|
22TU
Human 80S ribosome in complex with DHX29
提交 2026-01-22
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
28LN
XBP1u-stalled RPL4 RNC in complex with NAC
提交 2026-02-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:86-meric
|
链 Af
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.70 Å
|
|
28ZU
human 48S PIC with Kozak mRNA and eIF1A W70A mutant
提交 2026-03-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 38
PDB 声明:41-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 3.20 Å
|
|
28ZV
human 48S PIC with mRNA (non-Kozak)
提交 2026-03-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 38
PDB 声明:41-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.90 Å
|
|
28ZX
human 48S PIC with mRNA (Kozak_1)
提交 2026-03-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.80 Å
|
|
28ZY
human 48S PIC with mRNA (Kozak_2)
提交 2026-03-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 3.00 Å
|
|
3AXC
Crystal structure of linear diubiquitin
提交 2011-04-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–76(76 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;289 K;30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.1M MgCl2, 30% Dioxane, 30% Isopropanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.278
|
|
3PHW
OTU Domain of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus in complex with Ubiquitin
提交 2010-11-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–75(75 aa)
片段:UNP residues 1-75
|
未记录
|
NEH ETHANAMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.27 M sodium phosphate dihydrogen, 1.53 M di-potassium phosphate hydrogen, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.278
|
|
3PHW
OTU Domain of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus in complex with Ubiquitin
提交 2010-11-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–75(75 aa)
片段:UNP residues 1-75
|
未记录
|
NEH ETHANAMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.27 M sodium phosphate dihydrogen, 1.53 M di-potassium phosphate hydrogen, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.278
|
|
3PHW
OTU Domain of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus in complex with Ubiquitin
提交 2010-11-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
1–75(75 aa)
片段:UNP residues 1-75
|
未记录
|
NEH ETHANAMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.27 M sodium phosphate dihydrogen, 1.53 M di-potassium phosphate hydrogen, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.278
|
|
3PHW
OTU Domain of Crimean Congo Hemorrhagic Fever Virus in complex with Ubiquitin
提交 2010-11-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 H
1–75(75 aa)
片段:UNP residues 1-75
|
未记录
|
NEH ETHANAMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.27 M sodium phosphate dihydrogen, 1.53 M di-potassium phosphate hydrogen, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.278
|
|
3TBL
Structure of Mono-ubiquitinated PCNA: Implications for DNA Polymerase Switching and Okazaki Fragment Maturation
提交 2011-08-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 D
1–76(76 aa)
链 E
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.9 to 1.3 M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.293
|
|
4R62
Structure of Rad6~Ub
提交 2014-08-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–76(76 aa)
片段:Ubiquitin
|
未记录
|
ACT ACETATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;293 K;24% PEG 300, 50 mM sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.28 Å
R-free 0.265
|
|
4UG0
STRUCTURE OF THE HUMAN 80S RIBOSOME
提交 2015-03-20
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:89-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 239
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
4V6X
Structure of the human 80S ribosome
提交 2013-02-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 84
PDB 声明:89-meric
|
链 Af
77–156(80 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 3 seconds using two pieces of filter paper, then plunge into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 5.00 Å
|
|
5AJ0
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (POST state).
提交 2015-02-19
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Bf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 326
ZN ZINC ION × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM HEPES-KOH, PH 7.5, 100 MM KCL, 1.5 MM MGCL2, 0.5 MM SPERMIDINE, 0.04 MM SPERMINE, 1 MM DTT;pH 7.5;20 MM HEPES-KOH, PH 7.5, 100 MM KCL, 1.5 MM MGCL2, 0.5 MM SPERMIDINE, 0.04 MM SPERMINE, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 93, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK II, METHOD- BLOT FOR 2-4 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5FLX
Mammalian 40S HCV-IRES complex
提交 2015-10-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 33
PDB 声明:35-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 74
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL, 7.5MM MGCL2, 100MM KCL, 0.2MM SPERMIDINE, 2MM DTT;pH 7.6;20MM TRIS-HCL, 7.5MM MGCL2, 100MM KCL, 0.2MM SPERMIDINE, 2MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 93, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK I, METHOD- BLOT FOR 2-4 SECONDS BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 3.90 Å
|
|
5LKS
Structure-function insights reveal the human ribosome as a cancer target for antibiotics
提交 2016-07-23
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:80-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
MG MAGNESIUM ION × 224
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
5T2C
CryoEM structure of the human ribosome at 3.6 Angstrom resolution
提交 2016-08-23
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:81-meric
|
链 AH
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
5WVO
Crystal structure of DNMT1 RFTS domain in complex with K18/K23 mono-ubiquitylated histone H3
提交 2016-12-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–76(76 aa)
链 B
1–76(76 aa)
|
突变:G76C
突变:G76C
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;100mM Bis-Tris (pH 6.0), 200mM lithium sulfate monohydrate, 20% PEG 10000
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.239
|
|
5YDK
Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, tetrameric form
提交 2017-09-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–76(76 aa)
片段:UNP residues 1-76
链 D
1–77(77 aa)
片段:UNP residues 1-76
|
突变:K63R
突变:D77
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Tris pH 7.6
21% PEG3350
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.260
|
|
5YDK
Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, tetrameric form
提交 2017-09-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 H
1–76(76 aa)
片段:UNP residues 1-76
链 J
1–77(77 aa)
片段:UNP residues 1-76
|
突变:K63R
突变:D77
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Tris pH 7.6
21% PEG3350
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.260
|
|
5YDK
Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, tetrameric form
提交 2017-09-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
1–77(77 aa)
片段:UNP residues 1-76
链 E
1–76(76 aa)
片段:UNP residues 1-76
|
突变:D77
突变:K63R
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Tris pH 7.6
21% PEG3350
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.260
|
|
5YDK
Crystal structure of RNF168 UDM1 in complex with Lys63-linked diubiquitin, tetrameric form
提交 2017-09-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 I
