SAXSdb — 8zyq

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–140 链 A； UniProt 351–870 链 A； UniProt 1006–1159 链 B； UniProt 1–140 链 B； UniProt 351–870 链 B； UniProt 1006–1159 链 C； UniProt 1–140 链 C； UniProt 351–870 链 C； UniProt 1006–1159 链 D； UniProt 1–140 链 D； UniProt 351–870 链 D； UniProt 1006–1159	未记录	1II 3-[1-[4,4-bis(4-fluorophenyl)butyl]piperidin-4-yl]-1~{H}-benzimidazol-2-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.18 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8ZYQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BYW STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF THE HUMAN-ERG POTASSIUM CHANNEL 提交 1998-10-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–135（110 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	突变：R73C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；PROTEIN SOLUTION AT 10MG/ML IN 10MM DTT, 5 MM N-OCTYL-GLUCO MIXED WITH EQUAL VOLUME OF 100 MM HEPES PH 7.0, 0.8-1.0 M SODIUM AND POTASSIUM TARTRAT	分辨率 2.60 Å R-free 0.286
1UJL Solution Structure of the HERG K+ channel S5-P extracellular linker 提交 2003-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 570–611（42 aa）片段：RESIDUES 1-42	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 1.4mM S5-P peptide \| 100mM SDS, 90% H2O, 10% D2O	分辨率未提供
2L1M Solution structure of the eag domain of the hERG (Kv11.1) K+ channel 提交 2010-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–135（135 aa）片段：UNP residues 1-135	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM [U-100% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2L4R NMR solution structure of the N-terminal PAS domain of hERG 提交 2010-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–135（135 aa）片段：UNP RESIDUES 1-135	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 AMBIENT NMR样品组成 0.5-1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] entity-1, 5 mM DTT-2, 1 mM EDTA-3, 150 mM sodium chloride-4, 20 mM sodium phosphate-5, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LE7 Solution nmr structure of the S4S5 linker of herg potassium channel 提交 2011-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 532–551（20 aa）片段：residues 532-551	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.6；300 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 100mM DPC-1, 90%(v/v) H2O-2, 10%(v/v) [U-2H] D2O-3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2N7G Structure of the cyclic nucleotide-binding homology domain of the hERG channel 提交 2015-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 734–864（131 aa）片段：UNP residues 734-869	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）170；压力 ambient NMR样品组成 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] the cyclic nucleotide-binding homology domain of the hERG channel-1, 20 mM sodium phosphate-2, 150 mM sodium chloride-3, 1 mM DTT-4, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4HP9 Crystal structure of the N-terminal truncated PAS domain from the hERG potassium channel 提交 2012-10-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 10–135（126 aa）片段：PAS domain of KCNH channel, UNP residues 10-135	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；30% PEG-MME2000, 0.1M potasiumm thiocyanate, 1.0% benzamidine-HCl, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 2.12 Å R-free 0.238
4HQA Crystal structure of PAS domain from the human ERG (hERG) potassium channel 提交 2012-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–135（135 aa）片段：PAS domain of KCNH channel, UNP residues 1-135	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.0M sodium/potassium tartrate, 0.1M Hepes, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K	分辨率 1.96 Å R-free 0.239
5VA1 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–140（140 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 381–870（490 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 1006–1159（154 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force	分辨率 3.70 Å
5VA1 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–140（140 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 381–870（490 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 1006–1159（154 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force	分辨率 3.70 Å
5VA1 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–140（140 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 381–870（490 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 1006–1159（154 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force	分辨率 3.70 Å
5VA2 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–140（140 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 351–870（520 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 1006–1159（154 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force	分辨率 3.80 Å
5VA2 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–140（140 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 351–870（520 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 1006–1159（154 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force	分辨率 3.80 Å
5VA2 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–140（140 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 351–870（520 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 1006–1159（154 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force	分辨率 3.80 Å
5VA3 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–140（140 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 381–870（490 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 1006–1159（154 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159	突变：S631A 突变：S631A 突变：S631A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force	分辨率 4.00 Å
5VA3 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–140（140 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 381–870（490 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 1006–1159（154 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159	突变：S631A 突变：S631A 突变：S631A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force	分辨率 4.00 Å
5VA3 Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel 提交 2017-03-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–140（140 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 381–870（490 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159 链 A 1006–1159（154 aa）片段：UNP residues 1-140,381-870,1006-1159	突变：S631A 突变：S631A 突变：S631A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；pH 7.4, adjusted with NaOH cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；one blot: 3 second blot time, 0 blot force	分辨率 4.00 Å
6SYG Crystal structure of the Cyclic Nucleotide-Binding Homology Domain of the human KCNH2 channel 提交 2019-09-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 734–864（131 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；20% w/v PEG 3350, 2% v/v Tacsimate, 0.1M Bis-Tris, pH 6.8	分辨率 1.50 Å R-free 0.184
8IO4 Herg1a-herg1b open state 提交 2023-03-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1159（1159 aa）链 B 1–1159（1159 aa）链 C 1–1159（1159 aa）链 D 1–1159（1159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8ZYN Cryo-EM Structure of inhibitor-free hERG Channel 提交 2024-06-18	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–140（140 aa）链 A 351–870（520 aa）链 A 1006–1159（154 aa）链 B 1–140（140 aa）链 B 351–870（520 aa）链 B 1006–1159（154 aa）链 C 1–140（140 aa）链 C 351–870（520 aa）链 C 1006–1159（154 aa）链 D 1–140（140 aa）链 D 351–870（520 aa）链 D 1006–1159（154 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8ZYO Cryo-EM Structure of astemizole-bound hERG Channel 提交 2024-06-18	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–140（140 aa）链 A 351–870（520 aa）链 A 1006–1159（154 aa）链 B 1–140（140 aa）链 B 351–870（520 aa）链 B 1006–1159（154 aa）链 C 1–140（140 aa）链 C 351–870（520 aa）链 C 1006–1159（154 aa）链 D 1–140（140 aa）链 D 351–870（520 aa）链 D 1006–1159（154 aa）	未记录	XB7 1-[(4-fluorophenyl)methyl]-N-{1-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]piperidin-4-yl}-1H-benzimidazol-2-amine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å
8ZYP Cryo-EM Structure of E-4031-bound hERG Channel 提交 2024-06-18	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–140（140 aa）链 A 351–870（520 aa）链 A 1006–1159（154 aa）链 B 1–140（140 aa）链 B 351–870（520 aa）链 B 1006–1159（154 aa）链 C 1–140（140 aa）链 C 351–870（520 aa）链 C 1006–1159（154 aa）链 D 1–140（140 aa）链 D 351–870（520 aa）链 D 1006–1159（154 aa）	未记录	A1L2J ~{N}-[4-[1-[2-(6-methylpyridin-2-yl)ethyl]piperidin-4-yl]carbonylphenyl]methanesulfonamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å
9CHP Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel (hERG) in 300 mM K+ 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1159（1159 aa）链 B 1–1159（1159 aa）链 C 1–1159（1159 aa）链 D 1–1159（1159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9CHQ Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel (hERG) in 3 mM K+ 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1159（1159 aa）链 B 1–1159（1159 aa）链 C 1–1159（1159 aa）链 D 1–1159（1159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9CHR Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel (hERG) in 300 mM K+ without symmetry 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1159（1159 aa）链 B 1–1159（1159 aa）链 C 1–1159（1159 aa）链 D 1–1159（1159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9CHS Cryo-EM structure of the human ether-a-go-go related K+ channel (hERG) in 3 mM K+ without symmetry 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1159（1159 aa）链 B 1–1159（1159 aa）链 C 1–1159（1159 aa）链 D 1–1159（1159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 20 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCNH2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 A； PDB构建体 141–660； UniProt 351–870 作者链 A； PDB构建体 661–814； UniProt 1006–1159 作者链 B； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 B； PDB构建体 141–660； UniProt 351–870 作者链 B； PDB构建体 661–814； UniProt 1006–1159 作者链 C； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 C； PDB构建体 141–660； UniProt 351–870 作者链 C； PDB构建体 661–814； UniProt 1006–1159 作者链 D； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 D； PDB构建体 141–660； UniProt 351–870 作者链 D； PDB构建体 661–814； UniProt 1006–1159

