9jns

50S precursor - Erm complex (C-II)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 213.5 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9jns

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9jns
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9jns
沉积日期 deposition_date2024-09-23
结构标题 title50S precursor - Erm complex (C-II)
关键词 keywords50S precursor, Erm, methyltransferase, antibiotic resistance, ribosome-protein complex, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier63.53
回转半径 Rg (电子) rg_electron63.77
零角强度 I(0) i017872500000.00
分子量 molecular_weight733380.0 kDa
排除体积 excluded_volume752460 ų
包络体积 envelope_volume1420100 ų
水化壳体积 shell_volume175780 ų
包络直径 envelope_diameter211.6
壳层 Rg shell_rg71.96
包络 Rg envelope_rg62.38
形状 Rg shape_rg63.77
总 Rg total_rg63.86
总原子数 total_atoms49329
残基数 n_residues3497
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax213.5
Rg (实空间) rg_real63.25
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.69
I(0) (实空间) i0_real1.7870e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.8860e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal63.74
I(0) (倒空间) i0_reciprocal17890000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8699
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary76.8
偏度 Skewness skewness0.223
峰度 Kurtosis kurtosis-0.467
角度范围 angular_range— – 0.1250 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0004
最高正则化参数 α highest_alpha2516000000.0000
实空间数据点数 n_real_points26
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.834; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.957; Smooth: 0.844

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (18)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)