|
2BCX
Crystal structure of calmodulin in complex with a ryanodine receptor peptide
提交 2005-10-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
3614–3643(30 aa)
片段:residues 3614-3643
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.7;293 K;23% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, 5 mM DTT, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.249
|
|
2XOA
Crystal Structure of the N-terminal three domains of the skeletal muscle Ryanodine Receptor (RyR1)
提交 2010-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–559(559 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-559
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;pH 8
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.234
|
|
3HSM
Crystal structure of distal N-terminal beta-trefoil domain of Ryanodine Receptor type 1
提交 2009-06-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–210(210 aa)
片段:sequence database residues 1-210
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;0.1M MES, 0.1M MgCl2, 24% PEG 3350, 5mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.276
|
|
3HSM
Crystal structure of distal N-terminal beta-trefoil domain of Ryanodine Receptor type 1
提交 2009-06-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1–210(210 aa)
片段:sequence database residues 1-210
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;0.1M MES, 0.1M MgCl2, 24% PEG 3350, 5mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.276
|
|
3ILA
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205)
提交 2009-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
9–205(197 aa)
片段:N-Terminal Domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.320
|
|
3ILA
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205)
提交 2009-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
9–205(197 aa)
片段:N-Terminal Domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.320
|
|
3ILA
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205)
提交 2009-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
9–205(197 aa)
片段:N-Terminal Domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.320
|
|
3ILA
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205)
提交 2009-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
9–205(197 aa)
片段:N-Terminal Domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.320
|
|
3ILA
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205)
提交 2009-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
9–205(197 aa)
片段:N-Terminal Domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.320
|
|
3ILA
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205)
提交 2009-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 F
9–205(197 aa)
片段:N-Terminal Domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.320
|
|
3ILA
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205)
提交 2009-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 7
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 G
9–205(197 aa)
片段:N-Terminal Domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.320
|
|
3ILA
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205)
提交 2009-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 8
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 H
9–205(197 aa)
片段:N-Terminal Domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.320
|
|
3ILA
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205)
提交 2009-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 9
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 I
9–205(197 aa)
片段:N-Terminal Domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.320
|
|
3J8H
Structure of the rabbit ryanodine receptor RyR1 in complex with FKBP12 at 3.8 Angstrom resolution
提交 2014-10-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–1491(1491 aa)
链 A
1510–1976(467 aa)
链 A
2057–2460(404 aa)
链 A
2494–2562(69 aa)
链 A
2734–2940(207 aa)
链 A
3645–5037(1393 aa)
链 C
1–1491(1491 aa)
链 C
1510–1976(467 aa)
链 C
2057–2460(404 aa)
链 C
2494–2562(69 aa)
链 C
2734–2940(207 aa)
链 C
3645–5037(1393 aa)
链 E
1–1491(1491 aa)
链 E
1510–1976(467 aa)
链 E
2057–2460(404 aa)
链 E
2494–2562(69 aa)
链 E
2734–2940(207 aa)
链 E
3645–5037(1393 aa)
链 G
1–1491(1491 aa)
链 G
1510–1976(467 aa)
链 G
2057–2460(404 aa)
链 G
2494–2562(69 aa)
链 G
2734–2940(207 aa)
链 G
3645–5037(1393 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 mM MOPS sodium, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 2 mM EGTA, 0.015% Tween20, protein inhibitors;pH 7.4;20 mM MOPS sodium, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 2 mM EGTA, 0.015% Tween20, protein inhibitors
cryo-EM玻璃化条件
protein solution was applied to glow-discharged carbon coated grid and blotted for 2 seconds before plunging;冷冻剂 NITROGEN;Protein solution was applied to glow-discharged carbon coated grid and blotted for 2 seconds before plunging into liquid nitrogen (FEI VITROBOT MARK III)
|
分辨率 3.80 Å
|
|
3RQR
Crystal structure of the RYR domain of the rabbit ryanodine receptor
提交 2011-04-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
2733–2940(208 aa)
片段:Residues 2733-2940
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;291 K;1.2M Na Citrate, 100mM Tris pH8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.16 Å
R-free 0.258
|
|
4ERT
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (2734-2940)
提交 2012-04-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2734–2940(207 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;19% PEG3350, 30% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.225
|
|
4ESU
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 mutant S2776M
提交 2012-04-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2734–2940(207 aa)
|
突变:S2776M
|
GOL GLYCEROL × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;25% PEG3350, 25% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
|
分辨率 1.59 Å
R-free 0.229
|
|
4ETT
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 mutant E2764K
提交 2012-04-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2734–2940(207 aa)
|
突变:E2764K
|
GOL GLYCEROL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;25% PEG3350, 25% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.287
|
|
4ETU
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 mutant R2939S
提交 2012-04-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2734–2940(207 aa)
|
突变:R2939S
|
GOL GLYCEROL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;15% PEG3350, 25% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
|
分辨率 2.19 Å
R-free 0.262
|
|
4I0Y
CRYSTAL STRUCTURE OF RABBIT RYANODINE RECEPTOR 1 (RESIDUES 1-536) DISEASE MUTANT C36R
提交 2012-11-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–536(536 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变:C36R
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 9.5;pH 9.5, EVAPORATION
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.246
|
|
4I1E
Crystal structure of Rabbit Ryanodine Receptor 1 (residues 1-536) disease mutant G249R
提交 2012-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–536(536 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变:G249R
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8;pH 8.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.258
|
|
4I2S
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant I404M
提交 2012-11-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–536(536 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变:I404M
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8;pH 8.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.249
|
|
4I37
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant R402G
提交 2012-11-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–536(536 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变:R402G
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;pH 6.5, EVAPORATION
|
分辨率 2.95 Å
R-free 0.289
|
|
4I3N
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant D61N
提交 2012-11-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–536(536 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变:D61N
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 9.5;pH 9.5, EVAPORATION
|
分辨率 2.95 Å
R-free 0.257
|
|
4I6I
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-559) disease mutant R45C
提交 2012-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–559(559 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-559
|
突变:R45C
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 7;pH 7.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.277
|
|
4I7I
Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant L14R
提交 2012-11-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–536(536 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变:L14R
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8;pH 8.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.249
|
|
4I8M
Crystal structure of rabbit Ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant V219I
提交 2012-12-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–536(536 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变:V219I
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 9;pH 9.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.253
|
|
4I96
Crystal structure of the N-terminal two domains of the skeletal muscle ryanodine receptor (rabbit RyR1) residues 217-536
提交 2012-12-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
217–536(320 aa)
片段:N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 217-536
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未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 8;pH 8.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.73 Å
R-free 0.241
|
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4P9J
Crystal Structure of rabbit Ryanodine Receptor 1 SPRY2 Domain (1070-1246)
提交 2014-04-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1070–1246(177 aa)
片段:UNP Residues 1070-1246
|
未记录
|
未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298.15 K;sodium citrate
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.220
|
|
4P9J
Crystal Structure of rabbit Ryanodine Receptor 1 SPRY2 Domain (1070-1246)
提交 2014-04-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1070–1246(177 aa)
片段:UNP Residues 1070-1246
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298.15 K;sodium citrate
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.220
|
|
4P9J
Crystal Structure of rabbit Ryanodine Receptor 1 SPRY2 Domain (1070-1246)
提交 2014-04-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1070–1246(177 aa)
片段:UNP Residues 1070-1246
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298.15 K;sodium citrate
|
分辨率 1.84 Å
R-free 0.220
|
|
4UWA
Structure of the ryanodine receptor at resolution of 6.1 A in closed state
提交 2014-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–533(533 aa)
链 A
649–1571(923 aa)
链 A
2734–2939(206 aa)
链 B
1–533(533 aa)
链 B
649–1571(923 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 C