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8zyq
沉积日期 deposition_date	2024-06-18
结构标题 title	Cryo-EM Structure of pimozide-bound hERG Channel
关键词 keywords	drug toxicity, potassium ion, hERG, cryo-EM, MEMBRANE PROTEIN, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	31.06 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	30.73 Å
零角强度 I(0) i0	99038900.00
分子量 molecular_weight	89410.0 kDa
排除体积 excluded_volume	116500 Å³
包络体积 envelope_volume	152380 Å³
水化壳体积 shell_volume	40904 Å³
包络直径 envelope_diameter	106.5 Å
壳层 Rg shell_rg	38.00 Å
包络 Rg envelope_rg	31.30 Å
形状 Rg shape_rg	30.73 Å
总 Rg total_rg	31.49 Å
总原子数 total_atoms	6329
残基数 n_residues	796
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	99.3 Å
Rg (实空间) rg_real	30.94 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.75 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.9040e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5790e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	31.00 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	99040000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8921
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	40.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.214
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.323
角度范围 angular_range	— – 0.2550 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	10290000.0000
实空间数据点数 n_real_points	52
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.896; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.905

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2
分子量 formula_weight	91792.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	6329

MPVRRGHVAPQNTFLDTIIRKFEGQSRKFIIANARVENCAVIYCNDGFCELCGYSRAEVMQRPCTCDFLHGPRTQRRAAAQIAQALLGAEERKVEIAFYRKDGSCFLCLVDVVPVKNEDGAVIMFILNFEVVMEKDMVGSSPTSDREIIAPKIKERTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTTYVNANEEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLLIFGSGSEELIGLLKTARLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDSRIGWLHNLGDQIGKPYNSSGLGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPFRGATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGDLLTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKNDIFGEPLNLYARPGKSNGDVRALTYCDLHKIHRDDLLEVLDMYPEFSDHFWSSLEITFNLRDTNMIPGGRQYQELPRCPAPTPSLLNIPLSSPGRRPRGDVESRLDALQRQLNRLETRLSADMATVLQLLQRQMTLVPPAYSAVTTPGPGPTSTSPLLPVSPLPTLTLDSLSQVSQFMACEELPPGAPELPQEGPTRRLSLPGQLGALTSQPLHRHGSDPGSLEVLFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	3-[1-[4,4-bis(4-fluorophenyl)butyl]piperidin-4-yl]-1~{H}-benzimidazol-2-one
分子量 formula_weight	461.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.18 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	98139

fit	/app/data/saxs_computation/zy/8zyq/8zyq.fit
pddf	/app/data/pr_computation/zy/8zyq/8zyq.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/zy/8zyq/8zyq.dat

Cryo-EM Structure of pimozide-bound hERG Channel

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)