8vha

Crystal Structure of Human IDH1 R132Q in complex with NADPH and Alpha-Ketoglutarate

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 128.1 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8vha

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8vha
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8vha
沉积日期 deposition_date2023-12-31
结构标题 titleCrystal Structure of Human IDH1 R132Q in complex with NADPH and Alpha-Ketoglutarate
关键词 keywordsOXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier39.71
回转半径 Rg (电子) rg_electron39.23
零角强度 I(0) i0541908000.00
分子量 molecular_weight189180.0 kDa
排除体积 excluded_volume235900 ų
包络体积 envelope_volume302990 ų
水化壳体积 shell_volume62348 ų
包络直径 envelope_diameter133.6
壳层 Rg shell_rg46.80
包络 Rg envelope_rg38.72
形状 Rg shape_rg39.25
总 Rg total_rg39.52
总原子数 total_atoms13387
残基数 n_residues1649
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax128.1
Rg (实空间) rg_real39.61
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.33
I(0) (实空间) i0_real5.4190e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.9710e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal39.68
I(0) (倒空间) i0_reciprocal541900000.0000
解质量估计 total_estimate0.8980
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary41.6
偏度 Skewness skewness0.227
峰度 Kurtosis kurtosis-0.586
角度范围 angular_range— – 0.2000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha155300000.0000
实空间数据点数 n_real_points41
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.920; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.913

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (8)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)