8zms

Acetylcholine-bound VAChT

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 74.3 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Vesicular acetylcholine transporter,DARPinoff7

synthetic construct

UniProt P0AEX9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 29–391 突变:A520E ACH ACETYLCHOLINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 366 个其他 PDB 条目、491 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MALE_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–364; UniProt 29–391

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Vesicular acetylcholine transporter,DARPinoff7

synthetic construct

UniProt Q16572

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 34–524 突变:A520E ACH ACETYLCHOLINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.25 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VACHT_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 379–869; UniProt 34–524

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8zms

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8zms
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8zms
沉积日期 deposition_date2024-05-23
结构标题 titleAcetylcholine-bound VAChT
关键词 keywordsVAChT, SLC18A3, Acetylcholine, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier21.93
回转半径 Rg (电子) rg_electron20.89
零角强度 I(0) i023565100.00
分子量 molecular_weight41417.0 kDa
排除体积 excluded_volume53785 ų
包络体积 envelope_volume64100 ų
水化壳体积 shell_volume24938 ų
包络直径 envelope_diameter75.9
壳层 Rg shell_rg28.26
包络 Rg envelope_rg21.38
形状 Rg shape_rg20.89
总 Rg total_rg21.95
总原子数 total_atoms2920
残基数 n_residues386
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax74.3
Rg (实空间) rg_real21.84
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.48
I(0) (实空间) i0_real2.3570e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1790e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal21.86
I(0) (倒空间) i0_reciprocal23570000.0000
解质量估计 total_estimate0.6727
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary26.6
偏度 Skewness skewness0.266
峰度 Kurtosis kurtosis-0.266
角度范围 angular_range— – 0.3600 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4753000.0000
实空间数据点数 n_real_points68
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.786; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.145; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.955

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)