8peq

Complex of diubiquitin-derived artificial binding protein (Affilin) variant Af2 with its target oncofetal fibronectin (fragment 7B8)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 128.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fibronectin

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1174–1447	未记录	Affilin variant Af2 × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.3；298 K；500 mM lithium sulfate, 15% PEG 8000 (w/v)	分辨率 2.32 Å R-free 0.251
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1174–1447	未记录	Affilin variant Af2 × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.3；298 K；500 mM lithium sulfate, 15% PEG 8000 (w/v)	分辨率 2.32 Å R-free 0.251
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1174–1447	未记录	Affilin variant Af2 × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 7.3；298 K；500 mM lithium sulfate, 15% PEG 8000 (w/v)	分辨率 2.32 Å R-free 0.251

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8PEQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1E88 Solution structure of 6F11F22F2, a compact three-module fragment of the gelatin-binding domain of human fibronectin 提交 2000-09-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 305–464（160 aa）片段：6F11F22F2, RESIDUES 305-464	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.5；298 K NMR样品组成 2MM 6F11F22F2, 20MM PHOSPHATE BUFFER	分辨率未提供
1E8B Solution structure of 6F11F22F2, a compact three-module fragment of the gelatin-binding domain of human fibronectin 提交 2000-09-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 305–464（160 aa）片段：6F11F22F2, RESIDUES 305-464	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.5；298 K NMR样品组成 2MM 6F11F22F2, 20MM PHOSPHATE BUFFER	分辨率未提供
1FBR FOURTH AND FIFTH FIBRONECTIN TYPE I MODULE PAIR 提交 1995-08-08	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 183–275（93 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1FNA CRYSTAL STRUCTURE OF THE TENTH TYPE III CELL ADHESION MODULE OF HUMAN FIBRONECTIN 提交 1994-01-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1452–1542（91 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1FNF FRAGMENT OF HUMAN FIBRONECTIN ENCOMPASSING TYPE-III REPEATS 7 THROUGH 10 提交 1995-09-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1173–1540（368 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.8；pH 5.8	分辨率 2.00 Å R-free 0.308
1FNH CRYSTAL STRUCTURE OF HEPARIN AND INTEGRIN BINDING SEGMENT OF HUMAN FIBRONECTIN 提交 1999-01-28	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1721–1991（271 aa）片段：HEPARIN AND INTEGRIN BINDING	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 0.1M HEPES, PH7.5, 0.8M NA, K TARTRATE	分辨率 2.80 Å R-free 0.295
1J8K NMR STRUCTURE OF THE FIBRONECTIN EDA DOMAIN, NMR, 20 STRUCTURES 提交 2001-05-22	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1631–1724（94 aa）片段：EXTRA DOMAIN 2 (RESIDUES 1631-1724)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）400mM sodium sulfate；压力 1 NMR样品组成 2mM EDA U-15N,13C; 50mM phosphate buffer, 400mM sodium sulfate; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1O9A Solution structure of the complex of 1F12F1 from fibronectin with B3 from FnBB from S. dysgalactiae 提交 2002-12-11	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–140（93 aa）片段：N-TERMINAL F1 MODULE PAIR, RESIDUES 48-140	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K	分辨率未提供
1OWW Solution structure of the first type III module of human fibronectin determined by 1H, 15N NMR spectroscopy 提交 2003-03-31	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 608–701（94 aa）片段：Residues 608-701 of SWS P02751	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；313 K；离子强度（mmCIF原始值）unbuffered；压力 ambient NMR样品组成 1-2 mM [U-15N] protein, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1Q38 Anastellin 提交 2003-07-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 631–705（75 aa）片段：Type 3 (FN3) domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mM anastellin U-15N, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4, 140 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 2 mM CHAPS \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.5 mM anastellin U-15N,13C, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4, 140 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 2 mM CHAPS \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1QGB SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL F1 MODULE PAIR FROM HUMAN FIBRONECTIN 提交 1999-04-21	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 48–140（93 aa）片段：N-TERMINAL F1 MODULE PAIR	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4；310 K NMR样品组成 2.2 mM [U-15N] 1F1-2F1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1QO6 Solution structure of a pair of modules from the gelatin-binding domain of fibronectin 提交 1999-11-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 305–405（101 aa）片段：FIBRONECTIN TYPE-I AND FIBRONECTIN TYPE-II MODULE PAIR FROM COLLAGEN-BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.5；310 K；压力 1	分辨率未提供
