8y71

positive allosteric modulator(BMS986187)-bound delta-opioid receptor-Gi complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1

Homo sapiens

UniProt P63096

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 (P54311) Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 × 1 (P63212) scFv16 × 1 Delta-type opioid receptor × 1 (P41143) 3,3,6,6-tetramethyl-9-[4-[(2-methylphenyl)methoxy]phenyl]-4,5,7,9-tetrahydro-2~{H}-xanthene-1,8-dione × 1 4-[(~{S})-[(2~{R},5~{S})-2,5-dimethyl-4-prop-2-enyl-piperazin-1-yl]-(3-methoxyphenyl)methyl]-~{N},~{N}-diethyl-benzamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GNAI1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–354; UniProt 1–354

Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1

Rattus norvegicus

UniProt P54311

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 × 1 (P63096) Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 × 1 (P63212) scFv16 × 1 Delta-type opioid receptor × 1 (P41143) 3,3,6,6-tetramethyl-9-[4-[(2-methylphenyl)methoxy]phenyl]-4,5,7,9-tetrahydro-2~{H}-xanthene-1,8-dione × 1 4-[(~{S})-[(2~{R},5~{S})-2,5-dimethyl-4-prop-2-enyl-piperazin-1-yl]-(3-methoxyphenyl)methyl]-~{N},~{N}-diethyl-benzamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GBB1_RAT
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 7–345; UniProt 2–340

Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2

Bos taurus

UniProt P63212

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 × 1 (P63096) Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 (P54311) scFv16 × 1 Delta-type opioid receptor × 1 (P41143) 3,3,6,6-tetramethyl-9-[4-[(2-methylphenyl)methoxy]phenyl]-4,5,7,9-tetrahydro-2~{H}-xanthene-1,8-dione × 1 4-[(~{S})-[(2~{R},5~{S})-2,5-dimethyl-4-prop-2-enyl-piperazin-1-yl]-(3-methoxyphenyl)methyl]-~{N},~{N}-diethyl-benzamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GBG2_BOVIN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–68; UniProt 1–68

Delta-type opioid receptor

Homo sapiens

UniProt P41143

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 × 1 (P63096) Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 (P54311) Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-2 × 1 (P63212) scFv16 × 1 3,3,6,6-tetramethyl-9-[4-[(2-methylphenyl)methoxy]phenyl]-4,5,7,9-tetrahydro-2~{H}-xanthene-1,8-dione × 1 4-[(~{S})-[(2~{R},5~{S})-2,5-dimethyl-4-prop-2-enyl-piperazin-1-yl]-(3-methoxyphenyl)methyl]-~{N},~{N}-diethyl-benzamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 OPRD_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–365; UniProt 2–366

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8y71
沉积日期 deposition_date2024-02-03
结构标题 titlepositive allosteric modulator(BMS986187)-bound delta-opioid receptor-Gi complex
关键词 keywordspositive allosteric modulator, BMS986187, delta-opioid receptor, allosteric agonism, allosteric opioid analgesics, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8y71__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8y71__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8y71__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)37.77 Å
Rg(电子密度)37.74 Å
总 Rg38.04 Å
原子数8933
残基数1136
排除体积159720 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8y71__assembly_1__model_1 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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7. 引用文献 (1)