9dw9

Phosphorylated (E1371Q)CFTR in complex with PKA-C

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 135.1 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator

Homo sapiens

UniProt P13569

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–1480 突变:E1371Q 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha × 1 (P00517) CLR CHOLESTEROL × 1 D10 DECANE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CL CHLORIDE ION × 4 UND UNDECANE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 52 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CFTR_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1480; UniProt 1–1480

cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha

Bos taurus

UniProt P00517

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 1–351 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator × 1 (P13569) CLR CHOLESTEROL × 1 D10 DECANE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 CL CHLORIDE ION × 4 UND UNDECANE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 97 个其他 PDB 条目、111 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KAPCA_BOVIN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9dw9

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9dw9
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9dw9
沉积日期 deposition_date2024-10-08
结构标题 titlePhosphorylated (E1371Q)CFTR in complex with PKA-C
关键词 keywordsCFTR, PKA, complex, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier40.89
回转半径 Rg (电子) rg_electron41.18
零角强度 I(0) i0402066000.00
分子量 molecular_weight175080.0 kDa
排除体积 excluded_volume223930 ų
包络体积 envelope_volume296080 ų
水化壳体积 shell_volume60916 ų
包络直径 envelope_diameter139.4
壳层 Rg shell_rg45.30
包络 Rg envelope_rg41.11
形状 Rg shape_rg41.16
总 Rg total_rg41.47
总原子数 total_atoms12329
残基数 n_residues1509
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax135.1
Rg (实空间) rg_real40.92
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.11
I(0) (实空间) i0_real4.0210e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.4510e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal40.89
I(0) (倒空间) i0_reciprocal402100000.0000
解质量估计 total_estimate0.8859
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary41.6
偏度 Skewness skewness0.317
峰度 Kurtosis kurtosis-0.560
角度范围 angular_range— – 0.1950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha128000000.0000
实空间数据点数 n_real_points40
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.894; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.958; Smooth: 0.873

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)