9h4q

Cryo-EM structure of the SEAC wing - EGOC

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 187.4 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maintenance of telomere capping protein 5

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–1148	未记录	GTP-binding protein GTR1 × 1 （Q00582） GTP-binding protein GTR2 × 1 （P53290） Nitrogen permease regulator 2 × 1 （P39923） Nitrogen permease regulator 3 × 1 （P38742） Vacuolar membrane-associated protein IML1 × 1 （P47170） Protein MEH1 × 1 （Q02205） Protein EGO2 × 1 （Q3E830） Protein SLM4 × 1 （P38247） MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9H4Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8ADL Cryo-EM structure of the SEA complex 提交 2022-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 C 1–1148（1148 aa）链 Q 1–1148（1148 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
8AE6 Cryo-EM structure of the SEA complex wing (SEACIT) 提交 2022-07-12	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 1–1148（1148 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 C 1–1148（1148 aa）链 K 1–1148（1148 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	WDR59_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–1148； UniProt 1–1148

GTP-binding protein GTR1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q00582

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 a； UniProt 1–310	未记录	Maintenance of telomere capping protein 5 × 1 （Q03897） GTP-binding protein GTR2 × 1 （P53290） Nitrogen permease regulator 2 × 1 （P39923） Nitrogen permease regulator 3 × 1 （P38742） Vacuolar membrane-associated protein IML1 × 1 （P47170） Protein MEH1 × 1 （Q02205） Protein EGO2 × 1 （Q3E830） Protein SLM4 × 1 （P38247） MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9H4Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3R7W Crystal Structure of Gtr1p-Gtr2p complex 提交 2011-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 8–310（303 aa）片段：residues 8-310	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1M HEPES, 10% PEG monomethyl ether 5000, 5%(v/v) Tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.77 Å R-free 0.283
3R7W Crystal Structure of Gtr1p-Gtr2p complex 提交 2011-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 8–310（303 aa）片段：residues 8-310	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1M HEPES, 10% PEG monomethyl ether 5000, 5%(v/v) Tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.77 Å R-free 0.283
4ARZ The crystal structure of Gtr1p-Gtr2p complexed with GTP-GDP 提交 2012-04-27	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–310（310 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.272
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–310（310 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 1–310（310 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 a 1–310（310 aa）链 b 1–310（310 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 4 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RAGAB_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–310； UniProt 1–310

GTP-binding protein GTR2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53290

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 c； UniProt 1–341	未记录	Maintenance of telomere capping protein 5 × 1 （Q03897） GTP-binding protein GTR1 × 1 （Q00582） Nitrogen permease regulator 2 × 1 （P39923） Nitrogen permease regulator 3 × 1 （P38742） Vacuolar membrane-associated protein IML1 × 1 （P47170） Protein MEH1 × 1 （Q02205） Protein EGO2 × 1 （Q3E830） Protein SLM4 × 1 （P38247） MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9H4Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3R7W Crystal Structure of Gtr1p-Gtr2p complex 提交 2011-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 11–341（331 aa）片段：residues 11-341	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1M HEPES, 10% PEG monomethyl ether 5000, 5%(v/v) Tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.77 Å R-free 0.283
3R7W Crystal Structure of Gtr1p-Gtr2p complex 提交 2011-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 11–341（331 aa）片段：residues 11-341	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1M HEPES, 10% PEG monomethyl ether 5000, 5%(v/v) Tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.77 Å R-free 0.283
4ARZ The crystal structure of Gtr1p-Gtr2p complexed with GTP-GDP 提交 2012-04-27	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–341（341 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.272
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–341（341 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 1–341（341 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 c 1–341（341 aa）链 d 1–341（341 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 4 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RAGCD_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341

Nitrogen permease regulator 2

物种未注明

UniProt P39923

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 T； UniProt 1–615	未记录	Maintenance of telomere capping protein 5 × 1 （Q03897） GTP-binding protein GTR1 × 1 （Q00582） GTP-binding protein GTR2 × 1 （P53290） Nitrogen permease regulator 3 × 1 （P38742） Vacuolar membrane-associated protein IML1 × 1 （P47170） Protein MEH1 × 1 （Q02205） Protein EGO2 × 1 （Q3E830） Protein SLM4 × 1 （P38247） MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9H4Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8ADL Cryo-EM structure of the SEA complex 提交 2022-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 S 1–615（615 aa）链 T 1–615（615 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
8AE6 Cryo-EM structure of the SEA complex wing (SEACIT) 提交 2022-07-12	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 S 1–615（615 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 T 1–615（615 aa）链 g 1–615（615 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NPR2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–615； UniProt 1–615

