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9b9g

Structure of the PI4KA complex bound to Calcineurin

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 282.1 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphatidylinositol 4-kinase alpha

Homo sapiens

UniProt P42356

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–2102 链 B； UniProt 1–2102 未记录 Tetratricopeptide repeat protein 7B × 2 （Q86TV6） Hyccin × 2 （Q9BYI3） Calcineurin subunit B type 1 × 2 （P63098） Protein phosphatase 3 catalytic subunit alpha × 2 （Q08209） CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；Freshly prepared gel filtration buffer, filtered through 0.22um filter and degassed cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1 s 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9B9G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6BQ1 Human PI4KIIIa lipid kinase complex 提交 2017-11-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 932–2102（1171 aa）
链 E 932–2102（1171 aa）
未记录 E4S 5-{2-amino-1-[4-(morpholin-4-yl)phenyl]-1H-benzimidazol-6-yl}-N-(2-fluorophenyl)-2-methoxypyridine-3-sulfonamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9BAX PI4KA complex bound to C-terminus of EFR3A 提交 2024-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2102（2102 aa）
链 B 1–2102（2102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；Freshly prepared gel filtration buffer, filtered through 0.22um filter and degassed
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1.5 s
分辨率 3.65 Å
9OT6 Cryo-EM structure of the PI4KA complex bound to an EFR3 interfering nanobody (F3IN) 提交 2025-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2102（2102 aa）
链 B 1–2102（2102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1.5 s.
分辨率 3.54 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PI4KA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–2102； UniProt 1–2102 作者链 B； PDB构建体 1–2102； UniProt 1–2102

Tetratricopeptide repeat protein 7B

Homo sapiens

UniProt Q86TV6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–843 链 F； UniProt 1–843 未记录 Phosphatidylinositol 4-kinase alpha × 2 （P42356） Hyccin × 2 （Q9BYI3） Calcineurin subunit B type 1 × 2 （P63098） Protein phosphatase 3 catalytic subunit alpha × 2 （Q08209） CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；Freshly prepared gel filtration buffer, filtered through 0.22um filter and degassed cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1 s 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9B9G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5DSE Crystal Structure of the TTC7B/Hyccin Complex 提交 2015-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 7–843（837 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.35 ul protein + 1.35 ul mother liquor (0.1 M HEPES [pH 7.0-7.4], 4-5% polyethylene glycol [PEG] 8,000) + 0.3 ul 0.2 M 3-(1-Pyridino)-1-propane sulfonate (NDSB-201)
分辨率 2.90 Å R-free 0.242
5DSE Crystal Structure of the TTC7B/Hyccin Complex 提交 2015-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 7–843（837 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.35 ul protein + 1.35 ul mother liquor (0.1 M HEPES [pH 7.0-7.4], 4-5% polyethylene glycol [PEG] 8,000) + 0.3 ul 0.2 M 3-(1-Pyridino)-1-propane sulfonate (NDSB-201)
分辨率 2.90 Å R-free 0.242
6BQ1 Human PI4KIIIa lipid kinase complex 提交 2017-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–843（843 aa）
链 F 1–843（843 aa）
未记录 E4S 5-{2-amino-1-[4-(morpholin-4-yl)phenyl]-1H-benzimidazol-6-yl}-N-(2-fluorophenyl)-2-methoxypyridine-3-sulfonamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9BAX PI4KA complex bound to C-terminus of EFR3A 提交 2024-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–843（843 aa）
链 F 1–843（843 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；Freshly prepared gel filtration buffer, filtered through 0.22um filter and degassed
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1.5 s
分辨率 3.65 Å
9OT6 Cryo-EM structure of the PI4KA complex bound to an EFR3 interfering nanobody (F3IN) 提交 2025-05-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–843（843 aa）
链 F 1–843（843 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1.5 s.
分辨率 3.54 Å

共 4 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TTC7B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–843； UniProt 1–843 作者链 F； PDB构建体 1–843； UniProt 1–843

