fru.dat

60S subunit of the Giardia lamblia 80S ribosome

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (49)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

聚合体 Polymer

Entity 16 polymer

聚合体 Polymer

Entity 17 polymer

聚合体 Polymer

Entity 18 polymer

聚合体 Polymer

Entity 19 polymer

聚合体 Polymer

Entity 20 polymer

聚合体 Polymer

Entity 21 polymer

聚合体 Polymer

Entity 22 polymer

聚合体 Polymer

Entity 23 polymer

聚合体 Polymer

Entity 24 polymer

聚合体 Polymer

Entity 25 polymer

聚合体 Polymer

Entity 26 polymer

聚合体 Polymer

Entity 27 polymer

聚合体 Polymer

Entity 28 polymer

聚合体 Polymer

Entity 29 polymer

聚合体 Polymer

Entity 30 polymer

聚合体 Polymer

Entity 31 polymer

聚合体 Polymer

Entity 32 polymer

聚合体 Polymer

Entity 33 polymer

聚合体 Polymer

Entity 34 polymer

聚合体 Polymer

Entity 35 polymer