SAXSdb — 9iy2

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Secreted protein ORF2

Hepatitis E virus (strain Pakistan)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Heavy Chain of mAb 8C11 × 1 Light Chain of mAb 8C11 × 1 Heavy Chain of mAb 8H3 × 1 Light Chain of mAb 8H3 × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Heavy Chain of mAb 8C11 × 1 Light Chain of mAb 8C11 × 1 Heavy Chain of mAb 8H3 × 1 Light Chain of mAb 8H3 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAPSD_HEVPA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–211； UniProt 394–603 作者链 B； PDB构建体 2–211； UniProt 394–603

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9iy2
沉积日期 deposition_date	2024-07-29
结构标题 title	Immune complex of HEV-E2s, nAb 8C11 and nAb 8H3
关键词 keywords	complex, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9iy2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9iy2__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9iy2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.44 Å
Rg（电子密度）	45.87 Å
总 Rg	45.95 Å
原子数	7718
残基数	1013
排除体积	136750 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9iy2__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`9iy2__assembly_2__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Secreted protein ORF2
分子量 formula_weight	23117.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	15430

MQLFYSRPVVSANGEPTVKLYTSVENAQQDKGIAIPHDIDLGESRVVIQDYDNQHEQDRPTPSPAPSRPFSVLRANDVLWLSLTAAEYDQSTYGSSTGPVYVSDSVTLVNVATGAQAVARSLDWTKVTLDGRPLSTIQQHSKTFFVLPLRGKLSFWEAGTTKAGYPYNYNTTASDQLLVENAAGHRVAISTYTTSLGAGPVSISAVAVLAPPPR

来源 Source

来源生物 organism	Hepatitis E virus (strain Pakistan)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	33774
宿主生物 host_organism	Bacterial expression vector pET-11a

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Heavy Chain of mAb 8C11
分子量 formula_weight	24476.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,D

QVTLKESGPGILQPSQTLSLTCSFSGFSLSTSGMGVGWIRQPSGKGLEWLAHIWWDDVKRYSPALKSRLTISKDTSSSQLFLKIASVDTADTATYYCARIKSVITTGDYALDYWGQGTSVAVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDCTSKP

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Light Chain of mAb 8C11
分子量 formula_weight	23648.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,C

DIQMTQSPASLSVSVGETVTITCRASEIIYSNLAWYQQKQGKSPQLLVYSATNLAEGVPSRFSGSGSGTQYSLKINSLQSEDFGSYYCQHFWGNPWTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Heavy Chain of mAb 8H3
分子量 formula_weight	23599.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,G

QVQLKESGPGLVAPSQSLSITCTVSGFSLIGYGVNWVRQPPEKGLEWLGMIWGDGSTDYNSALKSRLSITKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTARYYCAMGVRPDPFDYWGQGTLVTVSAAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSTVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDCTS

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Light Chain of mAb 8H3
分子量 formula_weight	24237.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,I

NIMMTQSPSSLAVSAGEKVTMSCKSSQSVLYSSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLIYWASARESGVPDRFTGSGSGTDFTLTINSVQTEDLAVYYCHQYLSSYTFGGGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC

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晶胞边长 a length_a	71.465 Å
晶胞边长 b length_b	248.941 Å
晶胞边长 c length_c	76.841 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	94.07 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.476 Å
最低分辨率 resolution_low	36.651 Å
R 因子 r_factor	0.2256
R_work r_work	0.2234
R_free r_free	0.2693

Immune complex of HEV-E2s, nAb 8C11 and nAb 8H3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Secreted protein ORF2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9iy2__assembly_1__model_1

9iy2__assembly_1__model_1 | I(q)

9iy2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Immune complex of HEV-E2s, nAb 8C11 and nAb 8H3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Secreted protein ORF2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9iy2__assembly_1__model_1

9iy2__assembly_1__model_1 | I(q)

9iy2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)