Hyccin

Homo sapiens

UniProt Q9BYI3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–308 链 G； UniProt 1–308 未记录 Phosphatidylinositol 4-kinase alpha × 2 （P42356） Tetratricopeptide repeat protein 7B × 2 （Q86TV6） Calcineurin subunit B type 1 × 2 （P63098） Protein phosphatase 3 catalytic subunit alpha × 2 （Q08209） CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；Freshly prepared gel filtration buffer, filtered through 0.22um filter and degassed cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1 s 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9B9G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5DSE Crystal Structure of the TTC7B/Hyccin Complex 提交 2015-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–308（307 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.35 ul protein + 1.35 ul mother liquor (0.1 M HEPES [pH 7.0-7.4], 4-5% polyethylene glycol [PEG] 8,000) + 0.3 ul 0.2 M 3-(1-Pyridino)-1-propane sulfonate (NDSB-201)
分辨率 2.90 Å R-free 0.242
5DSE Crystal Structure of the TTC7B/Hyccin Complex 提交 2015-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–308（307 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.35 ul protein + 1.35 ul mother liquor (0.1 M HEPES [pH 7.0-7.4], 4-5% polyethylene glycol [PEG] 8,000) + 0.3 ul 0.2 M 3-(1-Pyridino)-1-propane sulfonate (NDSB-201)
分辨率 2.90 Å R-free 0.242
6BQ1 Human PI4KIIIa lipid kinase complex 提交 2017-11-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 2–289（288 aa）
链 G 2–289（288 aa）
未记录 E4S 5-{2-amino-1-[4-(morpholin-4-yl)phenyl]-1H-benzimidazol-6-yl}-N-(2-fluorophenyl)-2-methoxypyridine-3-sulfonamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9BAX PI4KA complex bound to C-terminus of EFR3A 提交 2024-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–308（308 aa）
链 G 1–308（308 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；Freshly prepared gel filtration buffer, filtered through 0.22um filter and degassed
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1.5 s
分辨率 3.65 Å
9OT6 Cryo-EM structure of the PI4KA complex bound to an EFR3 interfering nanobody (F3IN) 提交 2025-05-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–308（308 aa） 片段：residues 1-308
链 G 1–308（308 aa） 片段：residues 1-308
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1.5 s.
分辨率 3.54 Å

共 4 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HYCCI_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–308； UniProt 1–308 作者链 G； PDB构建体 1–308； UniProt 1–308

