SAXSdb — 8r3y

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein kinase C iota type

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 248–585	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 × 1 （Q15334） Partitioning defective 6 homolog alpha × 1 （Q9NPB6） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；4 ul of aPKCiota-Par6-Llgl1 complex at a concentration of 0.4 mg/ml was applied to R1.2/1.3 Quantifoil 300 mesh copper grids which had been glow-discharged for 45 s at 45 mA . Grids were blotted for 2.5 s at 100% humidity using an FEI Vitrobot MK IV.	分辨率 3.68 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8R3Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1VD2 Solution Structure of the PB1 domain of PKCiota 提交 2004-03-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 16–99（84 aa）片段：PB1 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride；压力 ambient NMR样品组成 1mM PKCiota PB1 U-15N, U-13C; 50mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride; 5mM ditiothreitol; 0.05%(w/v) sodium azide; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM PKCiota PB1 U-15N, U-13C; 50mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride; 5mM ditiothreitol; 0.05%(w/v) sodium azide; 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
1WMH Crystal structure of a PB1 domain complex of Protein kinase c iota and Par6 alpha 提交 2004-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 16–99（84 aa）片段：PB1 domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；sodium formate, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.224
1ZRZ Crystal Structure of the Catalytic Domain of Atypical Protein Kinase C-iota 提交 2005-05-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 224–587（364 aa）片段：catalytic domain, residues 224-587	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	BI1 3-{1-[3-(DIMETHYLAMINO)PROPYL]-1H-INDOL-3-YL}-4-(1H-INDOL-3-YL)-1H-PYRROLE-2,5-DIONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 400, sodium acetate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.333
3A8W Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；PEG3350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
3A8W Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；PEG3350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
3A8W Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588 链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；PEG3350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
3A8X Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
3A8X Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
3A8X Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588 链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
3ZH8 A novel small molecule aPKC inhibitor 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 248–596（349 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 248-596	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 C58 (2S)-3-phenyl-N~1~-[2-(pyridin-4-yl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]propane-1,2-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M AMMONIUM IODIDE AND 20%(W/V) PEG3350.	分辨率 2.74 Å R-free 0.257
3ZH8 A novel small molecule aPKC inhibitor 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 248–596（349 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 248-596	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 C58 (2S)-3-phenyl-N~1~-[2-(pyridin-4-yl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]propane-1,2-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M AMMONIUM IODIDE AND 20%(W/V) PEG3350.	分辨率 2.74 Å R-free 0.257
3ZH8 A novel small molecule aPKC inhibitor 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 248–596（349 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 248-596	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 C58 (2S)-3-phenyl-N~1~-[2-(pyridin-4-yl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]propane-1,2-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M AMMONIUM IODIDE AND 20%(W/V) PEG3350.	分辨率 2.74 Å R-free 0.257
5LI1 Structure of a Par3-inhibitory peptide bound to PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 248–596（349 aa）片段：UNP residues 246-589	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 K POTASSIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；32% Peg 2000 MME, 0.08 M KSCN	分辨率 2.00 Å R-free 0.217
5LI9 Structure of a nucleotide-bound form of PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 248–596（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 FMT FORMIC ACID × 7 IMD IMIDAZOLE × 1 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；293 K；25% Morpheus precipitant mix 4, 10% Morpheus Carboxylic acids, Morpheus Buffer system 1	分辨率 1.79 Å R-free 0.231
5LIH Structure of a peptide-substrate bound to PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 248–596（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MN MANGANESE (II) ION × 3 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；32% Peg 2000 MME, 0.08 M KSCN	分辨率 3.25 Å R-free 0.284
5LIH Structure of a peptide-substrate bound to PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 248–596（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；32% Peg 2000 MME, 0.08 M KSCN	分辨率 3.25 Å R-free 0.284
6ILZ Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor 提交 2018-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 249–588（340 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
6ILZ Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor 提交 2018-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 249–588（340 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
6ILZ Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor 提交 2018-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 249–588（340 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
6ILZ Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor 提交 2018-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 249–588（340 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
8R3X Crystal structure of aPKC Iota kinase domain with LLGL2 peptide 提交 2023-11-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 241–596（356 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；Morpheus Condition: 25% (v/v) MPD, 25% (v/v) PEG 1000, 25% (v/v) PEG 3350, 0.3 M NaNO3, 0.3 M Na2HPO4, 0.3 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5	分辨率 2.59 Å R-free 0.269
8R3X Crystal structure of aPKC Iota kinase domain with LLGL2 peptide 提交 2023-11-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 241–596（356 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；Morpheus Condition: 25% (v/v) MPD, 25% (v/v) PEG 1000, 25% (v/v) PEG 3350, 0.3 M NaNO3, 0.3 M Na2HPO4, 0.3 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5	分辨率 2.59 Å R-free 0.269
9EJK Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6b complex in nucleotide-free form. Head sub-complex region subtracted 提交 2024-11-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–596（596 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
9EJL Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6B complex in nucleotide-free form. Conformation with visible head sub-complex. 提交 2024-11-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–596（596 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å
9EJM Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6B complex in its ADP-bound form 提交 2024-11-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–596（596 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å

