9ki1

Baseplate structure of Escherichia phage Mu

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA circularization protein N

物种未注明

UniProt P08557

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 Tail sheath protein × 6 (P79678) Tail tube protein × 6 (P79679) Baseplate protein gp46 × 6 (Q9T1V3) Baseplate hub protein gp44 × 3 (P08558) Baseplate protein gp47 × 12 (Q9T1V2) Baseplate puncturing device gp45 × 3 (Q9T1V4) Baseplate protein gp48 × 6 (Q9T1V1) Probable tape measure protein × 3 (Q9T1V6) Tail fiber protein S × 9 (Q9T1V0) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CIRCN_BPMU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 0; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 s; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 t; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 u; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 v; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 w; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495

Tail sheath protein

物种未注明

UniProt P79678

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 DNA circularization protein N × 6 (P08557) Tail tube protein × 6 (P79679) Baseplate protein gp46 × 6 (Q9T1V3) Baseplate hub protein gp44 × 3 (P08558) Baseplate protein gp47 × 12 (Q9T1V2) Baseplate puncturing device gp45 × 3 (Q9T1V4) Baseplate protein gp48 × 6 (Q9T1V1) Probable tape measure protein × 3 (Q9T1V6) Tail fiber protein S × 9 (Q9T1V0) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TSP_BPMU
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 1; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 2; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 3; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 x; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 y; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495 作者链 z; PDB构建体 1–495; UniProt 1–495

Tail tube protein

物种未注明

UniProt P79679

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 DNA circularization protein N × 6 (P08557) Tail sheath protein × 6 (P79678) Baseplate protein gp46 × 6 (Q9T1V3) Baseplate hub protein gp44 × 3 (P08558) Baseplate protein gp47 × 12 (Q9T1V2) Baseplate puncturing device gp45 × 3 (Q9T1V4) Baseplate protein gp48 × 6 (Q9T1V1) Probable tape measure protein × 3 (Q9T1V6) Tail fiber protein S × 9 (Q9T1V0) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TUBE_BPMU
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118 作者链 5; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118 作者链 6; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118 作者链 7; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118 作者链 8; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118 作者链 9; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118

Baseplate protein gp46

物种未注明

UniProt Q9T1V3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 DNA circularization protein N × 6 (P08557) Tail sheath protein × 6 (P79678) Tail tube protein × 6 (P79679) Baseplate hub protein gp44 × 3 (P08558) Baseplate protein gp47 × 12 (Q9T1V2) Baseplate puncturing device gp45 × 3 (Q9T1V4) Baseplate protein gp48 × 6 (Q9T1V1) Probable tape measure protein × 3 (Q9T1V6) Tail fiber protein S × 9 (Q9T1V0) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BP46_BPMU
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–145; UniProt 1–145 作者链 B; PDB构建体 1–145; UniProt 1–145 作者链 C; PDB构建体 1–145; UniProt 1–145 作者链 D; PDB构建体 1–145; UniProt 1–145 作者链 E; PDB构建体 1–145; UniProt 1–145 作者链 F; PDB构建体 1–145; UniProt 1–145

Baseplate hub protein gp44

物种未注明

UniProt P08558

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 DNA circularization protein N × 6 (P08557) Tail sheath protein × 6 (P79678) Tail tube protein × 6 (P79679) Baseplate protein gp46 × 6 (Q9T1V3) Baseplate protein gp47 × 12 (Q9T1V2) Baseplate puncturing device gp45 × 3 (Q9T1V4) Baseplate protein gp48 × 6 (Q9T1V1) Probable tape measure protein × 3 (Q9T1V6) Tail fiber protein S × 9 (Q9T1V0) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 BP44_BPMU
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–379; UniProt 1–379 作者链 N; PDB构建体 1–379; UniProt 1–379 作者链 U; PDB构建体 1–379; UniProt 1–379

Baseplate protein gp47

物种未注明

UniProt Q9T1V2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 DNA circularization protein N × 6 (P08557) Tail sheath protein × 6 (P79678) Tail tube protein × 6 (P79679) Baseplate protein gp46 × 6 (Q9T1V3) Baseplate hub protein gp44 × 3 (P08558) Baseplate puncturing device gp45 × 3 (Q9T1V4) Baseplate protein gp48 × 6 (Q9T1V1) Probable tape measure protein × 3 (Q9T1V6) Tail fiber protein S × 9 (Q9T1V0) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BP47_BPMU
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 I; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 J; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 K; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 L; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 M; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 O; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 P; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 Q; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 R; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 S; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 T; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360