Calcineurin subunit B type 1

Homo sapiens

UniProt P63098

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 1–170 链 J； UniProt 1–170 未记录 Phosphatidylinositol 4-kinase alpha × 2 （P42356） Tetratricopeptide repeat protein 7B × 2 （Q86TV6） Hyccin × 2 （Q9BYI3） Protein phosphatase 3 catalytic subunit alpha × 2 （Q08209） CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；Freshly prepared gel filtration buffer, filtered through 0.22um filter and degassed cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1 s 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9B9G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AUI HUMAN CALCINEURIN HETERODIMER 提交 1997-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–169（169 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 8% PEG 6000, 0.1M CACL2, 0.1M TES PH 7.5, 1 MM DTT.
分辨率 2.10 Å
1M63 Crystal structure of calcineurin-cyclophilin-cyclosporin shows common but distinct recognition of immunophilin-drug complexes 提交 2002-07-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–169（169 aa）
链 F 1–169（169 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M NA CACODYLATE, 0.2 M MGCL2, 13% PEG8000, 2.5% ETHANOL, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.322
1MF8 Crystal Structure of human calcineurin complexed with cyclosporin A and human cyclophilin 提交 2002-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 0–169（170 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；12% PEG 4000, 5MM POTASSIUM PHOSPHATE, 75MM SODIUM CITRATE, 15% GLYCEROL, 5MM TRIS, PH 4.6, MICROBATCH, TEMPERATURE 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.300
2P6B Crystal Structure of Human Calcineurin in Complex with PVIVIT Peptide 提交 2007-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 16–170（155 aa） 片段：Residues 16-170
链 D 16–170（155 aa） 片段：Residues 16-170
未记录 ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；12% PEG 4000, 0.1M calcium chloride, 0.1M TES, 0.001M DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.30 Å R-free 0.254
3LL8 Crystal Structure of Calcineurin in Complex with AKAP79 Peptide 提交 2010-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 16–170（155 aa） 片段：UNP residues 16-170
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 20,000 MgSO4 CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
3LL8 Crystal Structure of Calcineurin in Complex with AKAP79 Peptide 提交 2010-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 16–170（155 aa） 片段：UNP residues 16-170
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 20,000 MgSO4 CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
3LL8 Crystal Structure of Calcineurin in Complex with AKAP79 Peptide 提交 2010-01-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 16–170（155 aa） 片段：UNP residues 16-170
链 D 16–170（155 aa） 片段：UNP residues 16-170
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 20,000 MgSO4 CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
4F0Z Crystal Structure of Calcineurin in Complex with the Calcineurin-Inhibiting Domain of the African Swine Fever Virus Protein A238L 提交 2012-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–170（170 aa） 片段：Calcineurin B Subunit
未记录 GOL GLYCEROL × 8 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；0.16 M ammonium citrate dibasic, 20% (w/v) PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 1.70 Å R-free 0.178
4OR9 Crystal structure of human calcineurin 提交 2014-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–170（170 aa） 片段：regulatory subunit
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；294 K；100mM MES, pH 5.8, 7% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.23 Å R-free 0.215
4ORA Crystal structure of a human calcineurin mutant 提交 2014-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–170（170 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；294 K；100 mM MES, pH 5.8, 9% PEG 3350, 4% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.75 Å R-free 0.249
4ORC Crystal structure of mammalian calcineurin 提交 2014-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–170（170 aa） 片段：regulatory subunit
未记录 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；294 K；100mM MES, pH 6.1, 10% PEG3350, 0.2M CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.70 Å R-free 0.260
5SVE Structure of Calcineurin in complex with NFATc1 LxVP peptide 提交 2016-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–170（170 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M HEPES pH 7.0 15% Peg 4000
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
6NUC Structure of Calcineurin in complex with NHE1 peptide 提交 2019-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 16–170（155 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.194
6NUF Structure of Calcineurin in complex with NHE1 peptide 提交 2019-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 16–170（155 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
6NUU Structure of Calcineurin mutant in complex with NHE1 peptide 提交 2019-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 16–170（155 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
7U0T Crystal Structure of a human Calcineurin A - Calcineurin B fusion bound to FKBP12 and FK-520 提交 2022-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 3–170（168 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 KXX (3S,4R,5S,8R,9E,12S,14S,15R,16S,18R,19R,22R,26aS)-8-ethyl-5,19-dihydroxy-3-{(1E)-1-[(1R,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]prop-1-en-2-yl}-14,16-dimethoxy-4,10,12,18-tetramethyl-5,6,8,11,12,13,14,15,16,17,18,19,24,25,26,26a-hexadecahydro-3H-15,19-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclotricosine-1,7,20,21(4H,23H)-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；287 K；Microlytics MCSG-1 C5: 0.2M Magnesium Acetate, 20% PEG 3,350, HosaA.18272.a.TM11.PD38439 at 20mg/ml + FK-520 (Purified from SEC): cryo: 20% ethylene glycol: tray 318701c5, puck oxo8-2
分辨率 2.45 Å R-free 0.260
9CHU Cryo-EM structure of calcineurin fused beta2 adrenergic receptor in norepinephrine bound inactive state 提交 2024-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–170（155 aa）
未记录 E5E Noradrenaline × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
9CHV cryo-EM structure of calcineurin-fused beta2 adrenergic receptor in apo state 提交 2024-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–170（155 aa）
未记录 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
9CHX cryo-EM structure of calcineurin-fused beta2 adrenergic receptor in carazolol bound inactive state 提交 2024-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 16–170（155 aa）
未记录 CAU (2S)-1-(9H-Carbazol-4-yloxy)-3-(isopropylamino)propan-2-ol × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9NXE Crystal Structure of Calcineurin Clinical Variant E282K 提交 2025-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 16–170（155 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；290 K；0.1 M CAPS pH 9, 0.2 M MgCl2 and 24% PEG 600
分辨率 2.09 Å R-free 0.243
9NXF Crystal structure of CN:Tak1 complex 提交 2025-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 16–170（155 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；200 mM Sodium citrate tribasic pH 8.4, 22% PEG 3350, 3% ethanol. Microseeding
分辨率 3.13 Å R-free 0.295
9NXF Crystal structure of CN:Tak1 complex 提交 2025-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 16–170（155 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；200 mM Sodium citrate tribasic pH 8.4, 22% PEG 3350, 3% ethanol. Microseeding
分辨率 3.13 Å R-free 0.295
9NXN Crystal structure of CN:RII alpha 提交 2025-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–170（170 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；289 K；0.1 M sodium citrate pH 5.0, 0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 15% PEG 4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.250

共 20 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CANB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 J； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170

Protein phosphatase 3 catalytic subunit alpha

Homo sapiens

UniProt Q08209

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 I； UniProt 2–391 链 I； UniProt 162–391 链 K； UniProt 2–391 链 K； UniProt 162–391 突变：L236P,D238N Phosphatidylinositol 4-kinase alpha × 2 （P42356） Tetratricopeptide repeat protein 7B × 2 （Q86TV6） Hyccin × 2 （Q9BYI3） Calcineurin subunit B type 1 × 2 （P63098） CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；Freshly prepared gel filtration buffer, filtered through 0.22um filter and degassed cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force -5, blot time 1 s 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9B9G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AUI HUMAN CALCINEURIN HETERODIMER 提交 1997-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–521（521 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 8% PEG 6000, 0.1M CACL2, 0.1M TES PH 7.5, 1 MM DTT.
分辨率 2.10 Å
1M63 Crystal structure of calcineurin-cyclophilin-cyclosporin shows common but distinct recognition of immunophilin-drug complexes 提交 2002-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–372（372 aa） 片段：RESIDUES 1-372
链 E 1–372（372 aa） 片段：RESIDUES 1-372
未记录 ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M NA CACODYLATE, 0.2 M MGCL2, 13% PEG8000, 2.5% ETHANOL, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.322
1MF8 Crystal Structure of human calcineurin complexed with cyclosporin A and human cyclophilin 提交 2002-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 20–392（373 aa） 片段：TRUNCATED FORM (RESIDUES 20-392)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；12% PEG 4000, 5MM POTASSIUM PHOSPHATE, 75MM SODIUM CITRATE, 15% GLYCEROL, 5MM TRIS, PH 4.6, MICROBATCH, TEMPERATURE 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.300
2JOG Structure of the calcineurin-NFAT complex 提交 2007-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–347（327 aa） 片段：residues 21-347
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成 500uM [U-13C; U-15N; U-2H] calcineurin, 0.4-0.6 mM NFAT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 300uM calcineurin, 0.3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] NFAT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 400uM [2H, FIMY-1H] calcineurin, 0.4 mM [ul-2H15N, Id1LdVg -1H13C] NFAT, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2JZI Structure of Calmodulin complexed with the Calmodulin Binding Domain of Calcineurin 提交 2008-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 391–414（24 aa） 片段：UNP residues 391-414, Calmodulin_binding_domain_of_Calcineurin
未记录 CA CALCIUM ION × 4 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；310 K
NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Calmodulin, 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Calmodulin binding domain of Calcineurin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2P6B Crystal Structure of Human Calcineurin in Complex with PVIVIT Peptide 提交 2007-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–380（380 aa） 片段：Residues 1-381
链 C 1–380（380 aa） 片段：Residues 1-381
未记录 ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；12% PEG 4000, 0.1M calcium chloride, 0.1M TES, 0.001M DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.30 Å R-free 0.254
2R28 The complex Structure of Calmodulin Bound to a Calcineurin Peptide 提交 2007-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 389–413（25 aa）
链 D 389–413（25 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；20% PEG 3350, 0.2M ammonium phosphate, 0.1M citrite acid , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.86 Å R-free 0.280
2W73 High-resolution structure of the complex between calmodulin and a peptide from calcineurin A 提交 2008-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 395–411（17 aa） 片段：CALMODULIN BINDING DOMAIN, RESIDUES 385-411
链 L 395–411（17 aa） 片段：CALMODULIN BINDING DOMAIN, RESIDUES 385-411
未记录 CA CALCIUM ION × 11 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.45 Å R-free 0.217
2W73 High-resolution structure of the complex between calmodulin and a peptide from calcineurin A 提交 2008-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 M 395–411（17 aa） 片段：CALMODULIN BINDING DOMAIN, RESIDUES 385-411
链 O 395–411（17 aa） 片段：CALMODULIN BINDING DOMAIN, RESIDUES 385-411
未记录 CA CALCIUM ION × 9 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.45 Å R-free 0.217
3LL8 Crystal Structure of Calcineurin in Complex with AKAP79 Peptide 提交 2010-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–370（357 aa） 片段：UNP residues 14-370
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 20,000 MgSO4 CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
3LL8 Crystal Structure of Calcineurin in Complex with AKAP79 Peptide 提交 2010-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 14–370（357 aa） 片段：UNP residues 14-370
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 20,000 MgSO4 CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
3LL8 Crystal Structure of Calcineurin in Complex with AKAP79 Peptide 提交 2010-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 14–370（357 aa） 片段：UNP residues 14-370
链 C 14–370（357 aa） 片段：UNP residues 14-370
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 20,000 MgSO4 CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.228
4F0Z Crystal Structure of Calcineurin in Complex with the Calcineurin-Inhibiting Domain of the African Swine Fever Virus Protein A238L 提交 2012-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–370（370 aa） 片段：Calcineurin A Subunit
未记录 GOL GLYCEROL × 8 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；295 K；0.16 M ammonium citrate dibasic, 20% (w/v) PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 1.70 Å R-free 0.178
4Q5U Structure of calmodulin bound to its recognition site from calcineurin 提交 2014-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 391–414（24 aa） 片段：calmodulin-binding domain (UNP residues 391-414)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；3:1 10 mg/ml protein to mother liquor (24% PEG1000, 20% glycerol), final volume 200 nL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.95 Å R-free 0.248
5C1V CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF CATALYTIC SUBUNIT OF HUMAN CALCINEURIN 提交 2015-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–346（345 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 2-347
突变：YES FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；0.1 M HEPES, 25% PEG 3350, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 3.35 Å R-free 0.249
5C1V CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF CATALYTIC SUBUNIT OF HUMAN CALCINEURIN 提交 2015-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–346（345 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 2-347
突变：YES FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；0.1 M HEPES, 25% PEG 3350, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 3.35 Å R-free 0.249
5SVE Structure of Calcineurin in complex with NFATc1 LxVP peptide 提交 2016-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–370（370 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M HEPES pH 7.0 15% Peg 4000
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
6NUC Structure of Calcineurin in complex with NHE1 peptide 提交 2019-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–370（370 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.194
6NUF Structure of Calcineurin in complex with NHE1 peptide 提交 2019-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–370（370 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
6NUU Structure of Calcineurin mutant in complex with NHE1 peptide 提交 2019-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–370（370 aa）
突变：H155A, Y159A FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
6UUQ Structure of Calcineurin bound to RCAN1 提交 2019-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–339（314 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Sodium cacodylate, 12% Peg 8000, 0.1 M Calcium acetate
分辨率 1.85 Å R-free 0.205
9NXE Crystal Structure of Calcineurin Clinical Variant E282K 提交 2025-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–370（370 aa）
突变：E282K PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；290 K；0.1 M CAPS pH 9, 0.2 M MgCl2 and 24% PEG 600
分辨率 2.09 Å R-free 0.243
9NXF Crystal structure of CN:Tak1 complex 提交 2025-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–370（370 aa）
突变：D90A FE FE (III) ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；200 mM Sodium citrate tribasic pH 8.4, 22% PEG 3350, 3% ethanol. Microseeding
分辨率 3.13 Å R-free 0.295
9NXF Crystal structure of CN:Tak1 complex 提交 2025-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–370（370 aa）
突变：D90A FE FE (III) ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；298 K；200 mM Sodium citrate tribasic pH 8.4, 22% PEG 3350, 3% ethanol. Microseeding
分辨率 3.13 Å R-free 0.295
9NXN Crystal structure of CN:RII alpha 提交 2025-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–370（370 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；289 K；0.1 M sodium citrate pH 5.0, 0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 15% PEG 4000
分辨率 2.10 Å R-free 0.250

共 20 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PP2BA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–390； UniProt 2–391 作者链 I； PDB构建体 391–620； UniProt 162–391 作者链 K； PDB构建体 1–390； UniProt 2–391 作者链 K； PDB构建体 391–620； UniProt 162–391

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9b9g

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9b9g
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9b9g
沉积日期 deposition_date2024-04-02
结构标题 titleStructure of the PI4KA complex bound to Calcineurin
关键词 keywordsPI4KIIIa complex, PI4KA, TTC7B, FAM126A, CNA, CNB, Calcineurin, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier78.99 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron79.06 Å
零角强度 I(0) i06160680000.00
分子量 molecular_weight692110.0 kDa
排除体积 excluded_volume876440 ų
包络体积 envelope_volume1609800 ų
水化壳体积 shell_volume170750 ų
包络直径 envelope_diameter279.4 Å
壳层 Rg shell_rg76.78 Å
包络 Rg envelope_rg75.38 Å
形状 Rg shape_rg79.06 Å
总 Rg total_rg79.03 Å
总原子数 total_atoms48664
残基数 n_residues6075
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax282.1 Å
Rg (实空间) rg_real83.23 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.96 Å
I(0) (实空间) i0_real6.1960e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4240e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal78.88 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal6158000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9026
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary84.6 Å
偏度 Skewness skewness0.489
峰度 Kurtosis kurtosis-0.065
角度范围 angular_range— – 0.1000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha1.1020
最高正则化参数 α highest_alpha449800000.0000
实空间数据点数 n_real_points21
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.866; Stabil: 0.857; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.608
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)