8wgh

Cryo-EM structure of the red-shifted Fittonia albivenis PSI-LHCI

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Chlorophyll a-b binding protein 1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 2 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 4 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （G9IB61） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A4QJG7） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 （Q9SHE8） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 Photosystem I reaction center subunit VI × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A8A9WIB9） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q3C1K9） Photosystem I reaction center subunit psaK × 1 Photosystem I reaction center subunit XI × 1 Photosystem I reaction center subunit N × 1 Photosystem I reaction center subunit O × 1 CHLOROPHYLL B × 12 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 4 BETA-CAROTENE × 26 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 10 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8A0WPY6_9LAMI
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–750； UniProt 1–750

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt G9IB61

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Chlorophyll a-b binding protein 1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 2 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 4 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A8A0WPY6） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A4QJG7） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 （Q9SHE8） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 Photosystem I reaction center subunit VI × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A8A9WIB9） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q3C1K9） Photosystem I reaction center subunit psaK × 1 Photosystem I reaction center subunit XI × 1 Photosystem I reaction center subunit N × 1 Photosystem I reaction center subunit O × 1 CHLOROPHYLL B × 12 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 4 BETA-CAROTENE × 26 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 10 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	G9IB61_SESIN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–734； UniProt 1–734

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt A4QJG7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Chlorophyll a-b binding protein 1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 2 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 4 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A8A0WPY6） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （G9IB61） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 （Q9SHE8） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 Photosystem I reaction center subunit VI × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A8A9WIB9） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q3C1K9） Photosystem I reaction center subunit psaK × 1 Photosystem I reaction center subunit XI × 1 Photosystem I reaction center subunit N × 1 Photosystem I reaction center subunit O × 1 CHLOROPHYLL B × 12 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 4 BETA-CAROTENE × 26 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 10 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAC_AETCO
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q9SHE8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Chlorophyll a-b binding protein 1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 2 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 4 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A8A0WPY6） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （G9IB61） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A4QJG7） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 Photosystem I reaction center subunit VI × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A8A9WIB9） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q3C1K9） Photosystem I reaction center subunit psaK × 1 Photosystem I reaction center subunit XI × 1 Photosystem I reaction center subunit N × 1 Photosystem I reaction center subunit O × 1 CHLOROPHYLL B × 12 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 4 BETA-CAROTENE × 26 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 10 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAF_ARATH
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–221； UniProt 1–221

Photosystem I reaction center subunit VIII

物种未注明

UniProt A0A8A9WIB9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Chlorophyll a-b binding protein 1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 2 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 4 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A8A0WPY6） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （G9IB61） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A4QJG7） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 （Q9SHE8） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 Photosystem I reaction center subunit VI × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （Q3C1K9） Photosystem I reaction center subunit psaK × 1 Photosystem I reaction center subunit XI × 1 Photosystem I reaction center subunit N × 1 Photosystem I reaction center subunit O × 1 CHLOROPHYLL B × 12 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 4 BETA-CAROTENE × 26 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 10 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8A9WIB9_9LAMI
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–36； UniProt 1–36

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt Q3C1K9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Chlorophyll a-b binding protein 1 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 2 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 3 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 4 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A8A0WPY6） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （G9IB61） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A4QJG7） Photosystem I reaction center subunit II × 1 Photosystem I reaction center subunit IV × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 （Q9SHE8） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 Photosystem I reaction center subunit VI × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A8A9WIB9） Photosystem I reaction center subunit psaK × 1 Photosystem I reaction center subunit XI × 1 Photosystem I reaction center subunit N × 1 Photosystem I reaction center subunit O × 1 CHLOROPHYLL B × 12 CHLOROPHYLL A × 150 (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 7 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; × 4 BETA-CAROTENE × 26 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 5 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3 heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside × 10 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAJ_NICSY
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–44； UniProt 1–44

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8wgh
沉积日期 deposition_date	2023-09-21
结构标题 title	Cryo-EM structure of the red-shifted Fittonia albivenis PSI-LHCI
关键词 keywords	Complex, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8wgh__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8wgh__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8wgh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.56 Å
Rg（电子密度）	51.86 Å
总 Rg	51.97 Å
原子数	38187
残基数	3412
排除体积	713260 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8wgh__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (30)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein 1
分子量 formula_weight	26773.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1
原子数 atom_count	38187

MAANSMMTCGVAVAACPSVLSSSKSRFAAPVSLGYAATTSSRFSMSAEWFPGQPRPDHLDGSAPADFGFDPLGLGVEPELLERYKESEVYHCRWAMLAVPGILVPEALGLGNWVKAQEWAAIPGGQATYLGNPVPWGTLPTILVIEFLAIAFVEHQRTLEKDIEKKKYPGGAFDPLGFSKDPKKFEEYKVKEIKNGRLAMLAFVGFCVQQSARPGTGPVENLLSHLADPWHNNIGDIIIPRNISPY

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein 2
分子量 formula_weight	28533.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MASACASSAIAAAFSSPSSQRIGTTKASFFGGRKLRVAKFAAPVTARSVTTATFAPDPNRPLWFPGSTPPPWLDGSLPADFGFDPLGLASDPDSLKWNVQAEIVHCRWAMLGAAGIFIPELLTKIGILNTPSWYSAGELQYFTDTTTLFIVELFFIGWAEGRRWADILKPGCVNTDPIFPNNKLTGTDVGYPGGLWFDPLGWGTGSPEKLKELRTKEIKNGRLAMLAVMGAWFQHVYTGTGPIDNLSAHLADPGHATVFAAFSPK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein 3
分子量 formula_weight	29766.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MAAQALVSSSSICSSADAVRQTLGRRPVRSSRKASFVVKAESSPPVKQGADRQLWFASKQSLSYLNGSLPGDYGFDPLGLSDPEGAGFWFQPRWLSYGEVFNGRTAMVGVIGCLAPEILGKAGLIPPETALPWFKTGVFPPAGSYEYWADPYTLFVFELGLVGFAEHRRYQDWSNPGSMGKQYFLGLEKGLGGSGDPAYPGGPFFNPLGLGKDEKSMWDYKVKEVKNGRLAMLAMLGFFVQAPVTGVGPYQNLLDHLADPFNNNIFTNFKFY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein 4
分子量 formula_weight	27510.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

MAASVAAQSPVAVFRPRFLTGAPGKLNRPSVTVKQAVSSRGSFKVEAEKGEWLPGLPSPAYLDGSLPGDNGFDPLGLAEDPENLKWYIQAELVNSRWAMLGVAGMLLPEVFTYLGIINVPKWYDAGKSEYFASSSTLFVIEFILFHYVEIRRWQDIKNPGCVNQDPIFKNYSLPPHECGYPGSVFNPLNFEPTLEAKEKELANGRLAMLAFLGFIVQHNVTGKGPFDNLVQHVADPWHNTIINTIRGY

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	83138.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MIIRSPEPEVKILVDKDPVKTSFEEWAKPGHFSRTIAKGPDTTTWIWNLHADAHDFDSHTSDLEEISRKVFSAHFGQLSIIFLWLSGMYFHGARFSNYEAWLSDPTHIGPSAQVVWPIVGQEILNGDVGGGFRGIQITSGFFQMWRASGITSELQLYCTAIGALIFAALMLFAGWFHYHKAAPKLAWFQDVESMLNHHLAGLLGLGSLGWAGHQVHVSLPINQFLNAGVDPKEIPLPHEFILNRDLLSQLYPSFAEGATPFFTLNWSKYAEFLTFRGGLDPVTGGLWLTDIAHHHLAIAILFLIAGHMYRTNWGIGHGLKDILEAHKGPFTGQGHKGLYEILTTSWHAQLSLNLAMLGSLTIVVAHHMYSMPPYPYLATDYGTQLSLFTHHMWIGGFLIVGAAAHAAIFMVRDYDPTTRYNDLLDRVLRHRDAIISHLNWACIFLGFHSFGLYIHNDTMSALGRPQDMFSDTAIQLQPVFAQWIQNTHALAPGATAPSATASTSLTWGGGDLVAVGGKVALLPIPLGTADFLVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHVFLGLFWMYNSISVVIFHFSWKMQSDVWGSISDQGVVTHITGGNFAQSSITINGWLRDFLWAQASQVIQSYGSSLSAYGLFFLGAHFVWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPATQPRALSIVQGRAVGVTHYLLGGIATTWAFFLARIIAVG

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	82472.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MALRFPRFSQGLAQDPTTRRIWFGIATAHDFESHDDITEERLYQNIFASHFGQLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFESWVQDPLHVRPIAHAIWDPHFGQPAVEAFTRGGALGPVNIAYSGVYQWWYTIGLRTNEDLYTGALFLLFLSAISLIAGWLHLQPKWKPSVSWFKNAESRLNHHLSGLFGVSSLAWTGHLVHVAIPGSRGEYVRWNNFLDVLPHPQGLGPLFTGQWNLYAQNPDSSSHLFGTSQGAGTAILTLLGGFHPQTQSLWLTDIAHHHLAIAFIFLVAGHMYRTNFGIGHSIKDLLDAHIPPGGRLGRGHKGLYDTINNSLHFQLGLALASLGVITSLVAQHMYSLPAYAFIAQDFTTQAALYTHHQYIAGFIMTGAFAHGAIFFIRDYNPEQNEDNVLARMLDHKEAIISHLSWASLFLGFHTLGLYVHNDVMLAFGTPEKQILIEPIFAQWIQSAHGKTSYGFDVLLSSTSGPAFNAGRSIWLPGWLNAVNENTNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAVFWMLNTIGWVTFYWHWKHITLWQGNVSQFNESSTYLMGWLRDYLWLNSSQLINGYNPFGMNSLSVWAWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLAWAHERTPLANLIRWRDKPVALSIVQARLVGLAHFSVGYIFTYAAFLIASTSGKFG

