9if4

Structure of the Mycobacterium Tuberculosis ClpC1P1P2 complex bound to the activator Bz-Leu-Leu

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC1

Mycobacterium tuberculosis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2 × 7 （P9WPC3） ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 1 × 7 （P9WPC5） activator Bz-Leu-Leu × 7 Unknown peptide × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CLPC1_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–658； UniProt 168–825 作者链 B； PDB构建体 1–658； UniProt 168–825 作者链 C； PDB构建体 1–658； UniProt 168–825 作者链 D； PDB构建体 1–658； UniProt 168–825 作者链 E； PDB构建体 1–658； UniProt 168–825 作者链 F； PDB构建体 1–658； UniProt 168–825

ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P9WPC3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC1 × 6 （P9WPC9） ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 1 × 7 （P9WPC5） activator Bz-Leu-Leu × 7 Unknown peptide × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CLPP2_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–200； UniProt 15–214 作者链 H； PDB构建体 1–200； UniProt 15–214 作者链 I； PDB构建体 1–200； UniProt 15–214 作者链 J； PDB构建体 1–200； UniProt 15–214 作者链 K； PDB构建体 1–200； UniProt 15–214 作者链 L； PDB构建体 1–200； UniProt 15–214 作者链 M； PDB构建体 1–200； UniProt 15–214

ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 1

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P9WPC5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC1 × 6 （P9WPC9） ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2 × 7 （P9WPC3） activator Bz-Leu-Leu × 7 Unknown peptide × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CLPP1_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–179； UniProt 14–192 作者链 O； PDB构建体 1–179； UniProt 14–192 作者链 P； PDB构建体 1–179； UniProt 14–192 作者链 Q； PDB构建体 1–179； UniProt 14–192 作者链 R； PDB构建体 1–179； UniProt 14–192 作者链 S； PDB构建体 1–179； UniProt 14–192 作者链 T； PDB构建体 1–179； UniProt 14–192

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9if4
沉积日期 deposition_date	2025-02-17
结构标题 title	Structure of the Mycobacterium Tuberculosis ClpC1P1P2 complex bound to the activator Bz-Leu-Leu
关键词 keywords	protein quality control, peptide activator, protease, ATPase, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9if4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9if4__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9if4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	63.57 Å
Rg（电子密度）	63.39 Å
总 Rg	63.55 Å
原子数	90720
残基数	5755
排除体积	805730 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9if4__assembly_1__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC1
分子量 formula_weight	73575.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	90720

SLVLDQFGRNLTAAAMEGKLDPVIGREKEIERVMQVLSRRTKNNPVLIGEPGVGKTAVVEGLAQAIVHGEVPETLKDKQLYTLDLGSLVAGSRYRGDFEERLKKVLKEINTRGDIILFIDELHTLVGAGAAEGAIDAASILKPKLARGELQTIGATTLDEYRKYIEKDAALERRFQPVQVGEPTVEHTIEILKGLRDRYEAHHRVSITDAAMVAAATLADRYINDRFLPDKAIDLIDEAGARMRIRRMTAPPDLREFDEKIAEARREKESAIDAQDFEKAASLRDREKTLVAQRAEREKQWRSGDLDVVAEVDDEQIAEVLGNWTGIPVFKLTEAETTRLLRMEEELHKRIIGQEDAVKAVSKAIRRTRAGLKDPKRPSGSFIFAGPSGVGKTELSKALANFLFGDDDALIQIDMGEFHDRFTASRLFGAPPGYVGYEEGGQLTEKVRRKPFSVVLFDEIEKAHQEIYNSLLQVLEDGRLTDGQGRTVDFKNTVLIFTSNLGTSDISKPVGLGFSKGGGENDYERMKQKVNDELKKHFRPEFLNRIDDIIVFHQLTREEIIRMVDLMISRVAGQLKSKDMALVLTDAAKALLAKRGFDPVLGARPLRRTIQREIEDQLSEKILFEEVGPGQVVTVDVDNWDGEGPGEDAVFTFTGTRK

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2
分子量 formula_weight	21915.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.92
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I,J,L,M,K

ILPSFIEHSSFGVKESNPYNKLFEERIIFLGVQVDDASANDIMAQLLVLESLDPDRDITMYINSPGGGFTSLMAIYDTMQYVRADIQTVCLGQAASAAAVLLAAGTPGKRMALPNARVLIHQPSLSGVIQGQFSDLEIQAAEIERMRTLMETTLARHTGKDAGVIRKDTDRDKILTAEEAKDYGIIDTVLEYRKLSAQTA

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 1
分子量 formula_weight	19496.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.92
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,O,P,Q,R,S,T

LSLTDSVYERLLSERIIFLGSEVNDEIANRLCAQILLLAAEDASKDISLYINSPGGSISAGMAIYDTMVLAPCDIATYAMGMAASMGEFLLAAGTKGKRYALPHARILMHQPLGGVTGSAADIAIQAEQFAVIKKEMFRLNAEFTGQPIERIEADSDRDRWFTAAEALEYGFVDHIITR

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	activator Bz-Leu-Leu
分子量 formula_weight	348.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,V,W,Y,Z,a,b

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Unknown peptide
分子量 formula_weight	2230.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.09 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	71218

Structure of the Mycobacterium Tuberculosis ClpC1P1P2 complex bound to the activator Bz-Leu-Leu

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9if4__assembly_1__model_1

9if4__assembly_1__model_1 | I(q)

9if4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Structure of the Mycobacterium Tuberculosis ClpC1P1P2 complex bound to the activator Bz-Leu-Leu

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9if4__assembly_1__model_1

9if4__assembly_1__model_1 | I(q)

9if4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)