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9k3m

The structure of Microviridae PJNS001

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein F

物种未注明

UniProt Q2LLZ1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 180 Major spike protein G × 60 （A0A5J6T840） DNA-binding protein J × 60 （P69592） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
9k3m

共 1 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q2LLZ1_BPPHX
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 AB； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 AE； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 BC； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 BF； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 CA； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 CD； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 D； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 DB； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 DE； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 EC； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 EF； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 F； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 FA； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 FD； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 GB； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 GE； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 HC； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 HF； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 I； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 IA； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 ID； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 JB； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 JE； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 KC； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 KF； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 LA； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 LD； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 M； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 MB； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 ME； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 NC； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 NF； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 OA； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 OD； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 P； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 PB； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 PE； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 QC； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 QF； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 RA； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 RD； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 S； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 SB； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 SE； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 TC； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 TF； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 UA； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 UD； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 VB； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 VE； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 W； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 WC； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 WF； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 XA； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 XD； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 YB； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 YE； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 Z； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427 作者链 ZC； PDB构建体 1–427； UniProt 1–427

Major spike protein G

物种未注明

UniProt A0A5J6T840

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 180 Capsid protein F × 60 （Q2LLZ1） DNA-binding protein J × 60 （P69592） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
9k3m

共 1 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A5J6T840_9VIRU
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 AA； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 AD； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 B； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 BB； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 BE； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 CC； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 CF； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 DA； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 DD； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 E； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 EB； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 EE； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 FC； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 FF； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 G； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 GA； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 GD； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 HB； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 HE； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 IC； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 IF； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 JA； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 JD； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 K； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 KB； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 KE； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 LC； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 LF； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 MA； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 MD； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 N； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 NB； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 NE； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 OC； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 OF； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 PA； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 PD； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 Q； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 QB； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 QE； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 RC； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 RF； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 SA； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 SD； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 T； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 TB； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 TE； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 UC； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 UF； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 VA； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 VD； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 WB； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 WE； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 X； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 XC； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 XF； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 YA； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 YD； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 ZB； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175 作者链 ZE； PDB构建体 1–175； UniProt 1–175

DNA-binding protein J

物种未注明

UniProt P69592

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 180 Capsid protein F × 60 （Q2LLZ1） Major spike protein G × 60 （A0A5J6T840） 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1rb8 1rb8 1rb8 1rb8 1rb8 1rb8 2bpa 2bpa 2bpa 2bpa 2bpa 9k3m

共 12 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 J_BPPHS
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 AC； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 AF； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 BA； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 BD； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 C； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 CB； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 CE； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 DC； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 DF； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 EA； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 ED； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 FB； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 FE； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 GC； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 GF； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 H； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 HA； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 HD； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 IB； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 IE； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 J； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 JC； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 JF； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 KA； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 KD； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 L； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 LB； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 LE； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 MC； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 MF； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 NA； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 ND； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 O； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 OB； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 OE； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 PC； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 PF； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 QA； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 QD； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 R； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 RB； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 RE； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 SC； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 SF； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 TA； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 TD； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 UB； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 UE； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 V； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 VC； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 VF； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 WA； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 WD； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 XB； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 XE； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 Y； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 YC； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 YF； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 ZA； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 ZD； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9k3m
沉积日期 deposition_date2024-10-19
结构标题 titleThe structure of Microviridae PJNS001
关键词 keywordsstructual proteins, VIRUS; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9k3m__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9k3m__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9k3m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）129.80 Å
总 Rg129.90 Å
原子数302160
残基数38280
排除体积5351200 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9k3m__assembly_1__model_1 180-meric （180） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 引用文献 (1)