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9cfc

Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 2

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 230.9 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit

物种未注明

UniProt Q99437

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 0； UniProt 1–205 未记录 V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLW The Vo region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 0 1–205（205 aa）
未记录 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 0 1–205（205 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 0 1–205（205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 0 1–205（205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 0 1–205（205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 1 1–205（205 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 0 1–205（205 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9DET Human V-ATPase Vo subcomplex (containing subunit isoform a4) bound to nanobody and inhibitor 提交 2024-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：17-meric
链 b 1–205（205 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 A1A4Q Cladoniamide A × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；20 mM Tris, 150 mM NaCl, 0.5 mM EDTA, 2 mM DTT, pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATO_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 0； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205

V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit

物种未注明

UniProt P27449

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 1； UniProt 1–155 链 2； UniProt 1–155 链 3； UniProt 1–155 链 4； UniProt 1–155 链 5； UniProt 1–155 链 6； UniProt 1–155 链 7； UniProt 1–155 链 8； UniProt 1–155 链 9； UniProt 1–155 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLW The Vo region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–155（155 aa）
链 2 1–155（155 aa）
链 3 1–155（155 aa）
链 4 1–155（155 aa）
链 5 1–155（155 aa）
链 6 1–155（155 aa）
链 7 1–155（155 aa）
链 8 1–155（155 aa）
链 9 1–155（155 aa）
未记录 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 1 1–155（155 aa）
链 2 1–155（155 aa）
链 3 1–155（155 aa）
链 4 1–155（155 aa）
链 5 1–155（155 aa）
链 6 1–155（155 aa）
链 7 1–155（155 aa）
链 8 1–155（155 aa）
链 9 1–155（155 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 1 1–155（155 aa）
链 2 1–155（155 aa）
链 3 1–155（155 aa）
链 4 1–155（155 aa）
链 5 1–155（155 aa）
链 6 1–155（155 aa）
链 7 1–155（155 aa）
链 8 1–155（155 aa）
链 9 1–155（155 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 1 1–155（155 aa）
链 2 1–155（155 aa）
链 3 1–155（155 aa）
链 4 1–155（155 aa）
链 5 1–155（155 aa）
链 6 1–155（155 aa）
链 7 1–155（155 aa）
链 8 1–155（155 aa）
链 9 1–155（155 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 1 1–155（155 aa）
链 2 1–155（155 aa）
链 3 1–155（155 aa）
链 4 1–155（155 aa）
链 5 1–155（155 aa）
链 6 1–155（155 aa）
链 7 1–155（155 aa）
链 8 1–155（155 aa）
链 9 1–155（155 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 0 1–155（155 aa）
链 2 1–155（155 aa）
链 3 1–155（155 aa）
链 4 1–155（155 aa）
链 5 1–155（155 aa）
链 6 1–155（155 aa）
链 7 1–155（155 aa）
链 8 1–155（155 aa）
链 9 1–155（155 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 1 1–155（155 aa）
链 2 1–155（155 aa）
链 3 1–155（155 aa）
链 4 1–155（155 aa）
链 5 1–155（155 aa）
链 6 1–155（155 aa）
链 7 1–155（155 aa）
链 8 1–155（155 aa）
链 9 1–155（155 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9DET Human V-ATPase Vo subcomplex (containing subunit isoform a4) bound to nanobody and inhibitor 提交 2024-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：17-meric
链 c 1–155（155 aa）
链 g 1–155（155 aa）
链 h 1–155（155 aa）
链 i 1–155（155 aa）
链 j 1–155（155 aa）
链 k 1–155（155 aa）
链 l 1–155（155 aa）
链 m 1–155（155 aa）
链 n 1–155（155 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 A1A4Q Cladoniamide A × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；20 mM Tris, 150 mM NaCl, 0.5 mM EDTA, 2 mM DTT, pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATL_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 2； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 3； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 4； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 5； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 6； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 7； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 8； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155 作者链 9； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

V-type proton ATPase catalytic subunit A

物种未注明

UniProt P38606

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–617 链 B； UniProt 1–617 链 C； UniProt 1–617 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLZ The V1 region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–617（617 aa）
链 B 1–617（617 aa）
链 C 1–617（617 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 A 1–617（617 aa）
链 B 1–617（617 aa）
链 C 1–617（617 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 A 1–617（617 aa）
链 B 1–617（617 aa）
链 C 1–617（617 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 A 1–617（617 aa）
链 B 1–617（617 aa）
链 C 1–617（617 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 A 1–617（617 aa）
链 B 1–617（617 aa）
链 C 1–617（617 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 L 1–617（617 aa）
链 M 1–617（617 aa）
链 N 1–617（617 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 A 1–617（617 aa）
链 B 1–617（617 aa）
链 C 1–617（617 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617 作者链 B； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617 作者链 C； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617

V-type proton ATPase subunit B, brain isoform

物种未注明

UniProt P21281

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–511 链 E； UniProt 1–511 链 F； UniProt 1–511 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLZ The V1 region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–511（511 aa）
链 E 1–511（511 aa）
链 F 1–511（511 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 D 1–511（511 aa）
链 E 1–511（511 aa）
链 F 1–511（511 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 D 1–511（511 aa）
链 E 1–511（511 aa）
链 F 1–511（511 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 D 1–511（511 aa）
链 E 1–511（511 aa）
链 F 1–511（511 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 D 1–511（511 aa）
链 E 1–511（511 aa）
链 F 1–511（511 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 O 1–511（511 aa）
链 P 1–511（511 aa）
链 Q 1–511（511 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 D 1–511（511 aa）
链 E 1–511（511 aa）
链 F 1–511（511 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–511； UniProt 1–511 作者链 E； PDB构建体 1–511； UniProt 1–511 作者链 F； PDB构建体 1–511； UniProt 1–511

V-type proton ATPase subunit D

物种未注明

UniProt Q9Y5K8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–247 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLZ The V1 region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–247（247 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 G 1–247（247 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 G 1–247（247 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 G 1–247（247 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 G 1–247（247 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 D 1–247（247 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 G 1–247（247 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATD_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–247； UniProt 1–247

V-type proton ATPase subunit E 1

物种未注明

UniProt P36543

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 1–226 链 I； UniProt 1–226 链 J； UniProt 1–226 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLZ The V1 region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–226（226 aa）
链 I 1–226（226 aa）
链 J 1–226（226 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 H 1–226（226 aa）
链 I 1–226（226 aa）
链 J 1–226（226 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 H 1–226（226 aa）
链 I 1–226（226 aa）
链 J 1–226（226 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 H 1–226（226 aa）
链 I 1–226（226 aa）
链 J 1–226（226 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 H 1–226（226 aa）
链 I 1–226（226 aa）
链 J 1–226（226 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 b 1–226（226 aa）
链 c 1–226（226 aa）
链 d 1–226（226 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 H 1–226（226 aa）
链 I 1–226（226 aa）
链 J 1–226（226 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATE1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226 作者链 I； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226 作者链 J； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226

V-type proton ATPase subunit G 1

物种未注明

UniProt O75348

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 K； UniProt 1–118 链 L； UniProt 1–118 链 M； UniProt 1–118 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLZ The V1 region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–118（118 aa）
链 L 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 K 1–118（118 aa）
链 L 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 K 1–118（118 aa）
链 L 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 K 1–118（118 aa）
链 L 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 K 1–118（118 aa）
链 L 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 e 1–118（118 aa）
链 f 1–118（118 aa）
链 g 1–118（118 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 K 1–118（118 aa）
链 L 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATG1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118 作者链 L； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118 作者链 M； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

V-type proton ATPase subunit F

物种未注明

UniProt Q16864

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 N； UniProt 1–119 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLZ The V1 region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–119（119 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 N 1–119（119 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 N 1–119（119 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 N 1–119（119 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 N 1–119（119 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 F 1–119（119 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 N 1–119（119 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATF_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–119； UniProt 1–119

V-type proton ATPase subunit d 1

物种未注明

UniProt P61421

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 Q； UniProt 1–351 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLW The Vo region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 Q 1–351（351 aa）
未记录 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 Q 1–351（351 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 Q 1–351（351 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 Q 1–351（351 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–351（351 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 k 1–351（351 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–351（351 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9DET Human V-ATPase Vo subcomplex (containing subunit isoform a4) bound to nanobody and inhibitor 提交 2024-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：17-meric
链 d 1–351（351 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 A1A4Q Cladoniamide A × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；20 mM Tris, 150 mM NaCl, 0.5 mM EDTA, 2 mM DTT, pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VA0D1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351

V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1

物种未注明

UniProt Q93050

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 R； UniProt 1–837 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLW The Vo region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 R 1–837（837 aa）
未记录 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 R 1–837（837 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 R 1–837（837 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 R 1–837（837 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 R 1–837（837 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 R 1–837（837 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VPP1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 1–837； UniProt 1–837

V-type proton ATPase subunit e 1

物种未注明

UniProt O15342

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 S； UniProt 1–81 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLW The Vo region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 S 1–81（81 aa）
未记录 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 S 1–81（81 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 S 1–81（81 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 S 1–81（81 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 S 1–81（81 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 m 1–81（81 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 S 1–81（81 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9DET Human V-ATPase Vo subcomplex (containing subunit isoform a4) bound to nanobody and inhibitor 提交 2024-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：17-meric
链 e 1–81（81 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 A1A4Q Cladoniamide A × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；20 mM Tris, 150 mM NaCl, 0.5 mM EDTA, 2 mM DTT, pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VA0E1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 S； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Ribonuclease kappa

物种未注明

UniProt Q6P5S7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 T； UniProt 1–137 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLW The Vo region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 T 1–137（137 aa）
未记录 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 T 1–137（137 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 T 1–137（137 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 T 1–137（137 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 T 1–137（137 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 n 1–137（137 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 T 1–137（137 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9DET Human V-ATPase Vo subcomplex (containing subunit isoform a4) bound to nanobody and inhibitor 提交 2024-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：17-meric
链 f 1–137（137 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 A1A4Q Cladoniamide A × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；20 mM Tris, 150 mM NaCl, 0.5 mM EDTA, 2 mM DTT, pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RNK_HUMAN
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 T； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137

V-type proton ATPase subunit S1

物种未注明

UniProt Q15904

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 U； UniProt 1–470 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） Renin receptor × 1 （O75787） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6WLW The Vo region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–470（470 aa）
未记录 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 U 1–470（470 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 U 1–470（470 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 U 1–470（470 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 U 1–470（470 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7UNF CryoEM structure of a mEAK7 bound human V-ATPase complex 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 s 1–470（470 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 U 1–470（470 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9DET Human V-ATPase Vo subcomplex (containing subunit isoform a4) bound to nanobody and inhibitor 提交 2024-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：17-meric
链 o 1–470（470 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 A1A4Q Cladoniamide A × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；20 mM Tris, 150 mM NaCl, 0.5 mM EDTA, 2 mM DTT, pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VAS1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–470； UniProt 1–470

