SAXSdb — 8y6i

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent translocase ABCB1,mNeonGreen

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 27–260	未记录	UIC2 Fab light chain × 1 UIC2 Fab heavy chain × 1 CLR CHOLESTEROL × 12 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 R0Z elacridar × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8Y6I	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8OSI Genetically encoded green ratiometric calcium indicator FNCaMP in calcium-bound state 提交 2023-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–20（20 aa）链 A 25–169（145 aa）链 A 170–260（91 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；0.1 M MMT buffer, pH 8.0, 25% PEG 1500	分辨率 2.42 Å R-free 0.231
8Y6H P-glycoprotein in complex with UIC2 Fab and triple elacridar molecules in LMNG detergent 提交 2024-02-02	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 27–260（234 aa）	未记录	R0Z elacridar × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.49 Å
9FEM mNeonGreen - Directionality of Optical Properties of Fluorescent Proteins 提交 2024-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–260（236 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；100 mM sodium HEPES 20% PEG 8000	分辨率 2.32 Å R-free 0.294
9UT8 The full-length human sweet taste receptor TAS1R2 and TAS1R3 in the apo state 提交 2025-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 26–260（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
9UT9 The VFT domains of human sweet taste receptor TAS1R2 and TAS1R3 in the apo state 提交 2025-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 26–260（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å
9UTA The transmembrane domains of human sweet taste receptor TAS1R2 and TAS1R3 in the apo state 提交 2025-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 26–260（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.77 Å
9UTB The full-length human sweet taste receptor TAS1R2 and TAS1R3 in the sucralose-bound state 提交 2025-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 26–260（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.59 Å
9UTC The VFT domains of human sweet taste receptor TAS1R2 and TAS1R3 in the sucralose-bound state 提交 2025-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 26–260（235 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A1S4NYF2_BRALA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1293–1526； UniProt 27–260

ATP-dependent translocase ABCB1,mNeonGreen

Homo sapiens

UniProt P08183

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–1280	未记录	UIC2 Fab light chain × 1 UIC2 Fab heavy chain × 1 CLR CHOLESTEROL × 12 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 R0Z elacridar × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8Y6I	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6C0V Molecular structure of human P-glycoprotein in the ATP-bound, outward-facing conformation 提交 2018-01-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	突变：E556Q, E1201Q	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6QEX Nanodisc reconstituted human ABCB1 in complex with UIC2 fab and taxol 提交 2019-01-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CLR CHOLESTEROL × 16 TA1 TAXOL × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
7A65 Nanodisc reconstituted, drug-free human ABCB1 in complex with MRK16 Fab 提交 2020-08-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7A69 Nanodisc reconstituted human ABCB1 in complex with MRK16 Fab and vincristine 提交 2020-08-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	R1Q vincristine × 1 CLR CHOLESTEROL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7A6C Nanodisc reconstituted human ABCB1 in complex with MRK16 Fab and elacridar 提交 2020-08-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	R0Z elacridar × 2 CLR CHOLESTEROL × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7A6E Nanodisc reconstituted human ABCB1 in complex with MRK16 Fab and tariquidar 提交 2020-08-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	R1H tariquidar × 2 CLR CHOLESTEROL × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7A6F Nanodisc reconstituted human ABCB1 in complex with MRK16 Fab and zosuquidar 提交 2020-08-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	ZQU Zosuquidar × 2 CLR CHOLESTEROL × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7O9W Encequidar-bound human P-glycoprotein in complex with UIC2-Fab 提交 2021-04-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	V5Q ~{N}-[2-[2-[4-[2-(6,7-dimethoxy-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl)ethyl]phenyl]-1,2,3,4-tetrazol-5-yl]-4,5-dimethoxy-phenyl]-4-oxidanylidene-2,3-dihydrochromene-2-carboxamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8GMG CryoEM structure of P-Glycoprotein in Apo state 提交 2023-03-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
8GMJ CryoEM structure of P-Glycoprotein in collapsed closed state under continuous turnover conditions with verapamil 提交 2023-03-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8SA0 CryoEM structure of P-Glycoprotein in occluded closed state under continuous turnover conditions with verapamil 提交 2023-03-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1274（1274 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 I6H Dexverapamil × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8SA1 CryoEM structure of P-Glycoprotein in inward facing 2 state under continuous turnover conditions with verapamil 提交 2023-03-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 I6H Dexverapamil × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8SB7 CryoEM structure of P-Glycoprotein in inward facing 1 state under continuous turnover conditions with verapamil 提交 2023-04-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 I6H Dexverapamil × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8SB8 CryoEM structure of P-Glycoprotein in collapsed closed state with vanadate 提交 2023-04-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 AOV ADP ORTHOVANADATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8SB9 CryoEM structure of P-Glycoprotein in inward facing 1 state under continuous turnover conditions with vinblastine 提交 2023-04-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 VLB (2ALPHA,2'BETA,3BETA,4ALPHA,5BETA)-VINCALEUKOBLASTINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8SBA CryoEM structure of P-Glycoprotein in inward facing 2 state under continuous turnover conditions with vinblastine 提交 2023-04-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 VLB (2ALPHA,2'BETA,3BETA,4ALPHA,5BETA)-VINCALEUKOBLASTINE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8Y6H P-glycoprotein in complex with UIC2 Fab and triple elacridar molecules in LMNG detergent 提交 2024-02-02	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	R0Z elacridar × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.49 Å
9CR8 SapNP reconstituted human ABCB1 提交 2024-07-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	UPL UNKNOWN BRANCHED FRAGMENT OF PHOSPHOLIPID × 15	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25mM HEPES (pH 7.5), 150mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9CTC SapNP reconstituted Human ABCB1 in complex with Zosuquidar and ATP/Mg 提交 2024-07-24	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZQU Zosuquidar × 2 UPL UNKNOWN BRANCHED FRAGMENT OF PHOSPHOLIPID × 22	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25mM HEPES (pH 7.5), 150mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9CTF SapNP Reconstituted Human ABCB1 bound to Taxol in presence of ATP 提交 2024-07-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	UPL UNKNOWN BRANCHED FRAGMENT OF PHOSPHOLIPID × 22 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25mM HEPES (pH 7.5), 150mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9CTG SapNP Reconstituted Human ABCB1 bound to ATP gammaS 提交 2024-07-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1280（1280 aa）	未记录	UPL UNKNOWN BRANCHED FRAGMENT OF PHOSPHOLIPID × 9 MG MAGNESIUM ION × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；25mM HEPES (pH 7.5), 150mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 21 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MDR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1280； UniProt 1–1280

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8y6i
沉积日期 deposition_date	2024-02-02
结构标题 title	P-glycoprotein in complex with UIC2 Fab and triple elacridar molecules in nanodisc
关键词 keywords	ABC transporter, elacridar, P-glycoprotein, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	44.25 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	43.74 Å
零角强度 I(0) i0	168866000.00
分子量 molecular_weight	118810.0 kDa
排除体积 excluded_volume	153870 Å³
包络体积 envelope_volume	200790 Å³
水化壳体积 shell_volume	42942 Å³
包络直径 envelope_diameter	164.0 Å
壳层 Rg shell_rg	41.96 Å
包络 Rg envelope_rg	45.32 Å
形状 Rg shape_rg	43.71 Å
总 Rg total_rg	43.77 Å
总原子数 total_atoms	8406
残基数 n_residues	1041
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	154.3 Å
Rg (实空间) rg_real	45.04 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.99 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.6890e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.1550e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	44.25 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	168700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7169
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	34.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.654
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.289
角度范围 angular_range	— – 0.1800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	11020000.0000
实空间数据点数 n_real_points	37
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.559; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.413; Smooth: 0.225

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP-dependent translocase ABCB1,mNeonGreen
分子量 formula_weight	170535.8 kDa
EC 编号 ec_number	7.6.2.2,7.6.2.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	8406

