8txp

Crystal structure of 05.GC.w13.01 Fab in complex with H1 HA from A/California/04/2009(H1N1)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 135.2 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin

Influenza A virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 12 其他聚合物 15 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 18–344	片段：HA1 subdomain (UNP residues 18-344)	Hemagglutinin × 3 （I1ZFF9） GC_w13_A, Fab heavy chain × 3 GC_w13_A, Fab light chain × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate, pH 6.2, 20% PEG3350	分辨率 2.75 Å R-free 0.292

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8TXP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
24KR Structural basis of influenza A virus neutralization by broadly active single-domain antibody G2.3 recognizing glycosylated epitope within hemagglutinin stem 提交 2026-03-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–518（518 aa）链 B 1–518（518 aa）链 C 1–518（518 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.53 Å
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 B 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 D 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 F 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 H 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 J 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3AL4 Crystal structure of the swine-origin A (H1N1)-2009 influenza A virus hemagglutinin (HA) reveals similar antigenicity to that of the 1918 pandemic virus 提交 2010-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 L 345–520（176 aa）片段：UNP residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.87 Å R-free 0.270
3LZG Crystal structure of a 2009 H1N1 influenza virus hemagglutinin 提交 2010-03-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.60 Å R-free 0.252
3LZG Crystal structure of a 2009 H1N1 influenza virus hemagglutinin 提交 2010-03-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.60 Å R-free 0.252
3UBE Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand LSTc 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.15 Å R-free 0.252
3UBE Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand LSTc 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.15 Å R-free 0.252
3UBJ Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand LSTa 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.25 Å R-free 0.252
3UBJ Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand LSTa 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.25 Å R-free 0.252
3UBN Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand 6SLN 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.51 Å R-free 0.253
3UBN Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand 6SLN 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.51 Å R-free 0.253
3UBQ Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand 3SLN 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 B 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 C 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 D 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 E 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 F 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.00 Å R-free 0.249
3UBQ Influenza hemagglutinin from the 2009 pandemic in complex with ligand 3SLN 提交 2011-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 H 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 I 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 J 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520 链 K 18–344（327 aa）片段：Ectodomain HA1, residues 18-344 链 L 345–518（174 aa）片段：Ectodomain HA2, residues 345-520	突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C 突变：G205C, R220C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295.5 K；27% PEG-MME 2000, 0.1M Tris pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.00 Å R-free 0.249
3UYW Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	未记录	TAU 2-AMINOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
3UYW Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
3UYW Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	未记录	TAU 2-AMINOETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
3UYW Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.198
3UYX Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	突变：D228G	NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；20% PEG 3350, 0.2M ammonium nitrate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.201
3UYX Crystal structures of globular head of 2009 pandemic H1N1 hemagglutinin 提交 2011-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 65–278（214 aa）片段：UNP residues 65-278	突变：D228G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；20% PEG 3350, 0.2M ammonium nitrate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.201
3ZTN STRUCTURE OF INFLUENZA A NEUTRALIZING ANTIBODY SELECTED FROM CULTURES OF SINGLE HUMAN PLASMA CELLS IN COMPLEX WITH HUMAN H1 INFLUENZA HAEMAGGLUTININ. 提交 2011-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 18–344（327 aa）片段：HA1, RESIDUES 18-344 链 B 345–520（176 aa）片段：HA2, RESIDUES 345-520	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SO4 SULFATE ION × 15 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.289
4JTV Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin complexed with human receptor analogue LSTc 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 B 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506 链 C 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 D 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506 链 E 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 F 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.275
4JTV Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin complexed with human receptor analogue LSTc 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 H 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506 链 I 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 J 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506 链 K 18–338（321 aa）片段：UNP residues 18-338 链 L 345–506（162 aa）片段：UNP residues 345-506	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.275
4JTX Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin mutant D225E 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 B 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510 链 C 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 D 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510 链 E 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 F 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510	突变：D228E 突变：D228E 突变：D228E	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.243
4JTX Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin mutant D225E 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 H 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510 链 I 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 J 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510 链 K 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 L 345–510（166 aa）片段：UNP residues 345-510	突变：D228E 突变：D228E 突变：D228E	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.243
4JU0 Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin mutant D225E complexed with human receptor analogue LSTc 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 B 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508 链 C 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 D 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508 链 E 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 F 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508	突变：D228E 突变：D228E 突变：D228E	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.91 Å R-free 0.283
4JU0 Crystal structure of 2009 pandemic influenza virus hemagglutinin mutant D225E complexed with human receptor analogue LSTc 提交 2013-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 H 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508 链 I 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 J 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508 链 K 18–339（322 aa）片段：UNP residues 18-339 链 L 345–508（164 aa）片段：UNP residues 345-508	突变：D228E 突变：D228E 突变：D228E	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10% PEG 6000, 5% MPD, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.91 Å R-free 0.283
4M4Y Crystal structure of a 2009 H1N1 influenza virus hemagglutinin with a stabilization mutation HA2 E47G 提交 2013-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 18–344（327 aa）片段：ectodomain (residues 18-344) 链 B 345–518（174 aa）片段：ectodomain (residues 345-518) 链 C 18–344（327 aa）片段：ectodomain (residues 18-344) 链 D 345–518（174 aa）片段：ectodomain (residues 345-518) 链 E 18–344（327 aa）片段：ectodomain (residues 18-344) 链 F 345–518（174 aa）片段：ectodomain (residues 345-518)	突变：E47G 突变：E47G 突变：E47G	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；295 K；0.1 M Tris, pH 8.8, 25% w/v MPEG2000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.20 Å R-free 0.232
5GJS Crystal structure of H1 hemagglutinin from A/California/04/2009 in complex with a neutralizing antibody 3E1 提交 2016-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 18–344（327 aa）片段：UNP residues 18-344 链 B 345–520（176 aa）片段：neutralizing antibody 3E1	突变：G212C, R227C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES and 16% PEG 550MME	分辨率 2.90 Å R-free 0.303
5K9O Crystal structure of multidonor HV1-18+HD3-9 class broadly neutralizing Influenza A antibody 31.b.09 in complex with Hemagglutinin H1 A/California/04/2009 提交 2016-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 F 18–520（503 aa）链 I 18–520（503 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M imidazole, pH 6.5, 0.1M MgCl2, 1.75M NaCl, and 15% PEG-3350	分辨率 3.39 Å R-free 0.346
5WKO Crystal structure of antibody 27F3 recognizing the HA from A/California/04/2009 (H1N1) influenza virus 提交 2017-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 M 18–344（327 aa）链 N 18–344（327 aa）链 O 18–344（327 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268
5WKO Crystal structure of antibody 27F3 recognizing the HA from A/California/04/2009 (H1N1) influenza virus 提交 2017-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 S 18–344（327 aa）链 T 18–344（327 aa）链 U 18–344（327 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid pH 4.0	分辨率 3.49 Å R-free 0.268
7FAH Immune complex of head region of CA09 HA and neutralizing antibody 12H5 提交 2021-07-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 18–518（501 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M MES pH 6.5, 13% (w/v) PEG 2000	分辨率 3.15 Å R-free 0.289
7FAH Immune complex of head region of CA09 HA and neutralizing antibody 12H5 提交 2021-07-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 18–518（501 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M MES pH 6.5, 13% (w/v) PEG 2000	分辨率 3.15 Å R-free 0.289
7MEM CryoEM structure of monoclonal Fab 045-09 2B05 binding the lateral patch of influenza virus H1 HA 提交 2021-04-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 345–518（174 aa）链 B 345–518（174 aa）链 C 18–344（327 aa）链 D 345–518（174 aa）链 E 18–344（327 aa）链 F 18–344（327 aa）	突变：E47G 突变：E47G 突变：E47G	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；TBS + LMNG cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7T3D CryoEM map of anchor 222-1C06 Fab and lateral patch 2B05 Fab binding H1 HA 提交 2021-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 18–344（327 aa）链 B 345–518（174 aa）链 E 18–344（327 aa）链 F 18–344（327 aa）链 G 345–518（174 aa）链 I 345–518（174 aa）	突变：E47K 突变：E47K 突变：E47K	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Tris-buffered saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
8TXM Crystal structure of 05.GC.w13.02 Fab in complex with H1 HA from A/California/04/2009(H1N1) 提交 2023-08-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 18–341（324 aa）片段：HA1 subdomain (UNP residues 18-344)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate, pH 6.2, 20% PEG3350	分辨率 3.25 Å R-free 0.287

共 21 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C3W5S1_I09A0
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–331； UniProt 18–344

Hemagglutinin

Influenza A virus

UniProt I1ZFF9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 12 其他聚合物 15 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 326–499	片段：HA2 subdomain (UNP residues 326-499)	Hemagglutinin × 3 （C3W5S1） GC_w13_A, Fab heavy chain × 3 GC_w13_A, Fab light chain × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate, pH 6.2, 20% PEG3350	分辨率 2.75 Å R-free 0.292

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8TXP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8TY7 Crystal structure of 05.GC.w2.3C10 Fab in complex with H1 HA from A/California/04/2009(H1N1) 提交 2023-08-24	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 B 326–499（174 aa）片段：HA2 subdomain (UNP residues 326-499)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate, pH 6.4, 18% PEG3350	分辨率 3.21 Å R-free 0.288
9Y3X Crystal structure of hemagglutinin from H1N1 Influenza A virus A/California/04/2009 bound to the 3_H2 antibody 提交 2025-09-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 326–499（174 aa）片段：HA2 subdomain (UNP residues 326-499)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Tri-potassium citrate, 20% (w/v) PEG3350, pH 8.3	分辨率 3.39 Å R-free 0.261
9Y3Y Crystal structure of hemagglutinin from H1N1 Influenza A virus A/California/04/2009 bound to the 49_C09 antibody 提交 2025-09-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 326–499（174 aa）片段：HA2 subdomain (UNP residues 326-499)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2M ammonium sulfate, 15% (v/v) ethylene glycol, 0.2M lithium sulfate, 0.1M CAPS, pH 10.5	分辨率 3.80 Å R-free 0.240
9Y3Y Crystal structure of hemagglutinin from H1N1 Influenza A virus A/California/04/2009 bound to the 49_C09 antibody 提交 2025-09-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 326–499（174 aa）片段：HA2 subdomain (UNP residues 326-499)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2M ammonium sulfate, 15% (v/v) ethylene glycol, 0.2M lithium sulfate, 0.1M CAPS, pH 10.5	分辨率 3.80 Å R-free 0.240

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I1ZFF9_9INFA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–174； UniProt 326–499

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8txp
沉积日期 deposition_date	2023-08-24
结构标题 title	Crystal structure of 05.GC.w13.01 Fab in complex with H1 HA from A/California/04/2009(H1N1)
关键词 keywords	H1N1, Antibody, Hemagglutinin, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	40.93 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	40.88 Å
零角强度 I(0) i0	173444000.00
分子量 molecular_weight	105250.0 kDa
排除体积 excluded_volume	131030 Å³
包络体积 envelope_volume	185340 Å³
水化壳体积 shell_volume	40291 Å³
包络直径 envelope_diameter	140.3 Å
壳层 Rg shell_rg	42.90 Å
包络 Rg envelope_rg	40.31 Å
形状 Rg shape_rg	40.90 Å
总 Rg total_rg	40.95 Å
总原子数 total_atoms	7404
残基数 n_residues	930
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	135.2 Å
Rg (实空间) rg_real	41.06 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.33 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7340e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.2720e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	40.93 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	173400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8538
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	34.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.282
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.722
角度范围 angular_range	— – 0.1950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	14090000.0000
实空间数据点数 n_real_points	40
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.862; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.768; Smooth: 0.742

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Hemagglutinin
分子量 formula_weight	36729.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	7404

ADPGDTLCIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLLEDKHNGKLCKLRGVAPLHLGKCNIAGWILGNPECESLSTASSWSYIVETPSSDNGTCYPGDFIDYEELREQLSSVSSFERFEIFPKTSSWPNHDSNKGVTAACPHAGAKSFYKNLIWLVKKGNSYPKLSKSYINDKGKEVLVLWGIHHPSTSADQQSLYQNADTYVFVGSSRYSKKFKPEIAIRPKVRDQEGRMNYYWTLVEPGDKITFEATGNLVVPRYAFAMERNAGSGIIISDTPVHDCNTTCQTPKGAINTSLPFQNIHPITIGKCPKYVKSTKLRLATGLRNIPSIQSR

来源 Source

来源生物 organism	Influenza A virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11320
宿主生物 host_organism	Spodoptera aff. frugiperda 1 BOLD-2017

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Hemagglutinin
分子量 formula_weight	20206.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GLFGAIAGFIEGGWTGMVDGWYGYHHQNEQGSGYAADLKSTQNAIDGITNKVNSVIEKMNTQFTAVGKEFNHLEKRIENLNKKVDDGFLDIWTYNAELLVLLENERTLDYHDSNVKNLYEKVRSQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCDNTCMESVKNGTYDYPKYSEEAKLNREEIDSGR

来源 Source

来源生物 organism	Influenza A virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11320
宿主生物 host_organism	Spodoptera aff. frugiperda 1 BOLD-2017

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	GC_w13_A, Fab heavy chain
分子量 formula_weight	23561.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCEASGVTFSSYAVSWVRQAPGQGLEWMGGIIPIVGTANYAQKFQGRVTITADGLTSTVYMELSRLRSEDTAVYFCAREATWKGSSIGVLGIWGQGTMVTVSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	GC_w13_A, Fab light chain
分子量 formula_weight	23397.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISDYLNWYQQKPGKAPSLLIFSASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQNYNTPRTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	128.350 Å
晶胞边长 b length_b	128.350 Å
晶胞边长 c length_c	155.756 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 3 2 1
空间群编号 int_tables_number	150
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.750 Å
最低分辨率 resolution_low	45.240 Å
R 因子 r_factor	0.2517
R_work r_work	0.2496
R_free r_free	0.2918

fit	/app/data/saxs_computation/tx/8txp/8txp.fit
pddf	/app/data/pr_computation/tx/8txp/8txp.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/tx/8txp/8txp.dat

Crystal structure of 05.GC.w13.01 Fab in complex with H1 HA from A/California/04/2009(H1N1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Hemagglutinin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 branched

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)