9hd3

Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 27

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 75.8 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomeric repeat-binding factor 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 48–268	未记录	A1ITX 4-ethoxynaphthalene-1-sulfonic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.19 Å R-free 0.274

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9HD3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BA5 DNA-BINDING DOMAIN OF HUMAN TELOMERIC PROTEIN, HTRF1, NMR, 18 STRUCTURES 提交 1998-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 378–430（53 aa）片段：DNA-BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；300 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM PHOSPHATE POTASSIU；压力 1 NMR样品组成 H2O	分辨率未提供
1H6O Dimerisation domain from human TRF1 提交 2001-06-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 62–265（204 aa）片段：DIMERISATION DOMAIN RESIDUES 63-265	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；PH6, 5-15% GLYCEROL, 1-5 MM MAGNESIUM ACETATE, 1 % PEG 8000, pH 6.00	分辨率 2.90 Å R-free 0.303
1ITY Solution structure of the DNA binding domain of human TRF1 提交 2002-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 371–439（69 aa）片段：DNA binding domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；300 K；压力 ambient NMR样品组成 1.5-2.5mM TRF1 U-15N, 13C, 50mM phosphate buffer, 100mM NaCl \| 90% H2O, 10% D2O, 100% D2O	分辨率未提供
1IV6 Solution Structure of the DNA Complex of Human TRF1 提交 2002-03-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 371–439（69 aa）片段：DNA-binding domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；压力 ambient NMR样品组成 1.5-2.5mM TRF1-DNA complex; 5mM Phosphate buffer with 10mM NaCl \| 90% H2O, 10% D2O or 100% D2O	分辨率未提供
1W0T hTRF1 DNA-binding domain in complex with telomeric DNA. 提交 2004-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 379–431（53 aa）片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 379-431 链 B 379–431（53 aa）片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 379-431	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLISED IN 50 MM MES, PH 6.0, 0.1 M KCL, 2 MM MGCL2 AND 10 % PEG 400 AND CRYOPROTECTED IN 20 % GLYCEROL	分辨率 2.00 Å R-free 0.273
3BQO Crystal Structure of TRF1 TRFH domain and TIN2 peptide complex 提交 2007-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 58–268（211 aa）片段：TRFH domain, Dimerization domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；289 K；NaCl 2.5 M MgCl2 0.35 M Tris 0.1 M pH 8.6 DTT 5 mM , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
3BQO Crystal Structure of TRF1 TRFH domain and TIN2 peptide complex 提交 2007-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 58–268（211 aa）片段：TRFH domain, Dimerization domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；289 K；NaCl 2.5 M MgCl2 0.35 M Tris 0.1 M pH 8.6 DTT 5 mM , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
3L82 X-ray Crystal structure of TRF1 and Fbx4 complex 提交 2009-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 58–268（211 aa）片段：Dimerization domain residues 58-268	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；289 K；300 mM NH4H2PO4, 100 mM sodium citrate pH 6.2, 10% n-propanol and 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
3L82 X-ray Crystal structure of TRF1 and Fbx4 complex 提交 2009-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 58–268（211 aa）片段：Dimerization domain residues 58-268	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；289 K；300 mM NH4H2PO4, 100 mM sodium citrate pH 6.2, 10% n-propanol and 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
3L82 X-ray Crystal structure of TRF1 and Fbx4 complex 提交 2009-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 58–268（211 aa）片段：Dimerization domain residues 58-268	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.2；289 K；300 mM NH4H2PO4, 100 mM sodium citrate pH 6.2, 10% n-propanol and 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
5HKP Crystal structure of mouse Tankyrase/human TRF1 complex 提交 2016-01-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–55（55 aa）片段：UNP residues 1-55 链 D 1–55（55 aa）片段：UNP residues 1-55	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.035M Calcium Chloride dihydrate 0.07M MES monohydrate pH6.0 0.03M Tris pH8.5 31.5% v/v Polyethylene glycol 200 6% v/v Ethanol	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
5WIR Structure of the TRF1-TERB1 interface 提交 2017-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 62–265（204 aa）链 B 62–265（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；TRF1-TRFH and TERB1-TBM were mixed in a 1:5 molar ratio and crystal screens set up using 0.3 microliter protein solution and 0.3 microliter reservoir solution in a sitting drop format. Diffracting crystals were obtained in 0.1 M Tris-Cl (pH 8.5) and 30% PEG 300. Crystals were cryoprotected in the crystallization solution plus 10% PEG 400 and harvested in liquid nitrogen.	分辨率 2.10 Å R-free 0.210
5XUP Crystal structure of TRF1 and TERB1 提交 2017-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 65–266（202 aa）片段：TRFH domain (UNP RESIDUES 65-266) 链 B 65–266（202 aa）片段：TRFH domain (UNP RESIDUES 65-266)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；289 K；10% 2-propanol, 0.1M Tris-HCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.221
8F0A Client-bound structure of a DegP trimer within a 12mer cage 提交 2022-11-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.60 Å
8F0U Structure of a 12mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
8F0U Structure of a 12mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
8F0U Structure of a 12mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
8F1T Structure of an 18mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 12.10 Å
8F1T Structure of an 18mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 12.10 Å
8F1T Structure of an 18mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 12.10 Å
8F1U Structure of a 24mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 13.80 Å
8F1U Structure of a 24mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 13.80 Å
8F1U Structure of a 24mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 13.80 Å
8F21 Structure of a 30mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：90-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 14.10 Å
8F21 Structure of a 30mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 14.10 Å
8F21 Structure of a 30mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 b 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430 链 c 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 14.10 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 404–430（27 aa）片段：UNP residues 404-430	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 9.70 Å
8OX1 Structure of TRF1core in complex with telomeric nucleosome 提交 2023-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 L 1–439（439 aa）链 M 1–439（439 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s	分辨率 2.70 Å
8W8G Crystal structure of human TRF1 with PinX1 提交 2023-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 58–269（212 aa）链 B 58–269（212 aa）	未记录	HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；289 K；0.05 M HEPES, 4% PEG2000 MME, 3% 1.6-hexanediol and 0.04 M NaCl	分辨率 2.70 Å R-free 0.263
8W8G Crystal structure of human TRF1 with PinX1 提交 2023-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 58–269（212 aa）链 D 58–269（212 aa）	未记录	HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；289 K；0.05 M HEPES, 4% PEG2000 MME, 3% 1.6-hexanediol and 0.04 M NaCl	分辨率 2.70 Å R-free 0.263
9HCL Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 12 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	TWC 2-ethyl-5-(trifluoromethyl)-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.87 Å R-free 0.220
9HCM Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 45 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	LX7 1-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]thiourea × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.32 Å R-free 0.314
9HCN Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 46 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	UVA N-methyl-2-(methylsulfonyl)aniline × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.93 Å R-free 0.224
9HCP Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 15 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	LL0 2-(difluoromethoxy)benzene-1-sulfonamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.70 Å R-free 0.240
9HCQ Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 47 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 JHJ N-(4-methoxyphenyl)-N'-pyridin-4-ylurea × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.96 Å R-free 0.245
9HCR Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 48 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	W1P 5-methyl-2-phenyl-2,4-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.93 Å R-free 0.217
9HCS Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 49 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	JGA N-ethyl-N'-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)urea × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.20 Å R-free 0.242
9HCT Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 50 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	B0V 2-methoxy-~{N}-(2,4,6-trimethylphenyl)ethanamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 CA CALCIUM ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.70 Å R-free 0.240
9HCU Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 51 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	ZU7 N-(4-fluorophenyl)-2-(piperazin-1-yl)acetamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.07 Å R-free 0.260
9HCV Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 16 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1ITZ 5-cyclobutyl-3-pyridin-2-yl-1,2,4-oxadiazole × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.08 Å R-free 0.268
9HCW Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 52 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A1IT0 1-(methylsulfonylamino)cyclohexane-1-carboxylic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.08 Å R-free 0.255
9HCX Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 53 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	W0S 1-(3,4,5-trimethoxyphenyl)methanamine × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.69 Å R-free 0.247
9HCY Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 54 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A9E 2-(4-ethylphenoxy)-1-piperidin-1-yl-ethanone × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.93 Å R-free 0.223
9HCZ Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 6 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	TT3 2-(3-fluorophenoxy)-N,N-dimethylacetamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.55 Å R-free 0.214
9HD0 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 55 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A9E 2-(4-ethylphenoxy)-1-piperidin-1-yl-ethanone × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；SNAQVQVGAPEEEEEEEEDAGLVAEAEAVAAGWMLDFLCLSLCRAFRDGRSEDFRRTRNSAEAIIHGLSSLTACQLRTIYICQFLTRIAAGKTLDAQFENDERITPLESALMIWGSIEKEHDKLHEEIQNLIKIQAIAVCMENGNFKEAEEVFERIFGDPNSHMPFKSKLLMIISQKDTFHSFFQHFSYNHMMEKIKSYVNYVLSEKSSTFLMKAAAKVVESKR	分辨率 1.93 Å R-free 0.223
9HD1 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 59 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	XH1 N-propan-2-ylurea × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.73 Å R-free 0.227