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	9049.5 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSHSVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMIPWDGCKAKQIASAPRTEDCVGCKRCESACPTDFLSVRVYLWHETTRSMGLAY

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit II
分子量 formula_weight	21036.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MASLFTLSSPWKQSLAPQFTAAKNPKPLPRAVAMPIRAMAPEESAPAGFTPPQLDPSTPSPIFGGSTGGLLRKAQEEEFYVITWESPKEQVFEMPTGGAAIMREGPNLLKLARKEQCLALGTRLRSKYKINYQFYRVFPNGEVQYLHPKDGVYPEKVNEGRTGVGVNLRSIGKNVNPIEVKFTGKQVYDL

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IV
分子量 formula_weight	16282.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MATTGMASAACTFAVAPNFASSTATPKPAMVFFSTKPRRNLRLFMVRAGDDEPEAPAPPPEPEVESDTPAAATATTTAEPKVAKTPSVGPPRGSKVRILRRESYWYKGVGSVVTVDQDPKTRYPVVVRFDKVNYANISTNNYALDEVEQVA

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic
分子量 formula_weight	24203.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSLTIPANLVLNPRSNKSLTQSVPKSSARFVCSDDKSSSSTPQSMKAFSAAVALSSILLSAPMPAVADISGLTPCKDSKQFAKREKQQIKKLESSLKLYAPESAPALALNAQIEKTKRRFDNYGKYGLLCGSDGLPHLIVNGDQRHWGEFITPGILFLYIAGWIGWVGRSYLIAISGEKKPAMKEIIIDVPLASRIIFRGFIWPVAAYREFLNGDLIAKDV

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	15874.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MASSFLSTPTFQGLRPLNKATDSPRSLPLCRPVSVSATRKRNVAVKAELNPSLVISLSTGVSLFLGRFVFFNFQRENVGKQVPSQNGISHFEAGDERAKEYVSLLKSNDPVGFNIVDVLAWGSIGHIVAYYILATSSNGYDPNFF

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VI
分子量 formula_weight	15201.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MASLATFAAAHPAAVKGLAGSSISGTKLHIRPSRRVGVKSSNYRAGAVVAKYGEKSVYFDLEDIANTTGQWDVYGSDAPSPYNGLQSKFFETFAAPFTKRGLLLKFLLLGGGATLAFVSSQATGDDLPIVKGPQLPPQPGPRGKI

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	3930.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MTAFNLPSIFVPLVGLVFPAIAMASLFLHVQKNKIV

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	5029.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MRDLKTYLSVAPVLSTLWFGALAGLLIEINRFFPDALTFPFFSF

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit psaK
分子量 formula_weight	13435.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MAAAVTTSLPQFNGLKPQLSASSISPSKSLVAVRPLRRRGQGALGARCDYFGSPTNLIMVTSTTLLLFAGRFGLAPSANRKATAGLKLEVRDAGLQTGDPAGFTLADTLACGAVGHIIGVGVVLGLKSISVI

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XI
分子量 formula_weight	23094.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MATSTMASLGQQQLASSLCPSFSRLPTPKGISAAPFTFSRRRTSIIKASVVPEKPTYQVIQPINGDPFIGSLETPITSSPLIAWYLSNLPGYRTAVDPLLRGIEVGLAHGYLLVGPFVITGPLRNAPNHGAVGSLGAAGLIVILSITLTMYGIASFKEGDPSTAPSLTLTGRKKVPDPLQTADGWARFTGGFFFGGISGVIWAYFLLYVLDLPYFVK

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit N
分子量 formula_weight	18673.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MAAINSSSVLACNYALSAAGTELSSKVVNSVASPVSVAHPPRLPVIRAQQQQQPQSAAAGSRRAALFGLGAALLAVSTNANANASVIDYYLEKSKANKELNDKKRLATTDANFARAYTVEFGTCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFLSEDLDIECEGKDIYKCGSNVFWKWNEIK

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit O
分子量 formula_weight	15404.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MAASTMAAASTVVGLGTSSLIAPKKLNLSSGFLKSPIQARNPLRLAQASGGKFTCFERDWLRTDLNVIGFGLIGWLAPSSIPAINGNSLTGLFFSSIGPELAHFPTGPAVTSPFWLWMVLWHLGLFLTLTFGQIGFKGRSEGYF

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL B
分子量 formula_weight	907.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	150

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
分子量 formula_weight	568.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ;
分子量 formula_weight	600.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	26

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	heptyl 1-thio-beta-D-glucopyranoside
分子量 formula_weight	294.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 30 Entity 30 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	157342

Cryo-EM structure of the red-shifted Fittonia albivenis PSI-LHCI

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I iron-sulfur center

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8wgh__assembly_1__model_1

8wgh__assembly_1__model_1 | I(q)

8wgh__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (30)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer