9mu7

Structure of a native Drosophila melanogaster Pol II Elongation Complex with a well-defined Rpb4/Rpb7 stalk

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB1_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1470； UniProt 7–1476

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

物种未注明

UniProt P08266

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB2_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1164； UniProt 13–1176

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

物种未注明

UniProt O97183

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	O97183_DROME
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–269； UniProt 2–270

DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4

物种未注明

UniProt Q9VEA5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB4_DROME
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–130； UniProt 10–139

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

物种未注明

UniProt Q24320

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB2_DROME
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–84； UniProt 47–130

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

物种未注明

UniProt Q9VFB5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

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UniProt名称	Q9VFB5_DROME
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt Q9VNZ3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q9VNZ3_DROME
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–147； UniProt 2–148

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P36958

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

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UniProt名称	RPB9_DROME
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–116； UniProt 14–129

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

物种未注明

UniProt Q9VC49

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

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UniProt名称	RPAB5_DROME
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11

物种未注明

UniProt Q9VJE4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB11_DROME
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–116； UniProt 1–116

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12

物种未注明

UniProt Q6IGE3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （Q7JZF5） ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q6IGE3_DROME
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–46； UniProt 12–57

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5

物种未注明

UniProt Q7JZF5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 12 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04052） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08266） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （O97183） DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4 × 1 （Q9VEA5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （Q24320） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （Q9VFB5） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （Q9VNZ3） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36958） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （Q9VC49） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （Q9VJE4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （Q6IGE3） RNA × 1 Template DNA × 1 Non-template DNA × 1 ZINC ION × 8	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q7JZF5_DROME
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9mu7
沉积日期 deposition_date	2025-01-13
结构标题 title	Structure of a native Drosophila melanogaster Pol II Elongation Complex with a well-defined Rpb4/Rpb7 stalk
关键词 keywords	polymerase, Pol II, transcription, mRNA; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9mu7__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9mu7__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9mu7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.23 Å
Rg（电子密度）	51.57 Å
总 Rg	51.76 Å
原子数	33887
残基数	4091
排除体积	597990 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9mu7__assembly_1__model_1`	pentadecameric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
分子量 formula_weight	166420.4 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	33887

SKAPLRQVKRVQFGILSPDEIRRMSVTEGGVQFAETMEGGRPKLGGLMDPRQGVIDRTSRCQTCAGNMTECPGHFGHIDLAKPVFHIGFITKTIKILRCVCFYCSKMLVSPHNPKIKEIVMKSRGQPRKRLAYVYDLCKGKTICEGGEDMDLTKENQQPDPNKKPGHGGCGHYQPSIRRTGLDLTAEWKHQNEDSQEKKIVVSAERVWEILKHITDEECFILGMDPKYARPDWMIVTVLPVPPLAVRPAVVMFGAAKNQDDLTHKLSDIIKANNELRKNEASGAAAHVIQENIKMLQFHVATLVDNDMPGMPRAMQKSGKPLKAIKARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLRIDQVGVPRSIAQNLTFPELVTPFNIDRMQELVRRGNSQYPGAKYIVRDNGERIDLRFHPKSSDLHLQCGYKVERHLRDDDLVIFNRQPTLHKMSMMGHRVKVLPWSTFRMNLSCTSPYNADFDGDEMNLHVPQSMETRAEVENIHITPRQIITPQANKPVMGIVQDTLTAVRKMTKRDVFITREQVMNLLMFLPTWDAKMPQPCILKPRPLWTGKQIFSLIIPGNVNMIRTHSTHPDEEDEGPYKWISPGDTKVMVEHGELIMGILCKKSLGTSAGSLLHICFLELGHDIAGRFYGNIQTVINNWLLFEGHSIGIGDTIADPQTYNEIQQAIKKAKDDVINVIQKAHNMELEPTPGNTLRQTFENKVNRILNDARDKTGGSAKKSLTEYNNLKAMVVSGSKGSNINISQVIACVGQQNVEGKRIPYGFRKRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPSEFYFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKAMESVMVNYDGTVRNSVGQLIQLRYGEDGLCGELVEFQNMPTVKLSNKSFEKRFKFDWSNERLMKKVFTDDVIKEMTDSSEAIQELEAEWDRLVSDRDSLRQIFPNGESKVVLPCNLQRMIWNVQKIFHINKRLPTDLSPIRVIKGVKTLLERCVIVTGNDRISKQANENATLLFQCLIRSTLCTKYVSEEFRLSTEAFEWLVGEIETRFQQAQANPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHFAGVSSKNVTLGVPRLKEIINISKKPKAPSLTVFLTGGAARDAEKAKNVLCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPDPQRTVISEDQEFVNVYYEMPDFDPTRISPWLLRIELDRKRMTDKKLTMEQIAEKINVGFGEDLNCIFNDDNADKLVLRIRIMNNEENKFQDEDEAVDKMEDDMFLRCIEANMLSDMTLQGIEAIGKVYMHLPQTDSKKRIVITETGEFKAIGEWLLETDGTSMMKVLSERDVDPIRTSSNDICEIFQVLGIEAVRKSVEKEMNAVLQFYGLYVNYRHLALLCDVMTAKGHLMAITRHGINRQDTGALMRCSFEETVDVLMDAAAHAETDPMRGVSENIIMGQLPKMGTGCFDLLLDAEKCRFGI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2
分子量 formula_weight	132640.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

ENAEEISHELWQEACWIVINAYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVEDSPAIELQAEAQHTSGEVETPPRFSLKFEQIYLSKPTHWEKDGSPSPMMPNEARLRNLTYSAPLYVDITKTKNVEGLDPVETQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLSQLTDRDLTELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFSMKDGKYAFKTEIRSCLEHSSRPTSTLWVNMMARGSQNIKKSAIGQRIIAILPYIKQEIPIMIVFRALGFVADRDILEHIIYDFDDPEMMEMVKPSLDEAFVVQEQNVALNFIGARGARPGVTKDKRIKYAKEILQKEMLPHVGVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLASLGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGLFKNLMKEVRMYTQKFIDRGKDFNLELAIKTNIITDGLRYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLSHLRRVNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMLCPAETPEGAAVGLVKNLALMAYISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEIAPSAIADATKIFVNGCWVGIHRDPEQLMATLRKLRRQMDIIVSEVSMIRDIRDREIRIYTDAGRICRPLLIVENGSLLLKKTHVEMLKERDYNNYSWQVLVASGVVEYIDTLEEETVMIAMSPYDLKQDKDYAYCTTYTHCEIHPAMILGVCASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPMKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIVAILCYTGYNQEDSVILNASAVERGFFRSVFYRSYKDSENKRVGDQEENFEKPHRGTCQGMRNAHYDKLDDDGIIAPGIRVSGDDVVIGKTITLPENDDELDSNTKRFSKRDASTFLRNSETGIVDQVMLTLNSEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMAFTCEGLAPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKLGSNKGEIGDATPFNDAVNVQKISTFLQEYGYHLRGNEVMYNGHTGRKINAQVFLGPTYYQRLKHMVDDKIHSRARGPVQILVRQPMEGRARDGGLRFGEMERDCQISHGAAQFLRERLFEVSDPYRVHICNFCGLIAIANLRNNTFECKGCKNKTQISQVRLPYAAKLLFQELMSMNIAPRLMVT

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
分子量 formula_weight	30676.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

PYANQPSVQITELTDDNVKFVLEDTELSVANSLRRVFIAETPTLAIDWVQLEANSTVLSDEFLAHRIGLIPLISDDVVERLQYTRDCICLDFCPECSVEFTLDVKCSEEQTRHVTTADLKSSNAKVLPVTSRNQGEEDNEYGESNDEILIIKLRKGQELKLRAYAKKGFGKEHAKWNPTAGVCFEYDPDNSMRHTLYPKPDEWPKSEHTELEDDQYEAPYNWEAKPNKFFFNVESAGALKPENIVVMGVQVLKNKLSNLQTQLSHESQN

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4
分子量 formula_weight	15180.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

VDEDAADLQFPKEFENAETLLISEVHMLLDHRKRQNESADEEQEFSEVFMKTYAYTDSFRKFKNKETIMSARSLLMQKKLHKFELAALGNLCPEAPEEAKALIPSLEGRFEDEELRQILDDIGTKRSLQY

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2
分子量 formula_weight	9736.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

GGVPKSKRITTKYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPIMVELDGETDPLQIAMKELKQKKIPIIIRRYLPDHSYEDWSIDELIMVD

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
分子量 formula_weight	19127.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MFYHISLEQEILLHPRYFGPQLLETVKQKLYSEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDQIGSGVIQPGQGFVVYPVKYKAIVFRPFKGEVLDAVVKQINKVGMFAEIGPLSCFISHHSIPADMQFCPNGNPPCYKSKDEDVVISGEDKIRLKIVGTRVDATGIFAIGTLMDDYLGLVSN

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
分子量 formula_weight	16946.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

AGVLFEDIFNVKDMDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDINSWLYPMELGDKFRLVLATTLREDGCPDSGEYNPMEHEGTRADSFEYVMYGKIYRIEGDEAHNEASRLSAYVSFGGLLMRLQGDANNLHGFEVDQHMYLLMKRLA

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
分子量 formula_weight	13786.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

GFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENKILLYACRNCDYKQEADSNCIYVNKIMHEIDELTHIVPDVISDPTLPRTEDHACPKCSHREAVFFQAQTRRAEEEMRLYYVCTNQNCTHRWTE

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
分子量 formula_weight	7671.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MIIPIRCFTCGKVIGNKWESYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLGHVDLIEKLLNYAPLEK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
分子量 formula_weight	13288.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MNAPPTFESFLLYEGEKKIIKELDTKVTNAAIFTINKEDHTLGNMIRNQLLKDPNVLFAGYKVPHPLEHKFVIRIQTTADYSPQEAFMNAITDLLAELSLFEERFKDAIKEKKEGG

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12
分子量 formula_weight	5647.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

TAMTYICGECHHENEMRPRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	RNA
分子量 formula_weight	3247.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	R

AAAAAAAAAA

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Template DNA
分子量 formula_weight	15134.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTT

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Non-template DNA
分子量 formula_weight	12170.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5
分子量 formula_weight	24518.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MDDEAETYKLWRIRKTIMQLSHDRGYLVTQDELDQTLEQFKEMFGDKPSEKRPARSDLIVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEPKIGIKTIKTYCTRMQEENIHRAIVVVQGGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLESELLINITEHELVPEHVVMTVEEKQELLSRYKLKENMLMRIQAGDPVARYFGLKRGQVVKIIRSSETAGRYISYRLVC

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.440 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.44 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	70116

Structure of a native Drosophila melanogaster Pol II Elongation Complex with a well-defined Rpb4/Rpb7 stalk

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit Rpb4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体