9det

Human V-ATPase Vo subcomplex (containing subunit isoform a4) bound to nanobody and inhibitor

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase subunit e 1

物种未注明

UniProt O15342

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 17 Ribonuclease kappa × 1 (Q6P5S7) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (Q15904) Renin receptor × 1 (O75787) V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 (Q99437) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P27449) V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 (P61421) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 4 × 1 (Q9HBG4) Anti V-ATPase Nanobody 2CAS66 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CHOLESTEROL × 1 (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 Cladoniamide A × 9 methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VA0E1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 e; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81

Ribonuclease kappa

物种未注明

UniProt Q6P5S7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 17 V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 (O15342) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (Q15904) Renin receptor × 1 (O75787) V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 (Q99437) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P27449) V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 (P61421) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 4 × 1 (Q9HBG4) Anti V-ATPase Nanobody 2CAS66 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CHOLESTEROL × 1 (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 Cladoniamide A × 9 methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RNK_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 f; PDB构建体 1–137; UniProt 1–137

V-type proton ATPase subunit S1

物种未注明

UniProt Q15904

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 17 V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 (O15342) Ribonuclease kappa × 1 (Q6P5S7) Renin receptor × 1 (O75787) V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 (Q99437) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P27449) V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 (P61421) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 4 × 1 (Q9HBG4) Anti V-ATPase Nanobody 2CAS66 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CHOLESTEROL × 1 (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 Cladoniamide A × 9 methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VAS1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 o; PDB构建体 1–470; UniProt 1–470

Renin receptor

物种未注明

UniProt O75787

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 17 V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 (O15342) Ribonuclease kappa × 1 (Q6P5S7) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (Q15904) V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 (Q99437) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P27449) V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 (P61421) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 4 × 1 (Q9HBG4) Anti V-ATPase Nanobody 2CAS66 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CHOLESTEROL × 1 (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 Cladoniamide A × 9 methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RENR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 p; PDB构建体 1–350; UniProt 1–350

V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit

物种未注明

UniProt Q99437

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 17 V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 (O15342) Ribonuclease kappa × 1 (Q6P5S7) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (Q15904) Renin receptor × 1 (O75787) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P27449) V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 (P61421) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 4 × 1 (Q9HBG4) Anti V-ATPase Nanobody 2CAS66 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CHOLESTEROL × 1 (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 Cladoniamide A × 9 methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATO_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 b; PDB构建体 1–205; UniProt 1–205

V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit

物种未注明

UniProt P27449

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 17 V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 (O15342) Ribonuclease kappa × 1 (Q6P5S7) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (Q15904) Renin receptor × 1 (O75787) V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 (Q99437) V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 (P61421) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 4 × 1 (Q9HBG4) Anti V-ATPase Nanobody 2CAS66 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CHOLESTEROL × 1 (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 Cladoniamide A × 9 methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATL_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 g; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 h; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 i; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 j; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 k; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 l; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 m; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155 作者链 n; PDB构建体 1–155; UniProt 1–155

V-type proton ATPase subunit d 1

物种未注明

UniProt P61421

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 17 V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 (O15342) Ribonuclease kappa × 1 (Q6P5S7) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (Q15904) Renin receptor × 1 (O75787) V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 (Q99437) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P27449) V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 4 × 1 (Q9HBG4) Anti V-ATPase Nanobody 2CAS66 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CHOLESTEROL × 1 (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 Cladoniamide A × 9 methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VA0D1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351

V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 4

Homo sapiens

UniProt Q9HBG4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 17 V-type proton ATPase subunit e 1 × 1 (O15342) Ribonuclease kappa × 1 (Q6P5S7) V-type proton ATPase subunit S1 × 1 (Q15904) Renin receptor × 1 (O75787) V-type proton ATPase 21 kDa proteolipid subunit × 1 (Q99437) V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit × 9 (P27449) V-type proton ATPase subunit d 1 × 1 (P61421) Anti V-ATPase Nanobody 2CAS66 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CHOLESTEROL × 1 (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 3 Cladoniamide A × 9 methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VPP4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–840; UniProt 1–840

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9det
沉积日期 deposition_date2024-08-29
结构标题 titleHuman V-ATPase Vo subcomplex (containing subunit isoform a4) bound to nanobody and inhibitor
关键词 keywordsV-ATPase, lipid nanodisc, Vo subcomplex, inhibitor, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9det__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9det__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9det__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)47.58 Å
Rg(电子密度)46.51 Å
总 Rg46.78 Å
原子数50652
残基数3209
排除体积456410 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9det__assembly_1__model_1 17-meric (17) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

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7. 引用文献 (1)