共 14 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KPCI_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–338； UniProt 248–585

Lethal(2) giant larvae protein homolog 1

Homo sapiens

UniProt Q15334

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 15–951	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Protein kinase C iota type × 1 （P41743） Partitioning defective 6 homolog alpha × 1 （Q9NPB6） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；4 ul of aPKCiota-Par6-Llgl1 complex at a concentration of 0.4 mg/ml was applied to R1.2/1.3 Quantifoil 300 mesh copper grids which had been glow-discharged for 45 s at 45 mA . Grids were blotted for 2.5 s at 100% humidity using an FEI Vitrobot MK IV.	分辨率 3.68 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	L2GL1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–937； UniProt 15–951

Partitioning defective 6 homolog alpha

Homo sapiens

UniProt Q9NPB6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 154–252	未记录	Protein kinase C iota type × 1 （P41743） Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 × 1 （Q15334） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；4 ul of aPKCiota-Par6-Llgl1 complex at a concentration of 0.4 mg/ml was applied to R1.2/1.3 Quantifoil 300 mesh copper grids which had been glow-discharged for 45 s at 45 mA . Grids were blotted for 2.5 s at 100% humidity using an FEI Vitrobot MK IV.	分辨率 3.68 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8R3Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1WMH Crystal structure of a PB1 domain complex of Protein kinase c iota and Par6 alpha 提交 2004-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 14–95（82 aa）片段：PB1 domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；sodium formate, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.224

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAR6A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–99； UniProt 154–252

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8r3y
沉积日期 deposition_date	2023-11-10
结构标题 title	Cryo EM structure of a stable LGL/aPKC Iota/Par-6 complex
关键词 keywords	Kinase, Polarity, Kinase substrate complex., CYTOSOLIC PROTEIN; CYTOSOLIC PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	35.15 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.33 Å
零角强度 I(0) i0	321529000.00
分子量 molecular_weight	143870.0 kDa
排除体积 excluded_volume	179850 Å³
包络体积 envelope_volume	239010 Å³
水化壳体积 shell_volume	56063 Å³
包络直径 envelope_diameter	113.3 Å
壳层 Rg shell_rg	42.37 Å
包络 Rg envelope_rg	34.16 Å
形状 Rg shape_rg	34.34 Å
总 Rg total_rg	34.89 Å
总原子数 total_atoms	20120
残基数 n_residues	1290
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	109.0 Å
Rg (实空间) rg_real	34.99 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.51 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.2150e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.7850e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	35.09 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	321600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9044
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	41.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.159
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.564
角度范围 angular_range	— – 0.2250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0003
最高正则化参数 α highest_alpha	83400000.0000
实空间数据点数 n_real_points	46
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.942; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.939