Baseplate puncturing device gp45

物种未注明

UniProt Q9T1V4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 DNA circularization protein N × 6 (P08557) Tail sheath protein × 6 (P79678) Tail tube protein × 6 (P79679) Baseplate protein gp46 × 6 (Q9T1V3) Baseplate hub protein gp44 × 3 (P08558) Baseplate protein gp47 × 12 (Q9T1V2) Baseplate protein gp48 × 6 (Q9T1V1) Probable tape measure protein × 3 (Q9T1V6) Tail fiber protein S × 9 (Q9T1V0) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BP45_BPMU
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 V; PDB构建体 1–197; UniProt 1–197 作者链 W; PDB构建体 1–197; UniProt 1–197 作者链 X; PDB构建体 1–197; UniProt 1–197

Baseplate protein gp48

物种未注明

UniProt Q9T1V1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 DNA circularization protein N × 6 (P08557) Tail sheath protein × 6 (P79678) Tail tube protein × 6 (P79679) Baseplate protein gp46 × 6 (Q9T1V3) Baseplate hub protein gp44 × 3 (P08558) Baseplate protein gp47 × 12 (Q9T1V2) Baseplate puncturing device gp45 × 3 (Q9T1V4) Probable tape measure protein × 3 (Q9T1V6) Tail fiber protein S × 9 (Q9T1V0) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BP48_BPMU
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–180; UniProt 1–180 作者链 b; PDB构建体 1–180; UniProt 1–180 作者链 c; PDB构建体 1–180; UniProt 1–180 作者链 d; PDB构建体 1–180; UniProt 1–180 作者链 e; PDB构建体 1–180; UniProt 1–180 作者链 f; PDB构建体 1–180; UniProt 1–180

Probable tape measure protein

物种未注明

UniProt Q9T1V6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 DNA circularization protein N × 6 (P08557) Tail sheath protein × 6 (P79678) Tail tube protein × 6 (P79679) Baseplate protein gp46 × 6 (Q9T1V3) Baseplate hub protein gp44 × 3 (P08558) Baseplate protein gp47 × 12 (Q9T1V2) Baseplate puncturing device gp45 × 3 (Q9T1V4) Baseplate protein gp48 × 6 (Q9T1V1) Tail fiber protein S × 9 (Q9T1V0) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TMP_BPMU
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 g; PDB构建体 1–690; UniProt 1–690 作者链 h; PDB构建体 1–690; UniProt 1–690 作者链 i; PDB构建体 1–690; UniProt 1–690

Tail fiber protein S

物种未注明

UniProt Q9T1V0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 DNA circularization protein N × 6 (P08557) Tail sheath protein × 6 (P79678) Tail tube protein × 6 (P79679) Baseplate protein gp46 × 6 (Q9T1V3) Baseplate hub protein gp44 × 3 (P08558) Baseplate protein gp47 × 12 (Q9T1V2) Baseplate puncturing device gp45 × 3 (Q9T1V4) Baseplate protein gp48 × 6 (Q9T1V1) Probable tape measure protein × 3 (Q9T1V6) CALCIUM ION × 1 FE (III) ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 S1_BPMU
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 j; PDB构建体 1–504; UniProt 1–504 作者链 k; PDB构建体 1–504; UniProt 1–504 作者链 l; PDB构建体 1–504; UniProt 1–504 作者链 m; PDB构建体 1–504; UniProt 1–504 作者链 n; PDB构建体 1–504; UniProt 1–504 作者链 o; PDB构建体 1–504; UniProt 1–504 作者链 p; PDB构建体 1–504; UniProt 1–504 作者链 q; PDB构建体 1–504; UniProt 1–504 作者链 r; PDB构建体 1–504; UniProt 1–504

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ki1
沉积日期 deposition_date2024-11-11
结构标题 titleBaseplate structure of Escherichia phage Mu
关键词 keywordsphage, sheath, tube, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9ki1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9ki1__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9ki1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)79.71 Å
Rg(电子密度)79.28 Å
总 Rg79.35 Å
原子数114473
残基数15018
排除体积2025800 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9ki1__assembly_1__model_1 60-meric (60) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

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7. 引用文献 (1)