8rg0

Structure of human eIF3 core from closed 48S translation initiation complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 208.3 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K

物种未注明

UniProt Q9UBQ5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 3; UniProt 1–218 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 27 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3K_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 3; PDB构建体 1–218; UniProt 1–218

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F

物种未注明

UniProt O00303

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 4; UniProt 1–357 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3F_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–357; UniProt 1–357

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L

物种未注明

UniProt Q9Y262

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 5; UniProt 1–564 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3L_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 5; PDB构建体 1–564; UniProt 1–564

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M

物种未注明

UniProt Q7L2H7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 6; UniProt 1–374 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 EIF3M_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 6; PDB构建体 1–374; UniProt 1–374

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H

物种未注明

UniProt O15372

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 8; UniProt 1–352 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3H_HUMAN
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 8; PDB构建体 1–352; UniProt 1–352

40S ribosomal protein S27

物种未注明

UniProt P42677

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 H; UniProt 1–84 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 199 个其他 PDB 条目、204 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS27_HUMAN
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–84; UniProt 1–84

40S ribosomal protein S13

物种未注明

UniProt P62277

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 I; UniProt 1–151 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 199 个其他 PDB 条目、204 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS13_HUMAN
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–151; UniProt 1–151

40S ribosomal protein S17

物种未注明

UniProt P08708

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 M; UniProt 1–135 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 199 个其他 PDB 条目、204 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS17_HUMAN
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–135; UniProt 1–135

40S ribosomal protein SA

物种未注明

UniProt P08865

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 N; UniProt 1–295 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 192 个其他 PDB 条目、197 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RSSA_HUMAN
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–295; UniProt 1–295

40S ribosomal protein S3a

物种未注明

UniProt P61247

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 O; UniProt 1–264 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 199 个其他 PDB 条目、204 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS3A_HUMAN
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–264; UniProt 1–264

40S ribosomal protein S14

物种未注明

UniProt P62263

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 P; UniProt 1–151 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 197 个其他 PDB 条目、202 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS14_HUMAN
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–151; UniProt 1–151

40S ribosomal protein S26

物种未注明

UniProt P62854

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 Q; UniProt 1–115 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 175 个其他 PDB 条目、180 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS26_HUMAN
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–115; UniProt 1–115

40S ribosomal protein S28

物种未注明

UniProt P62857

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 n; UniProt 1–69 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 197 个其他 PDB 条目、202 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS28_HUMAN
Isoform
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 n; PDB构建体 1–69; UniProt 1–69

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A

物种未注明

UniProt Q14152

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 u; UniProt 1–1382 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3A_HUMAN
Isoform
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 u; PDB构建体 1–1382; UniProt 1–1382

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E

物种未注明

UniProt P60228

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 v; UniProt 1–445 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3E_HUMAN
Isoform
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 v; PDB构建体 1–445; UniProt 1–445

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D

物种未注明

UniProt O15371

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 x; UniProt 1–548 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C × 1 (Q99613) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3D_HUMAN
Isoform
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 x; PDB构建体 1–548; UniProt 1–548

Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C

物种未注明

UniProt Q99613

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 17 RNA 2 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物数一致 链 y; UniProt 1–913 未记录 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K × 1 (Q9UBQ5) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F × 1 (O00303) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L × 1 (Q9Y262) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M × 1 (Q7L2H7) mRNA × 1 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H × 1 (O15372) 18S rRNA × 1 40S ribosomal protein S27 × 1 (P42677) 40S ribosomal protein S13 × 1 (P62277) 40S ribosomal protein S17 × 1 (P08708) 40S ribosomal protein SA × 1 (P08865) 40S ribosomal protein S3a × 1 (P61247) 40S ribosomal protein S14 × 1 (P62263) 40S ribosomal protein S26 × 1 (P62854) 40S ribosomal protein S28 × 1 (P62857) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A × 1 (Q14152) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E × 1 (P60228) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D × 1 (O15371) MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 26 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EIF3C_HUMAN
Isoform
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 y; PDB构建体 1–913; UniProt 1–913

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8rg0

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8rg0
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8rg0
沉积日期 deposition_date2023-12-13
结构标题 titleStructure of human eIF3 core from closed 48S translation initiation complex
关键词 keywordsRIBOSOME, TRANSLATION, initiation, 48S, eIF, human, eukaryotic, factor, codon, scanning, open, reading; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier63.38
回转半径 Rg (电子) rg_electron62.57
零角强度 I(0) i03558670000.00
分子量 molecular_weight447610.0 kDa
排除体积 excluded_volume537180 ų
包络体积 envelope_volume928230 ų
水化壳体积 shell_volume123800 ų
包络直径 envelope_diameter207.3
壳层 Rg shell_rg63.60
包络 Rg envelope_rg60.90
形状 Rg shape_rg62.57
总 Rg total_rg62.58
总原子数 total_atoms31340
残基数 n_residues4085
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax208.3
Rg (实空间) rg_real63.39
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.41
I(0) (实空间) i0_real3.5590e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.6130e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal63.33
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3558000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8688
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary66.7
偏度 Skewness skewness0.252
峰度 Kurtosis kurtosis-0.627
角度范围 angular_range— – 0.1250 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha244400000.0000
实空间数据点数 n_real_points26
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.921; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.532

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (21)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)