SAXSdb — 9iqv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Muscarinic toxin 3

Dendroaspis angusticeps

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–65	未记录	Alpha-1A adrenergic receptor,Soluble cytochrome b562 × 1 （P35348）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9IQV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9IQR Cryo-EM structure of MT3-alpha2AAR 提交 2024-07-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–65（65 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.40 Å
9IQS Cryo-EM structure of MT3-Muscarinic acetylcholine receptor 4 提交 2024-07-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–65（65 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.60 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	3SIM3_DENAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–65； UniProt 1–65

Alpha-1A adrenergic receptor,Soluble cytochrome b562

Homo sapiens

UniProt P35348

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 5–214 链 B； UniProt 262–341	未记录	Muscarinic toxin 3 × 1 （P81031）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9IQV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8HN1 Cryo-EM structure of AdTx1-alpha1AAR-Nb6 提交 2022-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–371（371 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8THK Cryo-EM structure of A61603-bound alpha-1A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gq-protein 提交 2023-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 15–350（336 aa）	未记录	CGZ N-[(5S)-5-(4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl)-2-hydroxy-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-1-yl]methanesulfonamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8THL Cryo-EM structure of epinephrine-bound alpha-1A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gq-protein 提交 2023-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 15–350（336 aa）	未记录	ALE L-EPINEPHRINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9M4Q CryoEM structure of the alpha1AAR complex with doxazosin 提交 2025-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–341（323 aa）	未记录	A1EM4 Doxazosin, (S)- × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.99 Å
9M4T CryoEM structure of the alpha1AAR complex with silodosin 提交 2025-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–341（323 aa）	未记录	A1EMV Silodosin × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ADA1A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–210； UniProt 5–214 作者链 B； PDB构建体 311–390； UniProt 262–341

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9iqv
沉积日期 deposition_date	2024-07-13
结构标题 title	Cryo-EM structure of MT3-alpha1AAR
关键词 keywords	complex, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	24.26 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	23.21 Å
零角强度 I(0) i0	20949100.00
分子量 molecular_weight	37857.0 kDa
排除体积 excluded_volume	48711 Å³
包络体积 envelope_volume	58098 Å³
水化壳体积 shell_volume	22096 Å³
包络直径 envelope_diameter	86.9 Å
壳层 Rg shell_rg	29.13 Å
包络 Rg envelope_rg	23.59 Å
形状 Rg shape_rg	23.14 Å
总 Rg total_rg	24.29 Å
总原子数 total_atoms	2662
残基数 n_residues	338
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	83.6 Å
Rg (实空间) rg_real	24.47 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.64 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.0950e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.1680e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	24.43 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	20950000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8365
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.538
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.269
角度范围 angular_range	— – 0.3250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3907000.0000
实空间数据点数 n_real_points	64
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.719; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.739; Smooth: 0.973

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Muscarinic toxin 3
分子量 formula_weight	7396.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2662

LTCVTKNTIFGITTENCPAGQNLCFKRWHYVIPRYTEITRGCAATCPIPENYDSIHCCKTDKCNE

来源 Source

来源生物 organism	Dendroaspis angusticeps
通用名 common_name	eastern green mamba
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8618
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Alpha-1A adrenergic receptor,Soluble cytochrome b562
分子量 formula_weight	48969.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRELADLEDNWETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKASGSGSPEMKDFRHGFDILVGQIDDALKLANEGKVKEAQAAAEQLKTTRNAYIQKYLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVLKIAALKEKIAALKEKIAALKEAEEKRASRLEEELRRRLTEGSHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	569644

fit	/app/data/saxs_computation/iq/9iqv/9iqv.fit
pddf	/app/data/pr_computation/iq/9iqv/9iqv.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/iq/9iqv/9iqv.dat

Cryo-EM structure of MT3-alpha1AAR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Muscarinic toxin 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Alpha-1A adrenergic receptor,Soluble cytochrome b562

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)