9mj9

Condensing wing of FASN with phosphopantetheine-modified partial ACP

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 181.8 Å Quality: REASONABLE

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	9mj9
沉积日期 deposition_date	2024-12-14
结构标题 title	Condensing wing of FASN with phosphopantetheine-modified partial ACP
关键词 keywords	De novo fatty acid synthesis Fatty acid synthase, BIOSYNTHETIC PROTEIN, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	47.30 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	48.33 Å
零角强度 I(0) i0	517313000.00
分子量 molecular_weight	185460.0 kDa
排除体积 excluded_volume	231830 Å³
包络体积 envelope_volume	321820 Å³
水化壳体积 shell_volume	61155 Å³
包络直径 envelope_diameter	192.9 Å
壳层 Rg shell_rg	45.66 Å
包络 Rg envelope_rg	48.91 Å
形状 Rg shape_rg	48.34 Å
总 Rg total_rg	48.16 Å
总原子数 total_atoms	13047
残基数 n_residues	1723
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	181.8 Å
Rg (实空间) rg_real	50.89 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.25 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.2340e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.4620e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	47.31 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	516800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.5604
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	38.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.706
峰度 Kurtosis kurtosis	0.027
角度范围 angular_range	— – 0.1650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	1.1720
最高正则化参数 α highest_alpha	76060000.0000
实空间数据点数 n_real_points	34
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.543; Stabil: 0.841; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.566; Smooth: 0.605

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (2)

Entity 1 polymer

描述 description	Fatty acid synthase
分子量 formula_weight	92515.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.85,2.3.1.38,2.3.1.39,2.3.1.41,1.1.1.100,4.2.1.59,1.3.1.39,3.1.2.14
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	13047

MEEVVIAGMSGKLPESENLQEFWDNLIGGVDMVTDDDRRWKAGLYGLPRRSGKLKDLSRFDASFFGVHPKQAHTMDPQLRLLLEVTYEAIVDGGINPDSLRGTHTGVWVGVSGSETSEALSRDPETLVGYSMVGCQRAMMANRLSFFFDFRGPSIALDTACSSSLMALQNAYQAIHSGQCPAAIVGGINVLLKPNTSVQFLRLGMLSPEGTCKAFDTAGNGYCRSEGVVAVLLTKKSLARRVYATILNAGTNTDGFKEQGVTFPSGDIQEQLIRSLYQSAGVAPESFEYIEAHGTGTKVGDPQELNGITRALCATRQEPLLIGSTKSNMGHPEPASGLAALAKVLLSLEHGLWAPNLHFHSPNPEIPALLDGRLQVVDQPLPVRGGNVGINSFGFGGSNVHIILRPNTQPPPAPAPHATLPRLLRASGRTPEAVQKLLEQGLRHSQDLAFLSMLNDIAAVPATAMPFRGYAVLGGERGGPEVQQVPAGERPLWFICSGMGTQWRGMGLSLMRLDRFRDSILRSDEAVKPFGLKVSQLLLSTDESTFDDIVHSFVSLTAIQIGLIDLLSCMGLRPDGIVGHSLGEVACGYADGCLSQEEAVLAAYWRGQCIKEAHLPPGAMAAVGLSWEECKQRCPPGVVPACHNSKDTVTISGPQAPVFEFVEQLRKEGVFAKEVRTGGMAFHSYFMEAIAPPLLQELKKVIREPKPRSARWLSTSIPEAQWHSSLARTSSAEYNVNNLVSPVLFQEALWHVPEHAVVLEIAPHALLQAVLKRGLKPSCTIIPLMKKDHRDNLEFFLAGIGRLHLSGIDANPNALFPPVEFPAPRGTPLISPLIKWDHSLAWDVPAAEDFPNGS

Entity 2 polymer

描述 description	Fatty acid synthase
分子量 formula_weight	2247.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.85,2.3.1.38,2.3.1.39,2.3.1.41,1.1.1.100,4.2.1.59,1.3.1.39,3.1.2.14
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

DXLMSVEVRQTLEREL

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7. 引用文献 (1)

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分辨率 resolution	2.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	752729

fit	/app/data/saxs_computation/mj/9mj9/9mj9.fit
pddf	/app/data/pr_computation/mj/9mj9/9mj9.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/mj/9mj9/9mj9.dat

Condensing wing of FASN with phosphopantetheine-modified partial ACP

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (2)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)