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein kinase C iota type
分子量 formula_weight	39146.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.13
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I
原子数 atom_count	20120

SLGLQDFDLLRVIGRGSYAKVLLVRLKKTDRIYAMKVVKKELVNDDEDIDWVQTEKHVFEQASNHPFLVGLHSCFQTESRLFFVIEYVNGGDLMFHMQRQRKLPEEHARFYSAEISLALNYLHERGIIYRDLKLDNVLLDSEGHIKLTDYGMCKEGLRPGDTTSTFCGTPNYIAPEILRGEDYGFSVDWWALGVLMFEMMAGRSPFDIVGSSDNPDQNTEDYLFQVILEKQIRIPRSLSVKAASVLKSFLNKDPKERLGCHPQTGFADIQGHPFFRNVDWDMMEQKQVVPPFKPNISGEFGLDNFDSQFTNEPVQLTPDDDDIVRKIDQSEFEGFEYI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Lethal(2) giant larvae protein homolog 1
分子量 formula_weight	101889.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

REKLKQELFAFNKTVEHGFPNQPSALAFDPELRIMAIGTRSGAVKIYGAPGVEFTGLHRDAATVTQMHFLTGQGRLLSLLDDSSLHLWEIVHHNGCAHLEEALSFQLPSRPGFDGASAPLSLTRVTVVLLVAAGDIAALGTEGSSVFFLDVTTLTLLEGQTLAPGEVLRSVPDDYRCGKALGPVESLQGHLRDPTKILIGYSRGLLVIWNQASQCVDHIFLGNQQLESLCWGRDSSTVVSSHSDGSYAVWSVDAGSFPTLQPTVATTPYGPFPCKAINKILWRNCESGGHFIIFSGGMPRASYGDRHCVSVLRAETLVTLDFTSRIIDFFTVHSTRPEDEFDDPQALAVLLEEELVVLDLQTPGWPAVPAPYLAPLHSSAITCSAHVASVPAKLWARIVSAGEQQSPQPVSSALSWPITGGRNLAQEPSQRGLLLTGHEDGTVRFWDASGVALRPLYKLSTAGLFQTDCEHADSLAQAAEDDWPPFRKVGCFDPYSDDPRLGVQKVALCKYTAQMVVAGTAGQVLVLELSDVPVEQAVSVAIIDLLQDREGFTWKGHERLSPRTGPLPWPAGFQPRVLVQCLPPAAVTAVTLHTEWSLVAFGTSHGFGLFDYQRKSPVLARCTLHPNDSLAMEGPLSRVKSLKKSLRQSFRRIRKSRVSGKKRAANASSKLQEANAQLAEQACPHDVEMTPVQRRIEPRSADDSLSGVVRCLYFADTFLRDGAHHGPTMWAGTNSGSVFAYALEVPAAAVGGEKRPEQAVEAVLGKEVQLMHRAPVVAIAVLDGRGRPLPEPYEASRDLAQAPDMQGGHAVLIASEEQFKVFTLPKVSAKTKFKLTAHEGCRVRKVALATFASVACEDYAETCLACLTNLGDVHVFSVPGLRPQVHYSCIRKEDISGIASCVFTRHGQGFYLISPSEFERFSLSARNITEPLCSLDI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Partitioning defective 6 homolog alpha
分子量 formula_weight	10856.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

THRRVRLHKHGSDRPLGFYIRDGMSVRVAPQGLERVPGIFISRLVRGGLAESTGLLAVSDEILEVNGIEVAGKTLDQVTDMMVANSHNLIVTVKPANQR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	506.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.68 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	121194

fit	/app/data/saxs_computation/r3/8r3y/8r3y.fit
pddf	/app/data/pr_computation/r3/8r3y/8r3y.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/r3/8r3y/8r3y.dat

Cryo EM structure of a stable LGL/aPKC Iota/Par-6 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein kinase C iota type

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Lethal(2) giant larvae protein homolog 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Partitioning defective 6 homolog alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)