1TTF THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE TENTH TYPE III MODULE OF FIBRONECTIN: AN INSIGHT INTO RGD-MEDIATED INTERACTIONS 提交 1993-07-14	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1447–1540（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1TTG THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE TENTH TYPE III MODULE OF FIBRONECTIN: AN INSIGHT INTO RGD-MEDIATED INTERACTIONS 提交 1993-07-14	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1447–1540（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2CG6 Second and third fibronectin type I module pair (crystal form I). 提交 2006-02-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 93–182（90 aa）片段：RESIDUES 93-182 (62-151 IN COORDINATES)	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1M NA ACETATE PH 4.5, 2% MPD, 5% PEG MME 550	分辨率 1.55 Å R-free 0.231
2CG7 SECOND AND THIRD FIBRONECTIN TYPE I MODULE PAIR (CRYSTAL FORM II). 提交 2006-02-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 93–182（90 aa）片段：RESIDUES 93-182 (62-151 IN COORDINATES)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；WATER AND 0.02% SODIUM AZIDE, pH 7.00	分辨率 1.20 Å R-free 0.219
2CK2 Structure of core-swapped mutant of fibronectin 提交 2006-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1447–1542（96 aa）片段：RESIDUES 1447-1542 链 B 1447–1542（96 aa）片段：RESIDUES 1447-1542	突变：YES 突变：YES	ACE ACETYL GROUP × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.1；50% PEG-400, 0.1 M ACTEATE, 0.2 M LITHIUM SULPHATE, PH 5.1	分辨率 2.00 Å R-free 0.268
2CKU Solution structure of 2F13F1 from human fibronectin 提交 2006-04-21	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 93–182（90 aa）片段：2ND AND 3RD F1 MODULES, RESIDUES 93-182 (62-151 IN COORDINATES)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 298 K	分辨率未提供
2EC3 Solution structure of the 11th FN1 domain from human Fibronectin 1 提交 2007-02-09	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2239–2299（61 aa）片段：Fibronectin type-I	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成 1.14 mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl (pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2FN2 SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE GLYCOSYLATED SECOND TYPE TWO MODULE OF FIBRONECTIN, 20 STRUCTURES 提交 1997-08-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 375–433（59 aa）片段：RESIDUES 375 - 433	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0 mM；压力 10E+5 PA NMR样品组成 H2O/D2O(9:1) OR D2O	分辨率未提供
2FNB NMR STRUCTURE OF THE FIBRONECTIN ED-B DOMAIN, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1998-12-16	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1261–1355（95 aa）片段：TYPE III DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）63 mM；压力 1	分辨率未提供
2H41 Solution structure of the second type III domain of human Fibronectin: minimized average structure 提交 2006-05-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 721–809（89 aa）片段：Fibronectin type-III 2(2F3)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM NaCl, 20mM Na2HPO4；压力 ambient NMR样品组成 2.5mM 2F3 U-15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 2mM 2F3 U-13C,15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 2mM 2F3 U-13C,15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 1mM 2F3 U-15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 4% Radially compressed polyacrylamide gel, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2H45 Solution structure of the second type III domain of human Fibronectin: ensemble of 25 structures 提交 2006-05-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 721–809（89 aa）片段：Fibronectin type-III 2(2F3)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM NaCl, 20mM Na2HPO4；压力 ambient NMR样品组成 2.5mM 2F3 U-15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 2mM 2F3 U-13C,15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 2mM 2F3 U-13C,15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 1mM 2F3 U-15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 4% Radially compressed polyacrylamide gel, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2HA1 Complex of the first and second type III domains of human Fibronectin in solution 提交 2006-06-12	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 609–809（201 aa）片段：Fibronectin first and second type III domain pair (1F3-2F3)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）150mM NaCl, 20mM Na2HPO3；压力 ambient NMR样品组成 1.0mM 1F3-2F3 U-15N, 150mM NaCl, 20mM NaPi pH 7.0, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.0mM 1F3-2F3 U-15N, 13C, 150mM NaCl, 20mM NaPi pH 7.0, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.6mM 1F3-2F3 U-15N, 150mM NaCl, 20mM NaPi pH 7.0, 4% Radially compressed polyacrylamide gel, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2N1K Structure of the Third Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-04-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 808–905（98 aa）片段：third FN3 domain (UNP residues 808-905)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298.15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.17；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-99% 15N] 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.9 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 0.9 mM 3FN3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2OCF Human estrogen receptor alpha ligand-binding domain in complex with estradiol and the E2#23 FN3 monobody 提交 2006-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1447–1540（94 aa）片段：E2#23 FN3 MONOBODY, Fibronectin type III Domain 10, Residues 1447-1540	突变：R1452T, D1453K, R1524L, G1525R, D1526L, S1527M, P1528L, S1530G	EST ESTRADIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；2.5M NaCl, 0.1M Imidazole, pH 8.0, 0.2M Zn(OAc)2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K	分辨率 2.95 Å R-free 0.251
2RKY Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1 提交 2007-10-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 183–275（93 aa）片段：UNP residues 183-275	未记录	SCN THIOCYANATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；100mM Tris-HCl, pH8.5, 0.15M Potassium thiocyanate, 20% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
2RKY Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1 提交 2007-10-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 183–275（93 aa）片段：UNP residues 183-275	未记录	SCN THIOCYANATE ION × 3 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；100mM Tris-HCl, pH8.5, 0.15M Potassium thiocyanate, 20% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
2RKZ Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1 提交 2007-10-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 93–182（90 aa）片段：UNP residues 93-182	未记录	SIN SUCCINIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261
2RKZ Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1 提交 2007-10-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 93–182（90 aa）片段：UNP residues 93-182	未记录	SIN SUCCINIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261
2RKZ Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1 提交 2007-10-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 93–182（90 aa）片段：UNP residues 93-182	未记录	SIN SUCCINIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261
2RKZ Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1 提交 2007-10-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 93–182（90 aa）片段：UNP residues 93-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261
2RKZ Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1 提交 2007-10-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 93–182（90 aa）片段：UNP residues 93-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261
2RKZ Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1 提交 2007-10-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 93–182（90 aa）片段：UNP residues 93-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.261
2RL0 Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5 提交 2007-10-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 184–272（89 aa）片段：UNP residues 184-272	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；291 K；0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
2RL0 Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5 提交 2007-10-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 184–272（89 aa）片段：UNP residues 184-272	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；291 K；0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
2RL0 Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5 提交 2007-10-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 184–272（89 aa）片段：UNP residues 184-272	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；291 K；0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
2RL0 Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5 提交 2007-10-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 184–272（89 aa）片段：UNP residues 184-272	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；291 K；0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
2RL0 Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5 提交 2007-10-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 184–272（89 aa）片段：UNP residues 184-272	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；291 K；0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