1–533(533 aa)
链 C
649–1571(923 aa)
链 C
2734–2939(206 aa)
链 D
1–533(533 aa)
链 D
649–1571(923 aa)
链 D
2734–2939(206 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
10 MM MOPS, 200MM NACL, 2MM DTT, 1MM EGTA;pH 7.4;10 MM MOPS, 200MM NACL, 2MM DTT, 1MM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
|
分辨率 6.10 Å
|
|
4UWE
Structure of the ryanodine receptor at resolution of 8.5 A in partially open state
提交 2014-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–533(533 aa)
链 A
649–1571(923 aa)
链 A
2734–2939(206 aa)
链 B
1–533(533 aa)
链 B
649–1571(923 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 C
1–533(533 aa)
链 C
649–1571(923 aa)
链 C
2734–2939(206 aa)
链 D
1–533(533 aa)
链 D
649–1571(923 aa)
链 D
2734–2939(206 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
10 MM MOPS, 200 MM NACL, 2 MM DTT AND 10 MM CACL2, 0.2% FLUORINATED OCTYL- MALTOSIDE;pH 7.4;10 MM MOPS, 200 MM NACL, 2 MM DTT AND 10 MM CACL2, 0.2% FLUORINATED OCTYL- MALTOSIDE
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
|
分辨率 8.50 Å
|
|
5C30
Crystal Structure of Rabbit Ryanodine Receptor 1 Repeat12 Domain
提交 2015-06-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
857–1054(198 aa)
片段:repeat12 domain (UNP residues 857-1054)
|
突变:C906A, C937A, C1040A
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IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;0.1 M HEPES, pH 7.0, 19% w/v PEG20000
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.165
|
|
5GKY
Structure of RyR1 in a closed state (C1 conformer)
提交 2016-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 E
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.015% Tween20 (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
5GKZ
Structure of RyR1 in a closed state (C3 conformer)
提交 2016-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 E
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.015% Tween20 (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å
|
|
5GL0
Structure of RyR1 in a closed state (C4 conformer)
提交 2016-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 E
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.015% Tween20 (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
|
|
5GL1
Structure of RyR1 in an open state
提交 2016-07-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 E
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.5% CHAPS (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco),50 uM CaCl2 and 10 uM PCB95
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å
|
|
5J8V
Structure of rabbit ryanodine receptor RyR1 open state activated by calcium ion
提交 2016-04-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;1:1000 diluted protease inhibitor cocktail was also added in buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Grids were blotted for 2s before plunging.
|
分辨率 4.90 Å
|
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5T15
Structural basis for gating and activation of RyR1 (30 uM Ca2+ dataset, all particles)
提交 2016-08-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–5037(1399 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–5037(1399 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–5037(1399 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–5037(1399 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 3.60 Å
|
|
5T9M
Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 1)
提交 2016-09-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–5037(1399 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–5037(1399 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–5037(1399 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–5037(1399 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.00 Å
|
|
5T9N
Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 2)
提交 2016-09-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–5037(1399 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–5037(1399 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–5037(1399 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–5037(1399 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 3.80 Å
|
|
5T9R
Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 3)
提交 2016-09-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–5037(1399 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–5037(1399 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–5037(1399 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–5037(1399 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 5.80 Å
|
|
5T9S
Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 4)
提交 2016-09-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–5037(1399 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–5037(1399 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–5037(1399 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–5037(1399 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.20 Å
|
|
5T9V
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1)
提交 2016-09-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4540–5037(498 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4540–5037(498 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4540–5037(498 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4540–5037(498 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å
|
|
5TA3
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 2)
提交 2016-09-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å
|
|
5TAL
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1&2)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å
|
|
5TAM
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 4)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å
|
|
5TAN
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å
|
|
5TAP
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, all particles)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å
|
|
5TAQ
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3&4)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.10 Å
|
|
5TAS
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 1)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 6.20 Å
|
|
5TAT
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 2)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.80 Å
|
|
5TAU
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 3)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 6.20 Å
|
|
5TAV
Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 4)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.80 Å
|
|
5TAW
Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, all particles)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å
|
|
5TAX
Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 1)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 6.60 Å
|
|
5TAY
Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 2)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.60 Å
|
|
5TAZ
Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 3)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å
|
|
5TB0
Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, all particles)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å
|
|
5TB1
Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 1)
提交 2016-09-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.60 Å
|
|
5TB2
Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 2)
提交 2016-09-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.60 Å
|
|
5TB3
Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 3)
提交 2016-09-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.70 Å
|
|
5TB4
Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 4)
提交 2016-09-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
12–1275(1264 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–4253(615 aa)
链 B
4541–5037(497 aa)
链 E
12–1275(1264 aa)
链 E
1573–2479(907 aa)
链 E
2734–2939(206 aa)
链 E
3639–4253(615 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
12–1275(1264 aa)
链 G
1573–2479(907 aa)
链 G
2734–2939(206 aa)
链 G
3639–4253(615 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 I
12–1275(1264 aa)
链 I
1573–2479(907 aa)
链 I
2734–2939(206 aa)
链 I
3639–4253(615 aa)
链 I
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.50 Å
|
|
6FG3
Structure of Ryanodine receptor 1 in nanodiscs in the presence of calcium, ATP and ryanodine
提交 2018-01-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–1275(1275 aa)
链 A
1573–2479(907 aa)
链 A
2734–2939(206 aa)
链 A
3639–5037(1399 aa)
链 B
1–1275(1275 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–5037(1399 aa)
链 C
1–1275(1275 aa)
链 C
1573–2479(907 aa)
链 C
2734–2939(206 aa)
链 C
3639–5037(1399 aa)
链 D
1–1275(1275 aa)
链 D
1573–2479(907 aa)
链 D
2734–2939(206 aa)
链 D
3639–5037(1399 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.30 Å
|
|
6FOO
Structure of Ryanodine Receptor 1 in nanodiscs in the presence of calcium and ATP
提交 2018-02-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–1297(1297 aa)
链 A
1573–2479(907 aa)
链 A
2734–2939(206 aa)
链 A
3639–5037(1399 aa)
链 B
1–1297(1297 aa)
链 B
1573–2479(907 aa)
链 B
2734–2939(206 aa)
链 B
3639–5037(1399 aa)
链 C
1–1297(1297 aa)
链 C
1573–2479(907 aa)
链 C
2734–2939(206 aa)
链 C
3639–5037(1399 aa)
链 D
1–1297(1297 aa)
链 D
1573–2479(907 aa)
链 D
2734–2939(206 aa)
链 D
3639–5037(1399 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å
|
|
6M2W
Structure of RyR1 (Ca2+/Caffeine/ATP/CaM1234/CHL)
提交 2020-03-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–2634(2634 aa)
链 A
2741–2939(199 aa)
链 A
3623–4253(631 aa)
链 A
4541–5037(497 aa)
链 D
1–2634(2634 aa)
链 D
2741–2939(199 aa)
链 D
3623–4253(631 aa)
链 D
4541–5037(497 aa)
链 G
1–2634(2634 aa)
链 G
2741–2939(199 aa)
链 G
3623–4253(631 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
链 J
1–2634(2634 aa)
链 J
2741–2939(199 aa)
链 J
3623–4253(631 aa)
链 J
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6WOT
Cryo-EM structure of recombinant rabbit Ryanodine Receptor type 1 mutant R164C in complex with FKBP12.6
提交 2020-04-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:R164C
突变:R164C
突变:R164C
突变:R164C
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å
|
|
7CF9
Structure of RyR1 (Ca2+/CHL)
提交 2020-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–2634(2634 aa)
链 A
2741–2939(199 aa)
链 A
3623–4253(631 aa)
链 A
4541–5037(497 aa)
链 C
1–2634(2634 aa)
链 C
2741–2939(199 aa)
链 C
3623–4253(631 aa)
链 C
4541–5037(497 aa)
链 E
1–2634(2634 aa)
链 E
2741–2939(199 aa)
链 E
3623–4253(631 aa)
链 E
4541–5037(497 aa)
链 G
1–2634(2634 aa)
链 G
2741–2939(199 aa)
链 G
3623–4253(631 aa)
链 G
4541–5037(497 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å
|
|
7M6A
High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor
提交 2021-03-25
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 I
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
CFF CAFFEINE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å
|
|
7M6L
High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor
提交 2021-03-25
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 I
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
CFF CAFFEINE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å
|
|
7T64
Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the closed state
提交 2021-12-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:Y523S
突变:Y523S
突变:Y523S
突变:Y523S
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
|
分辨率 4.00 Å
|
|
7T65
Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the open state
提交 2021-12-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:Y523S
突变:Y523S
突变:Y523S
突变:Y523S
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
|
分辨率 4.05 Å
|
|
7TDG
Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in inactivated conformation (Dataset-A)
提交 2021-12-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–1275(1275 aa)
链 A
1565–2486(922 aa)
链 A
2704–2941(238 aa)
链 A
3614–5037(1424 aa)
链 B
1–1275(1275 aa)
链 B
1565–2486(922 aa)
链 B
2704–2941(238 aa)
链 B
3614–5037(1424 aa)
链 C
1–1275(1275 aa)
链 C
1565–2486(922 aa)
链 C
2704–2941(238 aa)
链 C
3614–5037(1424 aa)
链 D
1–1275(1275 aa)
链 D
1565–2486(922 aa)
链 D
2704–2941(238 aa)
链 D
3614–5037(1424 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 8
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4
POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 3.80 Å
|
|
7TDH
Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in open conformation
提交 2021-12-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–1275(1275 aa)
链 A
1565–2486(922 aa)
链 A
2704–2941(238 aa)
链 A
3614–5037(1424 aa)
链 B
1–1275(1275 aa)
链 B
1565–2486(922 aa)
链 B
2704–2941(238 aa)
链 B
3614–5037(1424 aa)
链 C
1–1275(1275 aa)
链 C
1565–2486(922 aa)
链 C
2704–2941(238 aa)
链 C
3614–5037(1424 aa)
链 D
1–1275(1275 aa)
链 D
1565–2486(922 aa)
链 D
2704–2941(238 aa)
链 D
3614–5037(1424 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 8
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 4.00 Å
|
|
7TDI
Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in closed-inactivated conformation class 2 (Dataset-A)
提交 2021-12-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–1275(1275 aa)
链 A
1565–2486(922 aa)
链 A
2704–2941(238 aa)
链 A
3614–5037(1424 aa)
链 B
1–1275(1275 aa)
链 B
1565–2486(922 aa)
链 B
2704–2941(238 aa)
链 B
3614–5037(1424 aa)
链 C
1–1275(1275 aa)
链 C
1565–2486(922 aa)
链 C
2704–2941(238 aa)
链 C
3614–5037(1424 aa)
链 D
1–1275(1275 aa)
链 D
1565–2486(922 aa)
链 D
2704–2941(238 aa)
链 D
3614–5037(1424 aa)
|
未记录
|
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7TDJ
Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in closed-inactivated conformation class 1(Dataset-A)
提交 2021-12-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–1275(1275 aa)
链 A
1565–2486(922 aa)
链 A
2704–2941(238 aa)
链 A
3614–5037(1424 aa)
链 B
1–1275(1275 aa)
链 B
1565–2486(922 aa)
链 B
2704–2941(238 aa)
链 B
3614–5037(1424 aa)
链 C
1–1275(1275 aa)
链 C
1565–2486(922 aa)
链 C
2704–2941(238 aa)
链 C
3614–5037(1424 aa)
链 D
1–1275(1275 aa)
链 D
1565–2486(922 aa)
链 D
2704–2941(238 aa)
链 D
3614–5037(1424 aa)
|
未记录
|
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 3.70 Å
|
|
7TDK
Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in closed-inactivated conformation class 3 (Dataset-A)
提交 2021-12-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–1275(1275 aa)
链 A
1565–2486(922 aa)
链 A
2704–2941(238 aa)
链 A
3614–5037(1424 aa)
链 B
1–1275(1275 aa)
链 B
1565–2486(922 aa)
链 B
2704–2941(238 aa)
链 B
3614–5037(1424 aa)
链 C
1–1275(1275 aa)
链 C
1565–2486(922 aa)
链 C
2704–2941(238 aa)
链 C
3614–5037(1424 aa)
链 D
1–1275(1275 aa)
链 D
1565–2486(922 aa)
链 D
2704–2941(238 aa)
链 D
3614–5037(1424 aa)
|
未记录
|
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 3.80 Å
|
|
7TZC
A drug and ATP binding site in type 1 ryanodine receptor
提交 2022-02-15
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 I
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 20
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8
ZN ZINC ION × 4
CFF CAFFEINE × 4
KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4
L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.45 Å
|
|
8DRP
Focus/local refined map in C4 of signal subtracted RyR1 particles
提交 2022-07-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CFF CAFFEINE × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å
|
|
8DTB
Focus/local refined map in C1 of signal subtracted RyR1 particles in complex with ImperaCalcin
提交 2022-07-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 J
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å
|
|
8DUJ
Global map in C1 of RyR1 particles in complex with ImperaCalcin
提交 2022-07-27
|
构建体不同
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:tridecameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 J
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
8DVE
RyR1 in presence of IpCa-T26E phosphomimetic and activating ligands
提交 2022-07-28
|
构建体不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 J
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å
|
|
8RRT
Structure of rabbit RyR1 reconstituted into lipid liposomes in open state in complex with FKBP and Nb9657
提交 2024-01-23
|
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 B
11–5037(5027 aa)
链 E
11–5037(5027 aa)
链 G
11–5037(5027 aa)
链 J
11–5037(5027 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å
|
|
8RRV
Structure of RyR1 in detergent in close state in complex with FKBP and Nb9657.