9HD2 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 40 提交 2024-11-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A1ITY 4-[(3,5-dimethoxyphenyl)methoxy]naphthalene-1-sulfonic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution	分辨率 2.07 Å R-free 0.268
9HD9 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 1 提交 2024-11-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	UUP N-cyclopropylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.87 Å R-free 0.266
9HDA Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 58 提交 2024-11-12	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	PYZ 4-IODOPYRAZOLE × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.10 Å R-free 0.283
9HF4 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 32 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A1IUC 4-phenylmethoxynaphthalene-1-sulfonic acid × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.17 Å R-free 0.258
9HF6 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 1 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 UUP N-cyclopropylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.23 Å R-free 0.248
9HF7 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 3 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 JFP N-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)propanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.38 Å R-free 0.255
9HF8 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 4 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 T9Q N-Benzyl-2-methoxyacetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.19 Å R-free 0.255
9HF9 Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 5 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	NZ1 5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-amine × 4 GOL GLYCEROL × 8 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 1.90 Å R-free 0.228
9HFA Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 6 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	TT3 2-(3-fluorophenoxy)-N,N-dimethylacetamide × 4 GOL GLYCEROL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.05 Å R-free 0.246
9HFB Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 7 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 JP4 [2-(morpholin-4-yl)phenyl]methanol × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.29 Å R-free 0.265
9HFC Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 8 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 WHM 2-[(3-fluorophenyl)methyl]-1lambda~6~,2-thiazolidine-1,1-dione × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.17 Å R-free 0.243
9HFD Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 9 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 VW4 (2S)-2-phenylpropane-1-sulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.15 Å R-free 0.245
9HFE Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 10 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	PK4 2-fluoro-N,3-dimethylbenzene-1-sulfonamide × 4 GOL GLYCEROL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.04 Å R-free 0.247
9HFF Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 11 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1IUE (2~{S})-2-[(5-chloranylpyrimidin-2-yl)-methyl-amino]propan-1-ol × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.06 Å R-free 0.261
9HFG Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 14 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1A34 2-methoxy-N-[(4-methylphenyl)methyl]acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.02 Å R-free 0.253
9HFH Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 16 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	A1ITZ 5-cyclobutyl-3-pyridin-2-yl-1,2,4-oxadiazole × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.12 Å R-free 0.263
9HFI Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 17 提交 2024-11-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1BGH (3R)-3-[1-methyl-4-(trifluoromethyl)-1H-imidazol-2-yl]piperidine × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.44 Å R-free 0.276
9HHK Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 2 提交 2024-11-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1IU1 ~{N}-(furan-2-ylmethyl)-2-methyl-furan-3-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.23 Å R-free 0.246
9HLP Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 18 提交 2024-12-05	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 A1IV7 1-piperidin-4-ylindole × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.24 Å R-free 0.255
9HLQ Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 57 提交 2024-12-05	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	HHQ 4-iodanyl-3~{H}-pyridin-2-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 50 mM CaCl2 and 35-45 % PEG 200, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.50 Å R-free 0.297
9HLR Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 15 提交 2024-12-05	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 LL0 2-(difluoromethoxy)benzene-1-sulfonamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.48 Å R-free 0.269
9HLT Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 13 提交 2024-12-05	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 UJK 1-(2-methylphenyl)-1,2,3-triazole-4-carboxylic acid × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.16 Å R-free 0.261
9HLU Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 19 提交 2024-12-05	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 48–268（221 aa）	未记录	UUG (4-bromo-2-methoxyphenyl)methanol × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；150 nanoliter of TRF1 TRFH at 28.6 mg/mL plus 150 nanoliter of a crystallisation solution consisting of 0.1 M MES pH 6, 1-12 mM Mg(OAc)2, 1% PEG8000, and 10-15% glycerol, against 35 microliter of crystallisation solution.	分辨率 2.23 Å R-free 0.279

共 57 个其他 PDB 条目、73 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TERF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–224； UniProt 48–268

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9hd3
沉积日期 deposition_date	2024-11-11
结构标题 title	Crystal structure of human TRF1 TRFH domain in complex with compound 27
关键词 keywords	Telomere, Shelterin, Inhibitor, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.71 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.30 Å
零角强度 I(0) i0	17208500.00
分子量 molecular_weight	21082.0 kDa
排除体积 excluded_volume	20440 Å³
包络体积 envelope_volume	34166 Å³
水化壳体积 shell_volume	15986 Å³
包络直径 envelope_diameter	77.2 Å
壳层 Rg shell_rg	24.28 Å
包络 Rg envelope_rg	20.05 Å
形状 Rg shape_rg	19.29 Å
总 Rg total_rg	19.90 Å
总原子数 total_atoms	1588
残基数 n_residues	206
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	75.8 Å
Rg (实空间) rg_real	19.89 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.80 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7210e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4420e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.86 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	17210000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7720
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	21.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.666
峰度 Kurtosis kurtosis	0.352
角度范围 angular_range	— – 0.4050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2457000.0000
实空间数据点数 n_real_points	72
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.488; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.599; Smooth: 0.971

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Telomeric repeat-binding factor 1
分子量 formula_weight	25556.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1620

SNAQVQVGAPEEEEEEEEDAGLVAEAEAVAAGWMLDFLCLSLCRAFRDGRSEDFRRTRNSAEAIIHGLSSLTACQLRTIYICQFLTRIAAGKTLDAQFENDERITPLESALMIWGSIEKEHDKLHEEIQNLIKIQAIAVCMENGNFKEAEEVFERIFGDPNSHMPFKSKLLMIISQKDTFHSFFQHFSYNHMMEKIKSYVNYVLSEKSSTFLMKAAAKVVESKR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	4-ethoxynaphthalene-1-sulfonic acid
分子量 formula_weight	252.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	26

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	51.817 Å
晶胞边长 b length_b	51.817 Å
晶胞边长 c length_c	145.720 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.190 Å
最低分辨率 resolution_low	42.230 Å
R 因子 r_factor	0.2412
R_work r_work	0.2395
R_free r_free	0.2738

fit	/app/data/saxs_computation/hd/9hd3/9hd3.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hd/9hd3/9hd3.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hd/9hd3/9hd3.dat