9nlw

Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vesicular-fusion protein SEC18

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Alpha-soluble NSF attachment protein × 3 （P32602） Synaptobrevin homolog 1 × 1 （P31109） Protein SSO1 × 1 （P32867） Protein transport protein SEC9 × 1 （P40357） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC18_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 B； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 C； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 D； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 E； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758 作者链 F； PDB构建体 4–761； UniProt 1–758

Alpha-soluble NSF attachment protein

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32602

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Vesicular-fusion protein SEC18 × 6 （P18759） Synaptobrevin homolog 1 × 1 （P31109） Protein SSO1 × 1 （P32867） Protein transport protein SEC9 × 1 （P40357） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC17_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 2–293； UniProt 1–292 作者链 H； PDB构建体 2–293； UniProt 1–292 作者链 I； PDB构建体 2–293； UniProt 1–292

Synaptobrevin homolog 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P31109

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Vesicular-fusion protein SEC18 × 6 （P18759） Alpha-soluble NSF attachment protein × 3 （P32602） Protein SSO1 × 1 （P32867） Protein transport protein SEC9 × 1 （P40357） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SNC1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 5–97； UniProt 1–93

Protein SSO1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32867

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Vesicular-fusion protein SEC18 × 6 （P18759） Alpha-soluble NSF attachment protein × 3 （P32602） Synaptobrevin homolog 1 × 1 （P31109） Protein transport protein SEC9 × 1 （P40357） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SSO1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 5–269； UniProt 1–265

Protein transport protein SEC9

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40357

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Vesicular-fusion protein SEC18 × 6 （P18759） Alpha-soluble NSF attachment protein × 3 （P32602） Synaptobrevin homolog 1 × 1 （P31109） Protein SSO1 × 1 （P32867） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SEC9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 5–222； UniProt 433–650

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9nlw
沉积日期 deposition_date	2025-03-03
最后修订 last_revision	2025-10-01
结构标题 title	Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6
关键词 keywords	SNARE, NSF, Sec18, AAA+, TRANSLOCASE; TRANSLOCASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9nlw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9nlw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9nlw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	66.55 Å
Rg（电子密度）	66.35 Å
总 Rg	66.38 Å
原子数	78921
残基数	5006
排除体积	701400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9nlw__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Vesicular-fusion protein SEC18
分子量 formula_weight	84423.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	78921

GAHMFKIPGFGKAAANHTPPDMTNMDTRTRHLKVSNCPNNSYALANVAAVSPNDFPNNIYIIIDNLFVFTTRHSNDIPPGTIGFNGNQRTWGGWSLNQDVQAKAFDLFKYSGKQSYLGSIDIDISFRARGKAVSTVFDQDELAKQFVRCYESQIFSPTQYLIMEFQGHFFDLKIRNVQAIDLGDIEPTSAVATGIETKGILTKQTQINFFKGRDGLVNLKSSNSLRPRSNAVIRPDFKFEDLGVGGLDKEFTKIFRRAFASRIFPPSVIEKLGISHVKGLLLYGPPGTGKTLIARKIGTMLNAKEPKIVNGPEILSKYVGSSEENIRNLFKDAEAEYRAKGEESSLHIIIFDELDSVFKQRGSRGDGTGVGDNVVNQLLAKMDGVDQLNNILVIGMTNRKDLIDSALLRPGRFEVQVEIHLPDEKGRLQIFDIQTKKMRENNMMSDDVNLAELAALTKNFSGAEIEGLVKSASSFAINKTVNIGKGATKLNTKDIAKLKVTREDFLNALNDVTPAFGISEEDLKTCVEGGMMLYSERVNSILKNGARYVRQVRESDKSRLVSLLIHGPAGSGKTALAAEIALKSGFPFIRLISPNELSGMSESAKIAYIDNTFRDAYKSPLNILVIDSLETLVDWVPIGPRFSNNILQMLKVALKRKPPQDRRLLIMTTTSAYSVLQQMDILSCFDNEIAVPNMTNLDELNNVMIESNFLDDAGRVKVINELSRSCPNFNVGIKKTLTNIETARHDEDPVNELVELMTQSA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Alpha-soluble NSF attachment protein
分子量 formula_weight	32899.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I

GMSDPVELLKRAEKKGVPSSGFMKLFSGSDSYKFEEAADLCVQAATIYRLRKELNLAGDSFLKAADYQKKAGNEDEAGNTYVEAYKCFKSGGNSVNAVDSLENAIQIFTHRGQFRRGANFKFELGEILENDLHDYAKAIDCYELAGEWYAQDQSVALSNKCFIKCADLKALDGQYIEASDIYSKLIKSSMGNRLSQWSLKDYFLKKGLCQLAATDAVAAARTLQEGQSEDPNFADSRESNFLKSLIDAVNEGDSEQLSEHCKEFDNFMRLDKWKITILNKIKESIQQQEDDLL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Synaptobrevin homolog 1
分子量 formula_weight	10943.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

GASHMSSSTPFDPYALSEHDEERPQNVQSKSRTAELQAEIDDTVGIMRDNINKVAERGERLTSIEDKADNLAVSAQGFKRGANRVRKAMWYKDLKMK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Protein SSO1
分子量 formula_weight	30798.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

GASHMSYNNPYQLETPFEESYELDEGSSAIGAEGHDFVGFMNKISQINRDLDKYDHTINQVDSLHKRLLTEVNEEQASHLRHSLDNFVAQATDLQFKLKNEIKSAQRDGIHDTNKQAQAENSRQRFLKLIQDYRIVDSNYKEENKEQAKRQYMIIQPEATEDEVEAAISDVGGQQIFSQALLNANRRGEAKTALAEVQARHQELLKLEKSMAELTQLFNDMEELVIEQQENVDVIDKNVEDAQLDVEQGVGHTDKAVKSARKARKNKIR

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Protein transport protein SEC9
分子量 formula_weight	25777.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

GASHIKFTKQSSVASTRNTLKMAQDAERAGMNTLGMLGHQSEQLNNVEGNLDLMKVQNKVADEKVAELKKLNRSILAVHVSNPFNSKRRRREREEQLKNRKIEEKLMREQTSQQLSQSTQRIEGAMNANNNISEVRERYQRKNVLEKAKRYQFENDEEDDEMELEIDRNLDQIQQVSNRLKKMALTTGKELDSQQKRLNNIEESTDDLDINLHMNTNRLAGI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

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分辨率 resolution	3.73 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	64857

Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vesicular-fusion protein SEC18

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Alpha-soluble NSF attachment protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Synaptobrevin homolog 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein SSO1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein transport protein SEC9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9nlw__assembly_1__model_1

9nlw__assembly_1__model_1 | I(q)

9nlw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)