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2L7E
The structure of a domain from yeast
提交 2010-12-08
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构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1–123(123 aa)
片段:YEATS domain residues 1-123
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.12;压力 ambient
NMR样品组成
20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供
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3QRL
Crystal Structure of the Taf14 YEATS domain
提交 2011-02-18
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1–137(137 aa)
片段:YEATS Domain (UNP Residues 1-137)
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未记录
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PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298 K;42.5% (v/v) PEG-600, 100 mM Sodium Citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.235
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5D7E
Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with H3K9ac
提交 2015-08-13
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
1–137(137 aa)
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未记录
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PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;291 K;0.2 M sodium citrate and 48% PEG600 (v/v)
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.218
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5IOK
Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with histone H3K9cr
提交 2016-03-08
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
1–137(137 aa)
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未记录
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PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;291 K;44% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)
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分辨率 2.22 Å
R-free 0.239
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5SVA
Mediator-RNA Polymerase II Pre-Initiation Complex
提交 2016-08-05
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 38
PDB 声明:40-meric
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链 n
1–244(244 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 15.30 Å
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6LQZ
Solution structure of Taf14ET-Sth1EBMC
提交 2020-01-15
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构建体不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
174–244(71 aa)
片段:Taf14ET
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Taf14ET, 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Sth1EBMC, 20 mM Phosphate buffer, 100 mM sodium chloride, 1 % v/v inhabitor cocktail, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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6MIN
Crystal structure of Taf14 YEATS domain G82A mutant in complex with histone H3K9cr
提交 2018-09-19
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构建体不同
突变/修饰不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
1–137(137 aa)
片段:YEATS domain residues 1-137
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突变:G82A
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;44% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.256
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6MIO
Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with histone H3K9pr
提交 2018-09-19
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构建体不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
1–137(137 aa)
片段:YEATS domain residues 1-137
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;46% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)
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分辨率 1.85 Å
R-free 0.232
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6MIP
Crystal structure of Taf14 YEATS domain G82A mutant
提交 2018-09-19
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1–137(137 aa)
片段:YEATS domain residues 1-137
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突变:G82A
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PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;48% PEG600 with 0.2 M sodium citrate (pH 6.0)
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.219
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6MIQ
Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with histone H3K9bu
提交 2018-09-19
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构建体不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
1–137(137 aa)
片段:YEATS domain residues 1-137
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;44% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)
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分辨率 1.75 Å
R-free 0.218
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7F4A
Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with H3K9bz peptide
提交 2021-06-18
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构建体不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
2–137(136 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;289 K;48% PEG 600, 0.04M citric acid
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.204
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7UHE
Taf14 ET domain in complex with C-terminal tail of Taf2
提交 2022-03-26
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 A
168–243(76 aa)
片段:ET domain
链 C
168–243(76 aa)
片段:ET domain
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;296 K;2.4 M sodium malonate
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分辨率 1.66 Å
R-free 0.234
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9UUO
The NuA3 histone acetyltransferase complex
提交 2025-05-07
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
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链 E
1–244(244 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 6
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.68 Å
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9UUS
The NuA3 histone acetyltransferase complex bound to acetyl-CoA and H3 tail
提交 2025-05-08
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 E
1–244(244 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 5
ACO ACETYL COENZYME *A × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å
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9VKW
Cryo-EM structure of the NuA3 complex bound to Ace-coenzyme A
提交 2025-06-24
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 E
1–244(244 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
ACO ACETYL COENZYME *A × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å
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