SAXSdb — 9b4r

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ras-related protein M-Ras

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 11–178	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；0.002 M divalent II mix, 50%v/v(30%w/v PEG 3000, 40%v/v 1,2,4-butanetriol, and 2%w/v NDSB 256)	分辨率 2.10 Å R-free 0.250

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9B4R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7SD0 Cryo-EM structure of the SHOC2:PP1C:MRAS complex 提交 2021-09-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–208（208 aa）	未记录	GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Used the "perpetually hydrated" method of applying graphene oxide. (Cheung et al., 2018)	分辨率 2.95 Å
7TVF Crystal structure of the SHOC2-MRAS-PP1CA (SMP) complex to a resolution of 2.17 Angstrom 提交 2022-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–178（178 aa）	突变：Q71L	GOL GLYCEROL × 7 SO4 SULFATE ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Crystals originally grown in 15% PEG 1500, 0.1M MIB pH 4.2 (15mg/ml of SMP) were used to make seeds. Microseeded into a condition with a reservoir consisting of 17.8% PEG 3350, 136mM sodium sulfate with 1:10 dilution of seeds (7.5mg/ml of SMP) using a ratio of 200nl protein:133nl reservoir:67nl diluted seeds	分辨率 2.17 Å R-free 0.226
7TVF Crystal structure of the SHOC2-MRAS-PP1CA (SMP) complex to a resolution of 2.17 Angstrom 提交 2022-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–178（178 aa）	突变：Q71L	GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Crystals originally grown in 15% PEG 1500, 0.1M MIB pH 4.2 (15mg/ml of SMP) were used to make seeds. Microseeded into a condition with a reservoir consisting of 17.8% PEG 3350, 136mM sodium sulfate with 1:10 dilution of seeds (7.5mg/ml of SMP) using a ratio of 200nl protein:133nl reservoir:67nl diluted seeds	分辨率 2.17 Å R-free 0.226
7TXH Human MRas Q71R in complex with human Shoc2 LRR domain M173I and human PP1Ca 提交 2022-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–178（178 aa）	突变：Q71R	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 MN MANGANESE (II) ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M NaH2PO4 pH 6.5, 12% PEG 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.210
7TXH Human MRas Q71R in complex with human Shoc2 LRR domain M173I and human PP1Ca 提交 2022-02-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–178（178 aa）	突变：Q71R	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M NaH2PO4 pH 6.5, 12% PEG 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.210
7UPI Cryo-EM structure of SHOC2-PP1c-MRAS holophosphatase complex 提交 2022-04-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–182（182 aa）	突变：Q71L	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Fluorinated octyl maltoside added immediately prior to vitrification cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
9B4T Crystal structure of the MRAS-p110alpha complex 提交 2024-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–178（178 aa）	突变：Q35A	5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M (Tris/Bicine) 1.2%w/v cholic acid mix, 50%v/v (40%v/v ethylene glycol, 20%w/v PEG 8000)	分辨率 2.75 Å R-free 0.262
9C1A Crystal structure of GDP-bound human M-RAS protein in crystal form I 提交 2024-05-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–178（178 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2M CaCl2, 20% PEG3350	分辨率 1.96 Å R-free 0.200
9C1B Crystal structure of GDP-bound human M-RAS protein in crystal form II 提交 2024-05-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–204（204 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；20% PEG3350	分辨率 2.27 Å R-free 0.247
9C1B Crystal structure of GDP-bound human M-RAS protein in crystal form II 提交 2024-05-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–204（204 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；20% PEG3350	分辨率 2.27 Å R-free 0.247
9C1B Crystal structure of GDP-bound human M-RAS protein in crystal form II 提交 2024-05-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–204（204 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；20% PEG3350	分辨率 2.27 Å R-free 0.247
9C1B Crystal structure of GDP-bound human M-RAS protein in crystal form II 提交 2024-05-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–204（204 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；20% PEG3350	分辨率 2.27 Å R-free 0.247
9MEZ Crystal structure of MRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–181（181 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；11.2% w/v PEG3350, 5.26% Tacsimate pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.255
9MEZ Crystal structure of MRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–181（181 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MLA MALONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；11.2% w/v PEG3350, 5.26% Tacsimate pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.255
9MEZ Crystal structure of MRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–181（181 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MLA MALONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；11.2% w/v PEG3350, 5.26% Tacsimate pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.255
9MEZ Crystal structure of MRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–181（181 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MLA MALONIC ACID × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；11.2% w/v PEG3350, 5.26% Tacsimate pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.255
9MEZ Crystal structure of MRAS(GDP) bound to LZTR1(Kelch domain) 提交 2024-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 1–181（181 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；11.2% w/v PEG3350, 5.26% Tacsimate pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.255
9O0P Crystal structure of GDP-bound mutant MRAS in complex with MRTX1133 提交 2025-04-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–178（178 aa）	突变：F74Y, R105H, F106Y, L109Q	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2M ammonium fluoride	分辨率 1.50 Å R-free 0.221
9O0P Crystal structure of GDP-bound mutant MRAS in complex with MRTX1133 提交 2025-04-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–178（178 aa）	突变：F74Y, R105H, F106Y, L109Q	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2M ammonium fluoride	分辨率 1.50 Å R-free 0.221
9O0Q Crystal structure of GMPPNP-bound mutant MRAS in complex with MRTX1133 提交 2025-04-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–178（178 aa）	突变：F74Y, R105H, F106Y, L109Q	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.6M magnesium sulfate, 0.1M MES, pH 6.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.207
9O0Q Crystal structure of GMPPNP-bound mutant MRAS in complex with MRTX1133 提交 2025-04-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–178（178 aa）	突变：F74Y, R105H, F106Y, L109Q	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.6M magnesium sulfate, 0.1M MES, pH 6.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.207
9O0Q Crystal structure of GMPPNP-bound mutant MRAS in complex with MRTX1133 提交 2025-04-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–178（178 aa）	突变：F74Y, R105H, F106Y, L109Q	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 6IC 4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-ethynyl-6-fluoronaphthalen-2-ol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1.6M magnesium sulfate, 0.1M MES, pH 6.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.207

共 10 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RASM_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–169； UniProt 11–178

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9b4r
沉积日期 deposition_date	2024-03-21
最后修订 last_revision	2025-01-22
结构标题 title	Crystal structure of MRAS bound to GMPPNP
关键词 keywords	RAS, RRAS3, MRAS, ONCOPROTEIN; ONCOPROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	16.53 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	15.22 Å
零角强度 I(0) i0	7303330.00
分子量 molecular_weight	19334.0 kDa
排除体积 excluded_volume	24006 Å³
包络体积 envelope_volume	26931 Å³
水化壳体积 shell_volume	14745 Å³
包络直径 envelope_diameter	53.4 Å
壳层 Rg shell_rg	21.32 Å
包络 Rg envelope_rg	15.57 Å
形状 Rg shape_rg	15.18 Å
总 Rg total_rg	16.39 Å
总原子数 total_atoms	1351
残基数 n_residues	164
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	52.4 Å
Rg (实空间) rg_real	16.39 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.31 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.3030e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.4470e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	16.41 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	7303000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8128
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	51.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.087
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.414
角度范围 angular_range	— – 0.4800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1443000.0000
实空间数据点数 n_real_points	78
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.858; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ras-related protein M-Ras
分子量 formula_weight	19467.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.5.2
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1521

GLPTYKLVVVGDGGVGKSALTIQFFQKIFVPDYDPTIEDSYLKHTEIDNQWAILDVLDTAGQEEFSAMREQYMRTGDGFLIVYSVTDKASFEHVDRFHQLILRVKDRESFPMILVANKVDLMHLRKITREQGKEMATKHNIPYIETSAKDPPLNVDKAFHDLVRVIRQQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER
分子量 formula_weight	522.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	170

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	65.481 Å
晶胞边长 b length_b	65.481 Å
晶胞边长 c length_c	107.806 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 42 21 2
空间群编号 int_tables_number	94
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	42.540 Å
R 因子 r_factor	0.2015
R_work r_work	0.1990
R_free r_free	0.2498

fit	/app/data/saxs_computation/b4/9b4r/9b4r.fit
pddf	/app/data/pr_computation/b4/9b4r/9b4r.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/b4/9b4r/9b4r.dat

Crystal structure of MRAS bound to GMPPNP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ras-related protein M-Ras

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction