Outer capsid protein lambda-2
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 | 链 J； UniProt 1–1289 | 未记录 | Outer capsid protein mu-1N × 6 （P11078） Outer capsid protein sigma-3 × 3 （P03527） | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4；Phosphate-buffered saline cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.70 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9CYT | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EJ6 Reovirus core 提交 2000-02-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：complete icosahedral assembly |
链 A
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 60 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；sodium chloride, sodium acetate, magnesium chloride, hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.208 |
| 1EJ6 Reovirus core 提交 2000-02-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；sodium chloride, sodium acetate, magnesium chloride, hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.208 |
| 1EJ6 Reovirus core 提交 2000-02-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric |
链 A
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；sodium chloride, sodium acetate, magnesium chloride, hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.208 |
| 1EJ6 Reovirus core 提交 2000-02-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric |
链 A
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；sodium chloride, sodium acetate, magnesium chloride, hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.208 |
| 1EJ6 Reovirus core 提交 2000-02-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；sodium chloride, sodium acetate, magnesium chloride, hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.208 |
| 1EJ6 Reovirus core 提交 2000-02-29 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric |
链 A
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；sodium chloride, sodium acetate, magnesium chloride, hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.208 |
| 2CSE Features of Reovirus Outer-Capsid Protein mu1 Revealed by Electron and Image Reconstruction of the virion at 7.0-A Resolution 提交 2005-05-21 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 1620 PDB 声明：1620-MERIC |
链 U
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
10 mM TRIS；pH 7.5；10 mM TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 2CSE Features of Reovirus Outer-Capsid Protein mu1 Revealed by Electron and Image Reconstruction of the virion at 7.0-A Resolution 提交 2005-05-21 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 U
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
10 mM TRIS；pH 7.5；10 mM TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 2CSE Features of Reovirus Outer-Capsid Protein mu1 Revealed by Electron and Image Reconstruction of the virion at 7.0-A Resolution 提交 2005-05-21 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 135 PDB 声明：135-meric |
链 U
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
10 mM TRIS；pH 7.5；10 mM TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 2CSE Features of Reovirus Outer-Capsid Protein mu1 Revealed by Electron and Image Reconstruction of the virion at 7.0-A Resolution 提交 2005-05-21 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 162 PDB 声明：162-meric |
链 U
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
10 mM TRIS；pH 7.5；10 mM TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 2CSE Features of Reovirus Outer-Capsid Protein mu1 Revealed by Electron and Image Reconstruction of the virion at 7.0-A Resolution 提交 2005-05-21 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 U
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
10 mM TRIS；pH 7.5；10 mM TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6ZTZ Assembly intermediates of orthoreovirus captured in the cell 提交 2020-07-20 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric |
链 O
2–1289（1288 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 6.50 Å |
| 9CYX Cryo-EM structure of MRV full core 提交 2024-08-02 | 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
2–1289（1288 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9CYY Cryo-EM structure of MRV virion 提交 2024-08-03 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric |
链 J
1–1289（1289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Phosphate-buffered saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | LMBD2_REOVD |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 J； PDB构建体 1–1289； UniProt 1–1289 |