1–77(77 aa)
片段:UNP residues 1-76
链 K
1–76(76 aa)
片段:UNP residues 1-76
|
突变:D77
突变:K63R
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Tris pH 7.6
21% PEG3350
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.260
|
|
6DC6
Crystal structure of human ubiquitin activating enzyme E1 (Uba1) in complex with ubiquitin
提交 2018-05-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–76(76 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
POP PYROPHOSPHATE 2- × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;285 K;0.1 M MgCl2, 0.2 M Tris HCl pH 8.0, 20% PEG 4000
|
分辨率 3.14 Å
R-free 0.250
|
|
6DC6
Crystal structure of human ubiquitin activating enzyme E1 (Uba1) in complex with ubiquitin
提交 2018-05-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–76(76 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
POP PYROPHOSPHATE 2- × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;285 K;0.1 M MgCl2, 0.2 M Tris HCl pH 8.0, 20% PEG 4000
|
分辨率 3.14 Å
R-free 0.250
|
|
6FEC
Human cap-dependent 48S pre-initiation complex
提交 2017-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 p
82–152(71 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Tris HCl,
50 mM KOAc,
2.5 mM MgCl2,
2 mM DTT,
0.25 mM spermidine
0.25 mM GMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.30 Å
|
|
6G18
Cryo-EM structure of a late human pre-40S ribosomal subunit - State C
提交 2018-03-20
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 34
PDB 声明:35-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
6G51
Cryo-EM structure of a late human pre-40S ribosomal subunit - State D
提交 2018-03-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 37
PDB 声明:38-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
6G53
Cryo-EM structure of a late human pre-40S ribosomal subunit - State E
提交 2018-03-28
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:38-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å
|
|
6IP5
Cryo-EM structure of the CMV-stalled human 80S ribosome (Structure ii)
提交 2018-11-02
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:84-meric
|
链 3R
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6IP6
Cryo-EM structure of the CMV-stalled human 80S ribosome with HCV IRES (Structure iii)
提交 2018-11-02
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 3R
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å
|
|
6IP8
Cryo-EM structure of the HCV IRES dependently initiated CMV-stalled 80S ribosome (Structure iv)
提交 2018-11-02
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:84-meric
|
链 3R
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6J99
Cryo-EM structure of human DOT1L in complex with an H2B-monoubiquitinated nucleosome
提交 2019-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 10
PDB 声明:dodecameric
|
链 L
1–76(76 aa)
|
突变:G76C
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
6KIU
Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom)
提交 2019-07-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:pentadecameric
|
链 O
1–76(76 aa)
|
突变:G76C
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
ZN ZINC ION × 1
LYS LYSINE × 1
GLN GLUTAMINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6KIV
Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom)
提交 2019-07-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:pentadecameric
|
链 O
1–76(76 aa)
|
突变:G76C
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å
|
|
6KIW
Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom)
提交 2019-07-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:pentadecameric
|
链 O
1–76(76 aa)
|
突变:G76C
|
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å
|
|
6OLE
Human ribosome nascent chain complex (CDH1-RNC) stalled by a drug-like molecule with AP and PE tRNAs
提交 2019-04-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 31
ZN ZINC ION × 6
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6OLF
Human ribosome nascent chain complex (CDH1-RNC) stalled by a drug-like molecule with AA and PE tRNAs
提交 2019-04-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 31
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6OLG
Human ribosome nascent chain complex stalled by a drug-like small molecule (CDH1_RNC with PP tRNA)
提交 2019-04-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 Bf
79–151(73 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 326
ZN ZINC ION × 5
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
6OLI
Structure of human ribosome nascent chain complex selectively stalled by a drug-like small molecule (USO1-RNC)
提交 2019-04-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 31
ZN ZINC ION × 6
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
6OLZ
Human ribosome nascent chain complex (PCSK9-RNC) stalled by a drug-like molecule with PP tRNA
提交 2019-04-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:82-meric
|
链 Bf
79–151(73 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 326
ZN ZINC ION × 5
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6OM0
Human ribosome nascent chain complex (PCSK9-RNC) stalled by a drug-like molecule with AP and PE tRNAs
提交 2019-04-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 31
ZN ZINC ION × 6
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6OM7
Human ribosome nascent chain complex (PCSK9-RNC) stalled by a drug-like small molecule with AA and PE tRNAs
提交 2019-04-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 31
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
6QZP
High-resolution cryo-EM structure of the human 80S ribosome
提交 2019-03-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:81-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 438
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
ZN ZINC ION × 8
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6XA1
Structure of a drug-like compound stalled human translation termination complex
提交 2020-06-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
89–151(63 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 190
MVM N-(3-chloropyridin-2-yl)-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-4-(3H-[1,2,3]triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl)benzamide × 1
ZN ZINC ION × 8
K POTASSIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
6Y0G
Structure of human ribosome in classical-PRE state
提交 2020-02-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 72
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6Y57
Structure of human ribosome in hybrid-PRE state
提交 2020-02-25
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:82-meric
|
链 sh
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 160
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
6YBS
Structure of a human 48S translational initiation complex - head
提交 2020-03-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 17
PDB 声明:octadecameric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 29
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6Z6L
Cryo-EM structure of human CCDC124 bound to 80S ribosomes
提交 2020-05-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6Z6M
Cryo-EM structure of human 80S ribosomes bound to EBP1, eEF2 and SERBP1
提交 2020-05-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6Z6N
Cryo-EM structure of human EBP1-80S ribosomes (focus on EBP1)
提交 2020-05-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6ZLW
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human 40S ribosomal subunit
提交 2020-07-01
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 g
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
6ZM7
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human CCDC124-80S-EBP1 ribosome complex
提交 2020-07-01
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
6ZME
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human CCDC124-80S-eERF1 ribosome complex
提交 2020-07-02
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 83
PDB 声明:88-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6ZMI
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human LYAR-80S ribosome complex
提交 2020-07-02
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
6ZMO
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to the human LYAR-80S-eEF1a ribosome complex
提交 2020-07-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6ZMT
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a pre-40S-like ribosome complex
提交 2020-07-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 34
PDB 声明:35-meric
|
链 g
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6ZMW
Structure of a human 48S translational initiation complex
提交 2020-07-04
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 54
PDB 声明:57-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 89
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
6ZON
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 1
提交 2020-07-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:48-meric
|
链 U
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6ZP4
SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 2
提交 2020-07-08
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:54-meric
|
链 U
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6ZUO
Human RIO1(kd)-StHA late pre-40S particle, structural state A (pre 18S rRNA cleavage)
提交 2020-07-23
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 34
PDB 声明:35-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6ZV6
Human RIO1(kd)-StHA late pre-40S particle, structural state B (post 18S rRNA cleavage)
提交 2020-07-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 34
PDB 声明:35-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6ZVH
EDF1-ribosome complex
提交 2020-07-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:37-meric
|
链 f
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 30
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
6ZVJ
Structure of a human ABCE1-bound 43S pre-initiation complex - State II
提交 2020-07-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:51-meric
|
链 U
88–149(62 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6ZXD
Cryo-EM structure of a late human pre-40S ribosomal subunit - State F1
提交 2020-07-29
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:37-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6ZXE
Cryo-EM structure of a late human pre-40S ribosomal subunit - State F2
提交 2020-07-29
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:37-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
6ZXF
Cryo-EM structure of a late human pre-40S ribosomal subunit - State G
提交 2020-07-29
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:37-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
6ZXG
Cryo-EM structure of a late human pre-40S ribosomal subunit - State H1
提交 2020-07-29
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:37-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 131
ZN ZINC ION × 3
ASP ASPARTIC ACID × 1
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
6ZXH
Cryo-EM structure of a late human pre-40S ribosomal subunit - State H2
提交 2020-07-29
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ASP ASPARTIC ACID × 1
MG MAGNESIUM ION × 131
ZN ZINC ION × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
7A09
Structure of a human ABCE1-bound 43S pre-initiation complex - State III
提交 2020-08-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:54-meric
|
链 U
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MET METHIONINE × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
7BWD
Structure of Dot1L-H2BK34ub Nucleosome Complex
提交 2020-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 11
PDB 声明:tridecameric
|
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
|
未记录
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.32 Å
|
|
7MQ9
Cryo-EM structure of the human SSU processome, state pre-A1*
提交 2021-05-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 70
PDB 声明:74-meric
|
链 NT
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 22
ZN ZINC ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.87 Å
|
|
7MQA
Cryo-EM structure of the human SSU processome, state post-A1
提交 2021-05-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 69
PDB 声明:72-meric
|
链 NT
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 64
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
7OOJ
Structure of D-Thr53 Ubiquitin
提交 2021-05-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–76(76 aa)
|
突变:Gly53D-Thr
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CD CADMIUM ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Bis-Tris, pH 7.5, 20 % polyethylene glycol monomethyl ether 2000, 50 mM CdCl2
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.269
|
|
7OOJ
Structure of D-Thr53 Ubiquitin
提交 2021-05-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1–76(76 aa)
|
突变:Gly53D-Thr
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CD CADMIUM ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Bis-Tris, pH 7.5, 20 % polyethylene glycol monomethyl ether 2000, 50 mM CdCl2
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.269
|
|
7QP6
Structure of the human 48S initiation complex in open state (h48S AUG open)
提交 2022-01-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:53-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5,
95 mM KOAc, 3.75 mM Mg(OAc)2, 1 mM ATP, 0.5 mM GTP, 0.25 mM spermidine, 2 mM DTT,
0.4 U/uL RiboLock RNase inhibitor
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Cryo-EM grids were prepared by
floating home-made continuous carbon on 40 ul sample in the wells of teflon block (custom-made). The sample-covered carbon was then adsorbed to an EM grid.
|
分辨率 4.70 Å
|
|
7QP7
Structure of the human 48S initiation complex in closed state (h48S AUG closed)
提交 2022-01-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:51-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM Hepes, pH 7.5,
95 mM KOAc, 3.75 mM Mg(OAc)2, 1 mM ATP, 0.5 mM GTP, 0.25 mM spermidine, 2 mM DTT,
0.4 U/uL RiboLock RNase inhibitor
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Cryo-EM grids were prepared by
floating home-made continuous carbon on 40 ul sample in the wells of teflon block (custom-made). The sample-covered carbon was then adsorbed to an EM grid.
|
分辨率 3.70 Å
|
|
7R4X
Cryo-EM reconstruction of the human 40S ribosomal subunit - Full map
提交 2022-02-09
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 34
PDB 声明:35-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 82
MG MAGNESIUM ION × 88
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.15 Å
|
|
7TQL
CryoEM structure of the human 40S small ribosomal subunit in complex with translation initiation factors eIF1A and eIF5B.
