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8x0g

Human FL Metabotropic glutamate receptor 5, mGlu5-5M with quisqualate, Acc conformation (purified with PAM VU0409551 but not modelled)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 161.5 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Metabotropic glutamate receptor 5

Homo sapiens

UniProt P41594

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 21–856 链 B； UniProt 21–856 突变：T742A, S753A, T777A, I799A, A813L,N445A,H350L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8X0G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3LMK Ligand Binding Domain of Metabotropoc glutamate receptor mGluR5 complexed with glutamate 提交 2010-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 18–505（488 aa） 片段：Ligand binding domain
链 B 18–505（488 aa） 片段：Ligand binding domain
突变：C241S 突变：C241S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；25% PEG 8000, 0.2M NaCl, 0.1M Hepes. protein concentration 5mg/mL plus 5mM L-Glu. Cryoprotectant used: 33% PEG 8000, 0.2M NaCl and 0.1M Hepes plus 20% Glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.44 Å R-free 0.281
4OO9 Structure of the human class C GPCR metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain in complex with the negative allosteric modulator mavoglurant 提交 2014-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 569–678（110 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 A 680–836（157 aa） 片段：SEE REMARK 999
突变：yes 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：yes 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OLA OLEIC ACID × 4 2U8 Mavoglurant × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.8；293.1 K；24-34% v/v PEG400, 0.2 M ammonium phosphate dibasic, 0.1 M MES, pH 6.8, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293.1K
分辨率 2.60 Å R-free 0.275
5CGC Structure of the human class C GPCR metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain in complex with the negative allosteric modulator 3-chloro-4-fluoro-5-[6-(1H-pyrazol-1-yl)pyrimidin-4-yl]benzonitrile 提交 2015-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 569–678（110 aa）
链 A 679–836（158 aa）
突变：;E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A ; 突变：;E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A ; OLA OLEIC ACID × 4 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 51D 3-chloro-4-fluoro-5-[6-(1H-pyrazol-1-yl)pyrimidin-4-yl]benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.8；293.1 K；24-34% V/V PEG400, 0.2 M AMMONIUM PHOSPHATE DIBASIC, 0.1 M MES, PH 6.8,
分辨率 3.10 Å R-free 0.287
5CGD Structure of the human class C GPCR metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain in complex with the negative allosteric modulator 3-chloro-5-[6-(5-fluoropyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl]benzonitrile - (HTL14242) 提交 2015-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 569–678（110 aa）
链 A 679–836（158 aa）
突变：;E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A ; 突变：;E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M C1054T C1097A T742A S753A ; OLA OLEIC ACID × 4 51E 3-chloro-5-[6-(5-fluoropyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl]benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.8；293.1 K；24-34% V/V PEG400, 0.2 M AMMONIUM PHOSPHATE DIBASIC, 0.1 M MES, PH 6.8,
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
6FFH Crystal Structure of mGluR5 in complex with Fenobam at 2.65 A 提交 2018-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 569–678（110 aa） 片段：MGLUR5
链 A 679–836（158 aa） 片段：MGLUR5
突变：C54T C97A E579A N667Y I669A G675M T742A S753A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：C54T C97A E579A N667Y I669A G675M T742A S753A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OLA OLEIC ACID × 5 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 D7W 1-(3-chlorophenyl)-3-(3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazol-2-yl)urea × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.8；293.1 K；24-34% V/V PEG400, 0.2 M AMMONIUM PHOSPHATE DIBASIC, 0.1 M MES, PH 6.8
分辨率 2.65 Å R-free 0.267
6FFI Crystal Structure of mGluR5 in complex with MMPEP at 2.2 A 提交 2018-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 569–678（110 aa） 片段：MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5
链 A 680–836（157 aa） 片段：MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5,MGLUR5
突变：;E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：;E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A,E579A N667Y I669A G675M T742A S753A ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OLA OLEIC ACID × 7 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 D8B 2-[2-(3-methoxyphenyl)ethynyl]-6-methyl-pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.8；293.1 K；24-34% V/V PEG400, 0.2 M AMMONIUM PHOSPHATE DIBASIC, 0.1 M MES, PH 6.8
分辨率 2.20 Å R-free 0.269
6N4X Metabotropic Glutamate Receptor 5 Apo Form Ligand Binding Domain 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–865（846 aa）
链 B 20–865（846 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG 3350, 0.2M Na Cacodylate pH 6.5
分辨率 4.00 Å R-free 0.282
6N4Y Metabotropic Glutamate Receptor 5 Extracellular Domain with Nb43 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–571（551 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；18-20% PEG 3350 0.15M Potassium Nitrate 1% Benzamidine
分辨率 3.26 Å R-free 0.251
6N4Y Metabotropic Glutamate Receptor 5 Extracellular Domain with Nb43 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–571（551 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；18-20% PEG 3350 0.15M Potassium Nitrate 1% Benzamidine
分辨率 3.26 Å R-free 0.251
6N4Y Metabotropic Glutamate Receptor 5 Extracellular Domain with Nb43 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–571（551 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；18-20% PEG 3350 0.15M Potassium Nitrate 1% Benzamidine
分辨率 3.26 Å R-free 0.251
6N4Y Metabotropic Glutamate Receptor 5 Extracellular Domain with Nb43 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 21–571（551 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；18-20% PEG 3350 0.15M Potassium Nitrate 1% Benzamidine
分辨率 3.26 Å R-free 0.251
6N50 Metabotropic Glutamate Receptor 5 Extracellular Domain in Complex with Nb43 and L-quisqualic acid 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–571（551 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100 mM NaCl 50 mM ADA pH 7.0 20% PEG 4000
分辨率 3.75 Å R-free 0.300
6N50 Metabotropic Glutamate Receptor 5 Extracellular Domain in Complex with Nb43 and L-quisqualic acid 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–571（551 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100 mM NaCl 50 mM ADA pH 7.0 20% PEG 4000
分辨率 3.75 Å R-free 0.300
6N50 Metabotropic Glutamate Receptor 5 Extracellular Domain in Complex with Nb43 and L-quisqualic acid 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 21–571（551 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100 mM NaCl 50 mM ADA pH 7.0 20% PEG 4000
分辨率 3.75 Å R-free 0.300
6N51 Metabotropic Glutamate Receptor 5 bound to L-quisqualate and Nb43 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–826（804 aa）
链 B 23–826（804 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；additional 0.1%OG was added to the sample right before applying sample to grid; 3.5ul sample was applied; blot for 1 second before plunging;
分辨率 4.00 Å
6N52 Metabotropic Glutamate Receptor 5 Apo Form 提交 2018-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–839（820 aa）
链 B 20–839（820 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；100mM NaCl, 20 mM HEPES pH 7.5, 5uM FFMTEB added as a negative allosteric modulator.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Addition 0.0005% Amphipol A8-35was added to sample prior to apply to grid; 3.5ul sample was applied; blot for 1s before plunging
分辨率 4.00 Å
7FD8 Thermostabilised full length human mGluR5-5M bound with L-quisqualic acid 提交 2021-07-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–856（836 aa）
链 B 21–856（836 aa）
突变：H350L, N445A, T742A, S753A, T777A, I799A, A813L 突变：H350L, N445A, T742A, S753A, T777A, I799A, A813L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force was 10, 3.5 seconds blotting time
分辨率 3.80 Å
7FD9 Thermostabilised full length human mGluR5-5M with orthosteric antagonist, LY341495 提交 2021-07-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–856（836 aa）
链 B 21–856（836 aa）
突变：H350L, N445A, T742A, S753A, T777A, I799A, A813L 突变：H350L, N445A, T742A, S753A, T777A, I799A, A813L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force was 10, 3.5 seconds blotting time
分辨率 4.00 Å
7P2L thermostabilised 7TM domain of human mGlu5 receptor bound to photoswitchable ligand alloswitch-1 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 569–678（110 aa）
链 A 679–836（158 aa）
突变：E579A,N667Y,I669A,G675M,T742A,S753A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：E579A,N667Y,I669A,G675M,T742A,S753A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YI 2-chloranyl-~{N}-[2-methoxy-4-[(~{E})-pyridin-2-yldiazenyl]phenyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；295 K；0.15-0.25 M ammonium phosphate dibasic, 22-24 % polyethylene glycol 400, either with 0.10 M 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.7-6.8 or 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.54 Å R-free 0.285
8T6J CDPPB-bound inactive mGlu5 提交 2023-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–876（857 aa）
链 B 20–876（857 aa）
未记录 YKU 3-cyano-N-(1,3-diphenyl-1H-pyrazol-5-yl)benzamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8T7H Quis-bound intermediate mGlu5 提交 2023-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 20–876（857 aa）
链 B 20–876（857 aa）
未记录 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8T8M Quis-bound intermediate mGlu5 提交 2023-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 20–876（857 aa）
链 B 20–876（857 aa）
未记录 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8TAO Quis and CDPPB bound active mGlu5 提交 2023-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 20–876（857 aa）
链 B 20–876（857 aa）
未记录 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 YKU 3-cyano-N-(1,3-diphenyl-1H-pyrazol-5-yl)benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8X0B Human FL Metabotropic glutamate receptor 5, mGlu5-5M with Quisqualate and VU0424465 提交 2023-11-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–856（836 aa）
链 B 21–856（836 aa）
突变：T742A, S753A, T777A, I799A, A813L,N445,H350L 突变：T742A, S753A, T777A, I799A, A813L,N445,H350L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 XQT VU0424465 × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8X0C Human FL Metabotropic glutamate receptor 5, mGlu5-5M with quisqualate and VU0424465, conformer 1 提交 2023-11-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–856（836 aa）
链 B 21–856（836 aa）
突变：T742A,S753A,T777A,I799A,A813L,N455A,H350L 突变：T742A,S753A,T777A,I799A,A813L,N455A,H350L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 XQT VU0424465 × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotting time was 5 seconds, blot force of 10
分辨率 3.20 Å
8X0D Human FL Metabotropic glutamate receptor 5, mGlu5-5M with quisqualate and VU0424465, conformer 2 提交 2023-11-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–856（836 aa）
链 B 21–856（836 aa）
突变：T742A,S753A,T777A,I799A,A813L,N445A,H350L 突变：T742A,S753A,T777A,I799A,A813L,N445A,H350L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 XQT VU0424465 × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotting time of 5 seconds and blot force of 10
分辨率 3.50 Å
8X0E Human FL Metabotropic glutamate receptor 5, mGlu5-5M with agonist and PAM, W785A mutant 提交 2023-11-04 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–856（836 aa）
链 B 21–856（836 aa）
突变：T742A,S753A,T777A,I799A,A813L,W785A,H350L 突变：T742A,S753A,T777A,I799A,A813L,W785A,H350L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force was set to 0
分辨率 3.40 Å
8X0F Human FL Metabotropic glutamate receptor 5, mGlu5-5M with quisqualate and PAM VU29 提交 2023-11-04 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–856（836 aa）
链 B 21–856（836 aa）
突变：T742A, S753A, T777A, I799A, A813L,N445A,H350L 突变：T742A, S753A, T777A, I799A, A813L,N445A,H350L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 XRQ N-(1,3-diphenyl-1H-pyrazol-5-yl)-4-nitrobenzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8X0H Human FL Metabotropic glutamate receptor 5, mGlu5-5M with quisqualate, Rcc conformation 提交 2023-11-04 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–856（836 aa）
链 B 21–856（836 aa）
突变：T742A, S753A, T777A, I799A, A813L,N445A,H350L 突变：T742A, S753A, T777A, I799A, A813L,N445A,H350L NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9HC0 Dark structure of the human metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain bound to photoswitchable ligand alloswitch-1 提交 2024-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 569–678（110 aa）
链 A 680–836（157 aa）
突变：E579A,N667Y,I669A,G675M,T742A,S753A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：E579A,N667Y,I669A,G675M,T742A,S753A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OLA OLEIC ACID × 5 4YI 2-chloranyl-~{N}-[2-methoxy-4-[(~{E})-pyridin-2-yldiazenyl]phenyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.2；293 K；PEG300, di-ammonium hydrogen phosphate, 1,6-hexanediol, BIS-TRIS
分辨率 2.33 Å R-free 0.271
9HC3 Apo-state structure of the human metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain freeze-trapped after light activation of photoswitchable ligand alloswitch-1 提交 2024-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 569–678（110 aa）
链 A 680–836（157 aa）
突变：E579A,N667Y,I669A,G675M,T742A,S753A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：E579A,N667Y,I669A,G675M,T742A,S753A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OLA OLEIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.2；293 K；PEG300, di-ammonium hydrogen phosphate, 1,6-hexanediol, BIS-TRIS
分辨率 2.90 Å R-free 0.302
9WQK GRM5-Gi Complex Structure 提交 2025-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 X 21–839（819 aa）
链 Y 21–839（819 aa）
未记录 YKU 3-cyano-N-(1,3-diphenyl-1H-pyrazol-5-yl)benzamide × 1 GGL GAMMA-L-GLUTAMIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CL CHLORIDE ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9WQL GRM5-Gq Complex Structure 提交 2025-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 X 21–839（819 aa）
链 Y 21–839（819 aa）
未记录 YKU 3-cyano-N-(1,3-diphenyl-1H-pyrazol-5-yl)benzamide × 1 GGL GAMMA-L-GLUTAMIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CL CHLORIDE ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å