提交 2024-01-23
|
构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 B
1–5037(5037 aa)
链 E
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 J
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
8RRW
Structure of RyR1 in detergent in open state in complex with FKBP and Nb9657.
提交 2024-01-23
|
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 B
11–5037(5027 aa)
链 E
11–5037(5027 aa)
链 G
11–5037(5027 aa)
链 J
11–5037(5027 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
|
|
8RRX
Structure of RyR1 reconstituted into lipid nanodisc in primed state in complex with Ca2+, ATP, caffeine and Nb9657
提交 2024-01-23
|
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
11–5037(5027 aa)
链 D
11–5037(5027 aa)
链 G
11–5037(5027 aa)
链 I
11–5037(5027 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8RS0
Structure of RyR1 in detergent in primed state in complex with nanobody and FKBP
提交 2024-01-24
|
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 B
11–5037(5027 aa)
链 E
11–5037(5027 aa)
链 G
11–5037(5027 aa)
链 J
11–5037(5027 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8SEN
Cryo-EM Structure of RyR1
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å
|
|
8SEO
Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å
|
|
8SEP
Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å
|
|
8SEQ
Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8SER
Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ADN ADENOSINE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å
|
|
8SES
Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
ADE ADENINE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å
|
|
8SET
Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å
|
|
8SEU
Cryo-EM Structure of RyR1 (Local Refinement of TMD)
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8SEV
Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S (Local Refinement of TMD)
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å
|
|
8SEW
Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP (Local Refinement of TMD)
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å
|
|
8SEX
Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP (Local Refinement of TMD)
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å
|
|
8SEY
Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine (Local Refinement of TMD)
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ADN ADENOSINE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å
|
|
8SEZ
Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine (Local Refinement of TMD)
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ADE ADENINE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å
|
|
8SF0
Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP (Local Refinement of TMD)
提交 2023-04-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8X48
Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (EGTA)
提交 2023-11-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å
|
|
8X49
Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (100 nM Ca2+)
提交 2023-11-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
8X4A
Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0,100 nM Ca2+, closed state)
提交 2023-11-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
8X4B
Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0,100 nM Ca2+, open state)
提交 2023-11-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
|
|
8X4C
Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (20 uM Ca2+, 2 mM ATP)
提交 2023-11-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
8X4D
Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0,20 uM Ca2+, 2 mM ATP)
提交 2023-11-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
8X4E
Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0, 5 mM Ca2+)
提交 2023-11-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
8XJI
Structure of chimeric RyR complex with flubendiamide
提交 2023-12-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
|
A1LVX Flubendiamide × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å
|
|
8XKH
Structure of chimeric RyR Complex with tetraniliprole
提交 2023-12-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
A1LV1 tetraniliprole × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.87 Å
|
|
8XLF
Structure of chimeric RyR
提交 2023-12-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
突变:R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S
|
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å
|
|
8XLH
Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E
提交 2023-12-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E
突变:R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E
突变:R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E
突变:R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E
|
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å
|
|
8Y40
Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E complex with chlorantraniliprole
提交 2024-01-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E
突变:R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E
突变:R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E
突变:R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E
|
F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4
ZN ZINC ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å
|
|
9CGP
RyR1 disease mutant Y523S with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the absence of calcium with refined P1 domain
提交 2024-06-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:Y523S
突变:Y523S
突变:Y523S
突变:Y523S
|
ZN ZINC ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
U1C Dantrolene × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.34 Å
|
|
9CGQ
Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the presence of activating calcium
提交 2024-06-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
突变:Y523S
突变:Y523S
突变:Y523S
突变:Y523S
|
ZN ZINC ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
U1C Dantrolene × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å
|
|
9E17
Structure of RyR1 in the primed state in the presence of caffeine (reprocessed/reanalyzed from EMPIAR-10997, 7TZC, EMD-26205)
提交 2024-10-21
|
构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 I
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 20
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8
ZN ZINC ION × 4
CFF CAFFEINE × 4
KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4
L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.45 Å
|
|
9E18
Structure of RyR1 in the primed state in the presence of pentoxifylline
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
PNX 3,7-DIMETHYL-1-(5-OXOHEXYL)-3,7-DIHYDRO-1H-PURINE-2,6-DIONE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM pentoxifylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å
|
|
9E19
Structure of RyR1 in the open state in the presence of pentoxifylline
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
PNX 3,7-DIMETHYL-1-(5-OXOHEXYL)-3,7-DIHYDRO-1H-PURINE-2,6-DIONE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM pentoxifylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.04 Å
|
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9E1A
Structure of RyR1 in the primed state in the presence of dyphylline
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
A1BD2 dyphylline × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM dyphylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å
|
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9E1B
Structure of RyR1 in the open state in the presence of dyphylline
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
A1BD2 dyphylline × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM dyphylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.49 Å
|
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9E1C
Structure of RyR1 in the primed state in the presence of IBMX
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
IBM 3-ISOBUTYL-1-METHYLXANTHINE × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM IBMX was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å
|
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9E1D
Structure of RyR1 in the primed state in the presence of enprofylline
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
A1BD3 enprofylline × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM enprofylline was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å
|
|
9E1E
Structure of RyR1 in the primed state in the presence of uracil
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
URA URACIL × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM uracil was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å
|
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9E1F
Structure of RyR1 in the primed state in the presence of allopurinol
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
A1BD4 allopurinol × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM allopurinol was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å
|
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9E1G
Structure of RyR1 in the primed state in the presence of oxypurinol
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
141 Oxypurinol × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM oxypurinol was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å
|
|
9E1H
Structure of RyR1 in the primed state in the presence of oxopyricid
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
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ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
A1BD5 oxopyricid × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM oxopyricid was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å
|
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9E1I
Structure of RyR1 in the open state in the presence of oxopyricid
提交 2024-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 B
1–5037(5037 aa)
链 C
1–5037(5037 aa)
链 D
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
A1BD5 oxopyricid × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;2 mM oxopyricid was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
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|
9HEO
Open-state RyR1 in 0.05% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP
提交 2024-11-14
|
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
11–5037(5027 aa)
链 C
11–5037(5027 aa)
链 G
11–5037(5027 aa)
链 J
11–5037(5027 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 72
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
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9HEQ
Open-state RyR1 in 0.01% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP12
提交 2024-11-14
|
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
11–5037(5027 aa)
链 C
11–5037(5027 aa)
链 G
11–5037(5027 aa)
链 J
11–5037(5027 aa)
|
未记录
|
POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 40
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
9OL4
Cryo-EM Structure of Ryanodine Receptor 1: Drug Bound Open Conformation
提交 2025-05-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 M
1–5037(5037 aa)
链 S
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 12
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å
|
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9OL5
Rabbit Ryanodine Receptor 1: Atorvastatin Bound Closed Conformation
提交 2025-05-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 M
1–5037(5037 aa)
链 S
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 4
117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 4
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å
|
|
9OL6
Rabbit Ryanodine Receptor 1: DMSO Control Closed Conformation
提交 2025-05-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–5037(5037 aa)
链 G
1–5037(5037 aa)
链 M
1–5037(5037 aa)
链 S
1–5037(5037 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å
|
|
9R8O
Primed-state RyR1 in 0.05% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP
提交 2025-05-16
|
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 C
11–5037(5027 aa)
链 F
11–5037(5027 aa)
链 I
11–5037(5027 aa)
链 J
11–5037(5027 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 40
ZN ZINC ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
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9RCW
Primed-state RyR1 in 0.01% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP12
提交 2025-05-30
|
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:12-meric
|
链 A
11–5037(5027 aa)
链 C
11–5037(5027 aa)
链 G
11–5037(5027 aa)
链 J
11–5037(5027 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
CFF CAFFEINE × 4
CA CALCIUM ION × 4
POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 24
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|