SAXSdb — 8if6

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-box/LRR-repeat MAX2 homolog

Oryza sativa subsp. japonica

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Strigolactone esterase D14 × 1 （Q10QA5） SKP1-like protein 20 × 1 （Q651E8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MAX2_ORYSJ
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–720； UniProt 1–720

Strigolactone esterase D14

Oryza sativa subsp. japonica

UniProt Q10QA5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-box/LRR-repeat MAX2 homolog × 1 （Q5VMP0） SKP1-like protein 20 × 1 （Q651E8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D14_ORYSJ
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–318； UniProt 1–318

SKP1-like protein 20

Oryza sativa subsp. japonica

UniProt Q651E8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	F-box/LRR-repeat MAX2 homolog × 1 （Q5VMP0） Strigolactone esterase D14 × 1 （Q10QA5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SKP20_ORYSJ
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8if6
沉积日期 deposition_date	2023-02-17
结构标题 title	Conformational Dynamics of the D53-D3-D14 Complex in Strigolactone Signaling
关键词 keywords	D14 D3 D53 SL, PLANT PROTEIN; PLANT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8if6__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8if6__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8if6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.18 Å
Rg（电子密度）	35.67 Å
总 Rg	36.21 Å
原子数	8690
残基数	1126
排除体积	154760 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8if6__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	F-box/LRR-repeat MAX2 homolog
分子量 formula_weight	79308.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	8690

MAEEEEVEEGRSSSSAILDLPEPLLLHILSFLTDVRSRHRAALACGRMRAAERATRSELSLRGDPRSPGFLFLSHAFRFPALEHLDLSLVSPWGHPLLSSVPPCGGGGGGAPSASSSSGMNVYHPEAISEQNAFIAARLAGCFPAVTSLAVYCRDPTTLANLTPHWQASLRRVKLVRWHQRPPTLPDGADLEPLLETCAALRELDLSEFYCWTEDVVRALTTHPSATAALTHLDLGLAAATDGFKSSELGPIAASCPNLRKLVAPCLFNPRFSDCVGDDALLSLATSCPRLTVLRLSEPFEAAANIQREEAAITVAGLVAFFAALPALEDFTMDLQHNVLEAAPAMEALARRCPRIKFLTLGSFQGLCKASWLHLDGVAVCGGLESLYMKNCQDLTDASLAAIGRGCRRLAKFGIHGCDLVTSAGIRRLAFTLRPTLKEVTVLHCRLLHTAECLTALSPIRDRIESLEINCVWNTTEQPCSVANGTTTECDPEDDELGEVYESAAKKCRYMEFDDLGSWEMLRSLSLWFSAGQLLSPLISAGLDSCPVLEEISIKVEGDCRTCPRPAPRTIFGLSDLAGFPVLAKMKLDLSEAVGYALTAPTGQMDLSLWERFYLHGIESLQTLYELDYWPPQDKDVHHRSLTLPAVGLIQRCVGLRKLFIHGTTHEHFMTFFLSIPNLRDMQLREDYYPAPENDLMFTEMRAESWLRFEVQLNSRQIDD

来源 Source

来源生物 organism	Oryza sativa subsp. japonica
通用名 common_name	Rice
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	39947
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Strigolactone esterase D14
分子量 formula_weight	33545.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.-.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MLRSTHPPPSSPSSSSSGGGGGGGSSASSSSEKTMVGGGGGGGGGSGSAAPSGAKLLQILNVRVVGSGERVVVLSHGFGTDQSAWSRVLPYLTRDHRVVLYDLVCAGSVNPDHFDFRRYDNLDAYVDDLLAILDALRIPRCAFVGHSVSAMIGILASIRRPDLFAKLVLIGASPRFLNDSDYHGGFELEEIQQVFDAMGANYSAWATGYAPLAVGADVPAAVQEFSRTLFNMRPDISLHVCQTVFKTDLRGVLGMVRAPCVVVQTTRDVSVPASVAAYLKAHLGGRTTVEFLQTEGHLPHLSAPSLLAQVLRRALARY

来源 Source

来源生物 organism	Oryza sativa subsp. japonica
通用名 common_name	Rice
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	39947
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	SKP1-like protein 20
分子量 formula_weight	19217.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MAAEAETKAMITLRSCEGQVFEVAEAVAMESQTIRHMIEDKCADTGIPLPNVSAKILSKVIEYCSKHVEARGGAAAAADGDAPAPAAVEANKAVEDELKTFDAEFVKVDQSTLFDLILAANYLNIKGLLDLTCQTVADMIKGKTPEEIRKTFNIKNDFTPEEEEEVRRENQWAFE

来源 Source

来源生物 organism	Oryza sativa subsp. japonica
通用名 common_name	Rice
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	39947
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

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分辨率 resolution	7.09 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	42499

Conformational Dynamics of the D53-D3-D14 Complex in Strigolactone Signaling

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-box/LRR-repeat MAX2 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Strigolactone esterase D14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SKP1-like protein 20

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8if6__assembly_1__model_1

8if6__assembly_1__model_1 | I(q)

8if6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Conformational Dynamics of the D53-D3-D14 Complex in Strigolactone Signaling

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-box/LRR-repeat MAX2 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Strigolactone esterase D14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SKP1-like protein 20

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8if6__assembly_1__model_1

8if6__assembly_1__model_1 | I(q)

8if6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)