共 28 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GRM5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–836； UniProt 21–856 作者链 B； PDB构建体 1–836； UniProt 21–856

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8x0g

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8x0g
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8x0g
沉积日期 deposition_date2023-11-04
结构标题 titleHuman FL Metabotropic glutamate receptor 5, mGlu5-5M with quisqualate, Acc conformation (purified with PAM VU0409551 but not modelled)
关键词 keywordsG-PROTEIN COUPLED RECEPTORS, SIGNAL TRANSDUCTION, METABOTROPIC GLUTAMATE RECEPTOR, Agonist, active state, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier52.71 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron54.67 Å
零角强度 I(0) i0410229000.00
分子量 molecular_weight172600.0 kDa
排除体积 excluded_volume217750 ų
包络体积 envelope_volume311740 ų
水化壳体积 shell_volume51488 ų
包络直径 envelope_diameter173.9 Å
壳层 Rg shell_rg50.10 Å
包络 Rg envelope_rg54.33 Å
形状 Rg shape_rg54.66 Å
总 Rg total_rg54.55 Å
总原子数 total_atoms12098
残基数 n_residues1530
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax161.5 Å
Rg (实空间) rg_real53.33 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.74 Å
I(0) (实空间) i0_real4.1020e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.3120e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal52.17 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal409600000.0000
解质量估计 total_estimate0.7299
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary37.7 Å
偏度 Skewness skewness0.516
峰度 Kurtosis kurtosis-0.781
角度范围 angular_range— – 0.1500 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha23910000.0000
实空间数据点数 n_real_points31
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.610; Stabil: 0.997; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.662; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)