|
6VVO
Structure of the human clamp loader (Replication Factor C, RFC) bound to the sliding clamp (Proliferating Cell Nuclear Antigen, PCNA)
提交 2020-02-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å
|
|
7Z6H
Structure of DNA-bound human RAD17-RFC clamp loader and 9-1-1 checkpoint clamp
提交 2022-03-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:decameric
|
链 G
2–340(339 aa)
|
未记录
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.59 Å
|
|
8UI7
Cryo-EM map of human clmap-clamp loader ATAD5-RFC-gapped PCNA complex in intermediate state 3
提交 2023-10-10
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 3
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
|
|
8UI8
Cryo-EM map of human clamp-clamp loader ATAD5-RFC-two PCNAs complex in intermediate state 3
提交 2023-10-10
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:heptameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 3
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8UI9
Cryo-EM map of human clamp-clamp loader ATAD5-RFC-cracked PCNA complex in intermediate state 2
提交 2023-10-10
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
8UII
Cryo-EM map of human clamp-clamp loader ATAD5-RFC-closed PCNA complex in intermediate state 1
提交 2023-10-10
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å
|
|
8UMT
Atomic model of the human CTF18-RFC-PCNA binary complex in the three-subunit binding state (state 2)
提交 2023-10-18
|
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 3
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.33 Å
|
|
8UMU
Atomic model of the human CTF18-RFC-PCNA binary complex in the four-subunit binding state (state 3)
提交 2023-10-18
|
聚集状态不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 3
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å
|
|
8UMV
Atomic model of the human CTF18-RFC-PCNA-DNA ternary complex with narrow PCNA opening state I (state 5)
提交 2023-10-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:decameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å
|
|
8UMW
Atomic model of the human CTF18-RFC-PCNA-DNA ternary complex in the five-subunit binding state (state 4)
提交 2023-10-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:decameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å
|
|
8UMY
Atomic model of the human CTF18-RFC-PCNA-DNA ternary complex with narrow PCNA opening state II (state 6)
提交 2023-10-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:decameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å
|
|
8UN0
Atomic model of the human CTF18-RFC-PCNA-DNA ternary complex with cracked and closed PCNA (state 7)
提交 2023-10-18
|
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:decameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8ZWO
Structure of CTF18-PCNA with ATP
提交 2024-06-13
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris-HCl, 200 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å
|
|
9IIN
Structure of CTF18-PCNA with ATP and Mg2+
提交 2024-06-20
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 C
1–340(340 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris-HCl, 200 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9UIQ
Structure of CTF18-PCNA with ATP
提交 2025-04-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 C
19–338(320 aa)
|
未记录
|
ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris-HCl, 200 mM NaCl, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|