MDLEGDRNGGAKKKNFFKLNNKSEKDKKEKKPTVSVFSMFRYSNWLDKLYMVVGTLAAIIHGAGLPLMMLVFGEMTDIFANAGNLEDLMSNITNRSDINDTGFFMNLEEDMTRYAYYYSGIGAGVLVAAYIQVSFWCLAAGRQIHKIRKQFFHAIMRQEIGWFDVHDVGELNTRLTDDVSKINEGIGDKIGMFFQSMATFFTGFIVGFTRGWKLTLVILAISPVLGLSAAVWAKILSSFTDKELLAYAKAGAVAEEVLAAIRTVIAFGGQKKELERYNKNLEEAKRIGIKKAITANISIGAAFLLIYASYALAFWYGTTLVLSGEYSIGQVLTVFFSVLIGAFSVGQASPSIEAFANARGAAYEIFKIIDNKPSIDSYSKSGHKPDNIKGNLEFRNVHFSYPSRKEVKILKGLNLKVQSGQTVALVGNSGCGKSTTVQLMQRLYDPTEGMVSVDGQDIRTINVRFLREIIGVVSQEPVLFATTIAENIRYGRENVTMDEIEKAVKEANAYDFIMKLPHKFDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIARALVRNPKILLLDEATSALDTESEAVVQVALDKARKGRTTIVIAHRLSTVRNADVIAGFDDGVIVEKGNHDELMKEKGIYFKLVTMQTAGNEVELENAADESKSEIDALEMSSNDSRSSLIRKRSTRRSVRGSQAQDRKLSTKEALDESIPPVSFWRIMKLNLTEWPYFVVGVFCAIINGGLQPAFAIIFSKIIGVFTRIDDPETKRQNSNLFSLLFLALGIISFITFFLQGFTFGKAGEILTKRLRYMVFRSMLRQDVSWFDDPKNTTGALTTRLANDAAQVKGAIGSRLAVITQNIANLGTGIIISFIYGWQLTLLLLAIVPIIAIAGVVEMKMLSGQALKDKKELEGSGKIATEAIENFRTVVSLTQEQKFEHMYAQSLQVPYRNSLRKAHIFGITFSFTQAMMYFSYAGCFRFGAYLVAHKLMSFEDVLLVFSAVVFGAMAVGQVSSFAPDYAKAKISAAHIIMIIEKTPLIDSYSTEGLMPNTLEGNVTFGEVVFNYPTRPDIPVLQGLSLEVKKGQTLALVGSSGCGKSTVVQLLERFYDPLAGKVLLDGKEIKRLNVQWLRAHLGIVSQEPILFDCSIAENIAYGDNSRVVSQEEIVRAAKEANIHAFIESLPNKYSTKVGDKGTQLSGGQKQRIAIARALVRQPHILLLDEATSALDTESEKVVQEALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADLIVVFQNGRVKEHGTHQQLLAQKGIYFSMVSVQAGTKRQLEVLFQGPRPRGSKGEEDNMASLPATHELHIFGSINGVDFDMVGQGTGNPNDGYEELNLKSTKGDLQFSPWILVPHIGYGFHQYLPYPDGMSPFQAAMVDGSGYQVHRTMQFEDGASLTVNYRYTYEGSHIKGEAQVKGTGFPADGPVMTNSLTAADWCRSKKTYPNDKTIISTFKWSYTTGNGKRYRSTARTTYTFAKPMAANYLKNQPMYVFRKTELKHSKTELNFKEWQKAFTDVMGMDELYKHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	UIC2 Fab light chain
分子量 formula_weight	24321.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

QVVMTQSPLSLPVSLGDQASISCRSSQSLLHSNGNTYLHWYLQKPGQSPKLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYFCSQSTHIPPWTFGGGTKLDIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGLSVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Mus musculus

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	UIC2 Fab heavy chain
分子量 formula_weight	24381.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

EVQLQESGPELVKTGASVKISCKASGYSFSNYYIHWVKQSHGKSLEWIGFISCYNGATFYNQKFKGKATFTVDNSSSTAYMKFNSLTFEDSAVYYCARLPIQFGNFYPMDYWGQGTTVTVSSAKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPRGPT

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Mus musculus

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL
分子量 formula_weight	386.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
分子量 formula_weight	748.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	elacridar
分子量 formula_weight	563.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.54 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	101021

fit	/app/data/saxs_computation/y6/8y6i/8y6i.fit
pddf	/app/data/pr_computation/y6/8y6i/8y6i.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/y6/8y6i/8y6i.dat

P-glycoprotein in complex with UIC2 Fab and triple elacridar molecules in nanodisc

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent translocase ABCB1,mNeonGreen

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP-dependent translocase ABCB1,mNeonGreen

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)