SAXSdb — 8jbv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T cell receptor delta variable 1,T cell receptor delta constant

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 21–114 链 m； UniProt 21–114	未记录	T cell receptor gamma variable 5,T cell receptor gamma constant 1 × 2 （A0A0B4J1U4,P0CF51）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4	分辨率 3.02 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8JBV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7RYL T cell receptor CO3 提交 2021-08-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 21–115（95 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.15M Ammonium sulfate, 15% PEG 4000, 0.1 MES pH 6	分辨率 2.00 Å R-free 0.247
7RYM CD1a-endo-gdTCR complex 提交 2021-08-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 21–115（95 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.2M Ammonium Sulfate	分辨率 3.20 Å R-free 0.286
7RYN CD1a-sulfatide-gdTCR complex 提交 2021-08-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 21–115（95 aa）	未记录	CIS (15Z)-N-((1S,2R,3E)-2-HYDROXY-1-{[(3-O-SULFO-BETA-D-GALACTOPYRANOSYL)OXY]METHYL}HEPTADEC-3-ENYL)TETRACOS-15-ENAMIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG 4000, 0.15M Ammonium Sulfate, 0.1M MES pH6	分辨率 2.70 Å R-free 0.268
7RYO CD1a-dideoxymycobactin-gdTCR complex 提交 2021-08-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 21–115（95 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 WGR dideoxymycobactin-838 × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Ammonium sulfate	分辨率 3.00 Å R-free 0.267
8JCB Vgamma5 Vdelta1 T cell receptor complex 提交 2023-05-10	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 M 21–114（94 aa）链 m 21–114（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.50 Å
8WXE Vgamma5Vdelta1 EH TCR-CD3 complex 提交 2023-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 m 21–114（94 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRDV1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 38–131； UniProt 21–114 作者链 m； PDB构建体 38–131； UniProt 21–114

T cell receptor delta variable 1,T cell receptor delta constant

Homo sapiens

UniProt B7Z8K6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 1–153 链 m； UniProt 1–153	未记录	T cell receptor gamma variable 5,T cell receptor gamma constant 1 × 2 （A0A0B4J1U4,P0CF51）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4	分辨率 3.02 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8JBV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8JC0 V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex in LMNG 提交 2023-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 m 1–153（153 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8JCB Vgamma5 Vdelta1 T cell receptor complex 提交 2023-05-10	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 M 1–153（153 aa）链 m 1–153（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.50 Å
8WXE Vgamma5Vdelta1 EH TCR-CD3 complex 提交 2023-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 m 1–153（153 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8WY0 T cell receptor delta 2 gamma 9 with F283A, F290A, and F291A 提交 2023-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 m 1–153（153 aa）	突变：F283A,F290A,F291A	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8WYI T cell receptor delta 2 gamma 9 with TCRD TM domain chimera of TRAC 提交 2023-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 m 1–133（133 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8YC0 T cell receptor V delta2 V gamma9 in GDN 提交 2024-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 m 1–153（153 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.12 Å
9JXZ V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex 提交 2024-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 m 1–153（153 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 2 LPE 1-O-OCTADECYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
9JY0 Fab-CD3-gamma epsilon-TCR complex 提交 2024-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 m 1–153（153 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.69 Å
9JY1 delta epsilon/delta epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 M 1–153（153 aa）链 m 1–153（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
9JY2 Fab-CD3-delta epsilon-TCR complex 提交 2024-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 m 117–152（36 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.24 Å
9JY3 delta epsilon/gamma epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 M 117–152（36 aa）链 m 117–152（36 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRDC_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 155–307； UniProt 1–153 作者链 m； PDB构建体 155–307； UniProt 1–153

T cell receptor gamma variable 5,T cell receptor gamma constant 1

Homo sapiens

UniProt A0A0B4J1U4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 19–118 链 n； UniProt 19–118	未记录	T cell receptor delta variable 1,T cell receptor delta constant × 2 （A0A1B0GX56,B7Z8K6）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4	分辨率 3.02 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8JBV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8JCB Vgamma5 Vdelta1 T cell receptor complex 提交 2023-05-10	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 N 19–118（100 aa）链 n 19–118（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.50 Å
8WXE Vgamma5Vdelta1 EH TCR-CD3 complex 提交 2023-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 n 19–118（100 aa）	突变：Y106E,R120H	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRGV5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 38–137； UniProt 19–118 作者链 n； PDB构建体 38–137； UniProt 19–118

T cell receptor gamma variable 5,T cell receptor gamma constant 1

Homo sapiens

UniProt P0CF51

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 1–173 链 n； UniProt 1–173	未记录	T cell receptor delta variable 1,T cell receptor delta constant × 2 （A0A1B0GX56,B7Z8K6）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4	分辨率 3.02 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8JBV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8JC0 V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex in LMNG 提交 2023-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 n 1–173（173 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8JCB Vgamma5 Vdelta1 T cell receptor complex 提交 2023-05-10	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 N 1–173（173 aa）链 n 1–173（173 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.50 Å
8WXE Vgamma5Vdelta1 EH TCR-CD3 complex 提交 2023-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 n 1–173（173 aa）	突变：Y106E,R120H	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8WY0 T cell receptor delta 2 gamma 9 with F283A, F290A, and F291A 提交 2023-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 n 1–173（173 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8WYI T cell receptor delta 2 gamma 9 with TCRD TM domain chimera of TRAC 提交 2023-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 n 1–173（173 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8YC0 T cell receptor V delta2 V gamma9 in GDN 提交 2024-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 n 1–173（173 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.12 Å
9CI8 T cell receptor complex 提交 2024-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 n 128–165（38 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Hepes buffer saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
9CIA T cell receptor complex 提交 2024-07-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 n 128–163（36 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；HEPES buffer saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
9JXZ V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex 提交 2024-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 n 1–173（173 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 2 LPE 1-O-OCTADECYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
9JY0 Fab-CD3-gamma epsilon-TCR complex 提交 2024-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 n 1–173（173 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.69 Å
9JY1 delta epsilon/delta epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 N 1–173（173 aa）链 n 1–173（173 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
9JY2 Fab-CD3-delta epsilon-TCR complex 提交 2024-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 n 127–164（38 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.24 Å
9JY3 delta epsilon/gamma epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 N 127–164（38 aa）链 n 127–164（38 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
9JY4 gamma epsilon/gamma epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 N 1–173（173 aa）链 n 1–173（173 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRGC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 159–331； UniProt 1–173 作者链 n； PDB构建体 159–331； UniProt 1–173

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8jbv
沉积日期 deposition_date	2023-05-09
结构标题 title	Extracellular domain of gamma delta TCR
关键词 keywords	Receptor, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	37.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	37.80 Å
零角强度 I(0) i0	128386000.00
分子量 molecular_weight	93948.0 kDa
排除体积 excluded_volume	118670 Å³
包络体积 envelope_volume	167690 Å³
水化壳体积 shell_volume	38392 Å³
包络直径 envelope_diameter	125.9 Å
壳层 Rg shell_rg	42.15 Å
包络 Rg envelope_rg	37.19 Å
形状 Rg shape_rg	37.77 Å
总 Rg total_rg	38.21 Å
总原子数 total_atoms	6624
残基数 n_residues	824
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	124.3 Å
Rg (实空间) rg_real	38.13 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.41 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.2840e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2400e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	38.04 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	128400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8912
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	38.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.323
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.656
角度范围 angular_range	— – 0.2100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	12170000.0000
实空间数据点数 n_real_points	43
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.922; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.926; Smooth: 0.889

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	T cell receptor delta variable 1,T cell receptor delta constant
分子量 formula_weight	34320.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m,M
原子数 atom_count	6624

MDMRVPAQLLGLLLLWLSGARCMDYKDDDDKGGSETGAQKVTQAQSSVSMPVRKAVTLNCLYETSWWSYYIFWYKQLPSKEMIFLIRQGSDEQNAKSGRYSVNFKKAAKSVALTISALQLEDSAKYFCALGDPGGLNTDKLIFGKGTRVTVEPRSQPHTKPSVFVMKNGTNVACLVKEFYPKDIRINLVSSKKITEFDPAIVISPSGKYNAVKLGKYEDSNSVTCSVQHDNKTVHSTDFEVKTDSTDHVKPKETENTKQPSKSCHKPKAIVHTEKVNMMSLTVLGLRMLFAKTVAVNFLLTAKLFFL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	T cell receptor gamma variable 5,T cell receptor gamma constant 1
分子量 formula_weight	37755.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	n,N

MDMRVPAQLLGLLLLWLSGARCMDYKDDDDKGGSETGSSNLEGGTKSVTRPTRSSAEITCDLTVINAFYIHWYLHQEGKAPQRLLYYDVSNSKDVLESGLSPGKYYTHTPRRWSWILILRNLIENDSGVYYCATWDRGNPKTHYYKKLFGSGTTLVVTDKQLDADVSPKPTIFLPSIAETKLQKAGTYLCLLEKFFPDVIKIHWQEKKSNTILGSQEGNTMKTNDTYMKFSWLTVPEKSLDKEHRCIVRHENNKNGVDQEIIFPPIKTDVITMDPKDNCSKDANDTLLLQLTNTSAYYMYLLLLLKSVVYFAIITCCLLRRTAFCCNGEKS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.02 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	567573

fit	/app/data/saxs_computation/jb/8jbv/8jbv.fit
pddf	/app/data/pr_computation/jb/8jbv/8jbv.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/jb/8jbv/8jbv.dat

Extracellular domain of gamma delta TCR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

T cell receptor delta variable 1,T cell receptor delta constant

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

T cell receptor delta variable 1,T cell receptor delta constant

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

T cell receptor gamma variable 5,T cell receptor gamma constant 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

T cell receptor gamma variable 5,T cell receptor gamma constant 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)