Renin receptor

物种未注明

UniProt O75787

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白拷贝数一致 链 V； UniProt 1–350 未记录 V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 （Q99437） V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 （P27449） V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P38606） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P21281） V-type proton ATPase subunit D × 1 （Q9Y5K8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P36543） V-type proton ATPase subunit G 1 × 3 （O75348） V-type proton ATPase subunit F × 1 （Q16864） V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 （P61421） V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1 × 1 （Q93050） V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 （O15342） Ribonuclease kappa × 1 （Q6P5S7） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （Q15904） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.47 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CFC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3LBS Crystal structure of the cytoplasmic tail of (pro)renin receptor as a MBP fusion (Maltose-bound form) 提交 2010-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 332–349（18 aa） 片段：Maltose-binding periplasmic protein, residues 29-390, Renin receptor, residues 332-350
链 B 332–349（18 aa） 片段：Maltose-binding periplasmic protein, residues 29-390, Renin receptor, residues 332-350
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；28% PEG4000, 0.2M Magnesium Chloride, 0.1 M Cacodylate, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.278
3LC8 Crystal structure of the cytoplasmic tail of (pro)renin receptor as a MBP fusion (Maltose-free form) 提交 2010-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 332–349（18 aa） 片段：Maltose-binding periplasmic protein, residues 29-390, Renin receptor, residues 332-350
链 B 332–349（18 aa） 片段：Maltose-binding periplasmic protein, residues 29-390, Renin receptor, residues 332-350
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 GOL GLYCEROL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；293 K；20% PEG 4000, 0.2M Magnesium Chloride, 0.1M Tris, pH 8.5, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.257
6WLW The Vo region of human V-ATPase in state 1 (focused refinement) 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 V 1–350（350 aa）
未记录 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6WM2 Human V-ATPase in state 1 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 V 1–350（350 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 4 PSF 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 13 WSS tri(methyl)-[2-[[(2~{R})-2-[(~{Z})-octadec-9-enoyl]oxy-3-[(~{E})-1-oxidanylideneoctadec-9-enoxy]propoxy]-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl]azanium × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WJS (2~{S})-2-$l^{4}-azanyl-3-[[(2~{R})-3-octadecanoyloxy-2-oxidanyl-propoxy]-oxidanyl-oxidanylidene-$l^{6}-phosphanyl]oxy-propanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6WM3 Human V-ATPase in state 2 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 V 1–350（350 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6WM4 Human V-ATPase in state 3 with SidK and ADP 提交 2020-04-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 V 1–350（350 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7U4T Human V-ATPase in state 2 with SidK and mEAK-7 提交 2022-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 V 1–350（350 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9CF8 Cryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 1 提交 2024-06-27 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 V 1–350（350 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9DET Human V-ATPase Vo subcomplex (containing subunit isoform a4) bound to nanobody and inhibitor 提交 2024-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：17-meric
链 p 1–350（350 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 A1A4Q Cladoniamide A × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；20 mM Tris, 150 mM NaCl, 0.5 mM EDTA, 2 mM DTT, pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RENR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–350； UniProt 1–350

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9cfc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9cfc
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9cfc
沉积日期 deposition_date2024-06-27
结构标题 titleCryo-EM structure of human kidney V-ATPase state 2
关键词 keywordshuman, kidney, V-ATPase, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier81.84 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron83.16 Å
零角强度 I(0) i08100380000.00
分子量 molecular_weight795520.0 kDa
排除体积 excluded_volume1007800 ų
包络体积 envelope_volume1504100 ų
水化壳体积 shell_volume154210 ų
包络直径 envelope_diameter279.3 Å
壳层 Rg shell_rg76.81 Å
包络 Rg envelope_rg80.13 Å
形状 Rg shape_rg83.20 Å
总 Rg total_rg82.93 Å
总原子数 total_atoms55935
残基数 n_residues7222
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax230.9 Å
Rg (实空间) rg_real80.01 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.97 Å
I(0) (实空间) i0_real7.8490e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.6260e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal79.13 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal8038000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6330
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary60.8 Å
偏度 Skewness skewness0.384
峰度 Kurtosis kurtosis-0.846
角度范围 angular_range— – 0.0950 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha1.4730
最高正则化参数 α highest_alpha1849000000.0000
实空间数据点数 n_real_points20
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.833; Stabil: 0.977; Sysdev: 0.008; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)