提交 2022-01-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:38-meric
|
链 g
85–149(65 aa)
|
未记录
|
GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1
5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
7WTT
Cryo-EM structure of a human pre-40S ribosomal subunit - State RRP12-A1 (with CK1)
提交 2022-02-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 33
PDB 声明:34-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
7WTU
Cryo-EM structure of a human pre-40S ribosomal subunit - State RRP12-A1 (without CK1)
提交 2022-02-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 32
PDB 声明:33-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
7WTV
Cryo-EM structure of a human pre-40S ribosomal subunit - State RRP12-A2
提交 2022-02-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 34
PDB 声明:35-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
7WTW
Cryo-EM structure of a human pre-40S ribosomal subunit - State RRP12-A3
提交 2022-02-05
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:37-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
7WTX
Cryo-EM structure of a human pre-40S ribosomal subunit - State RRP12-B1
提交 2022-02-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 33
PDB 声明:34-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
7WTZ
Cryo-EM structure of a human pre-40S ribosomal subunit - State RRP12-B2
提交 2022-02-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 33
PDB 声明:34-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
7WU0
Cryo-EM structure of a human pre-40S ribosomal subunit - State RRP12-B3
提交 2022-02-05
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 34
PDB 声明:35-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7XNY
High resolution cry-EM structure of the human 80S ribosome from SNORD127+/- Kasumi-1 cells
提交 2022-04-30
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:79-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 421
K POTASSIUM ION × 12
ZN ZINC ION × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å
|
|
8G5Y
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (IC state)
提交 2023-02-14
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
SPD SPERMIDINE × 13
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 11
K POTASSIUM ION × 77
MG MAGNESIUM ION × 524
ANM ANISOMYCIN × 1
3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 8
MET METHIONINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.29 Å
|
|
8G60
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (CR state)
提交 2023-02-14
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
SPD SPERMIDINE × 8
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 10
MG MAGNESIUM ION × 461
ANM ANISOMYCIN × 1
3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1
K POTASSIUM ION × 10
ZN ZINC ION × 7
PHE PHENYLALANINE × 1
MET METHIONINE × 1
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1
ZIY plitidepsin × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.54 Å
|
|
8G61
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (AC state)
提交 2023-02-14
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 4
K POTASSIUM ION × 16
MG MAGNESIUM ION × 326
ANM ANISOMYCIN × 1
SPD SPERMIDINE × 5
3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 8
MET METHIONINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å
|
|
8G6J
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (GA state 2)
提交 2023-02-15
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
SPD SPERMIDINE × 10
K POTASSIUM ION × 34
MG MAGNESIUM ION × 337
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 8
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
ZN ZINC ION × 8
PHE PHENYLALANINE × 1
MET METHIONINE × 1
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1
YRB (3R,6R,9S,12S,15S,18S,20R,24aR)-6-[(2S)-butan-2-yl]-3,12-bis[(1R)-1-hydroxy-2-methylpropyl]-8,9,11,17,18-pentamethyl-15-[(2S)-2-methylbutyl]hexadecahydropyrido[1,2-a][1,4,7,10,13,16,19]heptaazacyclohenicosine-1,4,7,10,13,16,19(21H)-heptone × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
8GLP
mRNA decoding in human is kinetically and structurally distinct from bacteria (Consensus LSU focused refined structure)
提交 2023-03-22
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:81-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
SPD SPERMIDINE × 15
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 9
K POTASSIUM ION × 152
MG MAGNESIUM ION × 671
ANM ANISOMYCIN × 1
3H3 4-{(2R,5S,6E)-2-hydroxy-5-methyl-7-[(2R,3S,4E,6Z,10E)-3-methyl-12-oxooxacyclododeca-4,6,10-trien-2-yl]-4-oxooct-6-en-1-yl}piperidine-2,6-dione × 1
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
ZN ZINC ION × 8
MET METHIONINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.67 Å
|
|
8IFD
Dibekacin-added human 80S ribosome
提交 2023-02-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:80-meric
|
链 3R
1–156(156 aa)
|
未记录
|
84D Dibekacin × 24
MG MAGNESIUM ION × 397
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å
|
|
8IFE
Arbekacin-added human 80S ribosome
提交 2023-02-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:80-meric
|
链 3R
1–156(156 aa)
|
未记录
|
84G Arbekacin × 23
MG MAGNESIUM ION × 410
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å
|
|
8IVB
K113-Ubiquitinated BAK
提交 2023-03-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;310 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成
20 mM sodium phosphate, 0.1 M sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供
|
|
8K2C
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with Tigecycline
提交 2023-07-12
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 259
T1C TIGECYCLINE × 9
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
8OZ0
Structure of a human 48S translation initiation complex with eIF4F and eIF4A
提交 2023-05-06
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 54
PDB 声明:57-meric
|
链 p
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 89
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
8PJ1
Structure of human 48S translation initiation complex in open codon scanning state (48S-1)
提交 2023-06-22
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 51
PDB 声明:54-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 90
ZN ZINC ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MET METHIONINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8PJ2
Structure of human 48S translation initiation complex in AUG recognition state after eIF5-induced GTP hydrolysis by eIF2 (48S-2)
提交 2023-06-22
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 46
PDB 声明:49-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 87
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8PJ3
Structure of human 48S translation initiation complex upon transfer of initiator tRNA to eIF5B (48S-3)
提交 2023-06-22
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 51
PDB 声明:54-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
NA SODIUM ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 89
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.70 Å
|
|
8PJ4
Structure of human 48S translation initiation complex after eIF5 release (48S-4)
提交 2023-06-22
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:53-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
NA SODIUM ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 89
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8PJ5
Structure of human 48S translation initiation complex after eIF2 release prior 60S subunit joining (48S-5)
提交 2023-06-22
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:51-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 91
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8PJ6
Structure of human 48S translation initiation complex with initiator tRNA, eIF1A and eIF3 (off-pathway)
提交 2023-06-22
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:50-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 87
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8PPL
MERS-CoV Nsp1 bound to the human 43S pre-initiation complex
提交 2023-07-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:52-meric
|
链 Af
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 116
MET METHIONINE × 1
UNX UNKNOWN LIGAND × 129
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.65 Å
|
|
8QOI
Structure of the human 80S ribosome at 1.9 A resolution - the molecular role of chemical modifications and ions in RNA
提交 2023-09-29
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:79-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 292
K POTASSIUM ION × 108
SPD SPERMIDINE × 2
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6;Titan Krios sample is prepared with Sodium cacodylate buffer.
CryoARM 300 sample is prepared with Hepes buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å
|
|
8T4S
MERS-CoV Nsp1 protein bound to the Human 40S Ribosomal subunit
提交 2023-06-09
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 97
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
8UKB
In situ HHT and CHX treated human hibernating state without E-tRNA 80S ribosome
提交 2023-10-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 255
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
WV3 4-{(2R)-2-[(1R,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å
|
|
8X7I
Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by intein-based E2-Ub-NCP conjugation strategy
提交 2023-11-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 11
PDB 声明:tridecameric
|
链 M
1–75(75 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å
|
|
8X7J
Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub/nucleosomes complex determined by activity-based chemical trapping strategy
提交 2023-11-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 11
PDB 声明:tridecameric
|
链 M
1–75(75 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å
|
|
8XP2
Cryo-EM structure of the human 40S ribosome with LARP1
提交 2024-01-02
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8XP3
Cryo-EM structure of the human 40S ribosome with LARP1 and LRRC47
提交 2024-01-02
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:37-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8XSX
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with Tigecycline, E-tRNA, SERBP1 and eEF2
提交 2024-01-10
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 259
T1C TIGECYCLINE × 7
ZN ZINC ION × 8
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
8XSY
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with Tigecycline, e-tRNA and CCDC124 (40S head Swivelled)
提交 2024-01-10
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 255
T1C TIGECYCLINE × 8
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8XSZ
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with Tigecycline, E-tRNA and P-tRNA
提交 2024-01-10
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 248
T1C TIGECYCLINE × 5
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8XXL
Cryo-EM structure of the human 40S ribosome with PDCD4
提交 2024-01-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 22
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8XXM
Cryo-EM structure of the human 40S ribosome with PDCD4 and eIF3G
提交 2024-01-18
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:37-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 23
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8XXN
Cryo-EM structure of the human 43S ribosome with PDCD4
提交 2024-01-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 49
PDB 声明:50-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 23
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8YOO
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with 100 um Tigecycline
提交 2024-03-13
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:81-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 257
T1C TIGECYCLINE × 6
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å
|
|
8YOP
Cryo-EM structure of the human 80S ribosome with 4 um Tigecycline
提交 2024-03-13
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:82-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 255
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
8ZDB
Cryo-EM structure of the human ubiquitylated 40S ribosome with RIOK3
提交 2024-05-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 37
PDB 声明:38-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
链 i
1–156(156 aa)
链 j
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8ZDC
Cryo-EM structure of the human ubiquitylated pre-40S ribosome with RIOK3
提交 2024-05-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 37
PDB 声明:38-meric
|
链 i
1–76(76 aa)
链 j
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
8ZDD
Cryo-EM structure of the human ubiquitylated pre-40S ribosome with RIOK3 (without NOB1)
提交 2024-05-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 36
PDB 声明:37-meric
|
链 i
1–76(76 aa)
链 j
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
9B0P
In situ human Hibernating class1 80S ribosome
提交 2024-03-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 255
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å
|
|
9B0Q
In situ human top-back di-ribosome structure (Composite map)
提交 2024-03-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 160
PDB 声明:172-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
链 sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 12
MG MAGNESIUM ION × 510
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9B0S
In situ human top-top di-ribosome structure (Composite map)
提交 2024-03-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 158
PDB 声明:171-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
链 sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 12
MG MAGNESIUM ION × 510
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
9BKD
The structure of human Pdcd4 bound to the 40S small ribosomal subunit
提交 2024-04-27
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
K POTASSIUM ION × 19
MG MAGNESIUM ION × 88
SPD SPERMIDINE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
|
9BLN
The structure of human Pdcd4 bound to the 40S-eIF4A-eIF3-eIF1 complex
提交 2024-04-30
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 49
PDB 声明:50-meric
|
链 k
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 88
K POTASSIUM ION × 19
SPD SPERMIDINE × 1
ZN ZINC ION × 3
ACY ACETIC ACID × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
9C3H
Structure of the CNOT3-bound human 80S ribosome with tRNA-ARG in the P-site.
提交 2024-06-01
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 77
PDB 声明:83-meric
|
链 Sz
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 326
K POTASSIUM ION × 94
B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å
|
|
9ED0
Human LARP1 bound to the 40S small ribosomal subunit
提交 2024-11-15
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
1–156(156 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 71
MG MAGNESIUM ION × 92
ZN ZINC ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9FQZ
CRYO-EM STRUCTURE OF HCT15 POLYSOMES BOUND TO EEF2, EBP1, AND SERBP1
提交 2024-06-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 271
K POTASSIUM ION × 104
ZN ZINC ION × 8
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 7
HYG HYGROMYCIN B × 1
SPD SPERMIDINE × 8
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ANM ANISOMYCIN × 1
NA SODIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å
|
|
9G8M
human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex
提交 2024-07-23
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 87
PDB 声明:92-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 232
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9G8O
human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex
提交 2024-07-23
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 49
PDB 声明:51-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
9I14
CRYO-EM STRUCTURE OF HCT15 POLYSOMES IN HYBRID-PRE STATE
提交 2025-01-15
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:82-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 40
MG MAGNESIUM ION × 267
NA SODIUM ION × 23
SPD SPERMIDINE × 1
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1
ZN ZINC ION × 7
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.34 Å
|
|
9I2D
NMT1-NAC bound human RNC with 10 amino acid ARF1-linker
提交 2025-01-20
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.19 Å
|
|
9I2E
NMT1-NAC bound human ribosome (combined translational states)
提交 2025-01-20
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 256
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å
|
|
9IJU
Sertraline enhances the deubiquitinase activity of USP7 by binding to its switching loop region
提交 2024-06-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–75(75 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Bis-tris pH 6.5, 0.2 M MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.270
|
|
9IJU
Sertraline enhances the deubiquitinase activity of USP7 by binding to its switching loop region
提交 2024-06-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–75(75 aa)
|
未记录
|
SRE (1S,4S)-4-(3,4-dichlorophenyl)-N-methyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Bis-tris pH 6.5, 0.2 M MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.270
|
|
9IJU
Sertraline enhances the deubiquitinase activity of USP7 by binding to its switching loop region
提交 2024-06-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
1–75(75 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Bis-tris pH 6.5, 0.2 M MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.270
|
|
9IJU
Sertraline enhances the deubiquitinase activity of USP7 by binding to its switching loop region
提交 2024-06-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 H
1–75(75 aa)
|
未记录
|
SRE (1S,4S)-4-(3,4-dichlorophenyl)-N-methyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Bis-tris pH 6.5, 0.2 M MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.46 Å
R-free 0.270
|
|
9IML
Sertraline enhances the deubiquitinase activity of USP7 by binding to its switching loop region
提交 2024-07-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–75(75 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Bis-tris pH 6.5, 0.2 M MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.78 Å
R-free 0.280
|
|
9IML
Sertraline enhances the deubiquitinase activity of USP7 by binding to its switching loop region
提交 2024-07-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1–75(75 aa)
|
未记录
|
XB7 1-[(4-fluorophenyl)methyl]-N-{1-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]piperidin-4-yl}-1H-benzimidazol-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Bis-tris pH 6.5, 0.2 M MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.78 Å
R-free 0.280
|
|
9IML
Sertraline enhances the deubiquitinase activity of USP7 by binding to its switching loop region
提交 2024-07-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
1–75(75 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Bis-tris pH 6.5, 0.2 M MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.78 Å
R-free 0.280
|
|
9IML
Sertraline enhances the deubiquitinase activity of USP7 by binding to its switching loop region
提交 2024-07-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 H
1–75(75 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1 M Bis-tris pH 6.5, 0.2 M MgCl2, 25% PEG3350
|
分辨率 2.78 Å
R-free 0.280
|
|
9IPU
cryo-EM structure of the RNF168(1-193)/UbcH5c-Ub ubiquitylation module bound to H1.0-K63-Ub3 modified chromatosome
提交 2024-07-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:tetradecameric
|
链 M
1–75(75 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å
|
|
9K4J
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA1.0
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:50-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
链 w
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9K4K
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA1.1
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 51
PDB 声明:51-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
链 v
1–76(76 aa)
链 w
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å
|
|
9K4L
Structure of substrate-engaged 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA1.2
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:48-meric
|
链 x
1–76(76 aa)
链 y
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.50 Å
|
|
9K4M
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA2.1
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:48-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9K4O
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA2.2
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:50-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
链 x
1–76(76 aa)
链 y
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.00 Å
|
|
9K4P
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EA2.3
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 49
PDB 声明:49-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
链 z
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å
|
|
9K4R
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EB.1
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:48-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9K4S
Structure of substrate-engaged 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EB.2
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:50-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
链 x
1–76(76 aa)
链 y
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å
|
|
9K4T
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EB.3
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 49
PDB 声明:49-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
链 z
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å
|
|
9K4U
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state EC1
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:48-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
9K54
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED2.2
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 51
PDB 声明:51-meric
|
链 w
1–76(76 aa)
链 x
1–76(76 aa)
链 y
1–76(76 aa)
链 z
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
9K55
Structure of substrate-engaged human 26S proteasome RP-CP subcomplex in state ED2.3
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 50
PDB 声明:50-meric
|
链 w
1–76(76 aa)
链 x
1–76(76 aa)
链 z
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å
|
|
9K56
Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state EA1
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 47
PDB 声明:47-meric
|
链 w
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
9K57
Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state EA2
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:48-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 5
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
9K58
Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state EB
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:48-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å
|
|
9K59
Structure of substrate-engaged single-cap human proteasome in state EC1
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 48
PDB 声明:48-meric
|
链 u
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å
|
|
9K5E
Structure of substrate-engaged double-cap human proteasome in state EA1-EA1
提交 2024-10-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 68
PDB 声明:68-meric
|
链 Au
1–76(76 aa)
链 Aw
1–76(76 aa)
链 Bu
1–76(76 aa)
链 Bw
1–76(76 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8
MG MAGNESIUM ION × 10
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
9KEN
cryo-EM structure of TRIP12 in complex with K29/48 branched-triUb
提交 2024-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
1–76(76 aa)
链 D
1–76(76 aa)
|
突变:K29C
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.63 Å
|
|
9KHS
Cryo-EM structure of Ufd2/Ubc4-Ub in complex with K29-linked diUb (monomeric conformation)
提交 2024-11-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 C
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.31 Å
|
|
9KHT
cryo-EM structure of Ufd2/Ubc4-Ub in complex with K29-linked triUb (dimeric conformation)
提交 2024-11-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 C
1–76(76 aa)
链 E
1–76(76 aa)
链 F
1–76(76 aa)
链 c
1–76(76 aa)
链 e
1–76(76 aa)
链 f
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.85 Å
|
|
9KKF
Structure of the human 40S ribosome complexed with HCV IRES and eIF3
提交 2024-11-13
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 43
PDB 声明:45-meric
|
链 sh
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9KMT
Bat SARSr-CoV RaTG15 Nsp1 bound to the Human 40S Ribosomal subunit-State1
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
78–151(74 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å
|
|
9KMU
Bat SARSr-CoV RaTG15 Nsp1 bound to the Human 40S Ribosomal subunit-State2
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
78–151(74 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.87 Å
|
|
9KMV
SARSr-MpCoV-GX Nsp1 bound to the Human 40S Ribosomal subunit-State1
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
78–151(74 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å
|
|
9KMW
SARSr-MpCoV-GX Nsp1 bound to the Human 40S Ribosomal subunit-State2
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
78–151(74 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.73 Å
|
|
9KMX
Bat MERSr-CoV NeoCoV Nsp1 bound to the Human 40S Ribosomal subunit-State1
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
78–151(74 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å
|
|
9KMY
Bat MERSr-CoV NeoCoV Nsp1 bound to the Human 40S Ribosomal subunit-State2
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
78–151(74 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
9KMZ
Bat MERSr-CoV NL140422 Nsp1 bound to the Human 40S Ribosomal subunit-State1
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
78–151(74 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å
|
|
9KN0
Bat MERSr-CoV NL140422 Nsp1 bound to the Human 40S Ribosomal subunit-State2
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:36-meric
|
链 f
78–151(74 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å
|
|
9KN5
Structure of the human 40S ribosome complexed with HCV IRES, eIF1A and eIF3
提交 2024-11-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 44
PDB 声明:46-meric
|
链 sh
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9KN6
Structure of the HCV IRES-dependent pre-48S translation initiation complex with eIF1A, eIF5B, and eIF3
提交 2024-11-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 45
PDB 声明:48-meric
|
链 sh
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 8
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9KRP
Structure of the HCV IRES-dependent 48S translation initiation complex with eIF5B and eIF3
提交 2024-11-28
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 44
PDB 声明:47-meric
|
链 sh
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 9
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9KZU
Cryo-EM structure of the HCV IRES-dependently initiated CMV-stalled 80S ribosome (non-rotated state) in complexed with eIF3
提交 2024-12-11
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 85
PDB 声明:92-meric
|
链 sh
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 81
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
9KZX
Cryo-EM structure of the HCV IRES-dependently initiated CMV-stalled 80S ribosome (rotated state) in complexed with eIF3
提交 2024-12-11
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 85
PDB 声明:93-meric
|
链 sh
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 66
ZN ZINC ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9L3L
Crystal structure of the C lobe of E6AP in complex with K48-linked diUb
提交 2024-12-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–76(76 aa)
链 C
1–73(73 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% v/v Polyethylene glycol 400
|
分辨率 2.59 Å
R-free 0.269
|
|
9M7O
Cryo-EM structure of Ufd2/Ubc4-ub complex with K29triUb(monomeric conformation)
提交 2025-03-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 C
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.14 Å
|
|
9O3V
Human 80S ribosome stalled on MYC nascent chain
提交 2025-04-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:82-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 352
K POTASSIUM ION × 165
SPD SPERMIDINE × 14
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 7
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20mM Tris, 100mM KOAc, 7.5mM MgOAc, 0.25mM Spermidine, 2mM DTT, 0.05% w/v b-OG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
9O3W
Human 80S ribosome bound to IDB-001 stalled on MYC nascent chain
提交 2025-04-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:82-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 170
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 7
SPD SPERMIDINE × 14
A1B75 (2R,3S,4S)-4-hydroxy-2-[(4-methoxyphenyl)methyl]pyrrolidin-3-yl {2-[(2S)-pyrrolidin-2-yl]ethyl}carbamate × 1
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
MG MAGNESIUM ION × 371
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20mM Tris, 100mM KOAc, 7.5mM MgOAc, 0.25mM Spermidine, 2mM DTT, 0.05% w/v b-OG, 50uM IDB-001
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å
|
|
9O3Y
Human 80S ribosome bound to IDB-002 stalled on FPAK-containing nascent chain
提交 2025-04-07
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 76
PDB 声明:82-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 168
SPD SPERMIDINE × 14
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 7
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2
MG MAGNESIUM ION × 332
A1B76 (2R,3S,4S)-4-hydroxy-2-[(4-methoxyphenyl)methyl]pyrrolidin-3-yl [(3-fluorophenyl)methyl]carbamate × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20mM Tris, 100mM KOAc, 7.5mM MgOAc, 0.25mM Spermidine, 2mM DTT, 0.05% w/v b-OG, 50uM IDB-001
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å
|
|
9P6Z
In situ human P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å
|
|
9P72
In situ human P-E state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9P73
In situ human eEF2-A/P-P/E state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.66 Å
|
|
9P76
In situ human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å
|
|
9P78
In situ human Hibernating rotate 3 with E-site tRNA state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
9P79
In situ human Hibernating rotate3 with Z site tRNA state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9P7A
In situ human hibernating class2 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å
|
|
9P7C
In situ human Hibernating class3 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å
|
|
9P7D
In situ human Hibernating class4 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å
|
|
9P7E
In situ human Hibernating class5 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å
|
|
9P7F
In situ HHT and CHX treated A-P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å
|
|
9P7G
In situ HHT and CHX treated A-P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å
|
|
9P7H
In situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å
|
|
9P7I
In situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å
|
|
9P7J
In situ HHT and CHX treated human P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å
|
|
9P7K
In situ human post eEF1A-A/T-P-E state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9P7L
In situ human Post-eEF1A-AT-P state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å
|
|
9P7N
In situ human Post-eEF1A-A/T-P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å
|
|
9P7O
In situ human AT-P-Z state ribosome
提交 2025-06-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å
|
|
9P7W
In situ human A-P state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å
|
|
9P7X
In situ human A-P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å
|
|
9P7Y
In situ human A-P-E state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å
|
|
9P8B
In situ human eEF1A-A/T-P-E state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:86-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.48 Å
|
|
9P8C
In situ human Hibernating class1 (rotate3) without E tRNA state 80S ribosome
提交 2025-06-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å
|
|
9P8H
In situ human A/P-P/E state 80S ribosome
提交 2025-06-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 218
ZN ZINC ION × 6
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å
|
|
9P8I
In situ HHT and CHX treated human P-Z state 80S ribosome
提交 2025-06-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
3HE 4-{(2R)-2-[(1S,3S,5S)-3,5-dimethyl-2-oxocyclohexyl]-2-hydroxyethyl}piperidine-2,6-dione × 1
HMT (3beta)-O~3~-[(2R)-2,6-dihydroxy-2-(2-methoxy-2-oxoethyl)-6-methylheptanoyl]cephalotaxine × 1
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.89 Å
|
|
9P9H
In situ human unrotated hibernating with CCDC124 state 80S ribosome
提交 2025-06-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:85-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å
|
|
9P9I
In situ human unrotated hibernating without CCDC124 state 80S ribosome
提交 2025-06-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å
|
|
9PA7
In situ human 80S consensus ribosome with EBP1
提交 2025-06-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:87-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 225
SPM SPERMINE × 8
SPD SPERMIDINE × 12
K POTASSIUM ION × 75
ZN ZINC ION × 7
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å
|
|
9PBE
In situ human 80S ribosome (composite map)
提交 2025-06-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 79
PDB 声明:84-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 225
SPM SPERMINE × 8
SPD SPERMIDINE × 12
K POTASSIUM ION × 75
ZN ZINC ION × 7
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.19 Å
|
|
9PKG
In situ human P state 80S ribosome
提交 2025-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 78
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
85–151(67 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 219
SPM SPERMINE × 7
SPD SPERMIDINE × 10
ZN ZINC ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å
|
|
9QLO
NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - State 1
提交 2025-03-21
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
G3D GUANOSINE-3'-MONOPHOSPHATE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.47 Å
|
|
9QLP
NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - State 2
提交 2025-03-21
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
G3D GUANOSINE-3'-MONOPHOSPHATE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å
|
|
9QLQ
NMT1-NAC bound human RNC with full length ARF1 - alternative State
提交 2025-03-21
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å
|
|
9RPV
Structure of the ZAK-bound human disome
提交 2025-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 154
PDB 声明:168-meric
|
链 Rf
1–156(156 aa)
链 sh
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 830
ZN ZINC ION × 7
ANM ANISOMYCIN × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.35 Å
|
|
9RU7
WT-HEK 80S ribosome bound to Kozak mRNA (WT-Kozak)
提交 2025-07-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:82-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 17
MG MAGNESIUM ION × 74
C CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2
NA SODIUM ION × 7
ZN ZINC ION × 5
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
9RU9
RPS26dC HEK mutant 80S ribosome bound to Kozak mRNA (RPS26dC-Kozak)
提交 2025-07-03
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:82-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.97 Å
|
|
9S3B
NMT1-NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker - State 1
提交 2025-07-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.38 Å
|
|
9S3C
NMT1-NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker - State 2
提交 2025-07-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 82
PDB 声明:88-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å
|
|
9S3D
NAC bound human RNC with 58 amino acid ARF1-linker
提交 2025-07-24
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 81
PDB 声明:87-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 191
ZN ZINC ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.32 Å
|
|
9SPF
CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN 80S RIBOSOME WITH A/P/E-SITE TRNA AND MRNA CONTAINING N1-METHYLPSEUDOURIDINE
提交 2025-09-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
K POTASSIUM ION × 151
MG MAGNESIUM ION × 225
NA SODIUM ION × 35
SPD SPERMIDINE × 19
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 9
ZN ZINC ION × 7
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
9SPI
CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN 80S RIBOSOME WITH A/P/E-SITE TRNA AND MRNA CONTAINING URIDINE
提交 2025-09-17
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–RNA
异源复合物;蛋白 × 75
PDB 声明:83-meric
|
链 Sf
1–156(156 aa)
|
未记录
|
PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 8
SPD SPERMIDINE × 18
MG MAGNESIUM ION × 195
K POTASSIUM ION × 75
ZN ZINC ION × 7
HYG HYGROMYCIN B × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å
|
|
9SYR
Human quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatD
提交 2025-10-13
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 80
PDB 声明:86-meric
|
链 Sr
1–156(156 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 10
COA COENZYME A × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.55 Å
|
|
9U5U
The 1:1 cryo-EM structure of BAP1/ASXL1-K351Ub in complex with H2AK119Ub nucleosome
提交 2025-03-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:tetradecameric
|
链 M
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å
|
|
9UUM
Cryo-EM structure of mezigdomide-organized CRL4-DDB1-CRBN-IKZF3(ZF2-ZF3)-UbcH5a-Ub ubiquitylation assembly
提交 2025-05-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 U
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 3.41 Å
|
|
9UV6
Encounter complex structure of E2N and Ubiquitin
提交 2025-05-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–76(76 aa)
|
未记录
|
A1EQF (5~{S},16~{S})-16-[2-[2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-1-yl]ethylamino]-2,11,12,17-tetraoxa-5,8-diaza-1$l^{4}-manganatricyclo[6.3.3.3^{1,5}]heptadecane-3,10,13-trione × 1
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.02;压力 1
NMR样品组成
0.6 mM [U-15N] Ubi, 0.2 mM E2N, 20 mM HEPES, 90 % H2O, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
|
9V0A
Cryo-EM structure of pomalidomide-organized CRL4-DDB1-CRBN-IKZF3(ZF2-ZF3)-UbcH5a-Ub ubiquitylation assembly
提交 2025-05-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 U
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 3.69 Å
|
|
9V0B
Cryo-EM structure of avadomide-organized CRL4-DDB1-CRBN-IKZF3(ZF2-ZF3)-UbcH5a-Ub ubiquitylation assembly
提交 2025-05-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 U
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 3.54 Å
|
|
9V0F
Cryo-EM structure of cemsidomide-organized CRL4-DDB1-CRBN-IKZF3(ZF2-ZF3)-UbcH5a-Ub ubiquitylation assembly
提交 2025-05-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 U
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 3.71 Å
|
|
9V9Q
Cryo-EM structure of the cPRC1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome
提交 2025-06-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:pentadecameric
|
链 R
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9V9R
Cryo-EM structure of the ncPRC1.1-UbcH5c E3-E2 complex bound to the H2BK120ub-modified nucleosome
提交 2025-06-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:pentadecameric
|
链 R
1–76(76 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 3.20 Å
|