Nitrogen permease regulator 3

物种未注明

UniProt P38742

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 h； UniProt 1–1146	未记录	Maintenance of telomere capping protein 5 × 1 （Q03897） GTP-binding protein GTR1 × 1 （Q00582） GTP-binding protein GTR2 × 1 （P53290） Nitrogen permease regulator 2 × 1 （P39923） Vacuolar membrane-associated protein IML1 × 1 （P47170） Protein MEH1 × 1 （Q02205） Protein EGO2 × 1 （Q3E830） Protein SLM4 × 1 （P38247） MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9H4Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8ADL Cryo-EM structure of the SEA complex 提交 2022-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 U 1–1146（1146 aa）链 V 1–1146（1146 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
8AE6 Cryo-EM structure of the SEA complex wing (SEACIT) 提交 2022-07-12	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 U 1–1146（1146 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 h 1–1146（1146 aa）链 i 1–1146（1146 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NPR3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 h； PDB构建体 1–1146； UniProt 1–1146

Vacuolar membrane-associated protein IML1

物种未注明

UniProt P47170

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 X； UniProt 1–1584	未记录	Maintenance of telomere capping protein 5 × 1 （Q03897） GTP-binding protein GTR1 × 1 （Q00582） GTP-binding protein GTR2 × 1 （P53290） Nitrogen permease regulator 2 × 1 （P39923） Nitrogen permease regulator 3 × 1 （P38742） Protein MEH1 × 1 （Q02205） Protein EGO2 × 1 （Q3E830） Protein SLM4 × 1 （P38247） MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9H4Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8ADL Cryo-EM structure of the SEA complex 提交 2022-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 W 1–1584（1584 aa）链 X 1–1584（1584 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
8AE6 Cryo-EM structure of the SEA complex wing (SEACIT) 提交 2022-07-12	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 W 1–1584（1584 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 X 1–1584（1584 aa）链 j 1–1584（1584 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IML1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–1584； UniProt 1–1584

Protein MEH1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q02205

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 R； UniProt 1–184	未记录	Maintenance of telomere capping protein 5 × 1 （Q03897） GTP-binding protein GTR1 × 1 （Q00582） GTP-binding protein GTR2 × 1 （P53290） Nitrogen permease regulator 2 × 1 （P39923） Nitrogen permease regulator 3 × 1 （P38742） Vacuolar membrane-associated protein IML1 × 1 （P47170） Protein EGO2 × 1 （Q3E830） Protein SLM4 × 1 （P38247） MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9H4Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4XPM Crystal structure of EGO-TC 提交 2015-01-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 146–184（39 aa）片段：UNP RESIDUES 146-184	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.2M NaCl, 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 25% PEG 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.217
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 33–184（152 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 33–184（152 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 R 1–184（184 aa）链 S 1–184（184 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MEH1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–184； UniProt 1–184

Protein EGO2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q3E830

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 U； UniProt 1–75	未记录	Maintenance of telomere capping protein 5 × 1 （Q03897） GTP-binding protein GTR1 × 1 （Q00582） GTP-binding protein GTR2 × 1 （P53290） Nitrogen permease regulator 2 × 1 （P39923） Nitrogen permease regulator 3 × 1 （P38742） Vacuolar membrane-associated protein IML1 × 1 （P47170） Protein MEH1 × 1 （Q02205） Protein SLM4 × 1 （P38247） MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9H4Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4XPM Crystal structure of EGO-TC 提交 2015-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–75（75 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.2M NaCl, 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 25% PEG 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.217
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–75（75 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 1–75（75 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 U 1–75（75 aa）链 W 1–75（75 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EGO2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75

Protein SLM4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38247

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9）与蛋白拷贝数一致	链 Y； UniProt 1–162	未记录	Maintenance of telomere capping protein 5 × 1 （Q03897） GTP-binding protein GTR1 × 1 （Q00582） GTP-binding protein GTR2 × 1 （P53290） Nitrogen permease regulator 2 × 1 （P39923） Nitrogen permease regulator 3 × 1 （P38742） Vacuolar membrane-associated protein IML1 × 1 （P47170） Protein MEH1 × 1 （Q02205） Protein EGO2 × 1 （Q3E830） MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9H4Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3LGO Structure of Gse1p, member of the GSE/EGO complex 提交 2010-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–162（162 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3；293 K；100 mM sodium citrate buffer, pH 2.0, 500-800 mM ammonium sulfate, 200 mM lithium sulfate, 200-350 mM L-arginine-HCl, pH 5.75, 5% DMSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.85 Å R-free 0.351
3LGO Structure of Gse1p, member of the GSE/EGO complex 提交 2010-01-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–162（162 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3；293 K；100 mM sodium citrate buffer, pH 2.0, 500-800 mM ammonium sulfate, 200 mM lithium sulfate, 200-350 mM L-arginine-HCl, pH 5.75, 5% DMSO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.85 Å R-free 0.351
4FTX Crystal structure of Ego3 homodimer 提交 2012-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–162（162 aa）链 B 1–162（162 aa）	未记录	SIN SUCCINIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；35% tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.221
4FUW Crystal structure of Ego3 mutant 提交 2012-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–162（162 aa）链 B 1–162（162 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M ammonium sulfate, 0.1M MES monohydrate, 10% 1,4-dioxane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.253
4XPM Crystal structure of EGO-TC 提交 2015-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–162（162 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.2M NaCl, 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 25% PEG 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.217
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–162（162 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
6JWP crystal structure of EGOC 提交 2019-04-21	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–162（162 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES (pH 7.5), 200mM NaCl, and 12%(w/v) PEG 8000	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric	链 Y 1–162（162 aa）链 Z 1–162（162 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 6 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SLM4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9h4q
沉积日期 deposition_date	2024-10-21
结构标题 title	Cryo-EM structure of the SEAC wing - EGOC
关键词 keywords	GTPase activating protein, GTPase, nutrient-sensing, amino acid signaling, cell growth, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	54.67 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	54.32 Å
零角强度 I(0) i0	2049710000.00
分子量 molecular_weight	390190.0 kDa
排除体积 excluded_volume	492700 Å³
包络体积 envelope_volume	731560 Å³
水化壳体积 shell_volume	111160 Å³
包络直径 envelope_diameter	200.9 Å
壳层 Rg shell_rg	58.50 Å
包络 Rg envelope_rg	53.87 Å
形状 Rg shape_rg	54.32 Å
总 Rg total_rg	54.45 Å
总原子数 total_atoms	27485
残基数 n_residues	3362
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	187.4 Å
Rg (实空间) rg_real	54.69 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.30 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.0500e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.4730e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	54.64 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2050000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6370
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	64.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.393
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.167
角度范围 angular_range	— – 0.1450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0003
最高正则化参数 α highest_alpha	155900000.0000
实空间数据点数 n_real_points	30
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.806; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.017; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.812

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Maintenance of telomere capping protein 5
分子量 formula_weight	131104.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	27485

MCSSINEGPYNSPTFGKSLSLKVDGGFNAVSINPSGRDIVLASRQGLYIIDLDDPFTPPRWLHHITPWQVADVQWSPHPAKPYWIVSTSNQKAIIWNLAKSSSNAIEFVLHGHSRAITDINFNPQHPDVLATCSVDTYVHAWDMRSPHRPFYSTSSWRSAASQVKWNYKDPNVLASSHGNDIFVWDLRKGSTPLCSLKGHVSSVNSIDFNRFKYSEIMSSSNDGTVKFWDYSKSTTESKRTVTTNFPIWRGRYLPFGEGYCIMPMVGGNNAVYLINLCDDDDSEQNKKTKLQPIYAFKGHSDRVIDFLWRSRHTCDGDYDDREFQLVTWSKDCDLKLWPISDSIYGKVNFDRGKRLEEKLPDYDYCSYNKEPENRENVQKNEFRRLRENFVTTSGLKKNKTNHITWLSGIRMNSATSQEDLFNETKIQNLGEEVSAIGHKFPKVVFEKISVSTRELCLTLNGPWSEENPDDYIFLRISINFPLNYPNKGDPPKFTIEENSNLTMSKRQEILSNLATIGQKYTDSNLYCLEPCIRFVLGEKVSLEDIEEGQEPLLNFDIADHIDFEELSSLDSSYSDSQNPENLSSQSDIESYKEALVFPDTSNQGLDFGRNLALDTTPVPNGCGSCWTATGELFCFFANEKKPEKKQNAIIKLSQKEAGVEKHPFKIEPQVLYDKEVDSSVITAADELKARPKRYVDTLGLGGGTNGDSRTYFDDETSSDDSFDSVADDWDDILRNDIIVRTKIPILRGNFKAFSSVHSESGKTVESTKKNKNLVISKNFSSLLSDRKELALEYLFMDATPEGFARNNALVAEKFDLDEISHCWQILSDMLIDQSDYDPYTTIWNNHPMGIKWFIKEAIVYFERQQNLQMLAMLCCVILSARRKKIPARYYGQELENMEGTIVFNDNESQNTSFWKGSDAFSTRSRSSTVTPNFYGNHLRGKNIHGGDNSSIRSDDHHARLRTHNTLNGSSKFTEPAQKQGSRAISSSPFHSRMPDIKVELLHDDIIEAYEQEDLLHLEVSDIPKFQTYIYQYSKLLFRWGLPLERVKILKVSTDFRSSYSSQGIPPNNNKKSPYNGVLTHWIENNEFGEEKFLARNCNYCDLRVTRSSFICGNCQHVLHSSCARIWWEIGDECPSGCGCNCPEMFDA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	GTP-binding protein GTR1
分子量 formula_weight	35892.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.5.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MSSNNRKKLLLMGRSGSGKSSMRSIIFSNYSAFDTRRLGATIDVEHSHLRFLGNMTLNLWDCGGQDVFMENYFTKQKDHIFQMVQVLIHVFDVESTEVLKDIEIFAKALKQLRKYSPDAKIFVLLHKMDLVQLDKREELFQIMMKNLSETSSEFGFPNLIGFPTSIWDESLYKAWSQIVCSLIPNMSNHQSNLKKFKEIMNALEIILFERTTFLVICSSNGENSNENHDSSDNNNVLLDPKRFEKISNIMKNFKQSCTKLKSGFKTLILNNNIYVSELSSNMVCFIVLKDMNIPQELVLENIKKAKEFFQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	GTP-binding protein GTR2
分子量 formula_weight	38634.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.5.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MSLEATDSKAMVLLMGVRRCGKSSICKVVFHNMQPLDTLYLESTSNPSLEHFSTLIDLAVMELPGQLNYFEPSYDSERLFKSVGALVYVIDSQDEYINAITNLAMIIEYAYKVNPSINIEVLIHKVDGLSEDFKVDAQRDIMQRTGEELLELGLDGVQVSFYLTSIFDHSIYEAFSRIVQKLIPELSFLENMLDNLIQHSKIEKAFLFDVNSKIYVSTDSNPVDIQMYEVCSEFIDVTIDLFDLYKAPVLRNSQKSSDKDNVINPRNELQNVSQLANGVIIYLRQMIRGLALVAIIRPNGTDMESCLTVADYNIDIFKKGLEDIWANARASQAKNSIEDDV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Nitrogen permease regulator 2
分子量 formula_weight	69937.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MLSYFQGFVPIHTIFYSVFHPTEGSKIKYEFPPNNLKNHGINFNTFKNYIIPKPILCHKLITFKYGTYRIVCYPVTINSPIYARNFFSFNFVFVFPYDCETSPYEPAITRLGKMFKVLEEQNQLLSKSERDPVFFDLKVLENSTTTPSTAGPSSTPNPSSNTTPTHPTSEKDTKDMRSSRYSDLIKDLGLPQSAFSIQDLLMRIFQDLNNYSECLIPIDEGNAVDIKIFPLLRPPTTCVSLEDVPLSSVNLKKIIDVNWDPTMMSIVPYIDGLNSIAKISKLSNSDPGLVIECIRHLIYYKCVTLSDIFQFSNIYAPSSLIRNFLTDPLMASDCQSYVTFPEVSKISNLPLNKSLGSGDQDSPSFSVRRKSKSSSIPSNPDSRTTSFSSTSRVSQNSSLNSSFSSIYKDWRQSQTSCSSSNIHVINNRNRFLPTRSCLFDLYRSLSQGQTLKTWYESKYMILKENNIDIRRFITFGLEKRIIYRCYSFPVMINAGSREPKEMTPIITKDLVNNDKLLEKRNHNHLLSATGSRNTAQSGNLKPERPSKVSFEMQRVSSLATGKSTMPKLSDEEEGILEESIRNAETFDKICVLLSKPKLEVESYLNELGEFKVINS

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Nitrogen permease regulator 3
分子量 formula_weight	130141.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h

MDECLPNSCLLGVHLVISTHSGPQIVYHYPPSNTAFLTNNPTKHQHLYGNHANLNKNTSTNKEEKLFNSGSTKTASQIALNESAKSYNTAITPSMTNTNTNNVTLPPTRSHANTVGSQSSIPAATNGVGYRKTDIEDTSRTFQYQETESETSSSGLSDSELSTDYLDISSDSFSISSSLSSSSLSSSPSSSSSSSPPQDGLSRTNSSFQSTDSMSPTSPQMIMENDSISVAESYLDSGTNNKSRAASKRSQNFFHKLSTKKSTDSKTHSPVRKLKSKPSQSTKKGNKLLKNTSNETDGNAFTGSCSISSKKSLSSTGEHNQELRNSSLNDTPGQSPHHYHHRYHHYHKNAATSQRNSHTQYDVEEEDMEVSAMLQDGKISMNEIFFEEENFQDINKILEFDNDFVAEFCSPEREMCNTRFEFTVDNFCFLGLPIHVDSQGRWRKSKHKNKTRSKRSSSTTTNISRKKSIASKISSLSENTLKKVNSGEADTVYDSNIGHEASTDTPNLRINTDVSGNEFEREKEDLGKNMNMFHVCFVMNPHLIEYNKRIDDMYQFVVTRLSLLLRYVQSKTSYISSECHIILKEKERVLKHSKTYQSIRGAGNKGKYLYQRILAKSSLARALTECVDKIQRNEIACLEINDDKVISLQIPIQNEFEKMPNFKLQPVLRGSYLTSILNMKFLEKSSLRIESQNRQNDQAQFSDTNNNIYRFGNNINSTGHCGAANVDDGDDNESNYYCDDNDDLLNYALLLLDEPNNIISSLETFSYQDDIGTIILKHLVRNIQPNIPLRSYRYLITDLLDNPSSLDDLTTETNSLESSILRSCALHLMYWRHARIVIPLSSKYTYIVSPLAPIQGYTIDDYKSTSQNDGNVKKMDDRENNKSGSDRVPLIYQNSMLFRSKFPSLPSLPIFLSLLSTDKPQAYSNIIPSREHKPVYLNALAWLIQYGYVTQLLTFINIRVDKHIKMAVDEDLEKEGFRKTNTARRPSMDYKKTDKKLDDEDGQSRDANASEACSGKNEGMQSNDNNKDVDEKDNENDSRVDDRDDNEIAIADEEEILHFEYDDPEMQHDYTIILEPERATAIEKRWLYRCIYGQPSDIQILFNKLLKYFNGKVPMELVIIKEEISRHDLKKLLNALDKYLIEIHHW

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Vacuolar membrane-associated protein IML1
分子量 formula_weight	182203.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MFAKLHGKKQRPISSINSQTPRTSNTTHANSISLSSGNLIVGSNRNLRQKKEQFGSQQRASGRKLISNKENDDNVNNGGDNNYDNGERVHRHHIPGLKIKAYQAELGYHESRFSENLVMLNLVEFPDIKPGDLVELKTYHKNPSASNGDKKIYFIAKDFDGETKRRAKTSNVSILSGQLQTLLDLPSRSRIWIKLKPNKFDLQADVVEFNIKDCLLNRGDMWVLSSKLVDTCVFMDQRLAFLDSIRGTIKGIYRNGKKIVSGYIGEQTRIIFRSESARLIFLIQITDEMWNFEETGEQLFQKMVNSFFPKIFKKWKDVDTHHTITIAFAISMDLSDTSFKDLTPGESLKNSQDYFRIVVDQVSIIHWVDIMETLREEFMEIRKDLLNKQTDKGYSVANGRFSPVIKSNFLELVNFATTILTDPFKQLDLRHTTTHVMIISPGSGLFDVDYSLLRLTGKKLLSLEMTMDLICLSKAPLHIVPLFRYRDFENKLHHCVPLWLSVFFWNDHDKKSNSEWTPRCKIYDLQMMGITENELIREVDVEYLQLNKKVKSLSEFMNDYDKNAFEVKILCAGSNTKQSKKLNSKFDTVFENDVVVKARKIPATATTTHGNTKFIWRGPKVALPAIKDIQKPNVIPDLSIKTIEASFYDDCNTTNDKISTPTTSNNDNLEMNDSLVSVRSADNQNTSLALDSLKGLSKRNSLKDFTQRVITKFISNIDTSKNKKIKSTLLRDDVDNSPLGSNTPLPSSESKISGLKLQQKGLADENVISKRGNLIIKKNLSIFGLPSNEIMSGSPSSYLGSSHTRTSSKLSNMSDKAAFITEGQKSKHDDSNTYSLTQQLKHRISETWVDIKSPSIPVSSEFANELLPIRWKDVWPKYVARKYSKWRSFTTPAELPITISDFPSKDDFDRNFIFRNHSVTLNTDQEQYNQTYKDLLRDMIYMRLLTGFQICVGRQVEKIELSRESGESETVVNKYLDFNQNDAFKLYLMIDSEIHRITCSSSGIIDVERYLRKDEANLFDQVPSYIPLVKTRYESSFRDAMIDPLHVKRESLNWNQIDQVLAGYGDNLIDRKWHGFRAKYVVLPTDIPPNTYSMVINGKSETLNPEEIRVEGLRRLIGSITRSRLRTEKEKKGRKTKREEIQPEVMFYTGPLYNFINEQQTSLESSAINFKDSIFVNDNNLLNRNVELSKLAYQIQRGEDRITLVNRKWHWKKHEKCFVGSEMVNWLIRNFSDIDTREDAIKYGQKVMKEGLFVHVLNKHNFLDGHYFYQFSPEYVMDTNKLEKTNSHRSTLSDPKQMLRKASTGSSNDPSAMTPFSSVVPAISASNASVADAKEPSRPILMLSNSLVIDVDPAGKSSKQESCTVHYDRVHNPDHCFHIRLEWLTTTPKLIDDLVGNWSRLCERYGLKMIEIPWEELCTIPSVNPFHSFVEIKLAINPWEDPEFKDRELFAKSKFYYHVYLLKASGFLLDNRASKFLQNQDIEFDIMYSWGKPQFKYVQYIHHTGAYVAELRENGCLFLAPNNIYISRVNPGNIIGKIHSASSSSLDAQKVILNFKSTCLDYQKLRSIFLDAKEMWITGKIVED

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Protein MEH1
分子量 formula_weight	20266.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MGAVLSCCRNHSGEENEALLREQQAGYGSQGNANDEYDAEQMRLKEHEHEQKLLAREQELRDIVANTNDKLIDISMINNSGIVIQGTDLQEALDKRQQEEGGDSREDERSAGDDNLSGHSVPSSGSAQATTHQTAPRTNTFTLLTSPDSAKISKEQLKKLHSNILNEIFSQSQVNKPGPLTVPF

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Protein EGO2
分子量 formula_weight	8104.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MEAEKQSDIKGTIAFDTHGNVIESTGVGSQRIEDIGDLSKVTLDAEGFAQVQGDSLLVHLYKRNDITLAVYTSAQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Protein SLM4
分子量 formula_weight	18371.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MVMLHSKNVKGFLENTLKPYDLHSVDFKTSSLQSSMIITATNGGILSYATSNNDVPKNSINEINSVNNLKMMSLLIKDKWSEDENDTEEQHSNSCYPVEIDSFKTKIYTYEMEDLHTCVAQIPNSDLLLLFIAEGSFPYGLLVIKIERAMRELTDLFGYKLG

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	ALUMINUM FLUORIDE
分子量 formula_weight	84.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▶

8. 引用文献 (1)

▶

分辨率 resolution	3.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	133077

fit	/app/data/saxs_computation/h4/9h4q/9h4q.fit
pddf	/app/data/pr_computation/h4/9h4q/9h4q.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/h4/9h4q/9h4q.dat

Cryo-EM structure of the SEAC wing - EGOC

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maintenance of telomere capping protein 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

GTP-binding protein GTR1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

GTP-binding protein GTR2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nitrogen permease regulator 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nitrogen permease regulator 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Vacuolar membrane-associated protein IML1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein MEH1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein EGO2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein SLM4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 non-polymer

实体 12 Entity 12 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)