SAXSdb — 8sr6

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic huntingtin interacting protein B

Legionella pneumophila subsp. pneumophila

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 84–532	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Bis-Tris 6.5 and 38% PPG P400	分辨率 2.22 Å R-free 0.230

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8SR6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5CZY Crystal structure of LegAS4 提交 2015-08-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 63–545（483 aa）片段：UNP residues 63-545	未记录	GOL GLYCEROL × 3 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1M sodium citrate, 15 % (v/v) isopropanol, 10%(w/v) PEG 10000	分辨率 2.20 Å R-free 0.248
8SWI Crystal structure of legAS4 from Legionella pneumophila subsp. pneumophila with histone H3 (1-12)peptide 提交 2023-05-18	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 84–532（449 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Bis-Tris 6.5 and 38% PPG P400	分辨率 3.00 Å R-free 0.310

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5ZUS4_LEGPH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–451； UniProt 84–532

Histone 3 peptide

物种未注明

UniProt Q6NXT2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 4–18	未记录	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Bis-Tris 6.5 and 38% PPG P400	分辨率 2.22 Å R-free 0.230

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8SR6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
21GE Solution structures of BRD9 bromodomain in complex with histone H3 acetyl-lysine 18 (H3K18ac) peptide 提交 2025-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 12–26（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）Null；压力 1 NMR样品组成 500 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 500 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
21HJ Solution structures of BRD9 bromodomain in complex with histone H3 lactyl-lysine 18 (H3K18la) peptide 提交 2025-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 12–26（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）null；压力 1 NMR样品组成 500 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 500 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 2 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
3KV4 Structure of PHF8 in complex with histone H3 提交 2009-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–25（24 aa）片段：UNP Residues 2-25	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2 FE2 FE (II) ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；25% (v/v) polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl, and 0.1 M NaCitrate pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.19 Å R-free 0.255
4Z5T The nucleosome containing human H3.5 提交 2015-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric	链 A 1–135（135 aa）链 E 1–135（135 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.269
7W67 The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide 提交 2021-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 2–10（9 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.222
7W6I The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me1 peptide 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–10（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.56 Å R-free 0.244
7W6J The crystal structure of MLL1 (N3861I/Q3867L/C3882SS)-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me2 peptide 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–10（9 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350	分辨率 2.68 Å R-free 0.252
7W6L The crystal structure of MLL3-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide 提交 2021-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 M 2–10（9 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 10% polyethylene glycol 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.26 Å R-free 0.223
8Q1G LSD1-CoREST bound to Acetylated K14 of Histone H3 提交 2023-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–22（21 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Tartrate 1.2M, ADA 0.1M,	分辨率 2.60 Å R-free 0.255
8Q1H LSD1 Y391K-CoREST bound to Histone H3 N-terminal tail 提交 2023-07-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–22（21 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Tartrate 1.2 M, ADA 0.1M	分辨率 2.90 Å R-free 0.254
8Q1J LSD1 Y391K-CoREST bound to Acetylated K14 of Histone H3 提交 2023-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–22（21 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Tartate 1.2 M, ADA 0.1M	分辨率 2.87 Å R-free 0.272
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric	链 M 1–135（135 aa）链 S 1–135（135 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8T4F Transporter associated with antigen processing (TAP) bound to the 9-mer peptide RRYQKSTEL 提交 2023-06-09	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 52–60（9 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8VLD Crystal structure of Ash1L PHD finger in complex with histone H3K4me2 提交 2024-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 2–12（11 aa）链 T 2–12（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1.6 M sodium citrate pH 6.5	分辨率 1.92 Å R-free 0.249
8VLF Crystal structure of Ash1L PHD finger in complex with histone H3K4me3 提交 2024-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 2–13（12 aa）链 T 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1.6 M sodium citrate pH 6.5	分辨率 1.34 Å R-free 0.188
8Z73 Crystal Structure of AF9 in complex with H3K9la peptide 提交 2024-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4M Sodium Malonate	分辨率 2.91 Å R-free 0.221
8Z73 Crystal Structure of AF9 in complex with H3K9la peptide 提交 2024-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4M Sodium Malonate	分辨率 2.91 Å R-free 0.221
8Z73 Crystal Structure of AF9 in complex with H3K9la peptide 提交 2024-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4M Sodium Malonate	分辨率 2.91 Å R-free 0.221
8Z73 Crystal Structure of AF9 in complex with H3K9la peptide 提交 2024-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.4M Sodium Malonate	分辨率 2.91 Å R-free 0.221
8ZXC NMR solution structures of ASH1L BRD-PHD domain in complex with H3K4me2 peptide 提交 2024-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–13（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）null；压力 1 NMR样品组成 100 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 100 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
9C0O Crystal structure of DmCfp1 PHD finger bound to H3K4me3 提交 2024-05-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–16（15 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；15% PEG3350, 0.01M Tris pH8.5, 0.2M Ammonium sulfate	分辨率 1.53 Å R-free 0.194
9DZN KAT6A MYST domain complexed with a H3K14-CoA bisubstrate inhibitor 提交 2024-10-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 6–24（19 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL* GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；294.15 K；1.25 M NH4SO4, 0.28 M NaCl, and 0.1 M HEPES pH 6.4	分辨率 1.72 Å R-free 0.245
9IM4 Crystal Structure of AF9 YEATS domain F28R mutant in complex with histone H3K9la 提交 2024-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.1M DL Malic acid pH7.0	分辨率 2.79 Å R-free 0.315
9IM4 Crystal Structure of AF9 YEATS domain F28R mutant in complex with histone H3K9la 提交 2024-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–11（10 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2.1M DL Malic acid pH7.0	分辨率 2.79 Å R-free 0.315
9N61 Transporter associated with antigen processing (TAP) bound to the 9-mer peptide RRYQKSTEL and ATP 提交 2025-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 52–60（9 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9V5M The crystal structure of RBBP4-H3 complex 提交 2025-05-26	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–15（14 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.211

共 22 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H3C_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–15； UniProt 4–18

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8sr6
沉积日期 deposition_date	2023-05-05
结构标题 title	Crystal structure of legAS4 from Legionella pneumophila subsp. pneumophila with histone H3 (3-17)peptide
关键词 keywords	ankyrin repeats, histone methyltransferase activity, CELL INVASION; CELL INVASION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	25.42 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	24.48 Å
零角强度 I(0) i0	49173300.00
分子量 molecular_weight	54231.0 kDa
排除体积 excluded_volume	67751 Å³
包络体积 envelope_volume	81852 Å³
水化壳体积 shell_volume	27837 Å³
包络直径 envelope_diameter	85.5 Å
壳层 Rg shell_rg	31.81 Å
包络 Rg envelope_rg	24.81 Å
形状 Rg shape_rg	24.46 Å
总 Rg total_rg	25.38 Å
总原子数 total_atoms	3824
残基数 n_residues	466
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	80.9 Å
Rg (实空间) rg_real	25.36 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.42 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.9170e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.0550e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	25.38 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	49170000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9055
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.248
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.529
角度范围 angular_range	— – 0.3100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	12630000.0000
实空间数据点数 n_real_points	63
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.924; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.996

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Eukaryotic huntingtin interacting protein B
分子量 formula_weight	51917.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3970

NADEWIDTSKIMLDLHIDNMSSSDYIPSAIDRTDLVMVQSVHLLRKTGGRGLFAREDIPKGTCIGIYTGEVYSEQEFEQYLKEHVGSDKSYAMYVGGRVIDAARKGNLTRYINFSDSQDNAEFVETTLNRKKVAKVITTKNIKAGQQLLINYNTYEEQASRYYYFLNPGDGWLSAQEFYQTYQSQYRLEQMPYNLEGFDLKAGDRVLMTQIGRIILANYSLAKEQELNASDIDLPFLKVGSDEKILDFDEADTFTPLMAACYLGQVENVKWLIEHGANIDQQQSHSGHCPLSLTLKGYSLAKDTQKYIDIIQLLIKNQVNLLVHDRSDKTFLHNAALVLNNLDFQSVVKFLIGQNPIDINEYFTYIDENDFDIVMHCYNNKLFDKALVLLAFYPDYFKRNYMSDNEGHNQFNINAFRKAIKDFNSNERSILLMQLRESGLHLPEDLLEQLG

来源 Source

来源生物 organism	Legionella pneumophila subsp. pneumophila
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	91891
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone 3 peptide
分子量 formula_weight	1591.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

TKQTARKSTGGKAPR

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
分子量 formula_weight	384.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	127

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	69.320 Å
晶胞边长 b length_b	69.320 Å
晶胞边长 c length_c	196.010 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.220 Å
最低分辨率 resolution_low	44.210 Å
R 因子 r_factor	0.1873
R_work r_work	0.1850
R_free r_free	0.2299

fit	/app/data/saxs_computation/sr/8sr6/8sr6.fit
pddf	/app/data/pr_computation/sr/8sr6/8sr6.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/sr/8sr6/8sr6.dat

Crystal structure of legAS4 from Legionella pneumophila subsp. pneumophila with histone H3 (3-17)peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic huntingtin interacting protein B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone 3 peptide

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)