2RL0 Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5 提交 2007-10-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 184–272（89 aa）片段：UNP residues 184-272	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；291 K；0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
3CAL Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5 提交 2008-02-20	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 93–182（90 aa）片段：UNP residues 93-182, Second and third F1 modules	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.95M succinic acid, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.70 Å R-free 0.217
3CAL Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5 提交 2008-02-20	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 93–182（90 aa）片段：UNP residues 93-182, Second and third F1 modules	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.95M succinic acid, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.70 Å R-free 0.217
3CH8 The crystal structure of PDZ-Fibronectin fusion protein 提交 2008-03-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1538–1631（94 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；31% isopropanol, 0.1M HEPES, 0.2M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.260
3EJH Crystal Structure of the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair in Complex with a Type-I Collagen Peptide 提交 2008-09-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 516–608（93 aa）片段：8-9FnI	突变：N528Q, R534K	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；2.5 M NaCl, 0.1 M BisTris pH 6.5 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.242
3EJH Crystal Structure of the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair in Complex with a Type-I Collagen Peptide 提交 2008-09-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 516–608（93 aa）片段：8-9FnI	突变：N528Q, R534K	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；2.5 M NaCl, 0.1 M BisTris pH 6.5 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.242
3GXE Complex of a Low Affinity Collagen Site with the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair 提交 2009-04-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 516–608（93 aa）片段：8-9FnI, UNP residues 516-608	突变：N528Q, R534K	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.1 K；0.1M HEPES pH 7.5, 4.3M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.1K	分辨率 2.60 Å R-free 0.271
3GXE Complex of a Low Affinity Collagen Site with the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair 提交 2009-04-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 516–608（93 aa）片段：8-9FnI, UNP residues 516-608	突变：N528Q, R534K	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.1 K；0.1M HEPES pH 7.5, 4.3M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.1K	分辨率 2.60 Å R-free 0.271
3R8Q Structure of Fibronectin domain 12-14 提交 2011-03-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1722–1992（271 aa）片段：unp residues 1722-1992	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Na HEPES, 0.8 M sodium dihydrogen phosphate, 0.8 M potassium dihydrogen phosphate, supplemented with 35% glycerol for cryo-protection, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.40 Å R-free 0.236
3ZRZ Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of Streptococcus pyogenes SfbI-5 提交 2011-06-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 93–182（90 aa）片段：SECOND AND THIRD F1 MODULES, RESIDUES 93-182	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；CRYSTALS OF THE PROTEIN/PEPTIDE COMPLEX (0.3 MM/3.5 MM, PH 7.7) WERE GROWN USING SITTING DROP VAPOUR DIFFUSION FROM A 1:1 DILUTION WITH WELL SOLUTION (0.1 M TRIS PH 7.0, 1.5 M (NH4)2SO4 AT 18 DEGREES CENTIGRADE	分辨率 1.70 Å R-free 0.222
3ZRZ Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of Streptococcus pyogenes SfbI-5 提交 2011-06-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 93–182（90 aa）片段：SECOND AND THIRD F1 MODULES, RESIDUES 93-182	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；CRYSTALS OF THE PROTEIN/PEPTIDE COMPLEX (0.3 MM/3.5 MM, PH 7.7) WERE GROWN USING SITTING DROP VAPOUR DIFFUSION FROM A 1:1 DILUTION WITH WELL SOLUTION (0.1 M TRIS PH 7.0, 1.5 M (NH4)2SO4 AT 18 DEGREES CENTIGRADE	分辨率 1.70 Å R-free 0.222
4GH7 Crystal structure of Anticalin N7A in complex with oncofetal fibronectin fragment Fn7B8 提交 2012-08-07	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1173–1448（276 aa）片段：Fn7B8, UNP residues 1173-1448	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17-19%(w/v) PEG3350, 0.1M Na-citrate, pH 5.5-6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.259
4GH7 Crystal structure of Anticalin N7A in complex with oncofetal fibronectin fragment Fn7B8 提交 2012-08-07	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1173–1448（276 aa）片段：Fn7B8, UNP residues 1173-1448	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17-19%(w/v) PEG3350, 0.1M Na-citrate, pH 5.5-6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.259
4LXO Crystal structure of 9,10Fn3-elegantin chimera 提交 2013-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1357–1540（184 aa）	突变：L1408P, V1490C, T1491R, G1492A, S1496N, A1498D, S1499C	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.2M calcium acetate, 7%(w/v) PEG10000, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.42 Å R-free 0.193
4LXO Crystal structure of 9,10Fn3-elegantin chimera 提交 2013-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1357–1540（184 aa）	突变：L1408P, V1490C, T1491R, G1492A, S1496N, A1498D, S1499C	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.2M calcium acetate, 7%(w/v) PEG10000, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.42 Å R-free 0.193
4MMX Integrin AlphaVBeta3 ectodomain bound to the tenth domain of Fibronectin 提交 2013-09-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1539–1631（93 aa）片段：Fibronectin type-III domain 10 (UNP residues 1448-1540)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277.15 K；12% PEG3350, 0.8 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 3.32 Å R-free 0.269
4MMY Integrin AlphaVBeta3 ectodomain bound to the tenth domain of Fibronectin with the IAKGDWND motif 提交 2013-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1448–1540（93 aa）片段：Fibronectin type-III domain 10 (UNP residues 1448-1540)	突变：TGRGDSPASS to IARGDWNDG	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277.15 K；12% PEG3350, 0.8 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 3.18 Å R-free 0.252
4MMZ Integrin AlphaVBeta3 ectodomain bound to an antagonistic tenth domain of Fibronectin 提交 2013-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1539–1631（93 aa）片段：Fibronectin type-III domain 10 (UNP residues 1448-1540)	突变：GRGDSPAS to PRGDWNEG	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 MN MANGANESE (II) ION × 8 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277.15 K；12% PEG3350, 0.8 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 3.10 Å R-free 0.255
4PZ5 Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of BBK32 from Borrelia burgdorferi 提交 2014-03-28	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 93–182（90 aa）片段：2FN1-3FN1, UNP RESIDUES 93-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；291 K；1.4 M Na/K phosphate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.96 Å R-free 0.199
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1539–1635（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 J 1539–1635（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1539–1635（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1539–1635（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1539–1635（97 aa）	未记录	CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1539–1635（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1539–1635（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1539–1635（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 1539–1635（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5DFT Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin 提交 2015-08-27	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 I 1539–1635（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine	分辨率 2.50 Å R-free 0.248
5J6Z Structure of anastellin bound to beta-strands A and B from the third type III domain of fibronectin 提交 2016-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 806–834（29 aa）片段：residues 806-834 链 B 631–705（75 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）166；压力 100000 NMR样品组成 0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] AB, 0.6 mM anastellin, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM AB, 0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] anastellin, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-99% 15N] AB, 0.6 mM anastellin, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM AB, 0.6 mM [U-99% 15N] anastellin, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5M0A Solution structure of isolated 15th Fibronectin III domain from human fibronectin 提交 2016-10-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2108–2193（86 aa）片段：15th Fibronectin III domain, UNP residues 2108-2193	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）161；压力 1 NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）161；压力 1 NMR样品组成 10 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.02 ug/mL TSP, 1 mM sodium azide, 0.35 mM [U-13C; U-15N] 15th Fibronectin III domain from human fibronectin, 0.5 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 10 mM [U-2H] TRIS, 0.35 mM [U-13C; U-15N] 15th Fibronectin III domain from human fibronectin, 150 mM sodium chloride, 1 mM sodium azide, 0.02 ug/mL TSP, 0.5 mM EDTA, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5N47 Structure of Anticalin N7E in complex with the three-domain fragment Fn7B8 of human oncofetal fibronectin 提交 2017-02-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1173–1448（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；17 % (w/v) PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na-malonate	分辨率 3.00 Å R-free 0.241
5N47 Structure of Anticalin N7E in complex with the three-domain fragment Fn7B8 of human oncofetal fibronectin 提交 2017-02-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1173–1448（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；17 % (w/v) PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na-malonate	分辨率 3.00 Å R-free 0.241
5N47 Structure of Anticalin N7E in complex with the three-domain fragment Fn7B8 of human oncofetal fibronectin 提交 2017-02-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1173–1448（276 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；17 % (w/v) PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na-malonate	分辨率 3.00 Å R-free 0.241
5N48 Structure of Anticalin N9B in complex with extra-domain B of human oncofetal fibronectin 提交 2017-02-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1266–1357（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；29 % (w/v) PEG4000, 0.1 M Na-malonate	分辨率 1.60 Å R-free 0.208
5N48 Structure of Anticalin N9B in complex with extra-domain B of human oncofetal fibronectin 提交 2017-02-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1266–1357（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；29 % (w/v) PEG4000, 0.1 M Na-malonate	分辨率 1.60 Å R-free 0.208
6HNF Structure in solution of human fibronectin type III-domain 14 提交 2018-09-14	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1904–1991（88 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）162.7；压力 1030 NMR样品组成 1.0 mM [U-13C; U-15N] FNIII14, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6MFA Fragment of human fibronectin containing the 4th-7th type III domains 提交 2018-09-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 903–1268（366 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M MES pH 5.5, 7% PEG 6000	分辨率 1.75 Å R-free 0.238
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 J 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 L 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 13 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1085–1173（89 aa）链 G 1085–1173（89 aa）链 H 1085–1173（89 aa）链 J 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 14 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1085–1173（89 aa）链 D 1085–1173（89 aa）链 F 1085–1173（89 aa）链 L 1085–1173（89 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 15 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1085–1173（89 aa）链 E 1085–1173（89 aa）链 I 1085–1173（89 aa）链 K 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1085–1173（89 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1085–1173（89 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6MSV Structure of the 6th type III domain from human fibronectin 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 I 1085–1173（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.295
6NAJ Integrin AlphaVBeta3 ectodomain bound to Hr10 variant of the 10th domain of Fibronectin. 提交 2018-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1539–1629（91 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；100 M Sodium Acetate, PEG4000, 800 mM Sodium Chloride.	分辨率 3.10 Å R-free 0.268
6XAX Structure of a fragment of human fibronectin containing the 11th type III domain, extra domain A, and the 12th type III domain 提交 2020-06-04	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1630–1903（274 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M Ca(CH3COO)2, 0.1M imidazole pH 8.0, 10%(w/v) PEG 8000	分辨率 2.40 Å R-free 0.312
6XAX Structure of a fragment of human fibronectin containing the 11th type III domain, extra domain A, and the 12th type III domain 提交 2020-06-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1630–1903（274 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M Ca(CH3COO)2, 0.1M imidazole pH 8.0, 10%(w/v) PEG 8000	分辨率 2.40 Å R-free 0.312
6XAY Structure of a fragment of human fibronectin containing the 10th, 11th and 12th type III domains 提交 2020-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1447–1722（276 aa）	突变：V1643G	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.5M (NH4)2SO4, 0.1M Citric acid pH 4.0, 30%(v/v)PEG 600, 10%(v/v) glycerol	分辨率 2.48 Å R-free 0.296
6XAY Structure of a fragment of human fibronectin containing the 10th, 11th and 12th type III domains 提交 2020-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1447–1722（276 aa）	突变：V1643G	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.5M (NH4)2SO4, 0.1M Citric acid pH 4.0, 30%(v/v)PEG 600, 10%(v/v) glycerol	分辨率 2.48 Å R-free 0.296
6XAY Structure of a fragment of human fibronectin containing the 10th, 11th and 12th type III domains 提交 2020-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1447–1722（276 aa）	突变：V1643G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.5M (NH4)2SO4, 0.1M Citric acid pH 4.0, 30%(v/v)PEG 600, 10%(v/v) glycerol	分辨率 2.48 Å R-free 0.296
6XAY Structure of a fragment of human fibronectin containing the 10th, 11th and 12th type III domains 提交 2020-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1447–1722（276 aa）	突变：V1643G	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.5M (NH4)2SO4, 0.1M Citric acid pH 4.0, 30%(v/v)PEG 600, 10%(v/v) glycerol	分辨率 2.48 Å R-free 0.296
7NWL Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 (open form) in complex with fibronectin and TS2/16 Fv-clasp 提交 2021-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1173–1540（368 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
9P6S Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 in complex with fibronectin (FN 7-10) 提交 2025-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1449–1631（183 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.61 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	FINC_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–275； UniProt 1174–1447 作者链 B； PDB构建体 2–275； UniProt 1174–1447 作者链 C； PDB构建体 2–275； UniProt 1174–1447

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8peq
沉积日期 deposition_date	2023-06-14
结构标题 title	Complex of diubiquitin-derived artificial binding protein (Affilin) variant Af2 with its target oncofetal fibronectin (fragment 7B8)
关键词 keywords	;extra domain B, EDB, oncofetal fibronectin, ubiquitin, diubiqutin, Affilin, beta strand register shift, strand slippage, scaffold, artificial binding protein, plasticity, directed evolution, DE NOVO PROTEIN ;; DE NOVO PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	39.70 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	39.13 Å
零角强度 I(0) i0	303471000.00
分子量 molecular_weight	141100.0 kDa
排除体积 excluded_volume	176610 Å³
包络体积 envelope_volume	245590 Å³
水化壳体积 shell_volume	54130 Å³
包络直径 envelope_diameter	139.0 Å
壳层 Rg shell_rg	43.20 Å
包络 Rg envelope_rg	39.09 Å
形状 Rg shape_rg	39.10 Å
总 Rg total_rg	39.47 Å
总原子数 total_atoms	9950
残基数 n_residues	1278
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	128.1 Å
Rg (实空间) rg_real	39.59 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.11 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.0350e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.6950e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	39.66 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	303500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8953
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	48.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.241
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.409
角度范围 angular_range	— – 0.2000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	19880000.0000
实空间数据点数 n_real_points	41
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.920; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.876

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fibronectin
分子量 formula_weight	29808.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	10486

MLSPPTNLHLEANPDTGVLTVSWERSTTPDITGYRITTTPTNGQQGNSLEEVVHADQSSSTFDNLSPGLEYNVSVYTVKDDKESVPISDTIIPEVPQLTDLSFVDITDSSIGLRWTPLNSSTIIGYRITVVAAGEGIPIFEDFVDSSVGYYTVTGLEPGIDYDISVITLINGGESAPTTLTQQTAVPPPTDLRFTNIGPDTMRVTWAPPPSIDLTNFLVRYSPVKNEEDVAELSISPSDNAVVLTNLLPGTEYVVSVSSVYEQHESTPLRGRQKT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Affilin variant Af2
分子量 formula_weight	17428.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,L,M

MQIFVHTDTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPQDQQRLIWAGKQLEDGRTLSDYNIDPQLKLHLVLRLRAAGGMQIFVTTQTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIWAGKQLEDGRTLSDYNIDYRFLHLVLRLRAA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	536

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	168.650 Å
晶胞边长 b length_b	105.856 Å
晶胞边长 c length_c	78.993 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	93.53 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.320 Å
最低分辨率 resolution_low	44.800 Å
R 因子 r_factor	0.2008
R_work r_work	0.1982
R_free r_free	0.2510

fit	/app/data/saxs_computation/pe/8peq/8peq.fit
pddf	/app/data/pr_computation/pe/8peq/8peq.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/pe/8peq/8peq.dat

Complex of diubiquitin-derived artificial binding protein (Affilin) variant Af2 with its target oncofetal fibronectin (fragment 7B8)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fibronectin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)